Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427XZC5

Protein Details
Accession A0A427XZC5    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48ALPQQARKKRETEKNAPLLSHydrophilic
61-84APDVTPKKSRPSSSKRIPPPEESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-38RKKR
53-77SGKRKDIRAPDVTPKKSRPSSSKRI
95-109RKHPAAAAGKGKAKA
642-665REKGIEGKKVLRQLERGAARKRKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, cyto 2.5, mito 2, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MEYNDVHSSSSRASTPPRRPGYRQGALPALPQQARKKRETEKNAPLLSSGTASGKRKDIRAPDVTPKKSRPSSSKRIPPPEESSSPDMGIISALRKHPAAAAGKGKAKAKDPLDVISSTRTARPTVQMSKSKQLSQEPRKDGTRGDPGRMKGSAFDKVQETLRKAPTTPERRRRLTPSSSPDPIDSLDGGSGHDDDDDDDDEVLSRPTVLGSRQDNVDRPRKAVVDLTYDSSVKTPTKAKKTISRTRSVISVATDDDVTPKATGSWRDTKISKKFDQPKPERDRQKAETNEHDQKAARKRGDPVQKHKIDKAPSGNEYFQTLSLKLPEDKQKALDEDKEEKDQQDRRLDYESKQKVEEMRKKGKAVSADANSFFSAIGPSLSQESRTERRKAKEEERITAKLKEATSYRFEGDETYRTPTKPANAFCDTSNLCPHPSPDLVDLRSHLEDTVAGRPEWHQTIDFCGLHRAEATTIPFGLQTGYPPKIDFERLDRRLETGFVRSRLRRVLHKPHLSKFFRRAAREIEDMGIAAWRDVSYQSSDKVLSVSSPGYYGEVGGAIMIQHFQHLVKWGHLPSLQTTAVHPLSVSDFIITVLVPEAAVLLIMEDKGWTGEQCRGDSWDKARAVAMELRTASAQFGRWRYREKGIEGKKVLRQLERGAARKRKRLEEEREMDEQNLLRRIDDDKQSARRAVDVETIVIVSTDTPDPSDYGEDDDWTEEAMAVATRVETSTKSTRLTESRHQGHSSTSSFGDWDDDFAIAAVNFDASSHQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.48
3 0.56
4 0.63
5 0.67
6 0.71
7 0.79
8 0.8
9 0.77
10 0.72
11 0.67
12 0.63
13 0.58
14 0.55
15 0.5
16 0.47
17 0.42
18 0.45
19 0.49
20 0.52
21 0.58
22 0.6
23 0.62
24 0.65
25 0.73
26 0.76
27 0.77
28 0.78
29 0.81
30 0.79
31 0.7
32 0.61
33 0.52
34 0.43
35 0.34
36 0.25
37 0.19
38 0.23
39 0.26
40 0.29
41 0.35
42 0.37
43 0.4
44 0.46
45 0.5
46 0.52
47 0.56
48 0.58
49 0.62
50 0.68
51 0.71
52 0.72
53 0.69
54 0.71
55 0.7
56 0.72
57 0.72
58 0.71
59 0.75
60 0.78
61 0.82
62 0.83
63 0.86
64 0.84
65 0.8
66 0.78
67 0.75
68 0.69
69 0.64
70 0.59
71 0.51
72 0.46
73 0.39
74 0.31
75 0.23
76 0.2
77 0.15
78 0.13
79 0.15
80 0.16
81 0.17
82 0.18
83 0.18
84 0.19
85 0.25
86 0.26
87 0.28
88 0.34
89 0.37
90 0.42
91 0.46
92 0.49
93 0.45
94 0.45
95 0.47
96 0.42
97 0.43
98 0.4
99 0.39
100 0.38
101 0.36
102 0.33
103 0.29
104 0.29
105 0.24
106 0.25
107 0.23
108 0.22
109 0.23
110 0.27
111 0.31
112 0.38
113 0.45
114 0.5
115 0.54
116 0.61
117 0.63
118 0.61
119 0.58
120 0.59
121 0.62
122 0.64
123 0.69
124 0.65
125 0.67
126 0.66
127 0.62
128 0.55
129 0.52
130 0.52
131 0.45
132 0.46
133 0.46
134 0.45
135 0.48
136 0.46
137 0.39
138 0.33
139 0.34
140 0.34
141 0.29
142 0.29
143 0.27
144 0.28
145 0.33
146 0.34
147 0.35
148 0.36
149 0.4
150 0.39
151 0.38
152 0.43
153 0.48
154 0.53
155 0.6
156 0.63
157 0.66
158 0.7
159 0.76
160 0.76
161 0.74
162 0.72
163 0.71
164 0.69
165 0.68
166 0.66
167 0.61
168 0.54
169 0.47
170 0.39
171 0.31
172 0.23
173 0.16
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.14
198 0.16
199 0.19
200 0.22
201 0.24
202 0.29
203 0.35
204 0.42
205 0.37
206 0.37
207 0.38
208 0.36
209 0.35
210 0.34
211 0.3
212 0.28
213 0.28
214 0.29
215 0.27
216 0.26
217 0.25
218 0.21
219 0.21
220 0.15
221 0.17
222 0.21
223 0.28
224 0.36
225 0.42
226 0.46
227 0.53
228 0.62
229 0.68
230 0.67
231 0.67
232 0.61
233 0.57
234 0.54
235 0.47
236 0.39
237 0.3
238 0.25
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.11
250 0.15
251 0.19
252 0.27
253 0.28
254 0.32
255 0.35
256 0.42
257 0.48
258 0.52
259 0.5
260 0.52
261 0.59
262 0.63
263 0.71
264 0.7
265 0.73
266 0.74
267 0.8
268 0.79
269 0.75
270 0.76
271 0.7
272 0.72
273 0.68
274 0.64
275 0.63
276 0.62
277 0.64
278 0.56
279 0.53
280 0.45
281 0.45
282 0.49
283 0.48
284 0.43
285 0.37
286 0.41
287 0.47
288 0.56
289 0.57
290 0.57
291 0.6
292 0.64
293 0.65
294 0.65
295 0.63
296 0.56
297 0.54
298 0.52
299 0.46
300 0.42
301 0.43
302 0.4
303 0.34
304 0.32
305 0.27
306 0.21
307 0.18
308 0.15
309 0.12
310 0.13
311 0.14
312 0.13
313 0.17
314 0.24
315 0.26
316 0.26
317 0.28
318 0.28
319 0.29
320 0.31
321 0.3
322 0.27
323 0.29
324 0.31
325 0.32
326 0.31
327 0.29
328 0.33
329 0.34
330 0.35
331 0.37
332 0.36
333 0.34
334 0.39
335 0.4
336 0.36
337 0.42
338 0.41
339 0.34
340 0.34
341 0.33
342 0.34
343 0.42
344 0.48
345 0.46
346 0.51
347 0.52
348 0.53
349 0.53
350 0.5
351 0.43
352 0.38
353 0.36
354 0.3
355 0.28
356 0.28
357 0.27
358 0.24
359 0.21
360 0.17
361 0.11
362 0.08
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.14
372 0.2
373 0.25
374 0.32
375 0.35
376 0.4
377 0.47
378 0.52
379 0.55
380 0.58
381 0.57
382 0.57
383 0.57
384 0.57
385 0.51
386 0.46
387 0.4
388 0.34
389 0.3
390 0.27
391 0.22
392 0.21
393 0.22
394 0.22
395 0.21
396 0.17
397 0.17
398 0.17
399 0.17
400 0.17
401 0.15
402 0.18
403 0.19
404 0.19
405 0.2
406 0.2
407 0.23
408 0.26
409 0.27
410 0.29
411 0.3
412 0.32
413 0.3
414 0.34
415 0.3
416 0.26
417 0.28
418 0.22
419 0.2
420 0.19
421 0.2
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.17
426 0.2
427 0.2
428 0.2
429 0.2
430 0.2
431 0.19
432 0.18
433 0.14
434 0.1
435 0.1
436 0.11
437 0.15
438 0.13
439 0.13
440 0.13
441 0.14
442 0.17
443 0.17
444 0.16
445 0.13
446 0.11
447 0.16
448 0.2
449 0.2
450 0.17
451 0.19
452 0.18
453 0.18
454 0.18
455 0.14
456 0.1
457 0.12
458 0.13
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.09
465 0.07
466 0.08
467 0.12
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.16
472 0.17
473 0.19
474 0.18
475 0.22
476 0.3
477 0.33
478 0.36
479 0.35
480 0.35
481 0.33
482 0.34
483 0.27
484 0.24
485 0.26
486 0.26
487 0.31
488 0.31
489 0.34
490 0.38
491 0.39
492 0.41
493 0.45
494 0.52
495 0.57
496 0.65
497 0.68
498 0.68
499 0.76
500 0.72
501 0.69
502 0.66
503 0.64
504 0.61
505 0.59
506 0.55
507 0.51
508 0.51
509 0.47
510 0.41
511 0.33
512 0.27
513 0.23
514 0.2
515 0.15
516 0.1
517 0.07
518 0.06
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.08
523 0.1
524 0.12
525 0.13
526 0.15
527 0.15
528 0.15
529 0.15
530 0.13
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.08
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.08
540 0.07
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.05
552 0.07
553 0.13
554 0.14
555 0.15
556 0.2
557 0.2
558 0.22
559 0.24
560 0.24
561 0.2
562 0.24
563 0.23
564 0.19
565 0.19
566 0.23
567 0.21
568 0.2
569 0.17
570 0.13
571 0.15
572 0.15
573 0.15
574 0.09
575 0.08
576 0.09
577 0.09
578 0.08
579 0.06
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.03
588 0.03
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.06
596 0.06
597 0.08
598 0.14
599 0.17
600 0.19
601 0.2
602 0.24
603 0.26
604 0.31
605 0.33
606 0.35
607 0.32
608 0.32
609 0.32
610 0.28
611 0.28
612 0.28
613 0.26
614 0.21
615 0.21
616 0.21
617 0.21
618 0.2
619 0.18
620 0.14
621 0.17
622 0.18
623 0.25
624 0.31
625 0.34
626 0.41
627 0.44
628 0.52
629 0.54
630 0.54
631 0.58
632 0.59
633 0.65
634 0.64
635 0.65
636 0.61
637 0.63
638 0.61
639 0.55
640 0.5
641 0.45
642 0.49
643 0.51
644 0.54
645 0.57
646 0.62
647 0.66
648 0.7
649 0.73
650 0.73
651 0.75
652 0.78
653 0.78
654 0.79
655 0.77
656 0.75
657 0.73
658 0.65
659 0.55
660 0.48
661 0.41
662 0.35
663 0.34
664 0.29
665 0.24
666 0.24
667 0.27
668 0.3
669 0.35
670 0.37
671 0.39
672 0.46
673 0.51
674 0.53
675 0.5
676 0.46
677 0.41
678 0.37
679 0.35
680 0.29
681 0.25
682 0.21
683 0.21
684 0.17
685 0.16
686 0.13
687 0.07
688 0.09
689 0.09
690 0.09
691 0.1
692 0.11
693 0.12
694 0.13
695 0.16
696 0.14
697 0.17
698 0.18
699 0.18
700 0.18
701 0.18
702 0.17
703 0.15
704 0.14
705 0.09
706 0.09
707 0.08
708 0.07
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.07
714 0.08
715 0.09
716 0.15
717 0.22
718 0.26
719 0.29
720 0.31
721 0.37
722 0.43
723 0.49
724 0.52
725 0.56
726 0.59
727 0.62
728 0.62
729 0.56
730 0.55
731 0.54
732 0.47
733 0.39
734 0.33
735 0.28
736 0.26
737 0.25
738 0.24
739 0.17
740 0.17
741 0.15
742 0.13
743 0.13
744 0.12
745 0.13
746 0.09
747 0.1
748 0.07
749 0.07
750 0.06
751 0.07