FuNGI

A0A427Y4C9

Protein Details

Accession

A0A427Y4C9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-128	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
932-951	GRGRGRGRGNYGGGPGRGGS

Subcellular Location(s)

mito 14, cyto 8.5, cyto_nucl 6.5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIVLGMREDVPTKVRQEDGQIVEVPVQFASANPNGFEIDNLYLDMNGIVHPCTHPEGRPAPETEEEMMVEVFRYTERVVNMARPRKVLIMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAAEKEQERLESIRLFEAMGHPVSEETKNKKSWDSNAITPGTPFMDLLSASLKYWVAEKLNNDPGWKDLKVIISDASVPGEGEHKIVDWIRRQRTFPDWDPNTKHAIYGLDADLIMLALATHEPNFYVLREDVFFQGSKGPQACRNCGGLGHLSANCRKDKQIKDPNVVEEAKPVDPKPFLWLDVACLREYLFVELNVPAPFPYDAELAIDDWIFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDVLLKIWRDELAHMGGYLTNNGKVNLGRAQHILDGIASREDSIFQQRKQDEKRQEANQKRRRIEEHRRQDREAGIVDDFGAAGDGGPGTMNLNGTDYVQVSAPSTRGNLPPKVENAPAPRPGKKLSYAEQAASLKAGLAAMSGSNADVVNNRKAIRMANVTAAQKLKAELEGDGDKPEGDEAEAKKPGEAIEEEDAEEDADGEGDDEEAAQGDVSMTESEAKRGQKRKADDDEDDDDAEGGDDDESPANPGDATVPKKKLKVNPDGTVDYEDTVRLFEPGYRERYYRQKFGVELPDDDFMAKITYHYMEGLCWVLEYYYQGVPAWDWYYPYHHAPFAQDFKDVGKLNIQFKSGIPFTPFGQLLGVFPAASRIHLPEPLQKLMTDEDSPIIDFYPEDFDIDMDGKKMAWQGVALLPFIDQKRLLDALKSKVELLTADEKRRNKWGDSVMYISGENQLFDMFANDLYGIKPVVELPIDTKLSHGVSGKVRADPKCVPHSTLESPLVSIAECPDLETNSSLSVRYFFPQQLHRHRSQILNGFRPARPRLNEADKDRIRRGDFDTGFGGGRGRGRGRGNYGGGPGRGGSDRDRPPRGNAYSGSHAQPSAPPRNAYGGPPPGYGAGAYGGGGYQSGGGGGGGGYAPQQTAYGGSQPAAAYGGGGYGARGGYGGGGYSQPPRNPYGAPPPPSYGRPPASGYGGGAYGGAGPSGYGGGAYGGGAYGGAGGAPGGRGGYGGNHNNNNNYGGGGRGRGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.6
3	0.63
4	0.65
5	0.65
6	0.63
7	0.6
8	0.55
9	0.5
10	0.48
11	0.42
12	0.38
13	0.35
14	0.31
15	0.29
16	0.3
17	0.28
18	0.33
19	0.4
20	0.4
21	0.4
22	0.38
23	0.35
24	0.36
25	0.35
26	0.29
27	0.2
28	0.17
29	0.13
30	0.11
31	0.17
32	0.17
33	0.18
34	0.17
35	0.19
36	0.19
37	0.2
38	0.2
39	0.17
40	0.15
41	0.14
42	0.15
43	0.14
44	0.12
45	0.13
46	0.12
47	0.09
48	0.08
49	0.08
50	0.08
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.17
55	0.19
56	0.2
57	0.27
58	0.33
59	0.37
60	0.41
61	0.41
62	0.41
63	0.41
64	0.42
65	0.37
66	0.32
67	0.27
68	0.23
69	0.21
70	0.16
71	0.13
72	0.1
73	0.09
74	0.07
75	0.09
76	0.09
77	0.13
78	0.14
79	0.17
80	0.19
81	0.27
82	0.37
83	0.44
84	0.45
85	0.44
86	0.45
87	0.44
88	0.44
89	0.39
90	0.32
91	0.29
92	0.27
93	0.25
94	0.24
95	0.21
96	0.2
97	0.18
98	0.15
99	0.1
100	0.13
101	0.19
102	0.26
103	0.37
104	0.46
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.79
109	0.81
110	0.78
111	0.74
112	0.75
113	0.72
114	0.68
115	0.68
116	0.64
117	0.58
118	0.6
119	0.54
120	0.45
121	0.4
122	0.33
123	0.27
124	0.24
125	0.25
126	0.21
127	0.22
128	0.22
129	0.2
130	0.19
131	0.18
132	0.19
133	0.18
134	0.16
135	0.15
136	0.13
137	0.14
138	0.16
139	0.2
140	0.24
141	0.28
142	0.34
143	0.38
144	0.41
145	0.47
146	0.49
147	0.51
148	0.55
149	0.53
150	0.52
151	0.55
152	0.55
153	0.48
154	0.43
155	0.37
156	0.29
157	0.23
158	0.17
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.1
166	0.12
167	0.12
168	0.11
169	0.13
170	0.15
171	0.16
172	0.18
173	0.21
174	0.27
175	0.35
176	0.37
177	0.36
178	0.33
179	0.33
180	0.35
181	0.33
182	0.27
183	0.22
184	0.25
185	0.25
186	0.25
187	0.23
188	0.18
189	0.19
190	0.18
191	0.15
192	0.11
193	0.1
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.11
201	0.14
202	0.18
203	0.25
204	0.33
205	0.41
206	0.46
207	0.47
208	0.49
209	0.54
210	0.57
211	0.55
212	0.57
213	0.54
214	0.58
215	0.62
216	0.6
217	0.59
218	0.51
219	0.44
220	0.35
221	0.31
222	0.24
223	0.22
224	0.19
225	0.14
226	0.14
227	0.13
228	0.11
229	0.09
230	0.08
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.07
240	0.08
241	0.09
242	0.12
243	0.12
244	0.13
245	0.14
246	0.15
247	0.15
248	0.16
249	0.15
250	0.13
251	0.17
252	0.16
253	0.19
254	0.2
255	0.22
256	0.26
257	0.31
258	0.35
259	0.33
260	0.35
261	0.31
262	0.29
263	0.29
264	0.25
265	0.22
266	0.21
267	0.2
268	0.21
269	0.25
270	0.28
271	0.28
272	0.27
273	0.31
274	0.36
275	0.41
276	0.49
277	0.56
278	0.6
279	0.65
280	0.67
281	0.65
282	0.62
283	0.56
284	0.45
285	0.38
286	0.33
287	0.28
288	0.26
289	0.24
290	0.21
291	0.2
292	0.21
293	0.22
294	0.2
295	0.19
296	0.19
297	0.19
298	0.19
299	0.23
300	0.24
301	0.19
302	0.17
303	0.16
304	0.16
305	0.17
306	0.15
307	0.12
308	0.11
309	0.12
310	0.13
311	0.15
312	0.13
313	0.12
314	0.09
315	0.1
316	0.1
317	0.09
318	0.1
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.1
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.03
333	0.03
334	0.04
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.08
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.11
349	0.12
350	0.11
351	0.11
352	0.1
353	0.07
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.1
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.12
371	0.1
372	0.1
373	0.11
374	0.12
375	0.13
376	0.12
377	0.14
378	0.17
379	0.17
380	0.17
381	0.17
382	0.18
383	0.17
384	0.17
385	0.15
386	0.1
387	0.09
388	0.08
389	0.08
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.08
395	0.17
396	0.21
397	0.21
398	0.29
399	0.32
400	0.4
401	0.46
402	0.54
403	0.53
404	0.57
405	0.63
406	0.64
407	0.72
408	0.74
409	0.79
410	0.78
411	0.78
412	0.73
413	0.71
414	0.69
415	0.69
416	0.7
417	0.7
418	0.73
419	0.75
420	0.76
421	0.73
422	0.69
423	0.6
424	0.52
425	0.43
426	0.33
427	0.23
428	0.18
429	0.16
430	0.12
431	0.1
432	0.07
433	0.06
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.1
459	0.15
460	0.19
461	0.21
462	0.23
463	0.25
464	0.27
465	0.29
466	0.28
467	0.27
468	0.29
469	0.3
470	0.35
471	0.36
472	0.37
473	0.36
474	0.38
475	0.36
476	0.35
477	0.35
478	0.31
479	0.35
480	0.34
481	0.31
482	0.33
483	0.31
484	0.26
485	0.22
486	0.18
487	0.1
488	0.09
489	0.08
490	0.04
