FuNGI

A0A443HI01

Protein Details

Accession

A0A443HI01

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
539-561	TPRGSRGSRGGSKNKNSNNNKGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
203-239	KKANKTKESASSAKGTKHGRSEKDSKPEKVQAKKLLQ
506-511	RGKGRN
516-532	PSSRGKSGSGGGRGPGG
540-550	PRGSRGSRGGS

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 12.5, cyto_nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MTQVSISKPTGGVLPISASATQKNASTPSKSSAKPPTPRLKLLVRRLPPGLTQVEFQSALGEEWKLGAGKVDWFQYKEGKVSKDPAKPSRPSRAYLRVASEQYIGPLAEKVGRTSFLDSRNTAGDPVLLGPPSLEFAPFARVPGSRVRKDARQGTIDQDPEFIDFLESLTNPITKPAPVEATADGEKAEAVTTTPLVQYIKEKKANKTKESASSAKGTKHGRSEKDSKPEKVQAKKLLQRPDKDAPPTTSTTDKKAKSEKATKEAIKVANKQAANVAAKASAKTPPATTSKETPAQTSAPERKRERGNISAAARIVQRDLGLAPPGNRRRGGKSTTTSTDTDASKTGGSSQEPVSSPAAGKQPAAARSSKEAKETAATQKSATEKASGATPSQSTVASSTVRPASSAGKSSKSVKSKQPAPTGSTQAFLKHANPSQGVTEPLLEAAFASFGRITKVEIDKKKGFGYIDFAEPEGLQKAIAASPVSVAQGQVVVLERKSSPSTEKSRGKGRNEQQSPSSRGKSGSGGGRGPGGGESSQSTPRGSRGSRGGSKNKNSNNNKGGGTGSTANAATAESK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.16
4	0.17
5	0.16
6	0.17
7	0.18
8	0.19
9	0.18
10	0.2
11	0.25
12	0.28
13	0.31
14	0.33
15	0.37
16	0.43
17	0.43
18	0.49
19	0.53
20	0.58
21	0.62
22	0.68
23	0.72
24	0.72
25	0.75
26	0.73
27	0.73
28	0.73
29	0.75
30	0.75
31	0.69
32	0.67
33	0.65
34	0.61
35	0.53
36	0.49
37	0.43
38	0.34
39	0.31
40	0.28
41	0.29
42	0.27
43	0.25
44	0.2
45	0.16
46	0.15
47	0.15
48	0.13
49	0.09
50	0.1
51	0.11
52	0.1
53	0.09
54	0.1
55	0.1
56	0.14
57	0.16
58	0.21
59	0.23
60	0.24
61	0.27
62	0.31
63	0.32
64	0.35
65	0.38
66	0.37
67	0.38
68	0.45
69	0.51
70	0.52
71	0.59
72	0.61
73	0.64
74	0.67
75	0.71
76	0.74
77	0.69
78	0.66
79	0.66
80	0.67
81	0.64
82	0.61
83	0.6
84	0.55
85	0.53
86	0.51
87	0.44
88	0.34
89	0.29
90	0.26
91	0.19
92	0.13
93	0.12
94	0.11
95	0.13
96	0.13
97	0.15
98	0.15
99	0.16
100	0.18
101	0.22
102	0.26
103	0.27
104	0.31
105	0.3
106	0.31
107	0.31
108	0.3
109	0.26
110	0.21
111	0.16
112	0.12
113	0.13
114	0.12
115	0.1
116	0.09
117	0.09
118	0.09
119	0.1
120	0.09
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.13
125	0.13
126	0.13
127	0.14
128	0.14
129	0.16
130	0.26
131	0.33
132	0.31
133	0.37
134	0.41
135	0.45
136	0.52
137	0.58
138	0.53
139	0.49
140	0.48
141	0.47
142	0.48
143	0.44
144	0.37
145	0.3
146	0.25
147	0.22
148	0.2
149	0.16
150	0.1
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.08
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.11
160	0.12
161	0.1
162	0.12
163	0.13
164	0.14
165	0.15
166	0.17
167	0.16
168	0.19
169	0.19
170	0.18
171	0.15
172	0.13
173	0.11
174	0.09
175	0.09
176	0.04
177	0.04
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.06
182	0.08
183	0.08
184	0.09
185	0.16
186	0.23
187	0.3
188	0.37
189	0.41
190	0.48
191	0.58
192	0.65
193	0.62
194	0.61
195	0.58
196	0.58
197	0.61
198	0.56
199	0.48
200	0.46
201	0.45
202	0.4
203	0.41
204	0.37
205	0.33
206	0.39
207	0.43
208	0.41
209	0.46
210	0.52
211	0.53
212	0.59
213	0.62
214	0.57
215	0.56
216	0.6
217	0.61
218	0.6
219	0.61
220	0.59
221	0.62
222	0.65
223	0.66
224	0.68
225	0.66
226	0.62
227	0.62
228	0.6
229	0.56
230	0.53
231	0.5
232	0.43
233	0.41
234	0.4
235	0.35
236	0.35
237	0.32
238	0.34
239	0.38
240	0.36
241	0.37
242	0.42
243	0.45
244	0.47
245	0.55
246	0.54
247	0.52
248	0.57
249	0.54
250	0.5
251	0.49
252	0.46
253	0.42
254	0.41
255	0.39
256	0.38
257	0.36
258	0.33
259	0.29
260	0.28
261	0.24
262	0.2
263	0.17
264	0.13
265	0.14
266	0.14
267	0.13
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.13
272	0.14
273	0.18
274	0.21
275	0.22
276	0.23
277	0.26
278	0.31
279	0.31
280	0.29
281	0.27
282	0.24
283	0.24
284	0.27
285	0.32
286	0.31
287	0.39
288	0.4
289	0.43
290	0.48
291	0.52
292	0.51
293	0.48
294	0.47
295	0.45
296	0.45
297	0.41
298	0.36
299	0.31
300	0.26
301	0.2
302	0.17
303	0.11
304	0.09
305	0.07
306	0.08
307	0.07
308	0.08
309	0.09
310	0.11
311	0.18
312	0.23
313	0.25
314	0.27
315	0.29
316	0.33
317	0.38
318	0.4
319	0.39
320	0.39
321	0.42
322	0.43
323	0.44
324	0.39
325	0.35
326	0.34
327	0.28
328	0.25
329	0.2
330	0.17
331	0.14
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.12
336	0.13
337	0.13
338	0.16
339	0.17
340	0.19
341	0.18
342	0.16
343	0.16
344	0.17
345	0.2
346	0.16
347	0.15
348	0.16
349	0.2
350	0.22
351	0.24
352	0.22
353	0.2
354	0.25
355	0.32
356	0.31
357	0.29
358	0.27
359	0.26
360	0.27
361	0.29
362	0.31
363	0.29
364	0.28
365	0.26
366	0.29
367	0.3
368	0.3
369	0.27
370	0.21
371	0.16
372	0.16
373	0.19
374	0.17
375	0.15
376	0.15
377	0.14
378	0.13
379	0.14
380	0.13
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.12
385	0.11
386	0.14
387	0.16
388	0.15
389	0.15
390	0.16
391	0.18
392	0.19
393	0.24
394	0.23
395	0.24
396	0.27
397	0.32
398	0.38
399	0.4
400	0.44
401	0.47
402	0.53
403	0.58
404	0.64
405	0.67
406	0.63
407	0.62
408	0.61
409	0.59
410	0.51
411	0.45
412	0.38
413	0.3
414	0.29
415	0.25
416	0.22
417	0.22
418	0.25
419	0.26
420	0.26
421	0.26
422	0.26
423	0.26
424	0.26
425	0.2
426	0.18
427	0.14
428	0.13
429	0.12
430	0.09
431	0.08
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.09
439	0.09
440	0.1
441	0.16
442	0.24
443	0.32
444	0.38
445	0.46
446	0.48
447	0.5
448	0.51
449	0.48
450	0.41
451	0.34
452	0.34
453	0.28
454	0.28
455	0.26
456	0.24
457	0.22
458	0.2
459	0.2
460	0.15
461	0.12
462	0.08
463	0.08
464	0.09
465	0.09
466	0.11
467	0.09
468	0.08
469	0.09
470	0.1
471	0.11
472	0.1
473	0.09
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.13
482	0.14
483	0.17
484	0.19
485	0.2
486	0.23
487	0.3
488	0.38
489	0.45
490	0.53
491	0.55
492	0.63
493	0.69
494	0.71
495	0.73
496	0.74
497	0.75
498	0.73
499	0.72
500	0.69
501	0.7
502	0.69
503	0.66
504	0.62
505	0.53
506	0.5
507	0.47
508	0.43
509	0.4
510	0.41
511	0.37
512	0.35
513	0.33
514	0.33
515	0.3
516	0.27
517	0.22
518	0.17
519	0.12
520	0.12
521	0.14
522	0.16
523	0.21
524	0.21
525	0.23
526	0.22
527	0.26
528	0.32
529	0.31
530	0.34
531	0.38
532	0.46
533	0.53
534	0.61
535	0.67
536	0.69
537	0.77
538	0.8
539	0.81
540	0.82
541	0.81
542	0.83
543	0.79
544	0.75
545	0.66
546	0.59
547	0.51
548	0.42
549	0.39
550	0.31
551	0.25
552	0.22
553	0.21
554	0.19
555	0.18

A0A443HI01

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer