Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A443HMI5

Protein Details
Accession A0A443HMI5    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-76SDHAPTSVERERKRKHKNKDHASPAKKRKHRDADAADLISAETSSKKEKKSKDKKKEKSSEAQEPSDBasic
373-405QADAQPPTTKTKKEKKEKDKDKSSKSKSKKKEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-40RERKRKHKNKDHASPAKKRKHR
54-67SKKEKKSKDKKKEK
382-405KTKKEKKEKDKDKSSKSKSKKKEK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSADAMDIDSDHAPTSVERERKRKHKNKDHASPAKKRKHRDADAADLISAETSSKKEKKSKDKKKEKSSEAQEPSDSPFNLVTSTLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYYPPLKGIILAYSNASISSKPPTSNPAKDSDNPQPLTLATTANEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQVLEGWVNVQSEGFLGAVVYNLFSVGIERRRLPADWKWIPPGEEDDSTDAKKSAATSAENSGDEEDSFDPEKEHFTPVRLPLGVETQDKGQDMDTEDSTATGYFQSASGHRVRGTIRFRVRDIDVIPSADRERGFISIEGTMLSPEEEEKLAADERRGITSYRRGDSLTMSGGVARAPSSAPSEQNGPAPQETQADAQPPTTKTKKEKKEKDKDKSSKSKSKKKEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.16
3 0.21
4 0.29
5 0.36
6 0.46
7 0.56
8 0.66
9 0.77
10 0.81
11 0.85
12 0.88
13 0.91
14 0.92
15 0.93
16 0.94
17 0.93
18 0.93
19 0.93
20 0.92
21 0.92
22 0.88
23 0.86
24 0.86
25 0.86
26 0.85
27 0.84
28 0.81
29 0.8
30 0.79
31 0.71
32 0.6
33 0.49
34 0.41
35 0.3
36 0.22
37 0.13
38 0.08
39 0.09
40 0.18
41 0.24
42 0.31
43 0.39
44 0.49
45 0.6
46 0.7
47 0.79
48 0.82
49 0.88
50 0.91
51 0.94
52 0.95
53 0.92
54 0.91
55 0.88
56 0.88
57 0.83
58 0.75
59 0.66
60 0.57
61 0.53
62 0.48
63 0.39
64 0.3
65 0.25
66 0.21
67 0.2
68 0.19
69 0.15
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.08
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.13
84 0.14
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.1
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.08
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.08
119 0.08
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.16
124 0.22
125 0.29
126 0.34
127 0.35
128 0.35
129 0.38
130 0.39
131 0.44
132 0.46
133 0.47
134 0.42
135 0.4
136 0.35
137 0.31
138 0.31
139 0.26
140 0.18
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.15
163 0.17
164 0.19
165 0.2
166 0.21
167 0.16
168 0.22
169 0.22
170 0.19
171 0.18
172 0.16
173 0.16
174 0.14
175 0.13
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.06
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.2
199 0.23
200 0.29
201 0.32
202 0.33
203 0.35
204 0.35
205 0.35
206 0.32
207 0.3
208 0.23
209 0.2
210 0.19
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.15
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.16
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.14
238 0.13
239 0.17
240 0.15
241 0.16
242 0.21
243 0.22
244 0.26
245 0.23
246 0.21
247 0.19
248 0.22
249 0.22
250 0.19
251 0.18
252 0.16
253 0.17
254 0.17
255 0.17
256 0.13
257 0.12
258 0.14
259 0.16
260 0.15
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.11
266 0.08
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.12
274 0.14
275 0.16
276 0.16
277 0.19
278 0.2
279 0.26
280 0.31
281 0.36
282 0.41
283 0.43
284 0.44
285 0.45
286 0.46
287 0.42
288 0.38
289 0.35
290 0.29
291 0.27
292 0.26
293 0.24
294 0.24
295 0.22
296 0.21
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.17
301 0.15
302 0.16
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.11
307 0.1
308 0.08
309 0.08
310 0.06
311 0.06
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.1
317 0.13
318 0.14
319 0.14
320 0.18
321 0.19
322 0.22
323 0.23
324 0.22
325 0.25
326 0.33
327 0.39
328 0.36
329 0.36
330 0.34
331 0.34
332 0.36
333 0.34
334 0.27
335 0.21
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.13
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.09
345 0.14
346 0.17
347 0.18
348 0.2
349 0.24
350 0.25
351 0.3
352 0.31
353 0.3
354 0.28
355 0.28
356 0.27
357 0.26
358 0.26
359 0.23
360 0.23
361 0.23
362 0.22
363 0.24
364 0.28
365 0.27
366 0.34
367 0.38
368 0.43
369 0.5
370 0.6
371 0.67
372 0.73
373 0.82
374 0.85
375 0.9
376 0.93
377 0.94
378 0.95
379 0.95
380 0.94
381 0.94
382 0.93
383 0.93
384 0.92
385 0.92