Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A443HLH2

Protein Details
Accession A0A443HLH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-314IKEQHRRRRAGENLKRKKPRTHDDDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-307KEQHRRRRAGENLKRKKPR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 6.333, cyto 6, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013921  Mediator_Med20  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08612  Med20  
Amino Acid Sequences MTITGVFFIPSNPNAPSALPILTERLRSVFAEEPIPIGRWALEHKLMRDTPSCLPASAHAPNPVPKPKYMQFLSLTHYPNHGFIYASEATDLPQASVAAGGSHRQTPLLGTISAAAGPPQAQAQSPTAAAGGAAPSSNASQSGMIMRTVPLSSYGPLFQHFMRACEPFWNHRHTVTVPAGVVYDIGDFRLRIGDVRQTFPQARARGTVVEVEWKGPSPLTSSSSSSPANFNEDGSSDSGIDVTTEPLDDSEIDAEYALVAQLIRDFWSQLGIEGAREAILVPDVGKEIKEQHRRRRAGENLKRKKPRTHDDDEEGWGWWDIEEDKNPDAGVDLARQYMEIYRFNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.21
4 0.18
5 0.18
6 0.16
7 0.16
8 0.2
9 0.22
10 0.23
11 0.22
12 0.21
13 0.22
14 0.21
15 0.25
16 0.25
17 0.24
18 0.25
19 0.24
20 0.24
21 0.24
22 0.25
23 0.2
24 0.16
25 0.14
26 0.13
27 0.17
28 0.2
29 0.25
30 0.27
31 0.29
32 0.37
33 0.38
34 0.4
35 0.39
36 0.38
37 0.34
38 0.37
39 0.36
40 0.28
41 0.28
42 0.26
43 0.29
44 0.29
45 0.28
46 0.27
47 0.29
48 0.34
49 0.4
50 0.46
51 0.42
52 0.4
53 0.45
54 0.45
55 0.5
56 0.47
57 0.46
58 0.42
59 0.42
60 0.45
61 0.44
62 0.42
63 0.35
64 0.36
65 0.31
66 0.28
67 0.27
68 0.22
69 0.16
70 0.13
71 0.19
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.13
95 0.14
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.07
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.1
146 0.16
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.18
152 0.21
153 0.24
154 0.23
155 0.26
156 0.29
157 0.28
158 0.27
159 0.29
160 0.25
161 0.29
162 0.24
163 0.22
164 0.17
165 0.16
166 0.16
167 0.13
168 0.12
169 0.06
170 0.06
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.13
181 0.15
182 0.18
183 0.19
184 0.21
185 0.22
186 0.25
187 0.31
188 0.26
189 0.26
190 0.25
191 0.25
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.14
196 0.17
197 0.17
198 0.16
199 0.15
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.12
204 0.09
205 0.11
206 0.14
207 0.16
208 0.18
209 0.19
210 0.23
211 0.23
212 0.21
213 0.22
214 0.19
215 0.22
216 0.19
217 0.18
218 0.16
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.04
249 0.05
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.13
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.16
275 0.26
276 0.37
277 0.45
278 0.55
279 0.65
280 0.7
281 0.73
282 0.75
283 0.76
284 0.77
285 0.79
286 0.79
287 0.8
288 0.85
289 0.91
290 0.87
291 0.86
292 0.85
293 0.85
294 0.82
295 0.81
296 0.79
297 0.76
298 0.74
299 0.69
300 0.59
301 0.49
302 0.42
303 0.33
304 0.24
305 0.17
306 0.14
307 0.12
308 0.15
309 0.19
310 0.21
311 0.22
312 0.23
313 0.23
314 0.21
315 0.2
316 0.17
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.15
324 0.19
325 0.21