FuNGI

A0A437A287

Protein Details

Accession

A0A437A287

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
75-95	LLTKAKKTTSKETPRPPPPGL	Hydrophilic
215-236	GGAVKQKKNMFKKKTQQVFQRD	Hydrophilic
428-452	LERSRKAHGRKVKKYLKQREKNAIY	Basic
586-608	AGDIPRNKNIKKRRKPTGAGSGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
220-222	QKK
425-446	KRALERSRKAHGRKVKKYLKQR
477-503	KEEEEKKKAAEKAVKEKEEEERKRERQ
591-601	RNKNIKKRRKP
626-662	KAAKKIKIRVGGEGPASIPARSGSPPVAKTAVGKKSR

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 11.833, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MLRWAVVDGDDVWFERLNVRSGFSSQSKFPVIIIITTTTTTTTTTTIIHLHQDPTSHKDFSTLRLQILDFRPLALLTKAKKTTSKETPRPPPPGLKPAINEDPEPDEDPSTYIEYKLVTTKKALLRNMRFHCMRLYSKNDVNIMDPEEFIRPIKLHRRDPRGPLQGARVDPGSNGATLDPDEKDIDPEEKAKREAEKAEKERQHAENLARIAPHGGAVKQKKNMFKKKTQQVFQRDEEERRLKYEEYFPWFIEDYENKNTWIGNLEGGLSGTSVMLVMDDGMFKMIPVEKFYRFQQRNNFKTLSADQAEAAMKQKERLNRWFMDVTKADEKEAKLKEEQENLRATKRLYTVKGDRLEGREAKPGFTDADELDFEEDFADDEAPPIIEGDEEELKVATKKMQREQLSANIFDIRDEKDYEREEQEKRALERSRKAHGRKVKKYLKQREKNAIYESDSDENPYASSQESVDSDEEAAKKEEEEKKKAAEKAVKEKEEEERKRERQEQKEAEEAVKSLKAAAAGKAASQPGIADAGPESSVQNKRAKKDDQSTSAKSLAAANGQTSAQSRLIAIKREPDTGAPSPSSSAGDIPRNKNIKKRRKPTGAGSGSEYETGGEMSDGATSEGGKAAKKIKIRVGGEGPASIPARSGSPPVAKTAVGKKSRSGSPSAGVSRGGSPSAAADKSKAPITEDEIKAVLTPEGIDFATISKKFHGRVNPSNKAEFFKKLKGLSRLVDDKERGKVFYPREETS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.16
3	0.18
4	0.21
5	0.21
6	0.23
7	0.24
8	0.26
9	0.32
10	0.32
11	0.34
12	0.31
13	0.36
14	0.35
15	0.33
16	0.31
17	0.3
18	0.26
19	0.23
20	0.23
21	0.21
22	0.19
23	0.2
24	0.2
25	0.15
26	0.15
27	0.15
28	0.14
29	0.13
30	0.13
31	0.13
32	0.15
33	0.17
34	0.18
35	0.22
36	0.23
37	0.24
38	0.24
39	0.28
40	0.3
41	0.33
42	0.36
43	0.32
44	0.29
45	0.33
46	0.33
47	0.34
48	0.4
49	0.36
50	0.33
51	0.34
52	0.35
53	0.36
54	0.38
55	0.39
56	0.29
57	0.27
58	0.27
59	0.24
60	0.26
61	0.21
62	0.24
63	0.22
64	0.31
65	0.34
66	0.37
67	0.43
68	0.47
69	0.53
70	0.58
71	0.66
72	0.66
73	0.73
74	0.8
75	0.82
76	0.84
77	0.79
78	0.78
79	0.74
80	0.74
81	0.68
82	0.63
83	0.57
84	0.57
85	0.6
86	0.53
87	0.46
88	0.39
89	0.39
90	0.37
91	0.36
92	0.3
93	0.23
94	0.21
95	0.22
96	0.21
97	0.2
98	0.18
99	0.16
100	0.15
101	0.15
102	0.16
103	0.22
104	0.23
105	0.2
106	0.22
107	0.29
108	0.35
109	0.41
110	0.46
111	0.5
112	0.56
113	0.64
114	0.67
115	0.68
116	0.63
117	0.57
118	0.56
119	0.52
120	0.5
121	0.47
122	0.49
123	0.47
124	0.5
125	0.53
126	0.5
127	0.45
128	0.41
129	0.36
130	0.32
131	0.26
132	0.22
133	0.19
134	0.18
135	0.18
136	0.16
137	0.16
138	0.13
139	0.19
140	0.29
141	0.36
142	0.45
143	0.53
144	0.62
145	0.66
146	0.73
147	0.77
148	0.75
149	0.7
150	0.63
151	0.61
152	0.57
153	0.51
154	0.45
155	0.36
156	0.28
157	0.24
158	0.25
159	0.19
160	0.13
161	0.13
162	0.11
163	0.1
164	0.11
165	0.13
166	0.1
167	0.11
168	0.12
169	0.12
170	0.14
171	0.15
172	0.16
173	0.15
174	0.2
175	0.23
176	0.25
177	0.26
178	0.28
179	0.3
180	0.32
181	0.39
182	0.42
183	0.48
184	0.51
185	0.59
186	0.61
187	0.6
188	0.63
189	0.57
190	0.53
191	0.48
192	0.44
193	0.39
194	0.36
195	0.34
196	0.28
197	0.25
198	0.22
199	0.16
200	0.16
201	0.12
202	0.12
203	0.19
204	0.25
205	0.31
206	0.36
207	0.41
208	0.47
209	0.56
210	0.65
211	0.65
212	0.69
213	0.74
214	0.78
215	0.83
216	0.82
217	0.81
218	0.8
219	0.79
220	0.72
221	0.7
222	0.64
223	0.58
224	0.59
225	0.55
226	0.46
227	0.42
228	0.41
229	0.34
230	0.33
231	0.37
232	0.34
233	0.35
234	0.37
235	0.34
236	0.34
237	0.33
238	0.3
239	0.27
240	0.24
241	0.22
242	0.25
243	0.26
244	0.23
245	0.23
246	0.23
247	0.19
248	0.19
249	0.14
250	0.1
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.06
257	0.05
258	0.04
259	0.04
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.05
272	0.08
273	0.08
274	0.12
275	0.15
276	0.17
277	0.2
278	0.23
279	0.33
280	0.33
281	0.38
282	0.45
283	0.52
284	0.53
285	0.57
286	0.55
287	0.44
288	0.46
289	0.42
290	0.37
291	0.28
292	0.25
293	0.19
294	0.2
295	0.2
296	0.17
297	0.17
298	0.14
299	0.12
300	0.15
301	0.18
302	0.22
303	0.27
304	0.33
305	0.37
306	0.35
307	0.39
308	0.4
309	0.38
310	0.38
311	0.33
312	0.31
313	0.31
314	0.3
315	0.26
316	0.25
317	0.25
318	0.27
319	0.27
320	0.25
321	0.22
322	0.26
323	0.29
324	0.34
325	0.35
326	0.32
327	0.35
328	0.34
329	0.34
330	0.31
331	0.28
332	0.24
333	0.27
334	0.27
335	0.25
336	0.3
337	0.33
338	0.38
339	0.4
340	0.38
341	0.36
342	0.34
343	0.37
344	0.34
345	0.3
346	0.3
347	0.28
348	0.26
349	0.24
350	0.22
351	0.18
352	0.15
353	0.15
354	0.08
355	0.1
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.08
361	0.06
362	0.06
363	0.04
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.03
374	0.03
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.07
382	0.08
383	0.1
384	0.14
385	0.18
386	0.23
387	0.31
388	0.33
389	0.36
390	0.38
391	0.41
392	0.4
393	0.36
394	0.32
395	0.26
396	0.23
397	0.21
398	0.19
399	0.13
400	0.12
401	0.14
402	0.14
403	0.16
404	0.18
405	0.21
406	0.23
407	0.26
408	0.26
409	0.27
410	0.3
411	0.3
412	0.3
413	0.34
414	0.36
415	0.37
416	0.43
417	0.44
418	0.48
419	0.52
420	0.55
421	0.56
422	0.6
423	0.65
424	0.66
425	0.73
426	0.74
427	0.73
428	0.8
429	0.83
430	0.85
431	0.84
432	0.83
433	0.83
434	0.79
435	0.75
436	0.68
437	0.6
438	0.51
439	0.44
440	0.39
441	0.31
442	0.26
443	0.23
444	0.2
445	0.17
446	0.14
447	0.12
448	0.09
449	0.07
450	0.08
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.1
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.12
459	0.12
460	0.12
461	0.13
462	0.11
463	0.11
464	0.18
465	0.26
466	0.3
467	0.35
468	0.36
469	0.4
470	0.46
471	0.48
472	0.48
473	0.46
474	0.46
475	0.52
476	0.58
477	0.54
478	0.5
479	0.49
480	0.51
481	0.56
482	0.54
483	0.5
484	0.51
485	0.54
486	0.6
487	0.67
488	0.68
489	0.66
490	0.72
491	0.72
492	0.67
493	0.67
494	0.62
495	0.53
496	0.45
497	0.36
498	0.27
499	0.21
500	0.17
501	0.11
502	0.1
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.13
507	0.12
508	0.13
509	0.15
510	0.14
511	0.12
512	0.11
513	0.1
514	0.08
515	0.09
516	0.08
517	0.06
518	0.06
519	0.07
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.13
524	0.17
525	0.21
526	0.28
527	0.32
528	0.35
529	0.43
530	0.47
531	0.5
532	0.55
533	0.59
534	0.6
535	0.64
536	0.64
537	0.6
538	0.57
539	0.48
540	0.4
541	0.34
542	0.26
543	0.21
544	0.17
545	0.14
546	0.13
547	0.13
548	0.13
549	0.13
550	0.15
551	0.13
552	0.13
553	0.13
554	0.18
555	0.22
556	0.25
557	0.25
558	0.3
559	0.31
560	0.34
561	0.34
562	0.29
563	0.32
564	0.31
565	0.33
566	0.26
567	0.24
568	0.23
569	0.23
570	0.22
571	0.16
572	0.16
573	0.17
574	0.24
575	0.31
576	0.34
577	0.41
578	0.48
579	0.5
580	0.56
581	0.63
582	0.67
583	0.7
584	0.76
585	0.78
586	0.81
587	0.85
588	0.85
589	0.85
590	0.8
591	0.71
592	0.66
593	0.58
594	0.49
595	0.42
596	0.33
597	0.22
598	0.16
599	0.14
600	0.09
601	0.06
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.09
611	0.1
612	0.1
613	0.13
614	0.19
615	0.24
616	0.29
617	0.34
618	0.39
619	0.47
620	0.48
621	0.51
622	0.5
623	0.49
624	0.46
625	0.41
626	0.34
627	0.3
628	0.29
629	0.22
630	0.18
631	0.14
632	0.15
633	0.15
634	0.18
635	0.18
636	0.23
637	0.24
638	0.27
639	0.28
640	0.27
641	0.3
642	0.37
643	0.41
644	0.41
645	0.42
646	0.43
647	0.48
648	0.53
649	0.51
650	0.48
651	0.42
652	0.4
653	0.46
654	0.44
655	0.39
656	0.34
657	0.33
658	0.3
659	0.28
660	0.24
661	0.16
662	0.14
663	0.15
664	0.19
665	0.19
666	0.17
667	0.18
668	0.2
669	0.23
670	0.27
671	0.25
672	0.23
673	0.24
674	0.3
675	0.38
676	0.36
677	0.35
678	0.32
679	0.31
680	0.29
681	0.27
682	0.2
683	0.11
684	0.11
685	0.08
686	0.1
687	0.1
688	0.09
689	0.08
690	0.1
691	0.17
692	0.17
693	0.19
694	0.22
695	0.26
696	0.28
697	0.35
698	0.42
699	0.44
700	0.54
701	0.63
702	0.68
703	0.69
704	0.73
705	0.69
706	0.66
707	0.61
708	0.59
709	0.55
710	0.53
711	0.55
712	0.55
713	0.61
714	0.62
715	0.64
716	0.6
717	0.62
718	0.61
719	0.59
720	0.61
721	0.57
722	0.54
723	0.57
724	0.55
725	0.48
726	0.45
727	0.48
728	0.46
729	0.51

A0A437A287

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer