Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1E9Q6

Protein Details
Accession A0A0D1E9Q6    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
584-606LLEKQREREKLLRKQALKRGAGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-53RERREREVAAKLAEREAREREQKDRERK
138-141RRKR
264-274KVKEARGNGRR
475-479KKKLA
589-606REREKLLRKQALKRGAGR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG uma:UMAG_01030  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSSYAKLKEMALKKAEEEQAALNRERERREREVAAKLAEREAREREQKDRERKILLQRMTRQKEEEAREKMQKERAVKLEQEKVADEENAARPSSVPSLRQGLSSSARTASVKASCSTQKVDLSHRLKAKPSNGNATRRKRKVEEDDFVGNRLDKIGGSKAELTSSFAGSSTPKRKATPMTREEKQAIKRAREFGSLPKLPPIARISSNSVSARFSPSVGAGDVERTNRPSARSQLAKDNGLVALGTKKRDHRSIDEIERDLRKVKEARGNGRREAPSQAELEREAALARRQKAMEEKRKSDLEARELASRRKLDGSGDDSKDDLFGSDDDGNEAEASKRRKMPPSKDKSQAATANGSHSGSASTSRFVTAPQSREVKPIAARAPGGINPADFLPGAPLRPEAMARLSQKARTKTELASASRVKSPESDSRSKPKRTVSESDSKSSPAPALTSFSAGPPRRETARERFIREQEEKKKLAAGRSDDGGRKAEGRSSRSDEYASEEDNYSDEYDSDGIDDDDDGAEGEGGQSYRDEIWKLFGKDRKKYASRVVDSDDDMEADAASVLQEELRSSKQAREEDLREELLEKQREREKLLRKQALKRGAGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.5
3 0.41
4 0.37
5 0.35
6 0.37
7 0.4
8 0.4
9 0.37
10 0.39
11 0.44
12 0.49
13 0.52
14 0.52
15 0.55
16 0.59
17 0.63
18 0.63
19 0.66
20 0.64
21 0.61
22 0.58
23 0.52
24 0.51
25 0.47
26 0.43
27 0.39
28 0.41
29 0.43
30 0.48
31 0.49
32 0.52
33 0.59
34 0.66
35 0.72
36 0.76
37 0.74
38 0.72
39 0.75
40 0.78
41 0.77
42 0.74
43 0.73
44 0.73
45 0.78
46 0.78
47 0.75
48 0.67
49 0.65
50 0.66
51 0.64
52 0.64
53 0.6
54 0.6
55 0.64
56 0.64
57 0.63
58 0.62
59 0.6
60 0.56
61 0.56
62 0.57
63 0.54
64 0.57
65 0.58
66 0.6
67 0.56
68 0.53
69 0.47
70 0.42
71 0.38
72 0.32
73 0.26
74 0.22
75 0.25
76 0.25
77 0.23
78 0.21
79 0.19
80 0.22
81 0.28
82 0.25
83 0.22
84 0.24
85 0.3
86 0.3
87 0.31
88 0.29
89 0.28
90 0.3
91 0.3
92 0.28
93 0.23
94 0.25
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.23
99 0.23
100 0.22
101 0.26
102 0.27
103 0.3
104 0.32
105 0.31
106 0.32
107 0.33
108 0.38
109 0.44
110 0.44
111 0.48
112 0.51
113 0.5
114 0.5
115 0.54
116 0.56
117 0.55
118 0.55
119 0.6
120 0.6
121 0.67
122 0.72
123 0.76
124 0.78
125 0.76
126 0.78
127 0.72
128 0.74
129 0.75
130 0.75
131 0.69
132 0.64
133 0.66
134 0.6
135 0.56
136 0.48
137 0.37
138 0.28
139 0.23
140 0.17
141 0.1
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.16
146 0.18
147 0.17
148 0.19
149 0.19
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.14
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.21
158 0.25
159 0.3
160 0.32
161 0.33
162 0.37
163 0.46
164 0.53
165 0.56
166 0.57
167 0.59
168 0.59
169 0.62
170 0.62
171 0.59
172 0.55
173 0.53
174 0.51
175 0.5
176 0.52
177 0.53
178 0.52
179 0.48
180 0.45
181 0.43
182 0.46
183 0.42
184 0.38
185 0.36
186 0.35
187 0.32
188 0.35
189 0.3
190 0.25
191 0.24
192 0.27
193 0.29
194 0.29
195 0.34
196 0.3
197 0.28
198 0.26
199 0.25
200 0.26
201 0.2
202 0.19
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.13
207 0.13
208 0.08
209 0.1
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.16
215 0.17
216 0.2
217 0.21
218 0.25
219 0.3
220 0.33
221 0.34
222 0.4
223 0.42
224 0.41