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.07
501	0.1
502	0.12
503	0.14
504	0.15
505	0.15
506	0.16
507	0.17
508	0.18
509	0.18
510	0.17
511	0.18
512	0.22
513	0.21
514	0.23
515	0.23
516	0.19
517	0.16
518	0.15
519	0.13
520	0.1
521	0.1
522	0.07
523	0.1
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.1
529	0.09
530	0.09
531	0.06
532	0.05
533	0.08
534	0.09
535	0.13
536	0.16
537	0.16
538	0.16
539	0.16
540	0.16
541	0.14
542	0.12
543	0.11
544	0.11
545	0.11
546	0.11
547	0.11
548	0.11
549	0.09
550	0.08
551	0.06
552	0.04
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.02
564	0.02
565	0.02
566	0.02
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.06
571	0.06
572	0.08
573	0.12
574	0.15
575	0.22
576	0.28
577	0.34
578	0.38
579	0.42
580	0.49
581	0.53
582	0.54
583	0.5
584	0.49
585	0.46
586	0.41
587	0.37
588	0.28
589	0.21
590	0.15
591	0.13
592	0.08
593	0.04
594	0.03
595	0.03
596	0.04
597	0.04
598	0.04
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.07
605	0.1
606	0.15
607	0.2
608	0.25
609	0.28
610	0.32
611	0.37
612	0.41
613	0.45
614	0.51
615	0.52
616	0.52
617	0.54
618	0.51
619	0.48
620	0.44
621	0.36
622	0.26
623	0.2
624	0.15
625	0.1
626	0.09
627	0.08
628	0.06
629	0.06
630	0.07
631	0.11
632	0.15
633	0.2
634	0.21
635	0.22
636	0.25
637	0.36
638	0.39
639	0.4
640	0.38
641	0.36
642	0.36
643	0.4
644	0.45
645	0.36
646	0.33
647	0.29
648	0.27
649	0.25
650	0.23
651	0.18
652	0.1
653	0.09
654	0.07
655	0.05
656	0.06
657	0.07
658	0.07
659	0.08
660	0.08
661	0.07
662	0.08
663	0.08
664	0.07
665	0.06
666	0.06
667	0.05
668	0.05
669	0.06
670	0.07
671	0.07
672	0.08
673	0.08
674	0.08
675	0.08
676	0.1
677	0.1
678	0.08
679	0.09
680	0.09
681	0.13
682	0.16
683	0.19
684	0.19
685	0.18
686	0.19
687	0.2
688	0.25
689	0.25
690	0.24
691	0.21
692	0.2
693	0.21
694	0.26
695	0.24
696	0.19
697	0.2
698	0.23
699	0.26
700	0.28
701	0.28
702	0.23
703	0.23
704	0.27
705	0.22
706	0.2
707	0.18
708	0.17
709	0.17
710	0.2
711	0.2
712	0.15
713	0.15
714	0.14
715	0.12
716	0.12
717	0.11
718	0.07
719	0.06
720	0.1
721	0.09
722	0.1
723	0.1
724	0.11
725	0.13
726	0.15
727	0.17
728	0.2
729	0.25
730	0.26
731	0.26
732	0.23
733	0.24
734	0.23
735	0.24
736	0.18
737	0.14
738	0.13
739	0.13
740	0.13
741	0.11
742	0.1
743	0.07
744	0.06
745	0.07
746	0.1
747	0.1
748	0.1
749	0.1
750	0.1
751	0.11
752	0.12
753	0.11
754	0.08
755	0.08
756	0.07
757	0.08
758	0.1
759	0.09
760	0.08
761	0.08
762	0.09
763	0.12
764	0.13
765	0.12
766	0.11
767	0.1
768	0.14
769	0.15
770	0.15
771	0.12
772	0.11
773	0.14
774	0.17
775	0.17
776	0.17
777	0.21
778	0.25
779	0.28
780	0.28
781	0.26
782	0.24
783	0.24
784	0.2
785	0.2
786	0.23
787	0.25
788	0.3
789	0.36
790	0.38
791	0.4
792	0.48
793	0.47
794	0.4
795	0.42
796	0.44
797	0.43
798	0.44
799	0.44
800	0.37
801	0.35
802	0.32
803	0.26
804	0.23
805	0.18
806	0.14
807	0.11
808	0.1
809	0.09
810	0.09
811	0.1
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.06
816	0.07
817	0.07
818	0.08
819	0.07
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.08
824	0.08
825	0.08
826	0.09
827	0.15
828	0.16
829	0.16
830	0.16
831	0.17
832	0.17
833	0.19
834	0.18
835	0.17
836	0.19
837	0.26
838	0.28
839	0.3
840	0.35
841	0.34
842	0.39
843	0.39
844	0.42
845	0.44
846	0.44
847	0.41
848	0.39
849	0.44
850	0.41
851	0.42
852	0.39
853	0.3
854	0.29
855	0.27
856	0.24
857	0.18
858	0.14
859	0.1
860	0.09
861	0.09
862	0.1
863	0.11
864	0.11
865	0.12
866	0.13
867	0.12
868	0.13
869	0.13
870	0.12
871	0.12
872	0.13
873	0.13
874	0.14
875	0.17
876	0.17
877	0.21
878	0.29
879	0.38
880	0.47
881	0.53
882	0.55
883	0.56
884	0.58
885	0.58
886	0.57
887	0.57
888	0.54
889	0.52
890	0.54
891	0.53
892	0.51
893	0.53
894	0.51
895	0.5
896	0.46
897	0.45
898	0.48
899	0.53
900	0.59
901	0.59
902	0.64
903	0.62
904	0.65
905	0.64
906	0.63
907	0.56
908	0.51
909	0.51
910	0.51
911	0.46
912	0.42
913	0.39
914	0.34
915	0.32
916	0.28
917	0.23
918	0.14
919	0.16
920	0.18
921	0.18
922	0.22
923	0.26
924	0.31
925	0.36
926	0.41
927	0.41
928	0.39
929	0.42
930	0.4
931	0.37
932	0.33
933	0.27
934	0.22
935	0.21
936	0.21
937	0.2
938	0.25
939	0.34
940	0.41
941	0.48
942	0.48
943	0.52
944	0.59
945	0.59
946	0.55
947	0.49
948	0.48
949	0.47
950	0.48
951	0.45
952	0.37
953	0.33
954	0.29
955	0.31
956	0.32
957	0.35
958	0.36
959	0.35
960	0.35
961	0.41
962	0.41
963	0.4
964	0.4
965	0.39
966	0.37
967	0.36
968	0.35
969	0.3
970	0.29
971	0.25
972	0.18
973	0.11
974	0.09
975	0.08
976	0.07
977	0.06
978	0.06
979	0.06
980	0.05
981	0.04
982	0.04
983	0.04
984	0.04
985	0.04
986	0.04
987	0.04
988	0.04
989	0.04
990	0.04
991	0.04
992	0.05
993	0.05
994	0.05
995	0.06
996	0.06
997	0.08
998	0.1
999	0.13
1000	0.13
1001	0.13
1002	0.15
1003	0.15
1004	0.15
1005	0.14
1006	0.12
1007	0.09
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.06
1011	0.06
1012	0.06
1013	0.06
1014	0.06
1015	0.05
1016	0.06
1017	0.05
1018	0.05
1019	0.06
1020	0.06
1021	0.05
1022	0.07
1023	0.09
1024	0.15
1025	0.21
1026	0.23
1027	0.26
1028	0.29
1029	0.31
1030	0.32
1031	0.36
1032	0.41
1033	0.44
1034	0.47
1035	0.48
1036	0.51
1037	0.52
1038	0.54
1039	0.54
1040	0.52
1041	0.47
1042	0.46
1043	0.46
1044	0.43
1045	0.43
1046	0.4
1047	0.35
1048	0.28
1049	0.24
1050	0.2
1051	0.16
1052	0.12
1053	0.09
1054	0.08
1055	0.07
1056	0.05
1057	0.05
1058	0.05
1059	0.05
1060	0.05
1061	0.04
1062	0.04
1063	0.04
1064	0.05
1065	0.05
1066	0.04
1067	0.04
1068	0.04
1069	0.04
1070	0.04
1071	0.03
1072	0.03
1073	0.03
1074	0.03
1075	0.03
1076	0.03
1077	0.04
1078	0.04
1079	0.04
1080	0.04
1081	0.05
1082	0.05
1083	0.1
1084	0.18
1085	0.25
1086	0.32
1087	0.39
1088	0.42
1089	0.45
1090	0.47
1091	0.44
1092	0.37
1093	0.3
1094	0.24
1095	0.2
1096	0.2
1097	0.21

A0A427Y4C9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer