Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CAC0

Protein Details
Accession A0A0D1CAC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGRRSKNKQAPPQPLREDHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-44GKRKAHESSLPVKKAKIA
663-674LKKATAKGKARR
Subcellular Location(s) nucl 13mito 13mito_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031341  Methyltr_RsmF_N  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR011023  Nop2p  
IPR023267  RCMT  
IPR023273  RCMT_NOP2  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0009383  F:rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
KEGG uma:UMAG_01467  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PF17125  Methyltr_RsmF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
Amino Acid Sequences MGRRSKNKQAPPQPLREDHSLTNTIKGKRKAHESSLPVKKAKIAPTSTKALRSAPAAVARSIKTSNSKTGANGKAKARAATIEESEDEDRDEEVELEGEEDEEVDQEEEDEEEEEEEDEEEVEEDPLEALGLPKNGKLSERQRKKALAEAERLEELLKSQGLSLESDDDDDEQDEDLEGSEEGEEGSEQEELGDEFDLGEEDIEGEEGDQVELDDGDDDKDDEDDEDDEDEEAGGAEFMLPTLEEREAEKVRGADLQLVHMRIQEVVTVLSNFKKLAVDGRSRSEYVEQLLADICTYYGYNAFLAEKLFELFTPAEAIEFFEANETPRPVTIRANTLRTRRRDLAQALINRGVNLEPIGAWSKVGLQVFESSVPIGATPEYLAGHYMLQAASSFLPCIALAPQPNERVLDMASAPGGKSTYLSALMQNTGTVFANDSNKNRIKSLVANIHRLGCKNVVVCNYDGRQFPKVIGGFDRVLLDSPCSGTGVIHKDQSVKVNKSERDFALLTHLQKQLLLCAIDSVNPRSSTGGYVVYSTCSVMVEENEEVVQYALRKRSNVKIVDTGIQFGRDGFKSFGRSKFDERMVYARRIFPHVHNLDGFFVCKLKVNPPSNNNASAARSEKPNSATAGIVDDQDQDDVQQDTDNGLVSLDNPEDQKLMQKSLKKATAKGKARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.77
3 0.73
4 0.68
5 0.6
6 0.58
7 0.55
8 0.47
9 0.49
10 0.5
11 0.51
12 0.55
13 0.6
14 0.6
15 0.6
16 0.69
17 0.68
18 0.7
19 0.71
20 0.7
21 0.72
22 0.75
23 0.75
24 0.67
25 0.61
26 0.6
27 0.57
28 0.57
29 0.56
30 0.52
31 0.54
32 0.57
33 0.65
34 0.62
35 0.6
36 0.55
37 0.49
38 0.44
39 0.39
40 0.37
41 0.33
42 0.36
43 0.33
44 0.32
45 0.34
46 0.33
47 0.33
48 0.31
49 0.3
50 0.32
51 0.34
52 0.4
53 0.39
54 0.39
55 0.4
56 0.48
57 0.53
58 0.52
59 0.54
60 0.5
61 0.55
62 0.56
63 0.53
64 0.45
65 0.39
66 0.36
67 0.34
68 0.32
69 0.27
70 0.25
71 0.27
72 0.27
73 0.24
74 0.21
75 0.17
76 0.15
77 0.13
78 0.13
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.07
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.14
122 0.15
123 0.16
124 0.24
125 0.33
126 0.41
127 0.51
128 0.57
129 0.61
130 0.66
131 0.67
132 0.66
133 0.64
134 0.6
135 0.57
136 0.53
137 0.49
138 0.44
139 0.42
140 0.35
141 0.25
142 0.19
143 0.15
144 0.12
145 0.09
146 0.09
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.12
234 0.14
235 0.14
236 0.16
237 0.14
238 0.15
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.16
244 0.17
245 0.18
246 0.17
247 0.16
248 0.16
249 0.13
250 0.13
251 0.09
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.13
264 0.17
265 0.23
266 0.24
267 0.29
268 0.31
269 0.31
270 0.31
271 0.27
272 0.23
273 0.19
274 0.18
275 0.14
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.09
280 0.08
281 0.06
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.1
316 0.11
317 0.14
318 0.14
319 0.2
320 0.23
321 0.28
322 0.32
323 0.39
324 0.44
325 0.45
326 0.5
327 0.45
328 0.44
329 0.44
330 0.42
331 0.4
332 0.39
333 0.38
334 0.34
335 0.34
336 0.32
337 0.26
338 0.24
339 0.18
340 0.12
341 0.09
342 0.07
343 0.04
344 0.06
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.1
351 0.11
352 0.09
353 0.08
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.08
387 0.09
388 0.12
389 0.16
390 0.17
391 0.18
392 0.18
393 0.17
394 0.15
395 0.14
396 0.13
397 0.09
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.07
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.07
419 0.07
420 0.09
421 0.15
422 0.18
423 0.2
424 0.26
425 0.31
426 0.32
427 0.32
428 0.31
429 0.28
430 0.29
431 0.35
432 0.37
433 0.36
434 0.39
435 0.4
436 0.43
437 0.42
438 0.38
439 0.33
440 0.25
441 0.24
442 0.21
443 0.23
444 0.21
445 0.22
446 0.22
447 0.24
448 0.24
449 0.25
450 0.26
451 0.26
452 0.26
453 0.24
454 0.23
455 0.25
456 0.25
457 0.23
458 0.22
459 0.23
460 0.21
461 0.21
462 0.22
463 0.16
464 0.16
465 0.15
466 0.13
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.13
474 0.17
475 0.18
476 0.19
477 0.2
478 0.22
479 0.24
480 0.32
481 0.35
482 0.33
483 0.38
484 0.44
485 0.47
486 0.48
487 0.52
488 0.45
489 0.42
490 0.39
491 0.33
492 0.33
493 0.33
494 0.31
495 0.32
496 0.33
497 0.27
498 0.28
499 0.28
500 0.22
501 0.21
502 0.2
503 0.13
504 0.13
505 0.14
506 0.16
507 0.19
508 0.2
509 0.21
510 0.21
511 0.22
512 0.22
513 0.22
514 0.2
515 0.19
516 0.19
517 0.15
518 0.16
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.13
523 0.12
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.11
529 0.1
530 0.11
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.13
538 0.19
539 0.21
540 0.24
541 0.28
542 0.36
543 0.44
544 0.46
545 0.46
546 0.46
547 0.47
548 0.51
549 0.47
550 0.42
551 0.34
552 0.31
553 0.26
554 0.2
555 0.22
556 0.16
557 0.19
558 0.18
559 0.21
560 0.27
561 0.32
562 0.37
563 0.4
564 0.43
565 0.47
566 0.52
567 0.54
568 0.52
569 0.5
570 0.52
571 0.51
572 0.53
573 0.5
574 0.47
575 0.44
576 0.45
577 0.46
578 0.41
579 0.46
580 0.42
581 0.42
582 0.38
583 0.37
584 0.36
585 0.34
586 0.31
587 0.21
588 0.19
589 0.16
590 0.19
591 0.2
592 0.24
593 0.33
594 0.4
595 0.47
596 0.52
597 0.61
598 0.61
599 0.62
600 0.56
601 0.49
602 0.44
603 0.4
604 0.38
605 0.32
606 0.33
607 0.33
608 0.35
609 0.35
610 0.36
611 0.35
612 0.33
613 0.31
614 0.26
615 0.27
616 0.23
617 0.2
618 0.18
619 0.16
620 0.15
621 0.15
622 0.14
623 0.1
624 0.12
625 0.12
626 0.11
627 0.11
628 0.11
629 0.11
630 0.12
631 0.12
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.08
636 0.11
637 0.11
638 0.13
639 0.13
640 0.14
641 0.15
642 0.16
643 0.23
644 0.23
645 0.3
646 0.34
647 0.4
648 0.46
649 0.55
650 0.63
651 0.59
652 0.63
653 0.66
654 0.71