Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427XT40

Protein Details
Accession A0A427XT40    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-30MSVPRPHKVKVKGRGRAPAAHydrophilic
290-318YERAQRTPTKRRYSPSPPRSPPTPRPRAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-32RPHKVKVKGRGRAPAAKS
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 11, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MPQPIALADRMSVPRPHKVKVKGRGRAPAAKSPNMAGNLNAPAVRPKWSTRGWKPYVAVRPKDRVASVASPSTKRLPFARAWDEYYRATRSERSNDYDRDRYSDDHRGYEESHKRTPGGQHDPSGQRGSPSRPNDNISRSPPSPSYPRRTSPPSPSCRHQGVHSPDRSSEYPRKHPRSYENEYTPWSLPASWAARRPLESRLTDQYSPPRNLVTRDERTVIVGPLPRDVRPEDVVRLMVCGVGPVRSVKMEGDMAIIVFEEGDAERAKERFHNKVVDQRYRLSVVSLPDYERAQRTPTKRRYSPSPPRSPPTPRPRAVWSPYTPRRNRSDAMLVDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.41
3 0.47
4 0.5
5 0.57
6 0.64
7 0.68
8 0.75
9 0.74
10 0.77
11 0.81
12 0.79
13 0.78
14 0.74
15 0.73
16 0.7
17 0.66
18 0.6
19 0.53
20 0.51
21 0.45
22 0.4
23 0.31
24 0.28
25 0.26
26 0.25
27 0.23
28 0.18
29 0.19
30 0.2
31 0.24
32 0.23
33 0.24
34 0.3
35 0.37
36 0.47
37 0.52
38 0.62
39 0.61
40 0.65
41 0.63
42 0.65
43 0.68
44 0.66
45 0.65
46 0.61
47 0.63
48 0.6
49 0.61
50 0.53
51 0.44
52 0.41
53 0.37
54 0.34
55 0.34
56 0.35
57 0.32
58 0.35
59 0.39
60 0.35
61 0.33
62 0.32
63 0.31
64 0.31
65 0.38
66 0.42
67 0.38
68 0.42
69 0.43
70 0.43
71 0.41
72 0.41
73 0.35
74 0.29
75 0.29
76 0.29
77 0.32
78 0.36
79 0.38
80 0.41
81 0.45
82 0.49
83 0.54
84 0.55
85 0.5
86 0.47
87 0.45
88 0.41
89 0.4
90 0.43
91 0.38
92 0.34
93 0.34
94 0.32
95 0.32
96 0.39
97 0.41
98 0.37
99 0.39
100 0.38
101 0.37
102 0.38
103 0.41
104 0.41
105 0.41
106 0.39
107 0.37
108 0.43
109 0.45
110 0.45
111 0.42
112 0.33
113 0.26
114 0.27
115 0.3
116 0.31
117 0.34
118 0.36
119 0.37
120 0.4
121 0.43
122 0.46
123 0.46
124 0.42
125 0.42
126 0.37
127 0.37
128 0.35
129 0.34
130 0.37
131 0.38
132 0.42
133 0.42
134 0.44
135 0.46
136 0.52
137 0.54
138 0.56
139 0.59
140 0.58
141 0.57
142 0.58
143 0.58
144 0.54
145 0.5
146 0.41
147 0.41
148 0.41
149 0.45
150 0.44
151 0.39
152 0.36
153 0.4
154 0.39
155 0.36
156 0.35
157 0.33
158 0.41
159 0.5
160 0.56
161 0.54
162 0.58
163 0.6
164 0.62
165 0.64
166 0.62
167 0.56
168 0.51
169 0.51
170 0.49
171 0.41
172 0.33
173 0.26
174 0.17
175 0.13
176 0.16
177 0.17
178 0.16
179 0.2
180 0.22
181 0.22
182 0.25
183 0.26
184 0.27
185 0.29
186 0.29
187 0.29
188 0.32
189 0.36
190 0.34
191 0.35
192 0.38
193 0.39
194 0.39
195 0.36
196 0.32
197 0.29
198 0.31
199 0.36
200 0.36
201 0.34
202 0.35
203 0.36
204 0.33
205 0.34
206 0.33
207 0.26
208 0.21
209 0.19
210 0.17
211 0.2
212 0.21
213 0.19
214 0.2
215 0.21
216 0.22
217 0.22
218 0.24
219 0.21
220 0.22
221 0.22
222 0.2
223 0.19
224 0.15
225 0.12
226 0.1
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.18
256 0.23
257 0.29
258 0.34
259 0.4
260 0.41
261 0.5
262 0.58
263 0.61
264 0.59
265 0.55
266 0.54
267 0.49
268 0.46
269 0.39
270 0.33
271 0.27
272 0.29
273 0.27
274 0.25
275 0.25
276 0.26
277 0.28
278 0.28
279 0.26
280 0.27
281 0.33
282 0.4
283 0.48
284 0.57
285 0.63
286 0.66
287 0.71
288 0.75
289 0.78
290 0.81
291 0.81
292 0.82
293 0.79
294 0.8
295 0.82
296 0.81
297 0.81
298 0.81
299 0.8
300 0.73
301 0.7
302 0.72
303 0.74
304 0.71
305 0.69
306 0.65
307 0.66
308 0.72
309 0.78
310 0.76
311 0.74
312 0.74
313 0.72
314 0.67
315 0.63
316 0.63