FuNGI

A0A448YHW6

Protein Details

Accession

A0A448YHW6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
576-595	YLVKHIETKRQKNKIAKFFT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MSNRNNITPGEQAKVLDNSITVIRQQVALMRKCLETKNHFMDALKHASTFLNELRTNSLTPKQYYELYIMVYEGLEYLSQDLKDTHPNNHLADLYELVQYAGNIVPRLYLMITVGTVYMGVKDAPVKEIMTDMMEMCRGVQHPIRGLFLRYYLSQRTKDLLPTEFSDPSTEKKDELALKGDVSDSIQFIITNFIEMNKLWVRWQHQGHSSEHRKRVEERKELQILVGSNLVRLSQLDAIDRVYYKKHILPLILEQIVKCRDLIAQEYLLDVIIQVFPDEFHLITLDEFFDATLNLDPHVSIKSIVLTLVDRLIGFKKREPDYVAKVVADDSVDIFGKIIGFIDKLSQLKPDMSATDYSSILESISKLSITYYPDRYANIDSIFAHATELFKDKGSSPELQAQNNWKTLLLAPISMYSDVRSILQLDNHYLEFFNLQSYQLRRSVSMEIVEKFLEEEVKITTKEELDKVFTVVQPLIVVPEDPTVKALKLGDPALNSLPGASVADTETEEDSKDSLDIILQQESLAKLLQLIYNKNPYKHFELLEIARDYLQPAKQRVKYTYPTLVAMTLKLVRKLYLVKHIETKRQKNKIAKFFTFISGLITVMGQHTYNAVDCFNLNLMTAEIADESKLVDISYDFFIESLVIYEQFFVDSRSQYQALMSLINKLISAKNMIQQNVENFDRLITKTTLYSSKLLRKTDQCRAVYMSSHLWWIVEDVDDYGDADESEPINAMMSHLSLKDDGKRVLECLQKSLRIADSILDNNVSLELFIEILNQSLYFFIHGNEMVSVRYLNGLIELIRNNFKAVGKIEGPFEATWKHFDRTLKYIREQKSIDPRFDEVNA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.3
3	0.23
4	0.2
5	0.18
6	0.19
7	0.19
8	0.15
9	0.15
10	0.15
11	0.16
12	0.16
13	0.2
14	0.27
15	0.3
16	0.33
17	0.33
18	0.35
19	0.38
20	0.43
21	0.46
22	0.45
23	0.5
24	0.53
25	0.54
26	0.53
27	0.5
28	0.51
29	0.48
30	0.48
31	0.39
32	0.32
33	0.3
34	0.29
35	0.29
36	0.27
37	0.24
38	0.26
39	0.26
40	0.27
41	0.31
42	0.32
43	0.33
44	0.33
45	0.37
46	0.35
47	0.36
48	0.39
49	0.37
50	0.38
51	0.38
52	0.37
53	0.31
54	0.27
55	0.24
56	0.2
57	0.17
58	0.14
59	0.12
60	0.09
61	0.07
62	0.06
63	0.06
64	0.08
65	0.1
66	0.1
67	0.11
68	0.13
69	0.15
70	0.25
71	0.27
72	0.3
73	0.34
74	0.38
75	0.39
76	0.4
77	0.39
78	0.31
79	0.3
80	0.26
81	0.21
82	0.18
83	0.16
84	0.14
85	0.13
86	0.11
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.11
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.12
95	0.1
96	0.09
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.06
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.06
108	0.06
109	0.1
110	0.1
111	0.12
112	0.14
113	0.13
114	0.13
115	0.14
116	0.14
117	0.12
118	0.12
119	0.11
120	0.11
121	0.11
122	0.1
123	0.1
124	0.12
125	0.11
126	0.14
127	0.17
128	0.2
129	0.25
130	0.27
131	0.31
132	0.29
133	0.31
134	0.28
135	0.26
136	0.25
137	0.22
138	0.25
139	0.29
140	0.34
141	0.34
142	0.35
143	0.37
144	0.37
145	0.39
146	0.38
147	0.33
148	0.31
149	0.31
150	0.33
151	0.31
152	0.29
153	0.28
154	0.26
155	0.27
156	0.3
157	0.27
158	0.23
159	0.23
160	0.28
161	0.29
162	0.3
163	0.31
164	0.26
165	0.25
166	0.25
167	0.24
168	0.19
169	0.16
170	0.14
171	0.1
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.12
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.11
183	0.16
184	0.15
185	0.15
186	0.16
187	0.21
188	0.25
189	0.32
