FuNGI

A0A436ZT48

Protein Details

Accession

A0A436ZT48

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
259-290	TTSSGGGKKRERDRKRRREKEKGREKEREKEK	Basic
421-449	PPTPTKPEGGKRLRNRNRDRDRRKDETPT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
236-245	PKIKEKGKGK
263-309	GGGKKRERDRKRRREKEKGREKEREKEKASQQAAGPSGDKGKKVDKK
427-444	PEGGKRLRNRNRDRDRRK
501-512	RGRGGRRGGRGG
580-603	RGRGGGRGFGPFGPFGPRGGRGRG

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 9, extr 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MATPGLIKIKPRGKGSVITVLQSAPASQPSVAPAAAPAPPPPAPKLKIVIRHLPASMTEQEYNILTADVINKDTVEWSSFIPGKVPQDRNKSTTFSIAYARARSTETLIKIKAGLNGKPLTDSRGQEYCVQVEFAPFQKFPQTKGRLRHDARSGTIDNEPEFITFLENLKHTGPNASISAPKTEGDAGKAGEKETKVYKDPLAAPIPSYEAPILEPGFKVTTTPLVEFIKQQKLAPKIKEKGKGKAAVIAAEEDDAKSTTSSGGGKKRERDRKRRREKEKGREKEREKEKASQQAAGPSGDKGKKVDKKASTSASAQATTTIPATTAGKSPNEPSARPARRERGNAGLSAAAILQRHLGLTTSGRGRRNRGAEPAFEKPAATSTAPDTDATTSTSANSTAATSTQPTPPAQPSEAKSTQEPPTPTKPEGGKRLRNRNRDRDRRKDETPTAPSTSAAASTPNQASRTEAATTSTDRNSTTSPAVATPAPAPVQPATQPQAHRGRGGRRGGRGGGSNRGPVQQATPTQTTQSPPAAPASEPAASSNTPAPAPQPSVATIPTGPKSMQQGPANNNNNYHGPPRGRGGGRGFGPFGPFGPRGGRGRGYPRGGGNQGGGGGSNNGGGSNANSGTANATPAAGTG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.55
3	0.56
4	0.5
5	0.45
6	0.42
7	0.36
8	0.33
9	0.27
10	0.22
11	0.14
12	0.14
13	0.14
14	0.14
15	0.14
16	0.15
17	0.17
18	0.16
19	0.14
20	0.13
21	0.14
22	0.16
23	0.16
24	0.15
25	0.18
26	0.21
27	0.24
28	0.28
29	0.34
30	0.34
31	0.38
32	0.44
33	0.46
34	0.52
35	0.56
36	0.61
37	0.57
38	0.57
39	0.53
40	0.47
41	0.42
42	0.38
43	0.35
44	0.3
45	0.27
46	0.24
47	0.25
48	0.24
49	0.23
50	0.18
51	0.14
52	0.09
53	0.09
54	0.12
55	0.13
56	0.13
57	0.13
58	0.13
59	0.13
60	0.14
61	0.14
62	0.12
63	0.12
64	0.12
65	0.18
66	0.2
67	0.2
68	0.21
69	0.23
70	0.29
71	0.37
72	0.44
73	0.46
74	0.54
75	0.59
76	0.61
77	0.61
78	0.58
79	0.51
80	0.5
81	0.44
82	0.35
83	0.34
84	0.36
85	0.36
86	0.34
87	0.33
88	0.28
89	0.28
90	0.27
91	0.27
92	0.28
93	0.28
94	0.32
95	0.32
96	0.31
97	0.31
98	0.32
99	0.34
100	0.32
101	0.29
102	0.3
103	0.31
104	0.31
105	0.32
106	0.3
107	0.29
108	0.3
109	0.3
110	0.29
111	0.3
112	0.32
113	0.32
114	0.34
115	0.31
116	0.26
117	0.26
118	0.2
119	0.19
120	0.19
121	0.19
122	0.21
123	0.19
124	0.19
125	0.27
126	0.28
127	0.3
128	0.38
129	0.43
130	0.46
131	0.55
132	0.63
133	0.65
134	0.68
135	0.71
136	0.69
137	0.65
138	0.6
139	0.57
140	0.5
141	0.42
142	0.41
143	0.35
144	0.27
145	0.24
146	0.22
147	0.16
148	0.15
149	0.12
150	0.11
151	0.1
152	0.11
153	0.12
154	0.12
155	0.14
156	0.15
157	0.16
158	0.14
159	0.16
160	0.16
161	0.16
162	0.17
163	0.16
164	0.18
165	0.18
166	0.21
167	0.2
168	0.19
169	0.17
170	0.19
171	0.18
172	0.16
173	0.17
174	0.15
175	0.17
176	0.18
177	0.17
178	0.18
179	0.18
180	0.19
181	0.22
182	0.24
183	0.24
184	0.26
185	0.27
186	0.28
187	0.3
188	0.33
189	0.31
190	0.27
191	0.25
192	0.23
193	0.25
194	0.2
195	0.19
196	0.13
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.12
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.11
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.13
209	0.14
210	0.14
211	0.16
212	0.17
213	0.18
214	0.22
215	0.27
216	0.29
217	0.28
218	0.29
219	0.31
220	0.38
221	0.44
222	0.46
223	0.5
224	0.51
225	0.57
226	0.64
227	0.62
228	0.62
229	0.63
230	0.62
231	0.53
232	0.52
233	0.45
234	0.37
235	0.34
236	0.27
237	0.19
238	0.14
239	0.14
240	0.08
241	0.08
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.07
248	0.1
249	0.14
250	0.2
251	0.27
252	0.31
253	0.38
254	0.48
255	0.57
256	0.65
257	0.71
258	0.76
259	0.81
260	0.88
261	0.91
262	0.92
263	0.92
264	0.93
265	0.93
266	0.93
267	0.92
268	0.89
269	0.88
270	0.83
271	0.81
272	0.79
273	0.77
274	0.7
275	0.67
276	0.64
277	0.63
278	0.59
279	0.53
280	0.45
281	0.4
282	0.37
283	0.3
284	0.25
285	0.17
286	0.21
287	0.19
288	0.19
289	0.17
290	0.24
291	0.29
292	0.33
293	0.41
294	0.4
295	0.44
296	0.48
297	0.49
298	0.44
299	0.39
300	0.39
301	0.33
302	0.28
303	0.23
304	0.19
305	0.16
306	0.14
307	0.13
308	0.08
309	0.06
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.1
314	0.11
315	0.11
316	0.12
317	0.14
318	0.2
319	0.21
320	0.2
321	0.21
322	0.3
323	0.34
324	0.38
325	0.42
326	0.42
327	0.46
328	0.49
329	0.49
330	0.46
331	0.43
332	0.39
333	0.34
334	0.27
335	0.21
336	0.18
337	0.15
338	0.08
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.09
349	0.14
350	0.19
351	0.24
352	0.27
353	0.31
354	0.37
355	0.41
356	0.4
357	0.43
358	0.41
359	0.4
360	0.42
361	0.42
362	0.37
363	0.32
364	0.3
365	0.22
366	0.21
367	0.19
368	0.15
369	0.12
370	0.11
371	0.14
372	0.14
373	0.14
374	0.14
375	0.12
376	0.13
377	0.13
378	0.12
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.07
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.09
390	0.11
391	0.13
392	0.15
393	0.15
394	0.18
395	0.2
396	0.22
397	0.22
398	0.24
399	0.25
400	0.31
401	0.34
402	0.32
403	0.31
404	0.33
405	0.35
406	0.36
407	0.36
408	0.33
409	0.38
410	0.41
411	0.4
412	0.41
413	0.43
414	0.44
415	0.52
416	0.55
417	0.56
418	0.61
419	0.72
420	0.75
421	0.8
422	0.83
423	0.84
424	0.86
425	0.88
426	0.89
427	0.89
428	0.88
429	0.84
430	0.8
431	0.78
432	0.74
433	0.72
434	0.69
435	0.63
436	0.57
437	0.51
438	0.46
439	0.37
440	0.31
441	0.22
442	0.16
443	0.13
444	0.11
445	0.14
446	0.17
447	0.18
448	0.19
449	0.18
450	0.21
451	0.2
452	0.22
453	0.19
454	0.17
455	0.17
456	0.18
457	0.21
458	0.22
459	0.21
460	0.2
461	0.19
462	0.21
463	0.2
464	0.21
465	0.19
466	0.17
467	0.17
468	0.16
469	0.17
470	0.15
471	0.15
472	0.13
473	0.14
474	0.14
475	0.13
476	0.15
477	0.13
478	0.15
479	0.16
480	0.2
481	0.21
482	0.25
483	0.26
484	0.31
485	0.4
486	0.39
487	0.43
488	0.44
489	0.48
490	0.52
491	0.6
492	0.58
493	0.53
494	0.56
495	0.53
496	0.5
497	0.49
498	0.44
499	0.43
500	0.4
501	0.39
502	0.36
503	0.35
504	0.34
505	0.28
506	0.27
507	0.25
508	0.26
509	0.28
510	0.3
511	0.29
512	0.3
513	0.32
514	0.31
515	0.3
516	0.3
517	0.26
518	0.24
519	0.26
520	0.25
521	0.23
522	0.22
523	0.22
524	0.19
525	0.18
526	0.19
527	0.18
528	0.17
529	0.19
530	0.2
531	0.18
532	0.16
533	0.17
534	0.17
535	0.18
536	0.22
537	0.21
538	0.2
539	0.2
540	0.22
541	0.23
542	0.23
543	0.21
544	0.22
545	0.23
546	0.23
547	0.22
548	0.23
549	0.29
550	0.32
551	0.38
552	0.39
553	0.44
554	0.49
555	0.59
556	0.63
557	0.59
558	0.55
559	0.51
560	0.48
561	0.44
562	0.41
563	0.38
564	0.34
565	0.35
566	0.38
567	0.43
568	0.41
569	0.44
570	0.46
571	0.46
572	0.45
573	0.45
574	0.42
575	0.35
576	0.36
577	0.3
578	0.26
579	0.25
580	0.22
581	0.21
582	0.23
583	0.28
584	0.29
585	0.34
586	0.36
587	0.36
588	0.44
589	0.5
590	0.51
591	0.5
592	0.51
593	0.53
594	0.52
595	0.48
596	0.41
597	0.34
598	0.3
599	0.25
600	0.21
601	0.14
602	0.13
603	0.11
604	0.11
605	0.09
606	0.08
607	0.09
608	0.09
609	0.09
610	0.12
611	0.12
612	0.12
613	0.12
614	0.13
615	0.15
616	0.16
617	0.16
618	0.12
619	0.12

A0A436ZT48

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer