FuNGI

A0A423XJ47

Protein Details

Accession

A0A423XJ47

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-84	AFIKKHFRVPMKRKNYEPEN	Hydrophilic
369-393	SPGLEDFKPRKNKPRRSSRSSSVAS	Hydrophilic
471-495	GGASAQPPRKKKRVDIFMRPKKIGR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
376-385	KPRKNKPRRS
477-495	PPRKKKRVDIFMRPKKIGR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MSVPSLAGLCRKTIFANIDELSYVSTLPYEKCREILQHVKTPQQLAVIEEYSPQIVGEDSELWEAFIKKHFRVPMKRKNYEPENPRSWRKVYERYAKEEAEEEAAALAQLGATFAGLNKAKQENKTGIADPRLLPSAGRTGGIARSRNRGFGTGTANLTFGGGARTSNVVKKAKKEAMEVAARKKLSTPALKPRANLVKVQQAPESMRNEYRIKRQPAFLPPTAKTATKRPREDDDRAQREARLLAAKKPKVLRDDELENTTHNAPEPSKPLATASTRSGASSNSKKPPAGIFSHAHNPSRQQNNKVIVKTGGSQPVSRASPEKASGALRARPDGHSSPAKTHLTSSRPTAVSRTTKAFDSPPISRVSSPGLEDFKPRKNKPRRSSRSSSVASSLFGSPEPGSPASDRGRRSSFHSDDGHAPSTSPPPATTKRPGTSEAARAGSPPQRHMEDLDAAGTSSAAATSAAGGGGGASAQPPRKKKRVDIFMRPKKIGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.25
3	0.3
4	0.28
5	0.28
6	0.27
7	0.26
8	0.21
9	0.17
10	0.15
11	0.08
12	0.09
13	0.1
14	0.12
15	0.2
16	0.24
17	0.25
18	0.27
19	0.3
20	0.34
21	0.4
22	0.48
23	0.47
24	0.5
25	0.53
26	0.58
27	0.58
28	0.56
29	0.49
30	0.44
31	0.38
32	0.31
33	0.32
34	0.26
35	0.23
36	0.21
37	0.2
38	0.16
39	0.15
40	0.12
41	0.08
42	0.07
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.12
48	0.12
49	0.12
50	0.14
51	0.14
52	0.14
53	0.2
54	0.23
55	0.23
56	0.3
57	0.36
58	0.43
59	0.54
60	0.63
61	0.66
62	0.73
63	0.78
64	0.78
65	0.8
66	0.8
67	0.78
68	0.76
69	0.74
70	0.73
71	0.73
72	0.74
73	0.71
74	0.65
75	0.64
76	0.63
77	0.64
78	0.64
79	0.68
80	0.66
81	0.68
82	0.71
83	0.63
84	0.56
85	0.48
86	0.4
87	0.32
88	0.26
89	0.19
90	0.13
91	0.12
92	0.1
93	0.08
94	0.07
95	0.03
96	0.03
97	0.03
98	0.03
99	0.03
100	0.03
101	0.03
102	0.1
103	0.1
104	0.11
105	0.15
106	0.22
107	0.26
108	0.29
109	0.34
110	0.33
111	0.36
112	0.4
113	0.38
114	0.36
115	0.35
116	0.36
117	0.31
118	0.3
119	0.28
120	0.24
121	0.2
122	0.18
123	0.2
124	0.17
125	0.16
126	0.14
127	0.14
128	0.19
129	0.24
130	0.28
131	0.25
132	0.33
133	0.33
134	0.37
135	0.36
136	0.33
137	0.29
138	0.29
139	0.31
140	0.26
141	0.27
142	0.24
143	0.23
144	0.21
145	0.19
146	0.15
147	0.1
148	0.07
149	0.06
150	0.05
151	0.06
152	0.08
153	0.1
154	0.13
155	0.19
156	0.25
157	0.27
158	0.32
159	0.4
160	0.43
161	0.44
162	0.44
163	0.42
164	0.41
165	0.47
166	0.45
167	0.42
168	0.42
169	0.4
170	0.37
171	0.34
172	0.32
173	0.3
174	0.34
175	0.35
176	0.41
177	0.5
178	0.52
179	0.51
180	0.54
181	0.56
182	0.5
183	0.47
184	0.39
185	0.39
186	0.39
187	0.41
188	0.35
189	0.28
190	0.29
191	0.32
192	0.32
