Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A443HMY5

Protein Details
Accession A0A443HMY5    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-148ESEKWDKRMEKKQRHRDDVABasic
235-259DLKKAEEVRLRKRRERRGEDEPDVTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-60K
63-63R
243-251RLRKRRERR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPREDRDDSSPQGAEQEKPTSAEKEVMDAKAGAASDNTGADESKEVDAAAKARERQERFKALRARAKAATERNLKETAAESQRLATDQSQLASLSRKHAFASHNLLKADTEASGEDFERKRAWDWTVEESEKWDKRMEKKQRHRDDVAFQDYRQDARKVYKRQLREMQPDLEGYEREKMAAIERAAASGGLEVVETNDGELVAVDKNGTFYSTADSTDFIENKPDRSAVDKLVNDLKKAEEVRLRKRRERRGEDEPDVTYINEKNKQFNQKLARFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.31
4 0.27
5 0.29
6 0.32
7 0.29
8 0.29
9 0.31
10 0.26
11 0.28
12 0.31
13 0.28
14 0.27
15 0.24
16 0.23
17 0.19
18 0.19
19 0.14
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.16
37 0.18
38 0.21
39 0.27
40 0.35
41 0.39
42 0.46
43 0.53
44 0.59
45 0.59
46 0.64
47 0.67
48 0.66
49 0.7
50 0.66
51 0.63
52 0.56
53 0.57
54 0.56
55 0.53
56 0.54
57 0.54
58 0.52
59 0.5
60 0.48
61 0.43
62 0.37
63 0.33
64 0.31
65 0.27
66 0.26
67 0.22
68 0.22
69 0.23
70 0.22
71 0.22
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.16
80 0.16
81 0.18
82 0.18
83 0.19
84 0.18
85 0.22
86 0.23
87 0.24
88 0.33
89 0.33
90 0.35
91 0.35
92 0.34
93 0.3
94 0.29
95 0.25
96 0.16
97 0.11
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.21
112 0.25
113 0.28
114 0.28
115 0.27
116 0.27
117 0.33
118 0.29
119 0.28
120 0.26
121 0.26
122 0.33
123 0.43
124 0.5
125 0.54
126 0.64
127 0.73
128 0.79
129 0.82
130 0.79
131 0.72
132 0.68
133 0.63
134 0.59
135 0.49
136 0.4
137 0.37
138 0.33
139 0.31
140 0.28
141 0.22
142 0.17
143 0.24
144 0.32
145 0.34
146 0.42
147 0.46
148 0.47
149 0.54
150 0.61
151 0.61
152 0.6
153 0.59
154 0.52
155 0.47
156 0.43
157 0.36
158 0.29
159 0.21
160 0.15
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.15
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.13
174 0.11
175 0.07
176 0.06
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.12
203 0.14
204 0.18
205 0.18
206 0.14
207 0.22
208 0.22
209 0.23
210 0.24
211 0.23
212 0.19
213 0.23
214 0.26
215 0.23
216 0.3
217 0.29
218 0.31
219 0.39
220 0.39
221 0.35
222 0.34
223 0.3
224 0.28
225 0.28
226 0.3
227 0.29
228 0.35
229 0.46
230 0.54
231 0.61
232 0.65
233 0.74
234 0.79
235 0.83
236 0.85
237 0.82
238 0.83
239 0.84
240 0.81
241 0.75
242 0.66
243 0.57
244 0.48
245 0.4
246 0.33
247 0.27
248 0.28
249 0.31
250 0.31
251 0.36
252 0.44
253 0.54
254 0.54
255 0.6
256 0.63
257 0.63
258 0.7
259 0.71
260 0.73
261 0.67
262 0.68
263 0.69
264 0.62
265 0.59
266 0.54
267 0.51
268 0.47
269 0.45
270 0.45
271 0.41
272 0.4
273 0.37