Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A436ZZ52

Protein Details
Accession A0A436ZZ52    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-91KRTATKKTTATKKKAPAKRSHydrophilic
107-146AKRSGTRRTATKKKPAAKKKKAAPKKKAVKKKAAPKKPGIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-144RTATKKTTATKKKAPAKRSTTATTKKPTAKNRAVAKRSGTRRTATKKKPAAKKKKAAPKKKAVKKKAAPKKP
245-251REKKGIK
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 3, cyto 1, extr 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MLAVGRSRLAASSGLSLPKLSALVARAIARSGPLSSGAANAINSQATFAPFVKANLPLLTNLVLREYATAAKRTATKKTTATKKKAPAKRSTTATTKKPTAKNRAVAKRSGTRRTATKKKPAAKKKKAAPKKKAVKKKAAPKKPGIQTQYDKALGDAPTKKANPYNLFFVDTLKNVDPSLKASEKAKKVAEQWRALSDAEKKTWSDRAAEETVKRKAAYAQWLAGQNPLDIEAANNARIRIRGYREKKGIKGVSPVTKIKDDRLVKRPRTAWVFFMKDKYSSGLVDHVEHKDKMSKLAELWKATPEAEKKKYEDLFTKDMAPLRGLCYLSLVPSCHPSMNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.2
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.14
11 0.17
12 0.18
13 0.17
14 0.18
15 0.18
16 0.16
17 0.16
18 0.14
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.15
38 0.16
39 0.17
40 0.18
41 0.19
42 0.18
43 0.18
44 0.16
45 0.17
46 0.18
47 0.17
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.14
55 0.16
56 0.18
57 0.17
58 0.2
59 0.26
60 0.28
61 0.35
62 0.34
63 0.36
64 0.41
65 0.5
66 0.59
67 0.62
68 0.68
69 0.68
70 0.75
71 0.8
72 0.8
73 0.79
74 0.78
75 0.76
76 0.75
77 0.72
78 0.68
79 0.68
80 0.67
81 0.67
82 0.63
83 0.63
84 0.63
85 0.65
86 0.69
87 0.69
88 0.7
89 0.7
90 0.74
91 0.76
92 0.72
93 0.68
94 0.65
95 0.63
96 0.63
97 0.62
98 0.56
99 0.49
100 0.54
101 0.6
102 0.64
103 0.64
104 0.66
105 0.68
106 0.73
107 0.8
108 0.82
109 0.84
110 0.84
111 0.85
112 0.84
113 0.86
114 0.88
115 0.88
116 0.87
117 0.86
118 0.86
119 0.87
120 0.88
121 0.86
122 0.86
123 0.84
124 0.85
125 0.85
126 0.83
127 0.81
128 0.77
129 0.78
130 0.74
131 0.73
132 0.66
133 0.62
134 0.56
135 0.52
136 0.5
137 0.42
138 0.35
139 0.28
140 0.28
141 0.22
142 0.23
143 0.22
144 0.19
145 0.23
146 0.23
147 0.24
148 0.23
149 0.29
150 0.28
151 0.28
152 0.31
153 0.27
154 0.29
155 0.28
156 0.27
157 0.22
158 0.18
159 0.19
160 0.14
161 0.14
162 0.12
163 0.13
164 0.11
165 0.12
166 0.16
167 0.14
168 0.15
169 0.18
170 0.26
171 0.27
172 0.31
173 0.31
174 0.28
175 0.34
176 0.41
177 0.44
178 0.41
179 0.4
180 0.37
181 0.37
182 0.35
183 0.31
184 0.29
185 0.26
186 0.23
187 0.23
188 0.22
189 0.23
190 0.27
191 0.25
192 0.21
193 0.19
194 0.23
195 0.25
196 0.28
197 0.29
198 0.31
199 0.33
200 0.32
201 0.31
202 0.26
203 0.26
204 0.28
205 0.31
206 0.28
207 0.26
208 0.28
209 0.3
210 0.3
211 0.28
212 0.25
213 0.17
214 0.14
215 0.14
216 0.11
217 0.09
218 0.08
219 0.1
220 0.1
221 0.13
222 0.14
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.17
227 0.19
228 0.25
229 0.33
230 0.39
231 0.48
232 0.56
233 0.61
234 0.62
235 0.66
236 0.63
237 0.55
238 0.56
239 0.53
240 0.52
241 0.51
242 0.51
243 0.45
244 0.47
245 0.46
246 0.42
247 0.45
248 0.44
249 0.47
250 0.53
251 0.6
252 0.58
253 0.65
254 0.65
255 0.63
256 0.63
257 0.58
258 0.53
259 0.52
260 0.53
261 0.48
262 0.51
263 0.45
264 0.39
265 0.38
266 0.35
267 0.28
268 0.23
269 0.21
270 0.2
271 0.2
272 0.21
273 0.24
274 0.26
275 0.29
276 0.29
277 0.29
278 0.32
279 0.31
280 0.35
281 0.34
282 0.31
283 0.29
284 0.38
285 0.42
286 0.39
287 0.4
288 0.36
289 0.35
290 0.34
291 0.37
292 0.36
293 0.4
294 0.43
295 0.47
296 0.47
297 0.55
298 0.58
299 0.57
300 0.57
301 0.54
302 0.53
303 0.5
304 0.49
305 0.44
306 0.44
307 0.4
308 0.34
309 0.28
310 0.26
311 0.29
312 0.27
313 0.23
314 0.23
315 0.22
316 0.23
317 0.25
318 0.23
319 0.2
320 0.24
321 0.27