FuNGI

A0A427Y581

Protein Details

Accession

A0A427Y581

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-22	ADAFFLKKKTRRAFGNRISGA	Hydrophilic
27-49	SASSTPPPPRPTRPVRPPPPGAA	Hydrophilic
638-659	GDVPAAAKKKKKSRASSGSATP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
427-438	EGRKLRKMMRKR
475-541	KPSRHGSRAGSRGPDGRSGSPSRRTGPPTPERAGSLPGAGAALLAKRAASRAGSPRLRASSPLARGA
570-594	PGAREGTPSGTAAAPRPKSKSAKRK
644-651	AKKKKKSR

Subcellular Location(s)

mito 18, mito_nucl 12.999, cyto_mito 10.999, nucl 6.5, cyto_nucl 5.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MADAFFLKKKTRRAFGNRISGASQAVSASSTPPPPRPTRPVRPPPPGAAGPGPSTATAAAVKAESTPPASTDHLVEIQIVSADPDSGLRFNLMKMNSTRDVDPSHIPSPILLNRKQPGPKQPPQFQFDESGNIVGRFVYDEEGKPVLDDEGNPKVEKRSEMDMSLVGMAPGQASKRRGKRSTKEVFHQDLEVIKLRREEANPWVLEAKNPSENATVLPEHWVGRMMEPSSLPTILLINEGEGASFTMVPLGRTYRFNPERPFKVMDADQANKYYELQTKYKIHDRWGQRQESSGPGFVKPEPSSHVEDRAQRMEWNIMHNKGEVSRPTAKREAFEDDYVREGRNIGRGLEGGVDEELDYDANEDFQDDEDSNTFYFNKEEDEEKKLLEEKQKKEYRWANANVGDRPQIEDDGDDDDDDLFAEKLNREGRKLRKMMRKRGEEEGELYDSSDDDDDDSDSDDEGADKAKDVPGSAEKPSRHGSRAGSRGPDGRSGSPSRRTGPPTPERAGSLPGAGAALLAKRAASRAGSPRLRASSPLARGASPDMGRGGSPAPNGRSGSPSLTRGGSPAPGAREGTPSGTAAAPRPKSKSAKRKATSESPLRDTAPPASMTSATSVKRKSPEDSSSNPGTPRVSSPAGDVPAAAKKKKKSRASSGSATPAPFEGDSFVGMITSDDVLSWLRQQPSTIPMGKAIQAFAKKIPAGDNTKKNQDLFLHWIRTFTDKVEGKVLRLKAEYA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.81
3	0.85
4	0.78
5	0.72
6	0.65
7	0.56
8	0.47
9	0.37
10	0.28
11	0.17
12	0.14
13	0.12
14	0.11
15	0.12
16	0.14
17	0.2
18	0.23
19	0.3
20	0.37
21	0.43
22	0.51
23	0.58
24	0.65
25	0.69
26	0.77
27	0.81
28	0.84
29	0.86
30	0.84
31	0.8
32	0.77
33	0.68
34	0.62
35	0.55
36	0.48
37	0.41
38	0.37
39	0.32
40	0.24
41	0.23
42	0.19
43	0.16
44	0.14
45	0.12
46	0.11
47	0.1
48	0.1
49	0.11
50	0.12
51	0.12
52	0.14
53	0.14
54	0.14
55	0.18
56	0.2
57	0.2
58	0.2
59	0.22
60	0.21
61	0.2
62	0.2
63	0.16
64	0.14
65	0.13
66	0.11
67	0.09
68	0.07
69	0.07
70	0.06
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.1
75	0.11
76	0.12
77	0.13
78	0.19
79	0.18
80	0.22
81	0.24
82	0.3
83	0.33
84	0.35
85	0.34
86	0.32
87	0.34
88	0.32
89	0.35
90	0.33
91	0.31
92	0.3
93	0.28
94	0.26
95	0.29
96	0.32
97	0.34
98	0.31
99	0.37
100	0.39
101	0.46
102	0.52
103	0.52
104	0.57
105	0.6
106	0.65
107	0.68
108	0.74
109	0.74
110	0.72
111	0.69
112	0.61
113	0.55
114	0.48
115	0.43
116	0.34
117	0.29
118	0.25
119	0.22
120	0.2
121	0.15
122	0.14
123	0.1
124	0.1
125	0.1
126	0.11
127	0.12
128	0.16
129	0.17
130	0.16
131	0.15
132	0.15
133	0.14
134	0.12
135	0.13
136	0.14
137	0.2
138	0.22
139	0.22
140	0.23
