FuNGI

A0A427Y6M3

Protein Details

Accession

A0A427Y6M3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
255-277	SVPAKRGRGRPRGSKNKPKPGLP	Basic
310-331	EEKALGIKRKRGRPRKFPELGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
258-339	AKRGRGRPRGSKNKPKPGLPPPEPAPPVARRPKGRPPKVRTEEELAEIERRKEEKALGIKRKRGRPRKFPELGLVREMRLKK

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 13.5, nucl 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR000116 HMGA
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription

Amino Acid Sequences

MMGTKLLLSPTAGSDTQHQSTLASLTGPPDLDPALLALAASHASTQPTPIDPALFAIEQVVNDVNGGRIAPEDIGMGLVTAQREPERDEQQPEPEPEPEPELPQPQPQPHHVALDHTDVNIDIGHVSSVEVADPNHIPLDDDGIDPALREIVNSLTNAQQSHHPNLSGDNDERERLDRERLQHTLQTTLEDFAQGGFGSYGAIFNTNFPQSPNNHNLILPLGAEAEAHTHGGALGHNHNQSDSGSVGGGGGGESSVPAKRGRGRPRGSKNKPKPGLPPPEPAPPVARRPKGRPPKVRTEEELAEIERRKEEKALGIKRKRGRPRKFPELGLVREMRLKKNREAVQEKIRVLEERARLAGTDLDEHGHSQLAGDDGTHMDVEGESSTALREAVALGEQVAAVVARGQVHDDDDDDHDHDEHTDYSAWPYQDGQSLLEAVGGAMGVEVGVGVDRGGLDDVTRVLQQQAEGVLAQGDDEMRGVFSLADVSGHE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.28
3	0.29
4	0.29
5	0.27
6	0.23
7	0.24
8	0.24
9	0.18
10	0.13
11	0.12
12	0.12
13	0.14
14	0.14
15	0.13
16	0.13
17	0.13
18	0.12
19	0.11
20	0.1
21	0.08
22	0.08
23	0.07
24	0.05
25	0.06
26	0.06
27	0.06
28	0.06
29	0.07
30	0.09
31	0.1
32	0.12
33	0.13
34	0.15
35	0.18
36	0.18
37	0.18
38	0.16
39	0.18
40	0.19
41	0.17
42	0.15
43	0.14
44	0.15
45	0.13
46	0.15
47	0.13
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.06
55	0.06
56	0.07
57	0.07
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.06
64	0.06
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.09
69	0.1
70	0.12
71	0.16
72	0.23
73	0.27
74	0.31
75	0.36
76	0.37
77	0.43
78	0.47
79	0.47
80	0.42
81	0.39
82	0.37
83	0.33
84	0.36
85	0.3
86	0.28
87	0.27
88	0.29
89	0.29
90	0.33
91	0.37
92	0.36
93	0.39
94	0.4
95	0.43
96	0.4
97	0.43
98	0.37
99	0.36
100	0.33
101	0.34
102	0.3
103	0.23
104	0.22
105	0.17
106	0.17
107	0.13
108	0.1
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.06
118	0.06
119	0.08
120	0.08
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.1
125	0.09
126	0.13
127	0.12
128	0.11
129	0.11
130	0.11
131	0.11
132	0.1
133	0.1
134	0.07
135	0.06
136	0.06
137	0.07
138	0.08
139	0.09
140	0.1
141	0.11
142	0.12
143	0.14
144	0.14
145	0.14
146	0.19
147	0.22
148	0.27
149	0.27
150	0.25
151	0.24
152	0.26
153	0.28
154	0.26
155	0.22
156	0.22
157	0.21
158	0.21
159	0.22
160	0.22
161	0.22
162	0.2
163	0.25
164	0.24
165	0.28
166	0.32
167	0.34
168	0.34
169	0.34
170	0.33
171	0.3
172	0.27
173	0.24
174	0.2
175	0.18
176	0.16
177	0.13
178	0.12
179	0.08
180	0.08
181	0.06
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.04
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.14
197	0.15
198	0.22
199	0.25
200	0.26
201	0.26
202	0.26
203	0.25
204	0.22
205	0.2
206	0.14
207	0.09
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.08
222	0.11
223	0.12
224	0.12
225	0.12
226	0.12
227	0.12
228	0.11
229	0.09
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.03
237	0.03
238	0.02
239	0.02
240	0.02
241	0.03
242	0.04
243	0.05
244	0.06
245	0.08
246	0.15
247	0.24
248	0.33
249	0.42
250	0.48
251	0.57
252	0.67
253	0.76
254	0.79
255	0.82
256	0.83
257	0.84
258	0.82
259	0.76
260	0.73
261	0.71
262	0.72
263	0.64
264	0.61
265	0.53
266	0.56
267	0.53
268	0.46
269	0.42
270	0.35
271	0.4
272	0.42
273	0.44
274	0.42
275	0.47
276	0.57
277	0.63
278	0.7
279	0.72
280	0.7
281	0.76
282	0.79
283	0.77
284	0.7
285	0.65
286	0.57
287	0.49
288	0.44
289	0.33
290	0.3
291	0.27
292	0.24
293	0.21
294	0.2
295	0.18
296	0.18
297	0.19
298	0.22
299	0.3
300	0.39
301	0.46
302	0.52
303	0.59
304	0.65
305	0.73
306	0.76
307	0.78
308	0.78
309	0.79
310	0.81
311	0.84
312	0.81
313	0.74
314	0.73
315	0.69
316	0.62
317	0.56
318	0.48
319	0.38
320	0.39
321	0.39
322	0.37
323	0.38
324	0.4
325	0.4
326	0.48
327	0.53
328	0.56
329	0.59
330	0.59
331	0.61
332	0.63
333	0.58
334	0.51
335	0.47
336	0.39
337	0.37
338	0.37
339	0.3
340	0.25
341	0.26
342	0.24
343	0.22
344	0.22
345	0.21
346	0.15
347	0.14
348	0.12
349	0.12
350	0.13
351	0.13
352	0.13
353	0.11
354	0.09
355	0.07
356	0.08
357	0.07
358	0.07
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.08
393	0.09
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.12
398	0.14
399	0.16
400	0.16
401	0.17
402	0.15
403	0.15
404	0.15
405	0.15
406	0.13
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.16
411	0.2
412	0.2
413	0.19
414	0.2
415	0.2
416	0.23
417	0.24
418	0.21
419	0.17
420	0.18
421	0.17
422	0.16
423	0.13
424	0.08
425	0.07
426	0.06
427	0.04
428	0.03
429	0.03
430	0.02
431	0.02
432	0.02
433	0.02
434	0.02
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.08
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.13
450	0.13
451	0.14
452	0.14
453	0.13
454	0.12
455	0.12
456	0.11
457	0.1
458	0.09
459	0.08
460	0.07
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.07
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.07

A0A427Y6M3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer