Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427Y5Q8

Protein Details
Accession A0A427Y5Q8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
345-371PPPPPPEPEPVRRKRKLREYAREQAPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-362PPPPPPEPEPVRRKRKLR
445-459RKKGRAVMRRAAGKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003228  TFIID_TAF12_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03847  TFIID_20kDa  
CDD cd07981  TAF12  
Amino Acid Sequences MSQTPTARPSPAGSPAPRPPINLEGIYMNIPVLIARVRNNLLVANQIPPLRNLIANHAKEIIIFHARLGRGNPIINLPDVLNPTKKVGNSEAITTEQAFLASVQAGIAAARNTKPDPVLIANMQAKTAAARASPAAQAAANAAKANQAAAGTASTPGSAPGTPSPAPVGQPGQAQTPQQAAAAAQAAAAARAAAPQQPPPQQPPMSIAQVKELMALPTEQRNAKLEADAALRQRFVASCQFYQRRTQQVRTQQQPPPAAANVNAPKPQPPPPAQPVSTPTPPTGTASPATQTPAPQPAGAPQQPPPGPQQPQQPQQQQPPQPQQVQTPTTPAVVIPPRPVSPPPPPPPPPEPEPVRRKRKLREYAREQAPGLDLELGIDDLFSEVLDKLVDTVARDSVRLAAHRSSPRVELKDMAFVLEHYHDIVVPGFSAHVPKKVHNESEADRKKGRAVMRRAAGKRDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.5
3 0.58
4 0.56
5 0.54
6 0.51
7 0.48
8 0.5
9 0.43
10 0.37
11 0.29
12 0.29
13 0.28
14 0.23
15 0.17
16 0.12
17 0.11
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.13
23 0.19
24 0.21
25 0.22
26 0.23
27 0.24
28 0.22
29 0.26
30 0.24
31 0.21
32 0.23
33 0.24
34 0.24
35 0.23
36 0.27
37 0.23
38 0.25
39 0.23
40 0.29
41 0.36
42 0.36
43 0.37
44 0.35
45 0.33
46 0.3
47 0.3
48 0.25
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.22
53 0.22
54 0.24
55 0.25
56 0.26
57 0.24
58 0.26
59 0.26
60 0.24
61 0.25
62 0.24
63 0.23
64 0.18
65 0.18
66 0.21
67 0.23
68 0.22
69 0.22
70 0.24
71 0.27
72 0.27
73 0.27
74 0.28
75 0.32
76 0.3
77 0.31
78 0.3
79 0.29
80 0.29
81 0.26
82 0.22
83 0.15
84 0.14
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.08
97 0.09
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.15
102 0.14
103 0.17
104 0.17
105 0.2
106 0.18
107 0.24
108 0.26
109 0.25
110 0.24
111 0.21
112 0.19
113 0.16
114 0.16
115 0.11
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.16
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.14
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.05
180 0.07
181 0.08
182 0.12
183 0.17
184 0.22
185 0.25
186 0.28
187 0.34
188 0.33
189 0.32
190 0.32
191 0.3
192 0.3
193 0.29
194 0.25
195 0.21
196 0.22
197 0.21
198 0.19
199 0.16
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.14
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.13
213 0.13
214 0.15
215 0.16
216 0.16
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.12
222 0.12
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.25
227 0.29
228 0.3
229 0.35
230 0.38
231 0.42
232 0.44
233 0.47
234 0.47
235 0.54
236 0.61
237 0.6
238 0.63
239 0.57
240 0.59
241 0.55
242 0.5
243 0.42
244 0.34
245 0.29
246 0.22
247 0.25
248 0.22
249 0.23
250 0.23
251 0.21
252 0.23
253 0.25
254 0.31
255 0.31
256 0.32
257 0.37
258 0.41
259 0.46
260 0.45
261 0.44
262 0.42
263 0.41
264 0.4
265 0.35
266 0.29
267 0.25
268 0.25
269 0.25
270 0.22
271 0.18
272 0.15
273 0.15
274 0.15
275 0.14
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.18
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.18
285 0.25
286 0.26
287 0.26
288 0.23
289 0.3
290 0.3
291 0.32
292 0.34
293 0.34
294 0.36
295 0.38
296 0.46
297 0.46
298 0.53
299 0.6
300 0.62
301 0.61
302 0.66
303 0.71
304 0.67
305 0.68
306 0.7
307 0.68
308 0.65
309 0.61
310 0.57
311 0.56
312 0.53
313 0.44
314 0.39
315 0.34
316 0.29
317 0.27
318 0.22
319 0.2
320 0.21
321 0.22
322 0.21
323 0.23
324 0.24
325 0.26
326 0.28
327 0.28
328 0.32
329 0.41
330 0.43
331 0.49
332 0.52
333 0.56
334 0.6
335 0.6
336 0.57
337 0.55
338 0.56
339 0.57
340 0.64
341 0.67
342 0.72
343 0.75
344 0.78
345 0.8
346 0.84
347 0.85
348 0.85
349 0.86
350 0.85
351 0.87
352 0.86
353 0.8
354 0.69
355 0.6
356 0.51
357 0.4
358 0.32
359 0.22
360 0.14
361 0.1
362 0.1
363 0.08
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.15
384 0.18
385 0.21
386 0.21
387 0.23
388 0.23
389 0.3
390 0.36
391 0.39
392 0.38
393 0.41
394 0.47
395 0.47
396 0.46
397 0.43
398 0.39
399 0.42
400 0.39
401 0.34
402 0.26
403 0.22
404 0.23
405 0.2
406 0.19
407 0.12
408 0.12
409 0.11
410 0.12
411 0.13
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.16
418 0.17
419 0.22
420 0.25
421 0.3
422 0.39
423 0.46
424 0.49
425 0.47
426 0.51
427 0.5
428 0.59
429 0.62
430 0.59
431 0.54
432 0.52
433 0.53
434 0.53
435 0.56
436 0.54
437 0.55
438 0.58
439 0.64
440 0.72
441 0.71
442 0.73