141	0.25
142	0.27
143	0.29
144	0.28
145	0.28
146	0.28
147	0.29
148	0.29
149	0.26
150	0.24
151	0.23
152	0.19
153	0.11
154	0.09
155	0.08
156	0.06
157	0.07
158	0.08
159	0.12
160	0.16
161	0.25
162	0.34
163	0.43
164	0.52
165	0.61
166	0.68
167	0.74
168	0.8
169	0.78
170	0.78
171	0.77
172	0.74
173	0.65
174	0.57
175	0.48
176	0.39
177	0.35
178	0.33
179	0.26
180	0.22
181	0.22
182	0.23
183	0.26
184	0.26
185	0.26
186	0.26
187	0.32
188	0.31
189	0.3
190	0.32
191	0.28
192	0.28
193	0.28
194	0.25
195	0.22
196	0.22
197	0.23
198	0.21
199	0.21
200	0.2
201	0.21
202	0.17
203	0.14
204	0.16
205	0.16
206	0.15
207	0.15
208	0.16
209	0.13
210	0.14
211	0.16
212	0.14
213	0.14
214	0.14
215	0.15
216	0.15
217	0.14
218	0.13
219	0.1
220	0.1
221	0.09
222	0.1
223	0.08
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.11
238	0.12
239	0.15
240	0.17
241	0.26
242	0.3
243	0.35
244	0.42
245	0.47
246	0.49
247	0.51
248	0.53
249	0.43
250	0.42
251	0.38
252	0.36
253	0.34
254	0.32
255	0.29
256	0.27
257	0.27
258	0.23
259	0.23
260	0.21
261	0.21
262	0.22
263	0.23
264	0.28
265	0.31
266	0.35
267	0.42
268	0.41
269	0.4
270	0.44
271	0.49
272	0.53
273	0.57
274	0.56
275	0.49
276	0.49
277	0.46
278	0.44
279	0.39
280	0.32
281	0.25
282	0.22
283	0.23
284	0.21
285	0.24
286	0.19
287	0.18
288	0.18
289	0.21
290	0.26
291	0.25
292	0.3
293	0.28
294	0.32
295	0.34
296	0.34
297	0.3
298	0.26
299	0.26
300	0.25
301	0.23
302	0.24
303	0.24
304	0.24
305	0.24
306	0.23
307	0.23
308	0.2
309	0.22
310	0.17
311	0.19
312	0.26
313	0.27
314	0.32
315	0.37
316	0.36
317	0.34
318	0.36
319	0.37
320	0.31
321	0.31
322	0.27
323	0.23
324	0.25
325	0.24
326	0.22
327	0.15
328	0.13
329	0.12
330	0.15
331	0.15
332	0.12
333	0.12
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.11
338	0.07
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.06
354	0.05
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.08
366	0.12
367	0.14
368	0.18
369	0.19
370	0.18
371	0.19
372	0.2
373	0.22
374	0.28
375	0.33
376	0.32
377	0.42
378	0.48
379	0.48
380	0.54
381	0.57
382	0.54
383	0.54
384	0.54
385	0.49
386	0.49
387	0.51
388	0.44
389	0.39
390	0.34
391	0.26
392	0.24
393	0.2
394	0.15
395	0.12
396	0.11
397	0.1
398	0.11
399	0.1
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.04
407	0.04
408	0.06
409	0.06
410	0.1
411	0.15
412	0.16
413	0.18
414	0.26
415	0.34
416	0.41
417	0.47
418	0.52
419	0.57
420	0.66
421	0.74
422	0.76
423	0.76
424	0.71
425	0.73
426	0.68
427	0.59
428	0.52
429	0.44
430	0.37
431	0.28
432	0.25
433	0.17
434	0.13
435	0.12
436	0.09
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.07
443	0.07
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.11
457	0.15
458	0.17
459	0.2
460	0.25
461	0.24
462	0.28
463	0.33
464	0.34
465	0.31
466	0.32
467	0.34
468	0.36
469	0.43
470	0.42
471	0.39
472	0.38
473	0.41
474	0.39
475	0.39
476	0.34
477	0.29
478	0.31
479	0.33
480	0.36
481	0.39
482	0.4
483	0.39
484	0.41
485	0.46
486	0.47
487	0.51
488	0.54
489	0.54
490	0.54
491	0.51
492	0.48
493	0.43
494	0.39
495	0.3
496	0.23
497	0.15
498	0.13
499	0.11
500	0.09
501	0.07
502	0.05
503	0.05
504	0.04
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.07
510	0.08
511	0.13
512	0.2
513	0.29
514	0.32
515	0.34
516	0.38
517	0.41
518	0.4
519	0.38
520	0.37
521	0.35
522	0.35
523	0.4
524	0.36
525	0.32
526	0.33
527	0.33
528	0.32
529	0.25
530	0.22
531	0.17
532	0.16
533	0.16
534	0.16
535	0.15
536	0.12
537	0.14
538	0.17
539	0.18
540	0.22
541	0.23
542	0.23
543	0.25
544	0.24
545	0.27
546	0.26
547	0.26
548	0.24
549	0.24
550	0.23
551	0.21
552	0.21
553	0.17
554	0.16
555	0.17
556	0.17
557	0.18
558	0.2
559	0.19
560	0.21
561	0.21
562	0.21
563	0.19
564	0.17
565	0.17
566	0.16
567	0.16
568	0.18
569	0.25
570	0.27
571	0.3
572	0.34
573	0.4
574	0.48
575	0.57
576	0.64
577	0.66
578	0.73
579	0.74
580	0.77
581	0.77
582	0.78
583	0.77
584	0.76
585	0.72
586	0.66
587	0.64
588	0.58
589	0.53
590	0.45
591	0.39
592	0.33
593	0.28
594	0.23
595	0.23
596	0.21
597	0.19
598	0.2
599	0.22
600	0.21
601	0.26
602	0.27
603	0.3
604	0.36
605	0.39
606	0.4
607	0.43
608	0.49
609	0.5
610	0.53
611	0.54
612	0.54
613	0.53
614	0.49
615	0.44
616	0.38
617	0.33
618	0.31
619	0.3
620	0.27
621	0.24
622	0.27
623	0.3
624	0.3
625	0.28
626	0.25
627	0.21
628	0.27
629	0.32
630	0.32
631	0.33
632	0.4
633	0.5
634	0.6
635	0.68
636	0.69
637	0.76
638	0.81
639	0.83
640	0.82
641	0.78
642	0.76
643	0.69
644	0.6
645	0.5
646	0.4
647	0.35
648	0.27
649	0.21
650	0.15
651	0.12
652	0.12
653	0.12
654	0.11
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.07
659	0.07
660	0.06
661	0.06
662	0.07
663	0.08
664	0.09
665	0.14
666	0.18
667	0.21
668	0.22
669	0.23
670	0.25
671	0.29
672	0.35
673	0.35
674	0.3
675	0.31
676	0.33
677	0.35
678	0.33
679	0.3
680	0.3
681	0.29
682	0.3
683	0.29
684	0.32
685	0.3
686	0.3
687	0.33
688	0.34
689	0.4
690	0.47
691	0.54
692	0.55
693	0.63
694	0.66
695	0.62
696	0.6
697	0.54
698	0.51
699	0.5
700	0.52
701	0.5
702	0.46
703	0.47
704	0.43
705	0.44
706	0.39
707	0.33
708	0.34
709	0.3
710	0.32
711	0.4
712	0.39
713	0.38
714	0.45
715	0.45
716	0.4

A0A427Y581

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer