Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A443HZE1

Protein Details
Accession A0A443HZE1    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-114GAKSEVGEKKKRKRAPHDPNAPKRALBasic
236-277KEPTPPRSGKRRRTGENIKPVASPVSKKASPEKKPKRGAAIAHydrophilic
297-317IGGAADNKRGKKKRKSEAADEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-111GAKSEVGEKKKRKRAPHDPNAPK
240-312PPRSGKRRRTGENIKPVASPVSKKASPEKKPKRGAAIAAQKKEEKETPKETPTGRKSIGGAADNKRGKKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.166, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRKEDSKAKDAIVTVNIDDFTRTRDSVIVSLATLQSAVSDLSRAYINHANTVLNRGPSNLDIGGITGGITSSLLENGLLGGGRHASPGAKSEVGEKKKRKRAPHDPNAPKRALTPYFLYMQHNRAQIASELGSNARPKEVADEGTRRWSEMPDAQKEVWKKLYADNLAVYKEKMKAYKAGLPVPEDDSAKAANQLQQDVAAGAEPSVEESEESEQEEEEEEDEDEEEESSPEPVKEPTPPRSGKRRRTGENIKPVASPVSKKASPEKKPKRGAAIAAQKKEEKETPKETPTGRKSIGGAADNKRGKKKRKSEAADE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.26
3 0.24
4 0.23
5 0.19
6 0.19
7 0.16
8 0.17
9 0.19
10 0.18
11 0.17
12 0.19
13 0.21
14 0.21
15 0.23
16 0.2
17 0.15
18 0.17
19 0.16
20 0.14
21 0.12
22 0.1
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.1
31 0.1
32 0.14
33 0.19
34 0.2
35 0.23
36 0.24
37 0.24
38 0.23
39 0.29
40 0.27
41 0.24
42 0.23
43 0.21
44 0.22
45 0.21
46 0.23
47 0.17
48 0.15
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.09
53 0.08
54 0.05
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.1
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.2
80 0.29
81 0.35
82 0.44
83 0.5
84 0.57
85 0.66
86 0.73
87 0.75
88 0.76
89 0.81
90 0.83
91 0.85
92 0.86
93 0.87
94 0.9
95 0.87
96 0.77
97 0.66
98 0.57
99 0.53
100 0.44
101 0.36
102 0.29
103 0.25
104 0.27
105 0.28
106 0.3
107 0.26
108 0.27
109 0.29
110 0.28
111 0.26
112 0.23
113 0.22
114 0.19
115 0.18
116 0.15
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.16
130 0.19
131 0.2
132 0.26
133 0.26
134 0.23
135 0.22
136 0.19
137 0.19
138 0.21
139 0.25
140 0.22
141 0.25
142 0.25
143 0.28
144 0.29
145 0.28
146 0.26
147 0.22
148 0.2
149 0.2
150 0.26
151 0.24
152 0.23
153 0.23
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.18
158 0.14
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.17
163 0.19
164 0.22
165 0.27
166 0.28
167 0.29
168 0.28
169 0.28
170 0.28
171 0.26
172 0.25
173 0.2
174 0.17
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.18
224 0.24
225 0.3
226 0.38
227 0.43
228 0.48
229 0.58
230 0.67
231 0.7
232 0.75
233 0.77
234 0.75
235 0.8
236 0.84
237 0.83
238 0.83
239 0.78
240 0.69
241 0.6
242 0.55
243 0.5
244 0.42
245 0.35
246 0.3
247 0.33
248 0.33
249 0.35
250 0.44
251 0.49
252 0.55
253 0.64
254 0.7
255 0.72
256 0.79
257 0.82
258 0.81
259 0.76
260 0.72
261 0.71
262 0.71
263 0.7
264 0.65
265 0.64
266 0.58
267 0.54
268 0.54
269 0.5
270 0.46
271 0.45
272 0.48
273 0.52
274 0.54
275 0.58
276 0.57
277 0.61
278 0.61
279 0.61
280 0.55
281 0.51
282 0.48
283 0.47
284 0.49
285 0.44
286 0.45
287 0.42
288 0.5
289 0.53
290 0.57
291 0.62
292 0.65
293 0.7
294 0.74
295 0.78
296 0.79
297 0.85