Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A443HMH1

Protein Details
Accession A0A443HMH1    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-308KKPTSTPGRGRGRPRKPESERKPPKPVSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
234-243KRKRGRPSKA
266-332GRGRPAGTTSGSASAKKPTSTPGRGRGRPRKPESERKPPKPVSLNPDGTPRGRGRPRKSEGGVTKKT
346-356TPRSRGRPRKS
376-408SKGPGRPKKAETAETKEATANGTPRGRGRPRKS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MERERDHQPSNHLKNSAKSSSCSSIPPQVDNMFSRASNAFAAAVAPAVEQPTAEQIGASGDDNARNASSAIALDETETDLTTGVPITGDPSHQMLFDVHATTNHFLFSASEYAQPQEDQAARDESAAAVTGEEGLEGLSGEDLATSADGKQGDSTAQEVKGNEKVEDNSHAESTREKTPPTTPPPTTEKSAMDATATPSRRSQRATPVAPSSAKKQTKSSSTESAKDETSTGEKRKRGRPSKAPEEADSAQETKRTKVSETDTPRGRGRPAGTTSGSASAKKPTSTPGRGRGRPRKPESERKPPKPVSLNPDGTPRGRGRPRKSEGGVTKKTTTPSKATSATANGTPRSRGRPRKSDAASAAASVEKTNANTKSVSKGPGRPKKAETAETKEATANGTPRGRGRPRKSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.66
3 0.65
4 0.57
5 0.51
6 0.51
7 0.5
8 0.48
9 0.45
10 0.41
11 0.42
12 0.42
13 0.42
14 0.4
15 0.38
16 0.4
17 0.38
18 0.36
19 0.3
20 0.27
21 0.28
22 0.23
23 0.22
24 0.18
25 0.17
26 0.14
27 0.12
28 0.12
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.06
37 0.07
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.09
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.11
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.12
86 0.13
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.14
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.14
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.15
104 0.16
105 0.14
106 0.16
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.08
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.19
148 0.19
149 0.18
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.21
154 0.21
155 0.18
156 0.18
157 0.18
158 0.17
159 0.18
160 0.19
161 0.22
162 0.21
163 0.2
164 0.21
165 0.25
166 0.33
167 0.38
168 0.41
169 0.36
170 0.39
171 0.45
172 0.45
173 0.44
174 0.39
175 0.32
176 0.28
177 0.28
178 0.23
179 0.18
180 0.16
181 0.16
182 0.2
183 0.2
184 0.18
185 0.21
186 0.23
187 0.25
188 0.28
189 0.28
190 0.31
191 0.38
192 0.39
193 0.39
194 0.39
195 0.39
196 0.38
197 0.36
198 0.31
199 0.33
200 0.34
201 0.32
202 0.34
203 0.36
204 0.4
205 0.44
206 0.44
207 0.43
208 0.43
209 0.46
210 0.44
211 0.42
212 0.36
213 0.31
214 0.26
215 0.18
216 0.2
217 0.2
218 0.24
219 0.28
220 0.32
221 0.38
222 0.45
223 0.55
224 0.6
225 0.64
226 0.68
227 0.72
228 0.78
229 0.8
230 0.75
231 0.66
232 0.63
233 0.55
234 0.47
235 0.39
236 0.3
237 0.22
238 0.23
239 0.22
240 0.17
241 0.2
242 0.19
243 0.18
244 0.22
245 0.27
246 0.32
247 0.39
248 0.45
249 0.46
250 0.49
251 0.51
252 0.47
253 0.43
254 0.39
255 0.34
256 0.33
257 0.32
258 0.33
259 0.32
260 0.31
261 0.31
262 0.32
263 0.3
264 0.24
265 0.22
266 0.23
267 0.24
268 0.23
269 0.22
270 0.24
271 0.31
272 0.38
273 0.44
274 0.48
275 0.56
276 0.62
277 0.72
278 0.76
279 0.77
280 0.8
281 0.81
282 0.81
283 0.8
284 0.85
285 0.83
286 0.84
287 0.85
288 0.82
289 0.86
290 0.79
291 0.78
292 0.76
293 0.73
294 0.7
295 0.68
296 0.65
297 0.56
298 0.59
299 0.54
300 0.46
301 0.46
302 0.41
303 0.41
304 0.45
305 0.53
306 0.55
307 0.62
308 0.67
309 0.7
310 0.71
311 0.71
312 0.71
313 0.72
314 0.71
315 0.65
316 0.63
317 0.57
318 0.58
319 0.54
320 0.49
321 0.45
322 0.43
323 0.44
324 0.43
325 0.41
326 0.41
327 0.38
328 0.37
329 0.35
330 0.35
331 0.32
332 0.31
333 0.33
334 0.34
335 0.4
336 0.47
337 0.53
338 0.58
339 0.65
340 0.7
341 0.76
342 0.76
343 0.76
344 0.69
345 0.64
346 0.56
347 0.46
348 0.41
349 0.32
350 0.27
351 0.19
352 0.17
353 0.13
354 0.14
355 0.21
356 0.21
357 0.22
358 0.24
359 0.26
360 0.31
361 0.34
362 0.38
363 0.38
364 0.45
365 0.54
366 0.62
367 0.67
368 0.67
369 0.67
370 0.71
371 0.72
372 0.71
373 0.69
374 0.67
375 0.69
376 0.64
377 0.61
378 0.53
379 0.46
380 0.4
381 0.36
382 0.3
383 0.28
384 0.3
385 0.32
386 0.35
387 0.45
388 0.52
389 0.58