Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A436ZPU2

Protein Details
Accession A0A436ZPU2    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-39VGNKSPKSSPTNSQKRRNHRKFSPVSLRHGVHydrophilic
55-86PTLPHGSPARRKRSSKHKRHAARRLQQSHDQGBasic
146-171DSPYYLPSERQRKQRHQLNPNSRAAAHydrophilic
213-239IDDLTIKNKKLKKKLRKMERLHCNELNHydrophilic
811-835VKTIQKPVSLRKSRFRKNGLIRHFIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-29KRRNHRK
49-49R
54-78PPTLPHGSPARRKRSSKHKRHAARR
219-229KNKKLKKKLRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018554  FRQ  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007623  P:circadian rhythm  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09421  FRQ  
Amino Acid Sequences MLHNNLMPVGNKSPKSSPTNSQKRRNHRKFSPVSLRHGVASASAAKPNRPFAIPPTLPHGSPARRKRSSKHKRHAARRLQQSHDQGIEVVAVEEEPHQPLTNEVDRESVLNSSTSGSDDRSVLEDWFKNLNTNVGDFNKPTIADGDSPYYLPSERQRKQRHQLNPNSRAAAAGGGILLRNRSTNLSRLPPFPNPSYPPMPPTQDSEDVYRSVIDDLTIKNKKLKKKLRKMERLHCNELNEEKLFEVRCYGLPPSRKQELQELLQNFAAGMDGNGKVYETKRSDAISNANAATSTNPSSSPLLQNTDSAYATETRMTSSDGVLGDATKGNTLNVDQAKARPKNAPGLSLHPETRSIQFTSEGARMNMVVKRLEQLFTGSDALQSELEKSQFQQQLAVTAATEKHDTAVDEVPAESGDEDDRREAAMMSHQQDDDLTKEKNRDQKSMFDTYHQRPTRPMDLDPNRAQVAADNLEYLEHLSFSSSHKNHRPASAGDTTGWVYLNLINNMAQIHTLHVSLPFIKKSIRAMSDKLELSPDGNKIRWRGGLAGTKLSSEGDSSSGMGDSSSGELSPGEGSSGLKSKTPPSSEDKSGINAVSAKDVKSRLSQISSPAPTPSAYNIDAFRYRPLMFHTLSTQKSNSTDHSEQDGSESSSEADTNNSGGPAPILESGICDIVKFAPIDGAIIYFGGAPFCTDLSAQVVFRGGGHAFVRSGDGKNYDRFVEEPVGSPAPTPSGDDDDTESQDRRPLSKFDWSAQDVEMSLTEDSEESLPGLTSIISPTTADRLPTPIPSPRPFEISGIGGVRSEDNFVTYVKTIQKPVSLRKSRFRKNGLIRHFIPPETLNQFLKDDSSTSVAGFETEITNAAHIQLQPSKLPDPVFAFYLSEDSSDPFASTPDDPQSHFSFAYNVECDSRSSSEGIPSFYSPDIGDHSPMDLDAEEGVDIYGNPLAPLSVVATVGSGDGGLADSTQDNHILKSLDDMDIGPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.52
3 0.53
4 0.56
5 0.6
6 0.69
7 0.75
8 0.8
9 0.82
10 0.86
11 0.92
12 0.92
13 0.91
14 0.89
15 0.91
16 0.88
17 0.89
18 0.89
19 0.85
20 0.82
21 0.78
22 0.7
23 0.6
24 0.53
25 0.42
26 0.32
27 0.28
28 0.24
29 0.2
30 0.24
31 0.24
32 0.28
33 0.32
34 0.36
35 0.36
36 0.34
37 0.34
38 0.35
39 0.44
40 0.42
41 0.4
42 0.42
43 0.41
44 0.39
45 0.4
46 0.43
47 0.4
48 0.48
49 0.56
50 0.59
51 0.65
52 0.71
53 0.77
54 0.8
55 0.83
56 0.84
57 0.85
58 0.86
59 0.87
60 0.93
61 0.94
62 0.94
63 0.93
64 0.92
65 0.9
66 0.86
67 0.84
68 0.79
69 0.75
70 0.65
71 0.56
72 0.45
73 0.37
74 0.3
75 0.22
76 0.15
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.14
87 0.2
88 0.24
89 0.25
90 0.24
91 0.25
92 0.24
93 0.25
94 0.25
95 0.19
96 0.14
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.16
110 0.21
111 0.21
112 0.22
113 0.26
114 0.25
115 0.25
116 0.25
117 0.29
118 0.24
119 0.24
120 0.26
121 0.26
122 0.28
123 0.26
124 0.28
125 0.25
126 0.23
127 0.23
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.21
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.18
137 0.17
138 0.18
139 0.25
140 0.31
141 0.37
142 0.47
143 0.57
144 0.66
145 0.76
146 0.82
147 0.83
148 0.83
149 0.88
150 0.88
151 0.87
152 0.83
153 0.75
154 0.65
155 0.55
156 0.45
157 0.35
158 0.24
159 0.15
160 0.09
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.14
169 0.16
170 0.21
171 0.27
172 0.34
173 0.36
174 0.4
175 0.44
176 0.47
177 0.5
178 0.48
179 0.49
180 0.46
181 0.49
182 0.49
183 0.46
184 0.43
185 0.42
186 0.43
187 0.38
188 0.39
189 0.39
190 0.38
191 0.38
192 0.39
193 0.36
194 0.32
195 0.3
