Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427XF63

Protein Details
Accession A0A427XF63    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-286EDTWTNAQRKRKRPSRANGNGRDDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-275RKRKRPS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011513  Nse1  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF07574  SMC_Nse1  
Amino Acid Sequences MAANGHPALRATDLHRIYIQSLLSRRAMTEDVAIEMYRRAVSAVLHTHPDFVPAHQRNRSGLKDFLDEISVLLEEVSMYVRRGQEGKHIWVVLCNTEAGDIAQHATDLTPLEITFYRTVVEAIITSYPANSVSTAEALHQTAELESTMKRSDAEHLLSALVSRQWLAKSKRGRYSLAPRAMLELDHYLKETYEDYVQKCKQCERLMLSGVACDAGDCDAHYHTHCYDKIKGSPRPKCRQCQADLNEIQPRAIGEGAIGRNEDTWTNAQRKRKRPSRANGNGRDDDDDEEDGNGASLEEEEVDRFTQSQAQSQSQSQSQSQSQAGPSRRRSGRETLVPDSIDDDDDDHDDHDDESAPPRRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.31
4 0.3
5 0.31
6 0.28
7 0.25
8 0.28
9 0.29
10 0.3
11 0.29
12 0.28
13 0.28
14 0.28
15 0.23
16 0.23
17 0.19
18 0.18
19 0.19
20 0.18
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.11
25 0.11
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.15
30 0.2
31 0.21
32 0.25
33 0.25
34 0.28
35 0.27
36 0.29
37 0.24
38 0.21
39 0.3
40 0.32
41 0.39
42 0.42
43 0.45
44 0.46
45 0.52
46 0.55
47 0.49
48 0.47
49 0.42
50 0.41
51 0.39
52 0.35
53 0.3
54 0.24
55 0.2
56 0.16
57 0.13
58 0.09
59 0.07
60 0.06
61 0.04
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.23
72 0.28
73 0.32
74 0.32
75 0.33
76 0.31
77 0.33
78 0.33
79 0.25
80 0.2
81 0.16
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.08
99 0.09
100 0.12
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.12
139 0.15
140 0.17
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.1
147 0.07
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.15
153 0.18
154 0.25
155 0.33
156 0.39
157 0.47
158 0.48
159 0.49
160 0.49
161 0.55
162 0.57
163 0.54
164 0.49
165 0.41
166 0.4
167 0.38
168 0.31
169 0.23
170 0.16
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.08
179 0.11
180 0.14
181 0.15
182 0.23
183 0.26
184 0.28
185 0.3
186 0.32
187 0.35
188 0.35
189 0.38
190 0.35
191 0.36
192 0.35
193 0.35
194 0.31
195 0.24
196 0.22
197 0.17
198 0.12
199 0.07
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.1
209 0.1
210 0.16
211 0.18
212 0.21
213 0.25
214 0.28
215 0.34
216 0.41
217 0.47
218 0.52
219 0.6
220 0.65
221 0.72
222 0.75
223 0.76
224 0.76
225 0.76
226 0.71
227 0.72
228 0.66
229 0.66
230 0.6
231 0.55
232 0.53
233 0.45
234 0.4
235 0.3
236 0.25
237 0.17
238 0.15
239 0.11
240 0.06
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.1
250 0.14
251 0.18
252 0.27
253 0.32
254 0.41
255 0.49
256 0.59
257 0.66
258 0.72
259 0.77
260 0.79
261 0.85
262 0.87
263 0.88
264 0.9
265 0.89
266 0.88
267 0.81
268 0.72
269 0.65
270 0.55
271 0.46
272 0.38
273 0.29
274 0.22
275 0.18
276 0.16
277 0.13
278 0.11
279 0.09
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.14
293 0.15
294 0.21
295 0.24
296 0.28
297 0.3
298 0.32
299 0.36
300 0.34
301 0.37
302 0.32
303 0.33
304 0.31
305 0.33
306 0.32
307 0.31
308 0.32
309 0.36
310 0.42
311 0.46
312 0.49
313 0.55
314 0.58
315 0.59
316 0.61
317 0.62
318 0.63
319 0.64
320 0.65
321 0.6
322 0.6
323 0.56
324 0.5
325 0.44
326 0.36
327 0.27
328 0.21
329 0.17
330 0.14
331 0.15
332 0.15
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.19
341 0.28