Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CDE0

Protein Details
Accession A0A0D1CDE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
658-678AKGGNKQPQKQQPRKDGNKGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
655-671PKGAKGGNKQPQKQQPR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
KEGG uma:UMAG_01013  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSAWSSSTGKAQLSYADRLRQASKSSSTTKQDPPSSSGFATRAVAKDAIKPPSSSVSSSAAVIPSGRLSSPSPVSLAAAASGSASNASVSSLPTKTTSASAESIAIPNAGGGGPTLNVWEARRKQLADREAEKERERRSTLAHQKQAPPVPSTSAASNAAAAGNKSKQPATEPKKANERQLKGSSTSSQSDRKSSKPATQPTSRASNAVPISSTSATPSTPPASAQTAEKTNASTTVPKVKVASSPKTATADHHSAEEADSADRPAEQSASTQPSQSPSSSNKAQKSKADDKIKPSDAVDDFPRQAKAANASTQTQTAAAQVLPSSALSVQLSSAPQPSHDDIPGSPVTVASAIEEVLKNGGAQGGQTEDDDAWLARIHLLNGGQNMPNFGGFGPNGASALSEEAEAQAAKKAERAVAAAWGVGKSVWNKSQQNRADAGKDTTAAPSSGDAVKGAASRSTANIASANDDNGNSAPSPASVAPNGVGSGSDEMQYSADTASQKQAITDEKAENCDADASPTKKVTGSKSRVPAEQQKQGKGSAKTAAASVPPFEDVNNWPSPLDAGKKPTEKARSPAATGDHNKVESTKTQSKTPKSLYETLGELQVRLAPGASPQQAGGAAGARKGKQQWVSILPEITHTASTSGAKPNRPTSEPKGAKGGNKQPQKQQPRKDGNKGSGQTQQGTQNEKKDGVNKAKSTRGEDKAQARGATAEVTTSTKSAESRGQPVSQGDKVDSGPKSTTTGRAASSGTEQASAQPTAGSGQTQMTSAAASSPIARGESPSKQLQQHTRTHFRAQPNGISSSLQPQPQPNGFRLPKSAPSSSGAVTPITNRSSPRGSVASSPKVHALPRGTPQAVHEFSAPSGAATPPPPPPLFYGPSGVATPMLSSNAPPPASWLPYNAYARPPAFLFDTTTQTGAPLPSGVLGQLLGQIEFYFSQHNLQGDFFLRQKMDGQGWVEIKVVAGFKRVLAITADLGMVKDALLCSAVLDVDEERLRVRRRFGWELFTLPTSMAERLERPGEKGEDKEADVEEEEEALGVVSASGFGGTLEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.39
4 0.4
5 0.43
6 0.46
7 0.43
8 0.43
9 0.42
10 0.43
11 0.43
12 0.47
13 0.52
14 0.55
15 0.58
16 0.62
17 0.64
18 0.66
19 0.63
20 0.61
21 0.59
22 0.56
23 0.5
24 0.46
25 0.38
26 0.33
27 0.32
28 0.31
29 0.27
30 0.26
31 0.28
32 0.25
33 0.33
34 0.37
35 0.41
36 0.39
37 0.39
38 0.38
39 0.42
40 0.44
41 0.37
42 0.33
43 0.31
44 0.3
45 0.3
46 0.29
47 0.22
48 0.2
49 0.18
50 0.16
51 0.13
52 0.13
53 0.12
54 0.13
55 0.15
56 0.2
57 0.23
58 0.23
59 0.22
60 0.21
61 0.22
62 0.21
63 0.19
64 0.14
65 0.11
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.13
78 0.14
79 0.15
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.2
84 0.21
85 0.2
86 0.21
87 0.2
88 0.2
89 0.21
90 0.21
91 0.18
92 0.16
93 0.12
94 0.1
95 0.1
96 0.08
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.09
105 0.11
106 0.21
107 0.24
108 0.31
109 0.36
110 0.38
111 0.44
112 0.51
113 0.56
114 0.55
115 0.56
116 0.55
117 0.57
118 0.61
119 0.6
120 0.58
121 0.56
122 0.55
123 0.53
124 0.49
125 0.49
126 0.54
127 0.59
128 0.63
129 0.66
130 0.64
131 0.67
132 0.73
133 0.73
134 0.66
135 0.58
136 0.49
137 0.45
138 0.41
139 0.37
140 0.3
141 0.26
142 0.25
143 0.22
144 0.21
145 0.17
146 0.16
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.16
151 0.19
152 0.21
153 0.21
154 0.21
155 0.27
156 0.37
157 0.41
158 0.47
159 0.51
160 0.55
161 0.65
162 0.68
163 0.72
164 0.71
165 0.68
166 0.67
167 0.67
168 0.64
169 0.57
170 0.57
171 0.51
172 0.46
173 0.44
174 0.4
175 0.41
176 0.4
177 0.45
178 0.45
179 0.44
180 0.48
181 0.49
182 0.52
183 0.55
184 0.61
185 0.6
186 0.63
187 0.65
188 0.61
189 0.64
190 0.56
191 0.49
192 0.4
193 0.41
194 0.34
195 0.3
196 0.26
197 0.19
198 0.23
199 0.22
200 0.21
201 0.16
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.18
206 0.16
207 0.15
208 0.16
209 0.17
210 0.19
211 0.2
212 0.21
213 0.22
214 0.24
215 0.25
216 0.25
217 0.23
218 0.2
219 0.21
220 0.21
221 0.2
222 0.2
223 0.28
224 0.28
225 0.28
226 0.29
227 0.29
228 0.34
229 0.37
230 0.4
231 0.36
232 0.38
233 0.4
234 0.41
235 0.4
236 0.37
237 0.37
238 0.35
239 0.3
240 0.28
241 0.25
242 0.22
243 0.22
244 0.2
245 0.13
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.14
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.23
262 0.25
263 0.24
264 0.24
265 0.22
266 0.29
267 0.35
268 0.41
269 0.46
270 0.5
271 0.54
272 0.55
273 0.6
274 0.63
275 0.64
276 0.67
277 0.64
278 0.64
279 0.69
280 0.66
281 0.58
282 0.5
283 0.47
284 0.38
285 0.37
286 0.33
287 0.29
288 0.27
289 0.28
290 0.28
291 0.21
292 0.21
293 0.2
294 0.21
295 0.21
296 0.24
297 0.24
298 0.25
299 0.26
300 0.26
301 0.24
302 0.19
303 0.16
304 0.12
305 0.11
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.12
322 0.1
323 0.11
324 0.15
325 0.17
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.15
330 0.21
331 0.2
332 0.16
333 0.14
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.12
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.14
374 0.12
375 0.11
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.1
404 0.12
405 0.12
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.11
414 0.14
415 0.21
416 0.26
417 0.3
418 0.4
419 0.42
420 0.44
421 0.44
422 0.42
423 0.38
424 0.35
425 0.33
426 0.24
427 0.21
428 0.18
429 0.16
430 0.14
431 0.12
432 0.1
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.08
446 0.11
447 0.1
448 0.09
449 0.11
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.05
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.06
472 0.06
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.05
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.11
488 0.11
489 0.1
490 0.12
491 0.12
492 0.14
493 0.16
494 0.17
495 0.16
496 0.19
497 0.19
498 0.17
499 0.14
500 0.13
501 0.1
502 0.1
503 0.14
504 0.13
505 0.15
506 0.15
507 0.16
508 0.16
509 0.19
510 0.22
511 0.28
512 0.31
513 0.36
514 0.42
515 0.44
516 0.44
517 0.45
518 0.49
519 0.44
520 0.47
521 0.45
522 0.41
523 0.4
524 0.42
525 0.44
526 0.36
527 0.32
528 0.28
529 0.25
530 0.23
531 0.22
532 0.19
533 0.14
534 0.13
535 0.11
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.07
540 0.09
541 0.1
542 0.14
543 0.14
544 0.14
545 0.13
546 0.13
547 0.13
548 0.13
549 0.15
550 0.13
551 0.16
552 0.2
553 0.23
554 0.24
555 0.3
556 0.35
557 0.33
558 0.35
559 0.39
560 0.36
561 0.35
562 0.37
563 0.33
564 0.32
565 0.33
566 0.33
567 0.26
568 0.25
569 0.24
570 0.22
571 0.21
572 0.17
573 0.23
574 0.27
575 0.27
576 0.34
577 0.41
578 0.44
579 0.49
580 0.5
581 0.49
582 0.47
583 0.5
584 0.45
585 0.4
586 0.37
587 0.31
588 0.31
589 0.24
590 0.19
591 0.14
592 0.13
593 0.11
594 0.09
595 0.09
596 0.05
597 0.06
598 0.1
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.09
606 0.08
607 0.08
608 0.1
609 0.12
610 0.12
611 0.14
612 0.15
613 0.19
614 0.21
615 0.23
616 0.25
617 0.27
618 0.31
619 0.31
620 0.3
621 0.26
622 0.23
623 0.22
624 0.19
625 0.14
626 0.1
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.11
631 0.17
632 0.2
633 0.23
634 0.26
635 0.31
636 0.34
637 0.36
638 0.4
639 0.4
640 0.48
641 0.48
642 0.46
643 0.47
644 0.46
645 0.47
646 0.49
647 0.51
648 0.49
649 0.54
650 0.57
651 0.58
652 0.66
653 0.72
654 0.73
655 0.73
656 0.75
657 0.77
658 0.81
659 0.82
660 0.79
661 0.74
662 0.74
663 0.66
664 0.59
665 0.55
666 0.48
667 0.4
668 0.36
669 0.37
670 0.31
671 0.37
672 0.36
673 0.35
674 0.35
675 0.36
676 0.35
677 0.34
678 0.39
679 0.41
680 0.45
681 0.44
682 0.46
683 0.51
684 0.51
685 0.53
686 0.53
687 0.49
688 0.47
689 0.48
690 0.49
691 0.49
692 0.5
693 0.43
694 0.35
695 0.3
696 0.26
697 0.21
698 0.16
699 0.1
700 0.08
701 0.09
702 0.09
703 0.09
704 0.09
705 0.09
706 0.09
707 0.12
708 0.17
709 0.18
710 0.23
711 0.26
712 0.26
713 0.27
714 0.29
715 0.32
716 0.28
717 0.26
718 0.21
719 0.2
720 0.2
721 0.24
722 0.22
723 0.2
724 0.19
725 0.19
726 0.22
727 0.21
728 0.25
729 0.22
730 0.24
731 0.22
732 0.23
733 0.22
734 0.2
735 0.21
736 0.19
737 0.16
738 0.15
739 0.14
740 0.14
741 0.17
742 0.16
743 0.14
744 0.11
745 0.1
746 0.11
747 0.11
748 0.09
749 0.07
750 0.08
751 0.09
752 0.09
753 0.09
754 0.08
755 0.08
756 0.07
757 0.07
758 0.06
759 0.06
760 0.06
761 0.07
762 0.08
763 0.09
764 0.09
765 0.11
766 0.16
767 0.19
768 0.23
769 0.27
770 0.31
771 0.34
772 0.41
773 0.47
774 0.5
775 0.54
776 0.59
777 0.63
778 0.62
779 0.65
780 0.65
781 0.61
782 0.63
783 0.58
784 0.55
785 0.49
786 0.48
787 0.42
788 0.37
789 0.31
790 0.29
791 0.29
792 0.25
793 0.23
794 0.24
795 0.29
796 0.34
797 0.36
798 0.33
799 0.39
800 0.39
801 0.4
802 0.42
803 0.4
804 0.42
805 0.44
806 0.44
807 0.36
808 0.37
809 0.37
810 0.33
811 0.31
812 0.24
813 0.19
814 0.18
815 0.18
816 0.19
817 0.19
818 0.21
819 0.2
820 0.24
821 0.26
822 0.27
823 0.29
824 0.27
825 0.26
826 0.32
827 0.38
828 0.41
829 0.39
830 0.4
831 0.39
832 0.38
833 0.37
834 0.35
835 0.32
836 0.29
837 0.33
838 0.4
839 0.37
840 0.35
841 0.37
842 0.41
843 0.37
844 0.34
845 0.29
846 0.23
847 0.22
848 0.24
849 0.21
850 0.12
851 0.12
852 0.11
853 0.12
854 0.12
855 0.15
856 0.16
857 0.21
858 0.22
859 0.22
860 0.26
861 0.3
862 0.32
863 0.31
864 0.32
865 0.28
866 0.29
867 0.28
868 0.24
869 0.18
870 0.15
871 0.14
872 0.11
873 0.11
874 0.1
875 0.1
876 0.13
877 0.18
878 0.18
879 0.17
880 0.22
881 0.24
882 0.28
883 0.28
884 0.27
885 0.26
886 0.33
887 0.37
888 0.34
889 0.33
890 0.34
891 0.34
892 0.33
893 0.3
894 0.25
895 0.24
896 0.23
897 0.25
898 0.22
899 0.27
900 0.26
901 0.26
902 0.24
903 0.22
904 0.22
905 0.17
906 0.15
907 0.1
908 0.09
909 0.09
910 0.09
911 0.08
912 0.07
913 0.07
914 0.06
915 0.09
916 0.09
917 0.09
918 0.09
919 0.09
920 0.1
921 0.1
922 0.11
923 0.1
924 0.1
925 0.14
926 0.16
927 0.18
928 0.18
929 0.17
930 0.19
931 0.19
932 0.22
933 0.21
934 0.23
935 0.22
936 0.22
937 0.24
938 0.26
939 0.26
940 0.27
941 0.27
942 0.29
943 0.3
944 0.3
945 0.28
946 0.23
947 0.21
948 0.19
949 0.19
950 0.14
951 0.16
952 0.15
953 0.14
954 0.19
955 0.18
956 0.17
957 0.16
958 0.17
959 0.15
960 0.16
961 0.16
962 0.12
963 0.12
964 0.11
965 0.09
966 0.07
967 0.08
968 0.06
969 0.06
970 0.07
971 0.07
972 0.07
973 0.07
974 0.07
975 0.06
976 0.08
977 0.08
978 0.12
979 0.13
980 0.13
981 0.15
982 0.22
983 0.28
984 0.31
985 0.37
986 0.4
987 0.47
988 0.56
989 0.58
990 0.58
991 0.55
992 0.55
993 0.52
994 0.46
995 0.38
996 0.29
997 0.28
998 0.22
999 0.2
1000 0.19
1001 0.19
1002 0.19
1003 0.23
1004 0.3
1005 0.29
1006 0.3
1007 0.35
1008 0.39
1009 0.4
1010 0.41
1011 0.43
1012 0.4
1013 0.39
1014 0.4
1015 0.34
1016 0.3
1017 0.27
1018 0.25
1019 0.19
1020 0.15
1021 0.14
1022 0.1
1023 0.09
1024 0.07
1025 0.06
1026 0.05
1027 0.04
1028 0.04
1029 0.04
1030 0.04
1031 0.04
1032 0.04