193	0.25
194	0.24
195	0.26
196	0.3
197	0.31
198	0.38
199	0.41
200	0.44
201	0.44
202	0.46
203	0.48
204	0.52
205	0.55
206	0.5
207	0.46
208	0.41
209	0.43
210	0.41
211	0.38
212	0.31
213	0.34
214	0.39
215	0.43
216	0.46
217	0.45
218	0.52
219	0.57
220	0.61
221	0.61
222	0.63
223	0.59
224	0.58
225	0.55
226	0.47
227	0.41
228	0.35
229	0.27
230	0.22
231	0.18
232	0.22
233	0.3
234	0.3
235	0.33
236	0.36
237	0.38
238	0.36
239	0.38
240	0.34
241	0.3
242	0.34
243	0.32
244	0.31
245	0.27
246	0.24
247	0.22
248	0.2
249	0.16
250	0.11
251	0.11
252	0.1
253	0.12
254	0.15
255	0.15
256	0.15
257	0.15
258	0.16
259	0.18
260	0.18
261	0.19
262	0.17
263	0.18
264	0.18
265	0.18
266	0.18
267	0.16
268	0.2
269	0.25
270	0.29
271	0.32
272	0.34
273	0.34
274	0.35
275	0.36
276	0.34
277	0.3
278	0.29
279	0.25
280	0.26
281	0.35
282	0.36
283	0.34
284	0.3
285	0.31
286	0.34
287	0.42
288	0.43
289	0.4
290	0.45
291	0.52
292	0.57
293	0.53
294	0.47
295	0.38
296	0.35
297	0.33
298	0.3
299	0.28
300	0.24
301	0.23
302	0.22
303	0.26
304	0.26
305	0.25
306	0.23
307	0.18
308	0.21
309	0.22
310	0.21
311	0.18
312	0.19
313	0.22
314	0.24
315	0.26
316	0.24
317	0.25
318	0.26
319	0.26
320	0.3
321	0.27
322	0.28
323	0.31
324	0.31
325	0.31
326	0.37
327	0.37
328	0.32
329	0.33
330	0.34
331	0.32
332	0.33
333	0.34
334	0.34
335	0.33
336	0.33
337	0.33
338	0.34
339	0.36
340	0.37
341	0.37
342	0.32
343	0.32
344	0.33
345	0.32
346	0.31
347	0.3
348	0.29
349	0.27
350	0.29
351	0.3
352	0.28
353	0.28
354	0.27
355	0.23
356	0.23
357	0.24
358	0.24
359	0.23
360	0.3
361	0.34
362	0.38
363	0.47
364	0.5
365	0.57
366	0.64
367	0.74
368	0.77
369	0.83
370	0.84
371	0.84
372	0.87
373	0.84
374	0.83
375	0.76
376	0.68
377	0.61
378	0.52
379	0.43
380	0.37
381	0.3
382	0.21
383	0.17
384	0.17
385	0.13
386	0.14
387	0.17
388	0.15
389	0.16
390	0.16
391	0.22
392	0.27
393	0.31
394	0.32
395	0.35
396	0.38
397	0.37
398	0.44
399	0.48
400	0.45
401	0.47
402	0.48
403	0.45
404	0.47
405	0.51
406	0.46
407	0.36
408	0.33
409	0.29
410	0.3
411	0.29
412	0.24
413	0.2
414	0.24
415	0.3
416	0.36
417	0.42
418	0.47
419	0.49
420	0.52
421	0.54
422	0.53
423	0.54
424	0.54
425	0.5
426	0.44
427	0.39
428	0.37
429	0.38
430	0.39
431	0.36
432	0.33
433	0.33
434	0.34
435	0.36
436	0.37
437	0.36
438	0.34
439	0.32
440	0.28
441	0.22
442	0.19
443	0.18
444	0.15
445	0.1
446	0.06
447	0.05
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.09
462	0.16
463	0.24
464	0.33
465	0.42
466	0.52
467	0.59
468	0.69
469	0.75
470	0.8
471	0.83
472	0.85
473	0.87
474	0.89
475	0.91

A0A423XJ47

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer