Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A436ZSD9

Protein Details
Accession A0A436ZSD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
367-392SERSDSRSRSRTPRRRRSSSRGSDSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-240PKFKHKKIPRGPPSPPP
369-420RSDSRSRSRTPRRRRSSSRGSDSEEERAIKEREEMRRERRKEAERELRMKRM
Subcellular Location(s) mito 13.5, mito_nucl 13.333, nucl 12, cyto_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATLTKSLLSALPAPKQSSTNDAGSKKPAGPRIVGANSAESQLILKRTGPPPYGQRASWRPKSVEDYGDGGAFPEIPIAQYPLEMGRKPTASKSRNNALTLEVDERGIVKYDAIARQGHNDKRVVHASFKDLIPLRQRADVGEISLERPSEEEVAEQTEKTRAALAKLVAGAVAAQKPKNIKGTNRPEPTFVRYTPANQMGETGKKNDRIIKIVEKQQDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPIMHSPPRKLTAADQEAWTIPPPISNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFSEALFIADRHAREEVKLRATMQQKLAEKEKMAKEEQLRKLAQQARDEHRSVTRGRITDRSSRSPSGSERSDSRSRSRTPRRRRSSSRGSDSEEERAIKEREEMRRERRKEAERELRMKRMGTERRVQMLAREQNRDIGEKMALGLVSKPTQSAESMFDARLFNQSSGLRMGAEFNEDQHYDKPLFAAAEISRSIYRPSAGHQDDDEGDGDMERFSKEKRFDVLGRGVFKGAADQEAREGPVQFEKDTSSGVDPFNVDAFLADVKAGQQKKHGLELSDRRKDTKRARVESDDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.37
4 0.37
5 0.36
6 0.36
7 0.37
8 0.4
9 0.41
10 0.42
11 0.44
12 0.47
13 0.45
14 0.47
15 0.47
16 0.43
17 0.43
18 0.43
19 0.47
20 0.45
21 0.43
22 0.38
23 0.35
24 0.32
25 0.3
26 0.26
27 0.17
28 0.16
29 0.17
30 0.18
31 0.15
32 0.16
33 0.23
34 0.27
35 0.35
36 0.36
37 0.38
38 0.43
39 0.51
40 0.54
41 0.48
42 0.52
43 0.55
44 0.63
45 0.66
46 0.65
47 0.58
48 0.59
49 0.65
50 0.61
51 0.55
52 0.48
53 0.43
54 0.37
55 0.35
56 0.29
57 0.23
58 0.18
59 0.14
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.14
70 0.19
71 0.19
72 0.22
73 0.25
74 0.27
75 0.29
76 0.37
77 0.42
78 0.44
79 0.51
80 0.55
81 0.6
82 0.63
83 0.63
84 0.56
85 0.48
86 0.45
87 0.39
88 0.34
89 0.25
90 0.19
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.11
96 0.08
97 0.11
98 0.16
99 0.18
100 0.2
101 0.21
102 0.2
103 0.28
104 0.37
105 0.39
106 0.38
107 0.4
108 0.38
109 0.42
110 0.47
111 0.42
112 0.39
113 0.36
114 0.36
115 0.36
116 0.35
117 0.36
118 0.31
119 0.33
120 0.35
121 0.38
122 0.35
123 0.34
124 0.35
125 0.29
126 0.32
127 0.28
128 0.22
129 0.2
130 0.19
131 0.17
132 0.17
133 0.16
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.18
149 0.14
150 0.15
151 0.19
152 0.18
153 0.18
154 0.18
155 0.17
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.14
164 0.17
165 0.2
166 0.28
167 0.3
168 0.34
169 0.42
170 0.52
171 0.6
172 0.65
173 0.63
174 0.59
175 0.58
176 0.58
177 0.52
178 0.42
179 0.36
180 0.3
181 0.32
182 0.34
183 0.36
184 0.31
185 0.26
186 0.28
187 0.26
188 0.3
189 0.29
190 0.27
191 0.25
192 0.28
193 0.31
194 0.35
195 0.34
196 0.32
197 0.35
198 0.39
199 0.41
200 0.45
201 0.49
202 0.44
203 0.43
204 0.42
205 0.41
206 0.36
207 0.38
208 0.38
209 0.35
210 0.35
211 0.45
212 0.49
213 0.48
214 0.55
215 0.57
216 0.6
217 0.67
218 0.77
219 0.75
220 0.77
221 0.79
222 0.78
223 0.76
224 0.72
225 0.66
226 0.56
227 0.52
228 0.49
229 0.5
230 0.5
231 0.5
232 0.48
233 0.49
234 0.5
235 0.45
236 0.4
237 0.39
238 0.39
239 0.36
240 0.32
241 0.28
242 0.26
243 0.26
244 0.25
245 0.22
246 0.13
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.16
251 0.19
252 0.26
253 0.32
254 0.38
255 0.43
256 0.42
257 0.46
258 0.41
259 0.4
260 0.38
261 0.41
262 0.38
263 0.38
264 0.39
265 0.36
266 0.33
267 0.33
268 0.29
269 0.2
270 0.18
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.11
276 0.13
277 0.12
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.12
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.11
298 0.1
299 0.11
300 0.17
301 0.19
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.26
306 0.29
307 0.32
308 0.29
309 0.32
310 0.31
311 0.34
312 0.36
313 0.32
314 0.29
315 0.32
316 0.32
317 0.3
318 0.28
319 0.3
320 0.33
321 0.41
322 0.45
323 0.45
324 0.42
325 0.39
326 0.46
327 0.47
328 0.44
329 0.41
330 0.43
331 0.43
332 0.47
333 0.48
334 0.41
335 0.38
336 0.37
337 0.32
338 0.31
339 0.3
340 0.26
341 0.28
342 0.33
343 0.34
344 0.4
345 0.44
346 0.45
347 0.45
348 0.45
349 0.44
350 0.41
351 0.4
352 0.38
353 0.35
354 0.3
355 0.28
356 0.33
357 0.37
358 0.38
359 0.4
360 0.41
361 0.43
362 0.52
363 0.6
364 0.64
365 0.69
366 0.77
367 0.81
368 0.85
369 0.89
370 0.88
371 0.88
372 0.87
373 0.85
374 0.78
375 0.74
376 0.68
377 0.61
378 0.56
379 0.47
380 0.38
381 0.3
382 0.3
383 0.25
384 0.21
385 0.24
386 0.27
387 0.32
388 0.39
389 0.45
390 0.51
391 0.61
392 0.64
393 0.65
394 0.68
395 0.69
396 0.69
397 0.72
398 0.73
399 0.71
400 0.76
401 0.74
402 0.71
403 0.65
404 0.58
405 0.52
406 0.51
407 0.51
408 0.48
409 0.51
410 0.49
411 0.5
412 0.51
413 0.47
414 0.41
415 0.43
416 0.45
417 0.42
418 0.43
419 0.39
420 0.42
421 0.44
422 0.41
423 0.33
424 0.26
425 0.22
426 0.17
427 0.17
428 0.13
429 0.11
430 0.09
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.13
439 0.13
440 0.14
441 0.17
442 0.19
443 0.19
444 0.21
445 0.2
446 0.2
447 0.23
448 0.22
449 0.17
450 0.2
451 0.2
452 0.2
453 0.21
454 0.2
455 0.16
456 0.14
457 0.16
458 0.12
459 0.15
460 0.13
461 0.13
462 0.17
463 0.17
464 0.19
465 0.18
466 0.21
467 0.19
468 0.19
469 0.18
470 0.16
471 0.15
472 0.13
473 0.16
474 0.13
475 0.15
476 0.15
477 0.17
478 0.16
479 0.17
480 0.19
481 0.16
482 0.17
483 0.15
484 0.19
485 0.27
486 0.28
487 0.29
488 0.28
489 0.3
490 0.29
491 0.3
492 0.26
493 0.17
494 0.15
495 0.13
496 0.13
497 0.1
498 0.09
499 0.08
500 0.09
501 0.1
502 0.18
503 0.22
504 0.26
505 0.3
506 0.35
507 0.38
508 0.44
509 0.51
510 0.49
511 0.48
512 0.45
513 0.42
514 0.35
515 0.32
516 0.28
517 0.21
518 0.19
519 0.17
520 0.16
521 0.19
522 0.21
523 0.22
524 0.2
525 0.2
526 0.18
527 0.23
528 0.25
529 0.22
530 0.22
531 0.23
532 0.22
533 0.22
534 0.22
535 0.19
536 0.2
537 0.2
538 0.21
539 0.19
540 0.19
541 0.19
542 0.17
543 0.13
544 0.1
545 0.11
546 0.09
547 0.09
548 0.07
549 0.07
550 0.09
551 0.17
552 0.2
553 0.2
554 0.26
555 0.34
556 0.37
557 0.45
558 0.46
559 0.42
560 0.49
561 0.59
562 0.63
563 0.65
564 0.64
565 0.61
566 0.64
567 0.71
568 0.71
569 0.71
570 0.71
571 0.69
572 0.75
573 0.78