225 0.37
226 0.33
227 0.26
228 0.21
229 0.19
230 0.1
231 0.12
232 0.13
233 0.15
234 0.16
235 0.22
236 0.26
237 0.31
238 0.35
239 0.34
240 0.4
241 0.45
242 0.49
243 0.47
244 0.45
245 0.43
246 0.41
247 0.36
248 0.33
249 0.26
250 0.25
251 0.23
252 0.27
253 0.31
254 0.35
255 0.44
256 0.49
257 0.53
258 0.5
259 0.54
260 0.51
261 0.45
262 0.43
263 0.36
264 0.29
265 0.27
266 0.25
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.14
271 0.11
272 0.09
273 0.09
274 0.12
275 0.15
276 0.16
277 0.18
278 0.18
279 0.19
280 0.28
281 0.37
282 0.44
283 0.46
284 0.48
285 0.49
286 0.5
287 0.5
288 0.47
289 0.4
290 0.34
291 0.32
292 0.3
293 0.31
294 0.32
295 0.33
296 0.31
297 0.28
298 0.25
299 0.23
300 0.22
301 0.17
302 0.19
303 0.24
304 0.25
305 0.26
306 0.25
307 0.23
308 0.23
309 0.22
310 0.18
311 0.12
312 0.06
313 0.05
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.06
323 0.1
324 0.13
325 0.16
326 0.22
327 0.26
328 0.35
329 0.43
330 0.53
331 0.59
332 0.66
333 0.69
334 0.71
335 0.71
336 0.65
337 0.63
338 0.56
339 0.47
340 0.42
341 0.35
342 0.29
343 0.27
344 0.24
345 0.17
346 0.13
347 0.12
348 0.08
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.17
357 0.19
358 0.21
359 0.25
360 0.29
361 0.29
362 0.32
363 0.33
364 0.29
365 0.26
366 0.28
367 0.26
368 0.23
369 0.23
370 0.21
371 0.21
372 0.19
373 0.19
374 0.14
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.08
380 0.07
381 0.09
382 0.09
383 0.1
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.09
390 0.11
391 0.16
392 0.17
393 0.23
394 0.24
395 0.29
396 0.36
397 0.4
398 0.42
399 0.41
400 0.42
401 0.37
402 0.42
403 0.43
404 0.39
405 0.4
406 0.39
407 0.37
408 0.37
409 0.36
410 0.3
411 0.25
412 0.28
413 0.3
414 0.35
415 0.39
416 0.41
417 0.51
418 0.59
419 0.62
420 0.61
421 0.61
422 0.62
423 0.62
424 0.65
425 0.61
426 0.63
427 0.62
428 0.61
429 0.54
430 0.47
431 0.41
432 0.34
433 0.28
434 0.18
435 0.16
436 0.13
437 0.16
438 0.15
439 0.16
440 0.15
441 0.16
442 0.24
443 0.25
444 0.27
445 0.27
446 0.3
447 0.31
448 0.35
449 0.4
450 0.41
451 0.49
452 0.52
453 0.56
454 0.6
455 0.62
456 0.66
457 0.66
458 0.66
459 0.65
460 0.67
461 0.62
462 0.55
463 0.56
464 0.51
465 0.5
466 0.47
467 0.43
468 0.38
469 0.4
470 0.43
471 0.4
472 0.4
473 0.36
474 0.3
475 0.26
476 0.24
477 0.27
478 0.28
479 0.29
480 0.33
481 0.38
482 0.4
483 0.39
484 0.39
485 0.34
486 0.35
487 0.34
488 0.29
489 0.24
490 0.22
491 0.21
492 0.2
493 0.21
494 0.15
495 0.12
496 0.11
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.08
518 0.1
519 0.12
520 0.13
521 0.12
522 0.19
523 0.26
524 0.29
525 0.35
526 0.4
527 0.47
528 0.54
529 0.62
530 0.65
531 0.63
532 0.66
533 0.69
534 0.73
535 0.7
536 0.66
537 0.63
538 0.57
539 0.53
540 0.49
541 0.39
542 0.29
543 0.24
544 0.19
545 0.13
546 0.1
547 0.08
548 0.06
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.06
554 0.07
555 0.1
556 0.13
557 0.17
558 0.19
559 0.24
560 0.31
561 0.35
562 0.4
563 0.45
564 0.47
565 0.48
566 0.5
567 0.47
568 0.4
569 0.37
570 0.37
571 0.38
572 0.42
573 0.38
574 0.41
575 0.46
576 0.49
577 0.55
578 0.58
579 0.59
580 0.62
581 0.72
582 0.75
583 0.76
584 0.82
585 0.84
586 0.85