Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A443HPD7

Protein Details
Accession A0A443HPD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
455-482PRKFTMTAIPRRKRPDPRKHVARPSSASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
464-477PRRKRPDPRKHVAR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13.833, cyto 11.5, cyto_mito 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MPGIESHGEFLRHAVLETVVPHATDIDIEGALSSALEGGAEDLSEVLSSIHQRSLLFFDEFVNARIVLRLSNCSEHALKTLLPRLDVRLDAFVVNPVDPNSEGTTPTRDLIFSGVVSENEDPLIVVNAFEGDEEKGNHVYVIWKIEAFLNRPRVRIQYPSVIFTASATLNPPKVSEHNNRDDRYLQSLVPASSNVFEPLAADPTLGTESPFLPASRLLRVVPAQHTEEPIYNIQQQTEHPTRIVPAASARIRYSRLNSYSSRPTTIASLDFEVTPFLTCEVVLEQAKLDLSDGNVETISDIPGLALPITCRPRDDVTLVYKLTPEYGPETNPSTTAMVSTLDIALAGVINLSDDCRPKISMQWRTNVDFSLPLNPTFGAPSQVLQRNKRPASLPMLPGQAGLPPSLPPSNRSSLRERAYSTTDLGVTISFSGPVSVEVSKPFYWDVFIVNRSGIPRKFTMTAIPRRKRPDPRKHVARPSSASATSRKEDQVAEAVTDDNIIHAMQKTAAGQDAELICLSTDIRVGPLLPGTCHSTEVKLLPLAAGSLHLEAVRLVDVNTNETTDIRDLPDILAFERKHV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.15
4 0.16
5 0.18
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.1
12 0.11
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.05
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.03
25 0.04
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.04
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.04
34 0.06
35 0.09
36 0.11
37 0.13
38 0.15
39 0.15
40 0.17
41 0.21
42 0.23
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.23
47 0.24
48 0.23
49 0.2
50 0.17
51 0.16
52 0.17
53 0.16
54 0.14
55 0.15
56 0.19
57 0.2
58 0.23
59 0.24
60 0.27
61 0.28
62 0.26
63 0.27
64 0.24
65 0.23
66 0.25
67 0.31
68 0.28
69 0.28
70 0.29
71 0.3
72 0.32
73 0.31
74 0.28
75 0.23
76 0.23
77 0.21
78 0.2
79 0.19
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.13
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.17
90 0.18
91 0.22
92 0.22
93 0.22
94 0.2
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.11
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.15
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.09
109 0.08
110 0.1
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.08
120 0.09
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.13
127 0.13
128 0.16
129 0.14
130 0.13
131 0.14
132 0.18
133 0.21
134 0.21
135 0.26
136 0.33
137 0.34
138 0.36
139 0.38
140 0.4
141 0.39
142 0.42
143 0.4
144 0.39
145 0.39
146 0.4
147 0.37
148 0.32
149 0.29
150 0.24
151 0.22
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.14
160 0.18
161 0.25
162 0.32
163 0.38
164 0.47
165 0.54
166 0.54
167 0.55
168 0.54
169 0.49
170 0.45
171 0.39
172 0.29
173 0.24
174 0.25
175 0.23
176 0.2
177 0.19
178 0.13
179 0.12
180 0.13
181 0.11
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.19
208 0.19
209 0.21
210 0.22
211 0.21
212 0.23
213 0.22
214 0.21
215 0.21
216 0.19
217 0.18
218 0.18
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.21
224 0.24
225 0.22
226 0.19
227 0.19
228 0.2
229 0.2
230 0.19
231 0.12
232 0.1
233 0.16
234 0.17
235 0.18
236 0.18
237 0.19
238 0.21
239 0.22
240 0.24
241 0.25
242 0.26
243 0.29
244 0.3
245 0.33
246 0.39
247 0.38
248 0.37
249 0.3
250 0.28
251 0.25
252 0.24
253 0.21
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.04
277 0.04
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.09
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.15
299 0.17
300 0.19
301 0.21
302 0.19
303 0.21
304 0.25
305 0.24
306 0.22
307 0.21
308 0.19
309 0.18
310 0.14
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.18
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.1
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.02
335 0.02
336 0.02
337 0.02
338 0.03
339 0.05
340 0.07
341 0.08
342 0.1
343 0.11
344 0.12
345 0.19
346 0.27
347 0.36
348 0.38
349 0.44
350 0.47
351 0.49
352 0.49
353 0.42
354 0.34
355 0.26
356 0.23
357 0.23
358 0.2
359 0.18
360 0.18
361 0.17
362 0.17
363 0.16
364 0.16
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.17
369 0.24
370 0.3
371 0.33
372 0.4
373 0.47
374 0.48
375 0.5
376 0.46
377 0.43
378 0.45
379 0.46
380 0.41
381 0.35
382 0.36
383 0.33
384 0.31
385 0.27
386 0.21
387 0.16
388 0.13
389 0.1
390 0.08
391 0.11
392 0.14
393 0.15
394 0.16
395 0.2
396 0.27
397 0.31
398 0.34
399 0.38
400 0.43
401 0.47
402 0.47
403 0.45
404 0.42
405 0.43
406 0.4
407 0.35
408 0.29
409 0.25
410 0.21
411 0.19
412 0.15
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.11
425 0.15
426 0.15
427 0.16
428 0.16
429 0.14
430 0.15
431 0.14
432 0.16
433 0.16
434 0.17
435 0.17
436 0.17
437 0.18
438 0.19
439 0.26
440 0.24
441 0.24
442 0.25
443 0.28
444 0.29
445 0.29
446 0.35
447 0.37
448 0.46
449 0.53
450 0.59
451 0.62
452 0.68
453 0.76
454 0.78
455 0.8
456 0.81
457 0.8
458 0.84
459 0.88
460 0.9
461 0.92
462 0.88
463 0.85
464 0.79
465 0.74
466 0.69
467 0.61
468 0.54
469 0.49
470 0.47
471 0.41
472 0.4
473 0.35
474 0.32
475 0.3
476 0.3
477 0.31
478 0.26
479 0.24
480 0.21
481 0.2
482 0.17
483 0.17
484 0.14
485 0.08
486 0.07
487 0.06
488 0.07
489 0.08
490 0.09
491 0.09
492 0.1
493 0.11
494 0.12
495 0.15
496 0.13
497 0.12
498 0.16
499 0.16
500 0.16
501 0.15
502 0.14
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.07
507 0.08
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.14
514 0.14
515 0.14
516 0.16
517 0.21
518 0.21
519 0.23
520 0.23
521 0.22
522 0.24
523 0.25
524 0.26
525 0.22
526 0.21
527 0.18
528 0.17
529 0.15
530 0.12
531 0.12
532 0.1
533 0.09
534 0.1
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.09
540 0.08
541 0.08
542 0.12
543 0.13
544 0.17
545 0.17
546 0.17
547 0.17
548 0.17
549 0.2
550 0.18
551 0.19
552 0.18
553 0.18
554 0.18
555 0.18
556 0.21
557 0.19
558 0.18
559 0.24