Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427Y546

Protein Details
Accession A0A427Y546    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-46LDRPGPSRTRGGKKAKAKGKGKGNMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-44GPSRTRGGKKAKAKGKGKG
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 11, cyto 9, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR012170  TFIIH_SSL1/p44  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04056  Ssl1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50234  VWFA  
Amino Acid Sequences MPADELYKPASPRSEVDSDDDLDRPGPSRTRGGKKAKAKGKGKGNMNAWEATYKRSWDVVQEDEQGGLQAAVDNFIARGRRKRALQSEAPLRRSLVRHMFIVVDLSESMRDKDFRPSRFDLTLQYLRSFVVEWFDQNPLGQVGIIVLRDRLAEVLVPMGGNPQEIIASLSDKRKLEPSGEPSLQNGLVMARGGMSHLPSTSSLEILVLFSAISTADPDGVMNIHQVLDELVTGRVRTTIISLSAEIKICRQIADRTGGRFGVAIDEDHYKDLLWETIPPPAQTVAAPTTLNVRDALARGGKAPGAGVKPAGDLMVMGFPTRLPAGESFCACHGLLKRGGYMCPRCGAKLCDVPTDCEVCGLMVVSSPHLARSFWLLFPVAAYGTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.38
4 0.37
5 0.35
6 0.34
7 0.33
8 0.27
9 0.23
10 0.22
11 0.18
12 0.19
13 0.21
14 0.23
15 0.31
16 0.4
17 0.48
18 0.57
19 0.66
20 0.71
21 0.76
22 0.83
23 0.82
24 0.83
25 0.81
26 0.8
27 0.81
28 0.79
29 0.77
30 0.76
31 0.73
32 0.7
33 0.66
34 0.58
35 0.49
36 0.46
37 0.39
38 0.34
39 0.31
40 0.26
41 0.24
42 0.25
43 0.25
44 0.25
45 0.29
46 0.3
47 0.31
48 0.33
49 0.31
50 0.29
51 0.28
52 0.23
53 0.18
54 0.13
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.1
63 0.15
64 0.16
65 0.24
66 0.3
67 0.36
68 0.41
69 0.5
70 0.57
71 0.6
72 0.63
73 0.64
74 0.68
75 0.69
76 0.67
77 0.59
78 0.52
79 0.48
80 0.43
81 0.42
82 0.4
83 0.35
84 0.33
85 0.33
86 0.32
87 0.27
88 0.27
89 0.19
90 0.12
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.13
98 0.13
99 0.23
100 0.3
101 0.31
102 0.38
103 0.41
104 0.44
105 0.45
106 0.44
107 0.38
108 0.39
109 0.41
110 0.35
111 0.31
112 0.27
113 0.25
114 0.24
115 0.21
116 0.13
117 0.11
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.13
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.05
154 0.07
155 0.09
156 0.12
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.19
161 0.2
162 0.22
163 0.24
164 0.28
165 0.31
166 0.32
167 0.32
168 0.29
169 0.29
170 0.26
171 0.2
172 0.15
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.18
240 0.26
241 0.27
242 0.26
243 0.28
244 0.27
245 0.24
246 0.22
247 0.18
248 0.14
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.11
257 0.1
258 0.11
259 0.1
260 0.08
261 0.1
262 0.11
263 0.16
264 0.17
265 0.17
266 0.18
267 0.17
268 0.17
269 0.14
270 0.17
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.18
276 0.18
277 0.19
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.15
282 0.19
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.13
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.09
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.11
311 0.16
312 0.2
313 0.21
314 0.21
315 0.21
316 0.24
317 0.22
318 0.24
319 0.22
320 0.25
321 0.28
322 0.28
323 0.32
324 0.31
325 0.34
326 0.39
327 0.41
328 0.38
329 0.4
330 0.4
331 0.38
332 0.41
333 0.41
334 0.4
335 0.43
336 0.42
337 0.45
338 0.45
339 0.47
340 0.46
341 0.45
342 0.38
343 0.3
344 0.27
345 0.18
346 0.17
347 0.13
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.13
353 0.13
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.14
358 0.21
359 0.23
360 0.21
361 0.24
362 0.22
363 0.21
364 0.22
365 0.22