Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CXF4

Protein Details
Accession A0A0D1CXF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
370-390AGLITKRSRGRRVPNKPEEMNHydrophilic
405-424GCGKCFKRSEHLKRHVRSIHBasic
431-453LCPYPSCNKRFSRHDNLNQHARVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, extr 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG uma:UMAG_00946  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MEEQLFSPSAAAQLFDLPPSSSSLFGFSPSIDSTSSLPLTFNETLETSAFMLEVQRKRADTVTTLKPDFDFKDDFGFDNSDFLNDIPQRPRAAQRLSLTPSIASSAASTASEYDDSCFDSEADLSNAASPATDEACTASWGDSSLQALDVSASIQSAFDRIKFHSPSGDSKDATIRASSFHPTVDFSFHDFIEDADQGAQRLAPSAMDDIQATNNVHTFVTAQVPISPLNLSDASTDGGHGHVRCSGSESCLGILEGADVGAVPMPIHPYPVNSYFGNVGPYPMVFSQSAPDASCFPPHGSPCPSSPSSARSSSPYPRFGMAGALPSVLASPSSRQIQVQHVPTQASGLALLPKGMSLYSHFAHLTNPYAGLITKRSRGRRVPNKPEEMNNLGKSGKVYTCKVPGCGKCFKRSEHLKRHVRSIHTDEKPFLCPYPSCNKRFSRHDNLNQHARVHTSMGGGAAAGEDYDASSVHPMSHLNAPLAHTMVLTAPPKGGISIASGASHQIKQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.16
4 0.14
5 0.15
6 0.19
7 0.19
8 0.16
9 0.16
10 0.18
11 0.17
12 0.18
13 0.19
14 0.14
15 0.17
16 0.17
17 0.18
18 0.15
19 0.16
20 0.16
21 0.2
22 0.21
23 0.18
24 0.18
25 0.17
26 0.23
27 0.23
28 0.21
29 0.19
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.2
34 0.13
35 0.12
36 0.11
37 0.09
38 0.13
39 0.19
40 0.23
41 0.26
42 0.3
43 0.31
44 0.33
45 0.36
46 0.35
47 0.32
48 0.35
49 0.4
50 0.43
51 0.43
52 0.42
53 0.4
54 0.41
55 0.38
56 0.36
57 0.29
58 0.23
59 0.29
60 0.29
61 0.29
62 0.27
63 0.27
64 0.22
65 0.22
66 0.21
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.18
71 0.17
72 0.22
73 0.24
74 0.27
75 0.29
76 0.31
77 0.38
78 0.38
79 0.41
80 0.43
81 0.43
82 0.48
83 0.5
84 0.49
85 0.43
86 0.36
87 0.31
88 0.26
89 0.22
90 0.15
91 0.11
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.09
146 0.11
147 0.13
148 0.2
149 0.22
150 0.23
151 0.26
152 0.28
153 0.33
154 0.38
155 0.4
156 0.33
157 0.33
158 0.36
159 0.32
160 0.3
161 0.25
162 0.17
163 0.15
164 0.17
165 0.18
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.16
172 0.15
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.12
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.15
236 0.15
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.03
250 0.02
251 0.03
252 0.05
253 0.05
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.12
258 0.15
259 0.17
260 0.15
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.17
265 0.14
266 0.12
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.08
271 0.1
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.16
285 0.17
286 0.2
287 0.21
288 0.22
289 0.22
290 0.27
291 0.26
292 0.25
293 0.25
294 0.25
295 0.26
296 0.27
297 0.27
298 0.25
299 0.29
300 0.35
301 0.39
302 0.38
303 0.35
304 0.33
305 0.33
306 0.29
307 0.27
308 0.19
309 0.16
310 0.13
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.06
319 0.1
320 0.12
321 0.13
322 0.14
323 0.17
324 0.23
325 0.29
326 0.32
327 0.33
328 0.32
329 0.32
330 0.31
331 0.29
332 0.22
333 0.16
334 0.12
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.11
346 0.12
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.16
351 0.17
352 0.17
353 0.14
354 0.14
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.13
359 0.17
360 0.17
361 0.23
362 0.29
363 0.35
364 0.43
365 0.51
366 0.6
367 0.66
368 0.74
369 0.78
370 0.81
371 0.83
372 0.8
373 0.77
374 0.72
375 0.67
376 0.63
377 0.53
378 0.46
379 0.37
380 0.34
381 0.3
382 0.27
383 0.25
384 0.23
385 0.25
386 0.27
387 0.35
388 0.36
389 0.4
390 0.44
391 0.46
392 0.47
393 0.54
394 0.53
395 0.54
396 0.58
397 0.57
398 0.58
399 0.64
400 0.69
401 0.7
402 0.76
403 0.77
404 0.75
405 0.82
406 0.78
407 0.72
408 0.69
409 0.66
410 0.66
411 0.62
412 0.63
413 0.57
414 0.53
415 0.52
416 0.46
417 0.39
418 0.33
419 0.27
420 0.3
421 0.37
422 0.43
423 0.43
424 0.49
425 0.55
426 0.59
427 0.68
428 0.72
429 0.71
430 0.73
431 0.8
432 0.82
433 0.82
434 0.84
435 0.77
436 0.7
437 0.61
438 0.53
439 0.44
440 0.37
441 0.31
442 0.22
443 0.2
444 0.17
445 0.16
446 0.12
447 0.11
448 0.08
449 0.06
450 0.05
451 0.04
452 0.03
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.05
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.1
462 0.13
463 0.19
464 0.21
465 0.2
466 0.22
467 0.24
468 0.25
469 0.25
470 0.22
471 0.16
472 0.14
473 0.14
474 0.18
475 0.17
476 0.16
477 0.15
478 0.16
479 0.16
480 0.16
481 0.15
482 0.1
483 0.13
484 0.15
485 0.15
486 0.15
487 0.15
488 0.18
489 0.22