Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427XHH0

Protein Details
Accession A0A427XHH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-348TEKPAPAAAKPKPKKKVVSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-53KRKGWGR
141-155GKGKKGKKNKGGKEP
310-324KNGQRGIAKRPGEEG
327-344VPTEKPAPAAAKPKPKKK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 6.5, cyto_nucl 6.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MARFTNIGMPRKTFVASAAEEARTEKEAPASPPPEAGPSTETSAGGKRKGWGRDPEIAKRAKDNTDRGEQRRLMRIDERAASTTCFACRGLGHSARDCPNILLAATGQNGSAAMLEADDMAARQAKALAEDGEAEAEAVEGKGKKGKKNKGGKEPAKDVTGASITGGKCYRCNSSAHSLKHCPKRADKSNPTPYATCFVCLGQGHLSAACPKNPRGVYVNGGSCKVCGSVAHRANDCPDDKRGPKPAFAEGDGFGYDPTRRGPAGRRENILGTGRGAGADEDDFMAASRGATANDGFEFQGNRTRHAPAKNGQRGIAKRPGEEGAFVPTEKPAPAAAKPKPKKKVVSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.24
4 0.26
5 0.28
6 0.26
7 0.26
8 0.27
9 0.27
10 0.23
11 0.23
12 0.19
13 0.21
14 0.24
15 0.27
16 0.35
17 0.35
18 0.33
19 0.33
20 0.33
21 0.32
22 0.28
23 0.27
24 0.21
25 0.21
26 0.24
27 0.23
28 0.23
29 0.21
30 0.27
31 0.29
32 0.29
33 0.28
34 0.29
35 0.35
36 0.41
37 0.47
38 0.49
39 0.51
40 0.58
41 0.62
42 0.65
43 0.66
44 0.65
45 0.58
46 0.56
47 0.55
48 0.53
49 0.54
50 0.53
51 0.51
52 0.56
53 0.63
54 0.61
55 0.65
56 0.62
57 0.6
58 0.62
59 0.57
60 0.52
61 0.49
62 0.49
63 0.45
64 0.44
65 0.41
66 0.35
67 0.34
68 0.3
69 0.27
70 0.24
71 0.19
72 0.17
73 0.15
74 0.13
75 0.13
76 0.15
77 0.21
78 0.24
79 0.27
80 0.28
81 0.34
82 0.36
83 0.37
84 0.34
85 0.27
86 0.23
87 0.2
88 0.17
89 0.12
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.04
100 0.04
101 0.03
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.06
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.11
130 0.14
131 0.2
132 0.3
133 0.39
134 0.47
135 0.57
136 0.65
137 0.71
138 0.79
139 0.8
140 0.77
141 0.74
142 0.66
143 0.57
144 0.49
145 0.38
146 0.29
147 0.22
148 0.16
149 0.1
150 0.12
151 0.11
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.14
156 0.16
157 0.18
158 0.15
159 0.17
160 0.19
161 0.27
162 0.34
163 0.35
164 0.39
165 0.43
166 0.49
167 0.57
168 0.58
169 0.53
170 0.53
171 0.59
172 0.63
173 0.67
174 0.68
175 0.7
176 0.74
177 0.74
178 0.7
179 0.61
180 0.53
181 0.47
182 0.38
183 0.28
184 0.19
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.15
189 0.11
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.18
198 0.18
199 0.25
200 0.25
201 0.27
202 0.26
203 0.28
204 0.28
205 0.3
206 0.34
207 0.27
208 0.28
209 0.26
210 0.22
211 0.2
212 0.17
213 0.12
214 0.09
215 0.12
216 0.2
217 0.26
218 0.29
219 0.3
220 0.3
221 0.32
222 0.36
223 0.34
224 0.27
225 0.26
226 0.29
227 0.31
228 0.37
229 0.44
230 0.41
231 0.43
232 0.43
233 0.45
234 0.4
235 0.39
236 0.36
237 0.27
238 0.26
239 0.22
240 0.2
241 0.14
242 0.12
243 0.11
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.14
249 0.22
250 0.31
251 0.42
252 0.46
253 0.47
254 0.48
255 0.49
256 0.51
257 0.46
258 0.37
259 0.27
260 0.23
261 0.2
262 0.17
263 0.16
264 0.11
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.21
288 0.21
289 0.24
290 0.25
291 0.3
292 0.34
293 0.38
294 0.44
295 0.44
296 0.54
297 0.59
298 0.59
299 0.59
300 0.61
301 0.6
302 0.61
303 0.62
304 0.53
305 0.46
306 0.46
307 0.46
308 0.38
309 0.36
310 0.3
311 0.26
312 0.25
313 0.24
314 0.21
315 0.19
316 0.2
317 0.18
318 0.18
319 0.16
320 0.18
321 0.24
322 0.32
323 0.39
324 0.49
325 0.58
326 0.67
327 0.72
328 0.77