Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1DZG0

Protein Details
Accession A0A0D1DZG0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-234STKTQKAKTRTQKEGKQLLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-100DARAGRPRNGESRGRGGRGRGRGAPRGR
247-277GGRGGARGGARGGARGERGAGRGRGGRGGRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, cyto 12, nucl 7, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG uma:UMAG_02955  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVATKNLFAILGDDDDVAAPKAAPAKAAAPAATPAPQRNIPGAGNQRRGGARNGAPRAAAGADAVEGEQQKDARAGRPRNGESRGRGGRGRGRGAPRGRAFDRHSQTDRVDSQKAVAQGWGGEDGKKELDNEQKAEADAQAEGAEAGATATPAEAEKVPEEEEDKTMTLDQYLAAQAGKKLNIESKAPREVATDDSAYAKLTKHEKEEADYFASTKTQKAKTRTQKEGKQLLDIEQTFNQPAVQRGGRGGARGGARGGARGERGAGRGRGGRGGRGGNVSVNLADKNAFPSLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.11
4 0.12
5 0.1
6 0.09
7 0.07
8 0.08
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.16
14 0.19
15 0.21
16 0.2
17 0.16
18 0.17
19 0.18
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.24
24 0.26
25 0.27
26 0.29
27 0.31
28 0.27
29 0.33
30 0.41
31 0.44
32 0.48
33 0.47
34 0.48
35 0.47
36 0.49
37 0.44
38 0.41
39 0.39
40 0.42
41 0.44
42 0.41
43 0.38
44 0.36
45 0.34
46 0.27
47 0.2
48 0.11
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.13
60 0.14
61 0.19
62 0.28
63 0.32
64 0.37
65 0.45
66 0.49
67 0.52
68 0.56
69 0.55
70 0.5
71 0.55
72 0.53
73 0.47
74 0.45
75 0.44
76 0.45
77 0.45
78 0.45
79 0.42
80 0.43
81 0.48
82 0.5
83 0.54
84 0.5
85 0.51
86 0.49
87 0.49
88 0.48
89 0.5
90 0.51
91 0.48
92 0.48
93 0.45
94 0.44
95 0.44
96 0.42
97 0.37
98 0.34
99 0.27
100 0.25
101 0.24
102 0.24
103 0.19
104 0.16
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.12
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.19
118 0.2
119 0.21
120 0.22
121 0.22
122 0.21
123 0.21
124 0.17
125 0.11
126 0.08
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.08
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.14
170 0.17
171 0.2
172 0.23
173 0.26
174 0.31
175 0.31
176 0.3
177 0.28
178 0.28
179 0.27
180 0.25
181 0.2
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.11
188 0.13
189 0.18
190 0.2
191 0.23
192 0.28
193 0.28
194 0.32
195 0.34
196 0.33
197 0.3
198 0.28
199 0.24
200 0.2
201 0.22
202 0.18
203 0.19
204 0.23
205 0.28
206 0.35
207 0.41
208 0.51
209 0.59
210 0.68
211 0.74
212 0.77
213 0.76
214 0.8
215 0.82
216 0.73
217 0.68
218 0.6
219 0.53
220 0.51
221 0.44
222 0.37
223 0.3
224 0.31
225 0.25
226 0.24
227 0.22
228 0.16
229 0.18
230 0.21
231 0.2
232 0.19
233 0.2
234 0.25
235 0.24
236 0.24
237 0.22
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.19
243 0.18
244 0.18
245 0.2
246 0.18
247 0.18
248 0.17
249 0.19
250 0.18
251 0.21
252 0.25
253 0.24
254 0.26
255 0.29
256 0.3
257 0.35
258 0.35
259 0.35
260 0.34
261 0.36
262 0.35
263 0.33
264 0.33
265 0.28
266 0.27
267 0.25
268 0.21
269 0.2
270 0.18
271 0.15
272 0.15
273 0.13
274 0.16