Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4JF27

Protein Details
Accession A0A3N4JF27    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-258GESREKTRIRERKQKNLLDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-290PRENRRGGDRGGRGRGDRGRGRGGGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 13, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSASVASKNLFDLLGNDIEDPDASPPPPPREVIKSSTTSKKKEEKLAPGASSDTGGYAPRDNAGRSYSGNERAYRDRDAGRQNNLSKDTTEGAAPRGGHRGGRGGRRDYDRHSATGRTDSDKKVSQGWGATEGTSEWNDELVGEQLAQKDAIGADPADPNDVAPADTPAGEEEAEEGLKPEEEKVKTLDEYHAELEQRRADLGPPTEARRPNEGSQNDKKWAGKELSRKEEEEDVFFAGESREKTRIRERKQKNLLDIETRYAEPRENRRGGDRGGRGRGDRGRGRGGGGDRLPRNDNYHHGGQKSGGHVDVADKSAFPALGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.15
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.12
9 0.12
10 0.11
11 0.16
12 0.22
13 0.27
14 0.3
15 0.31
16 0.34
17 0.39
18 0.44
19 0.45
20 0.45
21 0.45
22 0.49
23 0.57
24 0.59
25 0.57
26 0.6
27 0.64
28 0.65
29 0.69
30 0.71
31 0.71
32 0.72
33 0.74
34 0.66
35 0.58
36 0.53
37 0.43
38 0.36
39 0.26
40 0.18
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.16
48 0.15
49 0.17
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.22
54 0.24
55 0.3
56 0.34
57 0.34
58 0.36
59 0.4
60 0.43
61 0.42
62 0.4
63 0.36
64 0.39
65 0.46
66 0.48
67 0.48
68 0.52
69 0.53
70 0.54
71 0.54
72 0.48
73 0.39
74 0.36
75 0.31
76 0.24
77 0.21
78 0.16
79 0.15
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.18
84 0.18
85 0.17
86 0.17
87 0.23
88 0.25
89 0.32
90 0.36
91 0.36
92 0.41
93 0.46
94 0.48
95 0.46
96 0.5
97 0.44
98 0.41
99 0.4
100 0.36
101 0.33
102 0.35
103 0.32
104 0.28
105 0.3
106 0.3
107 0.32
108 0.33
109 0.32
110 0.29
111 0.29
112 0.25
113 0.23
114 0.22
115 0.21
116 0.18
117 0.17
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.11
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.12
169 0.12
170 0.14
171 0.15
172 0.17
173 0.17
174 0.19
175 0.2
176 0.16
177 0.17
178 0.17
179 0.18
180 0.16
181 0.16
182 0.18
183 0.17
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.15
189 0.16
190 0.18
191 0.19
192 0.22
193 0.27
194 0.31
195 0.33
196 0.35
197 0.38
198 0.36
199 0.43
200 0.43
201 0.46
202 0.5
203 0.52
204 0.5
205 0.48
206 0.47
207 0.39
208 0.41
209 0.37
210 0.35
211 0.4
212 0.45
213 0.5
214 0.52
215 0.51
216 0.48
217 0.51
218 0.46
219 0.39
220 0.31
221 0.23
222 0.21
223 0.19
224 0.17
225 0.11
226 0.13
227 0.12
228 0.14
229 0.2
230 0.21
231 0.26
232 0.36
233 0.46
234 0.52
235 0.61
236 0.66
237 0.71
238 0.8
239 0.82
240 0.79
241 0.77
242 0.72
243 0.68
244 0.62
245 0.55
246 0.48
247 0.42
248 0.36
249 0.29
250 0.3
251 0.3
252 0.37
253 0.43
254 0.44
255 0.46
256 0.49
257 0.53
258 0.52
259 0.54
260 0.53
261 0.52
262 0.54
263 0.56
264 0.52
265 0.55
266 0.56
267 0.55
268 0.53
269 0.5
270 0.5
271 0.47
272 0.47
273 0.46
274 0.43
275 0.42
276 0.4
277 0.43
278 0.4
279 0.44
280 0.46
281 0.43
282 0.45
283 0.41
284 0.43
285 0.41
286 0.47
287 0.48
288 0.45
289 0.44
290 0.42
291 0.42
292 0.4
293 0.36
294 0.28
295 0.23
296 0.22
297 0.24
298 0.24
299 0.22
300 0.18
301 0.16
302 0.16
303 0.18