Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A436ZPM1

Protein Details
Accession A0A436ZPM1    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-61DTLFKRKSTSTKSRKTINRSLISHydrophilic
258-278LGKKAEREKERRRREDIREAIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-271KKAEREKERRRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MKSANFASRKPKARIIASFDDDETETSSNPRPTATETNDTLFKRKSTSTKSRKTINRSLISLEDPHDDSSVPSTDSPELTRPIVVKKSTLSRQTIERGASSPSTHPPPPPKEKPRATLKSSILPSQPFSQLSLTSRPSYSKEALAELKGSTPTTPLHRKNDDDNDISMSDAPPPSKDPLDVAGKFAAERASAAAVATELSIPDSGTIKALKARRALLAQNPDYISLSGDAKKGSRLQKTQDDDEEILETFVEDGGLALGKKAEREKERRRREDIREAIDMVERPSDEDEEGSNDDGNGEWEANRLRTGGYGSNKRETLEEKLRKPPAVITPLPNFQEALANLKGILAGVNDTMEQKSKRVEELLSEKEMIGQREKELQKLLKETSEKYERLRAEAGTALHVGRGLESFGDDATGNGIPAGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.69
3 0.68
4 0.64
5 0.6
6 0.52
7 0.47
8 0.4
9 0.33
10 0.28
11 0.2
12 0.16
13 0.17
14 0.23
15 0.24
16 0.24
17 0.24
18 0.23
19 0.29
20 0.37
21 0.4
22 0.41
23 0.4
24 0.44
25 0.49
26 0.49
27 0.48
28 0.42
29 0.37
30 0.34
31 0.38
32 0.43
33 0.46
34 0.56
35 0.61
36 0.69
37 0.74
38 0.79
39 0.82
40 0.82
41 0.82
42 0.81
43 0.77
44 0.68
45 0.65
46 0.58
47 0.52
48 0.46
49 0.38
50 0.31
51 0.27
52 0.26
53 0.22
54 0.2
55 0.17
56 0.18
57 0.17
58 0.15
59 0.14
60 0.16
61 0.17
62 0.18
63 0.2
64 0.2
65 0.21
66 0.21
67 0.23
68 0.21
69 0.26
70 0.3
71 0.29
72 0.27
73 0.29
74 0.36
75 0.41
76 0.46
77 0.44
78 0.41
79 0.45
80 0.49
81 0.49
82 0.42
83 0.37
84 0.31
85 0.3
86 0.29
87 0.26
88 0.23
89 0.24
90 0.27
91 0.28
92 0.32
93 0.38
94 0.45
95 0.53
96 0.6
97 0.64
98 0.69
99 0.74
100 0.77
101 0.78
102 0.78
103 0.73
104 0.71
105 0.66
106 0.63
107 0.59
108 0.55
109 0.47
110 0.41
111 0.38
112 0.33
113 0.33
114 0.25
115 0.25
116 0.22
117 0.21
118 0.22
119 0.25
120 0.25
121 0.23
122 0.24
123 0.24
124 0.26
125 0.29
126 0.28
127 0.26
128 0.24
129 0.25
130 0.27
131 0.25
132 0.23
133 0.18
134 0.18
135 0.15
136 0.15
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.18
141 0.27
142 0.31
143 0.38
144 0.42
145 0.44
146 0.5
147 0.57
148 0.55
149 0.48
150 0.42
151 0.37
152 0.33
153 0.31
154 0.24
155 0.16
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.12
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.16
166 0.22
167 0.21
168 0.21
169 0.19
170 0.19
171 0.18
172 0.18
173 0.14
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.12
196 0.15
197 0.18
198 0.19
199 0.21
200 0.21
201 0.24
202 0.25
203 0.26
204 0.31
205 0.28
206 0.28
207 0.27
208 0.26
209 0.24
210 0.22
211 0.17
212 0.1
213 0.11
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.12
219 0.18
220 0.23
221 0.28
222 0.3
223 0.35
224 0.43
225 0.47
226 0.48
227 0.44
228 0.41
229 0.35
230 0.32
231 0.28
232 0.19
233 0.15
234 0.11
235 0.09
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.1
249 0.17
250 0.24
251 0.34
252 0.46
253 0.55
254 0.66
255 0.72
256 0.77
257 0.79
258 0.8
259 0.81
260 0.77
261 0.71
262 0.63
263 0.56
264 0.49
265 0.42
266 0.34
267 0.24
268 0.19
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.12
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.08
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.14
295 0.18
296 0.24
297 0.31
298 0.35
299 0.4
300 0.41
301 0.4
302 0.4
303 0.37
304 0.38
305 0.4
306 0.45
307 0.44
308 0.53
309 0.57
310 0.55
311 0.53
312 0.5
313 0.47
314 0.47
315 0.45
316 0.42
317 0.42
318 0.46
319 0.47
320 0.42
321 0.34
322 0.27
323 0.29
324 0.23
325 0.24
326 0.19
327 0.17
328 0.17
329 0.16
330 0.16
331 0.11
332 0.11
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.09
339 0.1
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.22
344 0.23
345 0.26
346 0.27
347 0.27
348 0.29
349 0.36
350 0.39
351 0.37
352 0.35
353 0.32
354 0.35
355 0.38
356 0.33
357 0.31
358 0.28
359 0.27
360 0.36
361 0.37
362 0.35
363 0.4
364 0.42
365 0.42
366 0.46
367 0.46
368 0.44
369 0.47
370 0.46
371 0.47
372 0.5
373 0.47
374 0.46
375 0.52
376 0.46
377 0.47
378 0.47
379 0.38
380 0.33
381 0.35
382 0.31
383 0.25
384 0.25
385 0.21
386 0.18
387 0.19
388 0.15
389 0.12
390 0.12
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.08
396 0.1
397 0.09
398 0.08
399 0.1
400 0.1
401 0.09