Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427XQU6

Protein Details
Accession A0A427XQU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-363IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYAGGEITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-354FRKEKNKKKR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MSAQQDTKALDAAILAYLVARGLTRSTKAFEKEASATQGTKGSLEAAWSAGQPKKEADSDSDSDSSSDSESESEEEKKDVEKAEVTPKQVAPAQVPLPESSSDSSSSDSSDSDSGSESDTESSDSDCDSDSDSDSDSEDVKPKVEKAASPVSASSSSGSSTVAEVKKEEPKSTSDSDSDSSSDSDSDSDSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSDSSSSEEEDAKPVIGKRARSASSSSSSSSEDEAPPAKKREVEESSSAPSGVSTPFAPSGTSTPNGGEKRARGGGNNNVRFERIKQDNVTFHDQRLMDNSFDAHIRNGANTNDFGARASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYAGGEITLQTHSIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.08
10 0.12
11 0.15
12 0.18
13 0.21
14 0.28
15 0.31
16 0.34
17 0.33
18 0.35
19 0.36
20 0.38
21 0.39
22 0.35
23 0.32
24 0.3
25 0.32
26 0.27
27 0.24
28 0.2
29 0.16
30 0.14
31 0.15
32 0.13
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.16
37 0.18
38 0.19
39 0.19
40 0.2
41 0.23
42 0.25
43 0.26
44 0.26
45 0.3
46 0.31
47 0.34
48 0.33
49 0.3
50 0.27
51 0.26
52 0.22
53 0.15
54 0.13
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.12
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.18
69 0.2
70 0.29
71 0.32
72 0.34
73 0.36
74 0.34
75 0.35
76 0.35
77 0.33
78 0.25
79 0.27
80 0.26
81 0.24
82 0.25
83 0.23
84 0.22
85 0.21
86 0.21
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.19
134 0.26
135 0.26
136 0.25
137 0.25
138 0.23
139 0.22
140 0.22
141 0.17
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.07
147 0.07
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.16
153 0.23
154 0.24
155 0.24
156 0.2
157 0.22
158 0.27
159 0.28
160 0.28
161 0.22
162 0.22
163 0.22
164 0.22
165 0.2
166 0.16
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.11
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.17
217 0.18
218 0.19
219 0.21
220 0.27
221 0.28
222 0.29
223 0.31
224 0.29
225 0.3
226 0.31
227 0.29
228 0.24
229 0.25
230 0.24
231 0.22
232 0.2
233 0.16
234 0.17
235 0.19
236 0.2
237 0.23
238 0.26
239 0.25
240 0.26
241 0.27
242 0.34
243 0.35
244 0.37
245 0.36
246 0.36
247 0.38
248 0.35
249 0.33
250 0.24
251 0.19
252 0.16
253 0.12
254 0.11
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.14
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.23
267 0.24
268 0.25
269 0.26
270 0.24
271 0.29
272 0.34
273 0.33
274 0.28
275 0.33
276 0.4
277 0.48
278 0.52
279 0.49
280 0.44
281 0.45
282 0.44
283 0.41
284 0.4
285 0.35
286 0.36
287 0.37
288 0.43
289 0.46
290 0.5
291 0.56
292 0.49
293 0.43
294 0.44
295 0.4
296 0.35
297 0.34
298 0.31
299 0.23
300 0.22
301 0.22
302 0.17
303 0.18
304 0.18
305 0.13
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.18
310 0.19
311 0.21
312 0.2
313 0.22
314 0.2
315 0.19
316 0.19
317 0.17
318 0.17
319 0.16
320 0.18
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.18
328 0.21
329 0.21
330 0.25
331 0.28
332 0.35
333 0.44
334 0.54
335 0.62
336 0.69
337 0.77
338 0.81
339 0.87
340 0.9
341 0.88
342 0.87
343 0.83
344 0.82
345 0.78
346 0.7
347 0.6
348 0.5
349 0.41
350 0.32
351 0.27
352 0.18
353 0.13