196 0.25
197 0.2
198 0.16
199 0.14
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.21
204 0.25
205 0.25
206 0.32
207 0.37
208 0.46
209 0.54
210 0.63
211 0.65
212 0.72
213 0.82
214 0.86
215 0.91
216 0.92
217 0.92
218 0.92
219 0.89
220 0.86
221 0.79
222 0.7
223 0.63
224 0.56
225 0.5
226 0.4
227 0.32
228 0.24
229 0.24
230 0.22
231 0.18
232 0.17
233 0.14
234 0.14
235 0.16
236 0.18
237 0.21
238 0.26
239 0.32
240 0.37
241 0.4
242 0.41
243 0.41
244 0.46
245 0.46
246 0.43
247 0.45
248 0.4
249 0.37
250 0.35
251 0.33
252 0.24
253 0.19
254 0.15
255 0.08
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.18
265 0.18
266 0.2
267 0.21
268 0.23
269 0.24
270 0.25
271 0.29
272 0.23
273 0.23
274 0.22
275 0.2
276 0.18
277 0.17
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.15
285 0.17
286 0.2
287 0.2
288 0.22
289 0.22
290 0.23
291 0.22
292 0.23
293 0.2
294 0.16
295 0.15
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.1
301 0.11
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.13
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.13
319 0.13
320 0.15
321 0.15
322 0.19
323 0.29
324 0.3
325 0.32
326 0.31
327 0.32
328 0.39
329 0.39
330 0.39
331 0.32
332 0.35
333 0.38
334 0.37
335 0.36
336 0.27
337 0.29
338 0.26
339 0.27
340 0.24
341 0.19
342 0.17
343 0.17
344 0.17
345 0.18
346 0.19
347 0.18
348 0.15
349 0.15
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.15
354 0.13
355 0.12
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.13
360 0.13
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.18
376 0.21
377 0.2
378 0.22
379 0.21
380 0.22
381 0.23
382 0.22
383 0.14
384 0.12
385 0.12
386 0.1
387 0.11
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.1
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.11
412 0.15
413 0.16
414 0.18
415 0.18
416 0.17
417 0.17
418 0.18
419 0.15
420 0.14
421 0.13
422 0.13
423 0.16
424 0.2
425 0.28
426 0.3
427 0.34
428 0.32
429 0.39
430 0.42
431 0.46
432 0.43
433 0.39
434 0.43
435 0.41
436 0.49
437 0.43
438 0.39
439 0.35
440 0.39
441 0.41
442 0.37
443 0.34
444 0.35
445 0.39
446 0.45
447 0.44
448 0.42
449 0.35
450 0.33
451 0.31
452 0.22
453 0.19
454 0.13
455 0.12
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.07
467 0.15
468 0.16
469 0.21
470 0.27
471 0.33
472 0.35
473 0.36
474 0.38
475 0.31
476 0.36
477 0.33
478 0.28
479 0.22
480 0.21
481 0.19
482 0.16
483 0.15
484 0.09
485 0.07
486 0.09
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.07
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.09
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.12
508 0.15
509 0.19
510 0.21
511 0.22
512 0.23
513 0.26
514 0.3
515 0.29
516 0.26
517 0.22
518 0.18
519 0.17
520 0.17
521 0.18
522 0.15
523 0.16
524 0.18
525 0.19
526 0.21
527 0.21
528 0.2
529 0.18
530 0.21
531 0.25
532 0.24
533 0.26
534 0.24
535 0.22
536 0.22
537 0.2
538 0.15
539 0.09
540 0.09
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.06
548 0.05
549 0.04
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.05
554 0.04
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.04
559 0.05
560 0.05
561 0.06
562 0.1
563 0.1
564 0.11
565 0.12
566 0.16
567 0.21
568 0.22
569 0.25
570 0.29
571 0.34
572 0.35
573 0.36
574 0.33
575 0.3
576 0.3
577 0.26
578 0.2
579 0.16
580 0.14
581 0.16
582 0.16
583 0.14
584 0.16
585 0.17
586 0.18
587 0.19
588 0.22
589 0.2
590 0.22
591 0.23
592 0.24
593 0.3
594 0.3
595 0.28
596 0.25
597 0.23
598 0.21
599 0.2
600 0.18
601 0.15
602 0.14
603 0.15
604 0.15
605 0.18
606 0.19
607 0.19
608 0.19
609 0.18
610 0.18
611 0.17
612 0.2
613 0.22
614 0.2
615 0.21
616 0.24
617 0.27
618 0.28
619 0.3
620 0.27
621 0.24
622 0.26
623 0.26
624 0.25
625 0.27
626 0.27
627 0.26
628 0.3
629 0.28
630 0.26
631 0.26
632 0.24
633 0.17
634 0.15
635 0.14
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.08
640 0.08
641 0.07
642 0.08
643 0.08
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.07
654 0.07
655 0.09
656 0.08
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.09
661 0.09
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.04
675 0.04
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.08
682 0.1
683 0.1
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.11
689 0.08
690 0.1
691 0.1
692 0.11
693 0.1
694 0.1
695 0.13
696 0.13
697 0.14
698 0.14
699 0.18
700 0.21
701 0.23
702 0.25
703 0.23
704 0.22
705 0.21
706 0.22
707 0.22
708 0.2
709 0.19
710 0.21
711 0.21
712 0.2
713 0.2
714 0.16
715 0.14
716 0.14
717 0.13
718 0.12
719 0.15
720 0.16
721 0.16
722 0.2
723 0.2
724 0.23
725 0.24
726 0.23
727 0.18
728 0.22
729 0.22
730 0.21
731 0.22
732 0.23
733 0.24
734 0.33
735 0.35
736 0.35
737 0.41
738 0.4
739 0.39
740 0.35
741 0.32
742 0.23
743 0.21
744 0.18
745 0.12
746 0.1
747 0.08
748 0.08
749 0.07
750 0.08
751 0.08
752 0.07
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.05
759 0.05
760 0.06
761 0.07
762 0.07
763 0.07
764 0.08
765 0.12
766 0.12
767 0.13
768 0.13
769 0.17
770 0.18
771 0.2
772 0.23
773 0.26
774 0.32
775 0.36
776 0.41
777 0.38
778 0.42
779 0.4
780 0.39
781 0.34
782 0.29
783 0.28
784 0.23
785 0.21
786 0.16
787 0.16
788 0.15
789 0.13
790 0.13
791 0.1
792 0.1
793 0.11
794 0.11
795 0.13
796 0.12
797 0.16
798 0.21
799 0.24
800 0.26
801 0.27
802 0.33
803 0.36
804 0.45
805 0.52
806 0.55
807 0.58
808 0.65
809 0.73
810 0.77
811 0.81
812 0.79
813 0.78
814 0.79
815 0.84
816 0.81
817 0.79
818 0.73
819 0.71
820 0.67
821 0.57
822 0.49
823 0.4
824 0.39
825 0.34
826 0.35
827 0.29
828 0.28
829 0.29
830 0.26
831 0.26
832 0.21
833 0.18
834 0.16
835 0.18
836 0.16
837 0.15
838 0.15
839 0.13
840 0.13
841 0.12
842 0.1
843 0.08
844 0.08
845 0.09
846 0.09
847 0.09
848 0.09
849 0.1
850 0.12
851 0.11
852 0.15
853 0.18
854 0.2
855 0.22
856 0.25
857 0.26
858 0.27
859 0.28
860 0.27
861 0.28
862 0.28
863 0.28
864 0.25
865 0.23
866 0.21
867 0.22
868 0.18
869 0.14
870 0.13
871 0.13
872 0.14
873 0.14
874 0.14
875 0.11
876 0.12
877 0.14
878 0.14
879 0.17
880 0.22
881 0.23
882 0.24
883 0.29
884 0.32
885 0.32
886 0.31
887 0.28
888 0.24
889 0.24
890 0.28
891 0.24
892 0.22
893 0.21
894 0.22
895 0.23
896 0.24
897 0.25
898 0.21
899 0.23
900 0.22
901 0.27
902 0.28
903 0.29
904 0.28
905 0.26
906 0.27
907 0.24
908 0.25
909 0.18
910 0.18
911 0.2
912 0.19
913 0.21
914 0.18
915 0.19
916 0.18
917 0.17
918 0.17
919 0.11
920 0.1
921 0.08
922 0.09
923 0.07
924 0.07
925 0.07
926 0.06
927 0.06
928 0.06
929 0.08
930 0.07
931 0.07
932 0.07
933 0.07
934 0.07
935 0.08
936 0.08
937 0.08
938 0.08
939 0.08
940 0.08
941 0.08
942 0.08
943 0.07
944 0.05
945 0.04
946 0.04
947 0.05
948 0.05
949 0.04
950 0.06
951 0.06
952 0.08
953 0.1
954 0.14
955 0.14
956 0.15
957 0.18
958 0.18
959 0.17
960 0.21
961 0.23
962 0.19
963 0.19