Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A443HPA9

Protein Details
Accession A0A443HPA9    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-138KLIGRHKRKRDGEDGERPKRKEGRRKKRRDDEEVGGEBasic
140-160AEGKGRRRRDGDRRRRKEATPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-158GRHKRKRDGEDGERPKRKEGRRKKRRDDEEVGGEEAEGKGRRRRDGDRRRRKEA
171-194RRRRALDRAMDEALKKPTKRRARK
429-431KAR
436-441QKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSATPEDRPGSPVAEENNHHEENGHEENGHEENGHEENGHEDAEATNIENEEQENDNAAADLLSDDESVLSEVDEAQFEDFDPDNVAIEERPALAIDEENLKLIGRHKRKRDGEDGERPKRKEGRRKKRRDDEEVGGEEAEGKGRRRRDGDRRRRKEATPEDEEHLDPATRRRRALDRAMDEALKKPTKRRARKADGIDLEQMADAEIEDVRKRMTQAAQLDAVNRREGKPAMHKLRMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMNALAKLPINKEALIASGIGKVIVFYTKSKRPEPGIKRQAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEADFDPTKLAMRPQVLNAQATAAEARARELLPPRLANRARVDQTHTSYTVVPRSTVVQESKFARPLGASGEDRFRRMKARQIAAQKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.35
4 0.41
5 0.38
6 0.37
7 0.33
8 0.29
9 0.3
10 0.33
11 0.28
12 0.2
13 0.2
14 0.24
15 0.25
16 0.25
17 0.17
18 0.12
19 0.15
20 0.16
21 0.17
22 0.13
23 0.12
24 0.13
25 0.15
26 0.15
27 0.11
28 0.1
29 0.09
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.12
39 0.14
40 0.13
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.13
46 0.1
47 0.08
48 0.07
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.12
90 0.18
91 0.27
92 0.33
93 0.42
94 0.5
95 0.6
96 0.68
97 0.73
98 0.77
99 0.76
100 0.76
101 0.78
102 0.8
103 0.8
104 0.8
105 0.75
106 0.72
107 0.72
108 0.71
109 0.72
110 0.73
111 0.74
112 0.77
113 0.87
114 0.91
115 0.93
116 0.93
117 0.91
118 0.87
119 0.83
120 0.79
121 0.7
122 0.6
123 0.49
124 0.4
125 0.31
126 0.23
127 0.19
128 0.13
129 0.13
130 0.17
131 0.21
132 0.26
133 0.3
134 0.39
135 0.47
136 0.57
137 0.66
138 0.72
139 0.77
140 0.81
141 0.81
142 0.75
143 0.74
144 0.73
145 0.7
146 0.66
147 0.61
148 0.55
149 0.52
150 0.49
151 0.39
152 0.29
153 0.22
154 0.15
155 0.2
156 0.25
157 0.26
158 0.26
159 0.3
160 0.35
161 0.41
162 0.49
163 0.5
164 0.45
165 0.47
166 0.48
167 0.45
168 0.4
169 0.37
170 0.34
171 0.29
172 0.27
173 0.28
174 0.36
175 0.46
176 0.55
177 0.62
178 0.66
179 0.71
180 0.79
181 0.79
182 0.79
183 0.71
184 0.64
185 0.55
186 0.44
187 0.35
188 0.27
189 0.2
190 0.11
191 0.08
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.1
202 0.11
203 0.16
204 0.18
205 0.2
206 0.21
207 0.21
208 0.23
209 0.23
210 0.23
211 0.19
212 0.18
213 0.17
214 0.18
215 0.18
216 0.19
217 0.24
218 0.33
219 0.37
220 0.39
221 0.4
222 0.39
223 0.44
224 0.43
225 0.35
226 0.26
227 0.2
228 0.18
229 0.17
230 0.16
231 0.11
232 0.1
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.12
267 0.11
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.1
300 0.17
301 0.23
302 0.29
303 0.31
304 0.35
305 0.41
306 0.5
307 0.55
308 0.6
309 0.64
310 0.65
311 0.66
312 0.67
313 0.66
314 0.59
315 0.52
316 0.43
317 0.41
318 0.35
319 0.33
320 0.29
321 0.25
322 0.25
323 0.25
324 0.25
325 0.19
326 0.21
327 0.25
328 0.3
329 0.38
330 0.37
331 0.39
332 0.42
333 0.43
334 0.42
335 0.41
336 0.35
337 0.28
338 0.32
339 0.32
340 0.34
341 0.31
342 0.29
343 0.28
344 0.27
345 0.27
346 0.21
347 0.2
348 0.18
349 0.22
350 0.23
351 0.25
352 0.31
353 0.32
354 0.31
355 0.29
356 0.25
357 0.21
358 0.19
359 0.17
360 0.11
361 0.1
362 0.09
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.16
367 0.21
368 0.27
369 0.31
370 0.36
371 0.36
372 0.44
373 0.46
374 0.49
375 0.5
376 0.52
377 0.5
378 0.49
379 0.54
380 0.51
381 0.54
382 0.53
383 0.47
384 0.4
385 0.39
386 0.4
387 0.39
388 0.33
389 0.28
390 0.24
391 0.27
392 0.28
393 0.31
394 0.32
395 0.28
396 0.33
397 0.37
398 0.42
399 0.42
400 0.39
401 0.34
402 0.3
403 0.29
404 0.28
405 0.3
406 0.27
407 0.26
408 0.36
409 0.37
410 0.4
411 0.41
412 0.38
413 0.4
414 0.42
415 0.48
416 0.48
417 0.54
418 0.59
419 0.66
420 0.73
421 0.73