Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427XIF3

Protein Details
Accession A0A427XIF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MASQEAKKSKKRKSMGSSSADVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-13KKSKKRK
404-425RRAVLKAPVKFPKTKTRGPARH
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MASQEAKKSKKRKSMGSSSADVSVVVAESSSGAGPAFVNFPSIKPSKRTPFTLYSRDPASSSELAKQHTLVAGETEDVEYFSTNRDRNAGEGADCQYLAAVYDPATRTLNVSPAPLYLLSHRVKRLREAPLSGTPEAMTMWKAKRNDLGETFGTRKAKSQIRAEERNKVDISAMSGVRTDLIASIGGVEAKPEGPVAPSEFIPVPNTQTNVPTEVYPRSAIVPDAEWSSIQVAAFTQAEDDRARSALLPFRRSRWIEDKLRVTVEGPSGTRKNNLRMLYYLSCLLGFYNAAHGLQKMSVSEMPAKFPGIPAQVLNGLCARFAEPVGKRFAVTDKCKMKLLAWICVCYLAADGWSVDVAKVAKELALPPTKVTDIFKSLGCSVDIASPAEREKLGLTQAEASKQRRAVLKAPVKFPKTKTRGPARH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.82
4 0.76
5 0.68
6 0.62
7 0.52
8 0.41
9 0.3
10 0.21
11 0.14
12 0.1
13 0.07
14 0.05
15 0.05
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.09
24 0.08
25 0.11
26 0.12
27 0.12
28 0.19
29 0.24
30 0.26
31 0.3
32 0.39
33 0.46
34 0.51
35 0.57
36 0.57
37 0.62
38 0.66
39 0.7
40 0.65
41 0.6
42 0.57
43 0.53
44 0.46
45 0.39
46 0.37
47 0.31
48 0.28
49 0.3
50 0.3
51 0.31
52 0.31
53 0.3
54 0.25
55 0.24
56 0.23
57 0.16
58 0.15
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.11
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.2
73 0.21
74 0.22
75 0.25
76 0.23
77 0.18
78 0.21
79 0.22
80 0.2
81 0.19
82 0.18
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.11
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.17
96 0.2
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.15
101 0.16
102 0.14
103 0.14
104 0.12
105 0.19
106 0.2
107 0.24
108 0.29
109 0.33
110 0.34
111 0.4
112 0.45
113 0.46
114 0.47
115 0.46
116 0.46
117 0.48
118 0.52
119 0.45
120 0.39
121 0.3
122 0.26
123 0.23
124 0.18
125 0.12
126 0.12
127 0.15
128 0.2
129 0.21
130 0.22
131 0.28
132 0.3
133 0.34
134 0.31
135 0.33
136 0.29
137 0.32
138 0.33
139 0.31
140 0.31
141 0.26
142 0.27
143 0.29
144 0.33
145 0.35
146 0.41
147 0.46
148 0.52
149 0.62
150 0.62
151 0.64
152 0.6
153 0.59
154 0.52
155 0.42
156 0.35
157 0.25
158 0.25
159 0.19
160 0.18
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.08
167 0.04
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.13
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.1
233 0.14
234 0.18
235 0.23
236 0.24
237 0.27
238 0.34
239 0.35
240 0.39
241 0.41
242 0.46
243 0.47
244 0.52
245 0.53
246 0.49
247 0.48
248 0.42
249 0.35
250 0.29
251 0.24
252 0.2
253 0.16
254 0.19
255 0.2
256 0.21
257 0.26
258 0.26
259 0.3
260 0.34
261 0.35
262 0.33
263 0.32
264 0.37
265 0.33
266 0.31
267 0.27
268 0.2
269 0.18
270 0.16
271 0.15
272 0.09
273 0.07
274 0.06
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.07
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.18
288 0.18
289 0.2
290 0.2
291 0.21
292 0.19
293 0.18
294 0.21
295 0.17
296 0.17
297 0.15
298 0.16
299 0.19
300 0.19
301 0.19
302 0.17
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.13
307 0.1
308 0.1
309 0.17
310 0.17
311 0.21
312 0.26
313 0.26
314 0.25
315 0.26
316 0.32
317 0.34
318 0.37
319 0.43
320 0.44
321 0.46
322 0.48
323 0.48
324 0.42
325 0.41
326 0.39
327 0.38
328 0.34
329 0.33
330 0.31
331 0.31
332 0.3
333 0.22
334 0.19
335 0.1
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.12
351 0.17
352 0.23
353 0.24
354 0.24
355 0.27
356 0.28
357 0.28
358 0.3
359 0.27
360 0.26
361 0.27
362 0.27
363 0.28
364 0.28
365 0.28
366 0.25
367 0.2
368 0.17
369 0.18
370 0.18
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.18
375 0.2
376 0.18
377 0.16
378 0.16
379 0.17
380 0.19
381 0.19
382 0.19
383 0.24
384 0.26
385 0.32
386 0.38
387 0.38
388 0.41
389 0.42
390 0.46
391 0.46
392 0.49
393 0.48
394 0.52
395 0.59
396 0.59
397 0.65
398 0.7
399 0.69
400 0.7
401 0.7
402 0.71
403 0.69
404 0.7
405 0.71