190	0.36
191	0.36
192	0.41
193	0.45
194	0.47
195	0.53
196	0.59
197	0.6
198	0.63
199	0.62
200	0.58
201	0.61
202	0.67
203	0.67
204	0.66
205	0.62
206	0.63
207	0.64
208	0.6
209	0.53
210	0.46
211	0.37
212	0.29
213	0.27
214	0.18
215	0.14
216	0.14
217	0.13
218	0.1
219	0.1
220	0.11
221	0.1
222	0.11
223	0.11
224	0.12
225	0.13
226	0.14
227	0.14
228	0.14
229	0.13
230	0.14
231	0.16
232	0.19
233	0.22
234	0.23
235	0.24
236	0.25
237	0.28
238	0.31
239	0.3
240	0.28
241	0.23
242	0.26
243	0.26
244	0.24
245	0.19
246	0.14
247	0.13
248	0.15
249	0.18
250	0.15
251	0.15
252	0.15
253	0.15
254	0.14
255	0.13
256	0.11
257	0.08
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.06
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.08
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.09
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.07
299	0.11
300	0.15
301	0.17
302	0.19
303	0.26
304	0.28
305	0.31
306	0.35
307	0.37
308	0.39
309	0.42
310	0.39
311	0.32
312	0.3
313	0.27
314	0.23
315	0.17
316	0.11
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.06
330	0.08
331	0.09
332	0.1
333	0.11
334	0.12
335	0.12
336	0.13
337	0.13
338	0.11
339	0.12
340	0.13
341	0.12
342	0.13
343	0.13
344	0.12
345	0.11
346	0.1
347	0.09
348	0.08
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.09
356	0.12
357	0.16
358	0.17
359	0.18
360	0.19
361	0.2
362	0.21
363	0.2
364	0.19
365	0.15
366	0.14
367	0.12
368	0.13
369	0.13
370	0.11
371	0.1
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.1
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.1
380	0.13
381	0.15
382	0.16
383	0.15
384	0.23
385	0.25
386	0.25
387	0.27
388	0.3
389	0.3
390	0.3
391	0.29
392	0.2
393	0.19
394	0.19
395	0.19
396	0.13
397	0.1
398	0.09
399	0.1
400	0.11
401	0.1
402	0.1
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.06
408	0.07
409	0.08
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.12
414	0.11
415	0.11
416	0.1
417	0.09
418	0.08
419	0.07
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.09
424	0.11
425	0.13
426	0.16
427	0.16
428	0.16
429	0.18
430	0.2
431	0.18
432	0.19
433	0.19
434	0.16
435	0.17
436	0.16
437	0.14
438	0.12
439	0.11
440	0.09
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.09
448	0.1
449	0.12
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.14
454	0.15
455	0.15
456	0.14
457	0.14
458	0.12
459	0.11
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.09
470	0.09
471	0.09
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.12
476	0.13
477	0.14
478	0.13
479	0.15
480	0.14
481	0.14
482	0.12
483	0.09
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.07
504	0.08
505	0.09
506	0.08
507	0.08
508	0.1
509	0.1
510	0.1
511	0.07
512	0.06
513	0.06
514	0.07
515	0.09
516	0.11
517	0.13
518	0.16
519	0.25
520	0.28
521	0.3
522	0.32
523	0.34
524	0.38
525	0.39
526	0.36
527	0.29
528	0.31
529	0.3
530	0.33
531	0.29
532	0.23
533	0.2
534	0.19
535	0.18
536	0.17
537	0.19
538	0.19
539	0.23
540	0.31
541	0.36
542	0.4
543	0.44
544	0.46
545	0.48
546	0.48
547	0.5
548	0.43
549	0.39
550	0.36
551	0.33
552	0.27
553	0.22
554	0.19
555	0.18
556	0.17
557	0.19
558	0.18
559	0.17
560	0.18
561	0.22
562	0.23
563	0.28
564	0.3
565	0.29
566	0.38
567	0.41
568	0.49
569	0.55
570	0.62
571	0.62
572	0.68
573	0.74
574	0.74
575	0.8
576	0.8
577	0.79
578	0.71
579	0.65
580	0.58
581	0.53
582	0.45
583	0.35
584	0.28
585	0.19
586	0.17
587	0.13
588	0.11
589	0.09
590	0.08
591	0.08
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.07
596	0.08
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.09
602	0.09
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.07
621	0.09
622	0.09
623	0.08
624	0.08
625	0.08
626	0.08
627	0.08
628	0.07
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.07
633	0.07
634	0.08
635	0.08
636	0.09
637	0.11
638	0.12
639	0.14
640	0.18
641	0.18
642	0.18
643	0.18
644	0.18
645	0.16
646	0.18
647	0.16
648	0.16
649	0.16
650	0.16
651	0.16
652	0.15
653	0.16
654	0.14
655	0.18
656	0.16
657	0.21
658	0.25
659	0.26
660	0.26
661	0.28
662	0.3
663	0.31
664	0.3
665	0.26
666	0.21
667	0.22
668	0.22
669	0.2
670	0.21
671	0.16
672	0.16
673	0.17
674	0.2
675	0.24
676	0.24
677	0.27
678	0.29
679	0.37
680	0.42
681	0.45
682	0.48
683	0.53
684	0.58
685	0.64
686	0.66
687	0.58
688	0.55
689	0.57
690	0.52
691	0.45
692	0.41
693	0.35
694	0.27
695	0.27
696	0.24
697	0.19
698	0.17
699	0.16
700	0.13
701	0.09
702	0.09
703	0.08
704	0.09
705	0.08
706	0.09
707	0.08
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.08
712	0.08
713	0.08
714	0.08
715	0.08
716	0.08
717	0.08
718	0.08
719	0.07
720	0.07
721	0.09
722	0.09
723	0.11
724	0.12
725	0.14
726	0.2
727	0.24
728	0.26
729	0.28
730	0.28
731	0.29
732	0.35
733	0.39
734	0.34
735	0.36
736	0.39
737	0.39
738	0.39
739	0.41
740	0.36
741	0.31
742	0.3
743	0.24
744	0.25
745	0.24
746	0.24
747	0.21
748	0.18
749	0.17
750	0.17
751	0.15
752	0.09
753	0.08
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.07
758	0.07
759	0.08
760	0.08
761	0.07
762	0.07
763	0.07
764	0.08
765	0.08
766	0.08
767	0.08
768	0.11
769	0.12
770	0.13
771	0.14
772	0.14
773	0.13
774	0.13
775	0.13
776	0.1
777	0.11
778	0.1
779	0.09
780	0.09
781	0.1
782	0.09
783	0.13
784	0.16
785	0.18
786	0.22
787	0.23
788	0.23
789	0.26
790	0.26
791	0.28
792	0.27
793	0.3
794	0.28
795	0.29
796	0.3
797	0.28
798	0.3
799	0.25
800	0.25
801	0.23
802	0.22
803	0.26
804	0.28
805	0.29
806	0.31
807	0.36
808	0.4
809	0.45
810	0.53
811	0.54
812	0.57
813	0.65
814	0.66
815	0.69
816	0.65
817	0.66
818	0.67
819	0.67
820	0.64
821	0.59
822	0.56

A0A448YHW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer