FuNGI

A0A3N4IWV1

Protein Details

Accession

A0A3N4IWV1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
86-105	APIVKFKPRNPGRRTQEERE	Hydrophilic
332-352	SSPEIKKKEIKSPTKRRRSSS	Hydrophilic
594-617	FDDLVRSEKRRARKGRAKEPEVVS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-10	KPR
118-143	PPRPRGNRSDRGTRGGRGGRGGRGGR
335-354	EIKKKEIKSPTKRRRSSSNR
601-611	EKRRARKGRAK

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRLKAKPRLVARRGAAKSNSTPGSGDATPPENPTDSPAPVTDPSSETATATETLQNVPIPPPVGRLDSLSTARTPSVGPRGTTAPIVKFKPRNPGRRTQEERENLNARFQHATDPPPRPRGNRSDRGTRGGRGGRGGRGGRGGYDAVSAYAPATASGPFALGSVSTAGVPRSKVAVERGMDRAKYKEFARSGAKRDIRTRTKLEGGGEDGQTPGYTSSDDSDGPRMDVEYISLLDQDKSEDEDGDKEMNGGSSHWGAGAPVRVHRSEHVDRTATVNTDSSSKKGKSDSRIKNENLFEDSVKVKEEPVDGNMITEWPSSPEASRKIKTSTSSPEIKKKEIKSPTKRRRSSSNRTKPLFTNAESKRELKVEENDRLKTLEELTGSFTDIKLDKDGDAGMESRNSETENQIFFFQFPTMLPQLVAPPIKEEKPQEAPAAPTDPNSTSTEKPSVGSSTIPPSDISPKVRTAVVPQASGPPSSSAPPEIKMPPPPIPKQTLKAQQALLEAFPPAGIAGKLRIHKSGRMTILWGNPADGEPFEMDVSRGTDCLFLQEAVVVKEVSPWGEEDVDEKGVRKGAAFSLGQVKGRYIVSPDFDDLVRSEKRRARKGRAKEPEVVS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.7
3	0.68
4	0.62
5	0.58
6	0.58
7	0.57
8	0.53
9	0.44
10	0.41
11	0.35
12	0.37
13	0.3
14	0.28
15	0.23
16	0.25
17	0.25
18	0.26
19	0.27
20	0.23
21	0.23
22	0.27
23	0.27
24	0.25
25	0.26
26	0.25
27	0.26
28	0.26
29	0.28
30	0.25
31	0.22
32	0.23
33	0.24
34	0.23
35	0.2
36	0.19
37	0.19
38	0.17
39	0.17
40	0.17
41	0.15
42	0.15
43	0.17
44	0.17
45	0.16
46	0.17
47	0.18
48	0.18
49	0.17
50	0.2
51	0.21
52	0.23
53	0.22
54	0.23
55	0.24
56	0.27
57	0.29
58	0.27
59	0.25
60	0.24
61	0.23
62	0.21
63	0.19
64	0.19
65	0.26
66	0.27
67	0.27
68	0.29
69	0.32
70	0.32
71	0.35
72	0.33
73	0.31
74	0.34
75	0.37
76	0.43
77	0.47
78	0.49
79	0.56
80	0.62
81	0.66
82	0.66
83	0.73
84	0.73
85	0.77
86	0.82
87	0.78
88	0.79
89	0.76
90	0.74
91	0.72
92	0.7
93	0.59
94	0.58
95	0.51
96	0.44
97	0.39
98	0.35
99	0.33
100	0.3
101	0.36
102	0.37
103	0.44
104	0.47
105	0.53
106	0.57
107	0.55
108	0.6
109	0.64
110	0.66
111	0.67
112	0.67
113	0.69
114	0.69
115	0.71
116	0.67
117	0.59
118	0.57
119	0.52
120	0.48
121	0.43
122	0.43
123	0.38
124	0.41
125	0.4
126	0.34
127	0.32
128	0.31
129	0.25
130	0.24
131	0.21
132	0.15
133	0.15
134	0.13
135	0.1
136	0.1
137	0.09
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.07
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.1
161	0.11
162	0.13
163	0.15
164	0.21
165	0.2
166	0.23
167	0.28
168	0.3
169	0.31
170	0.31
171	0.31
172	0.27
173	0.29
174	0.27
175	0.29
176	0.27
177	0.31
178	0.38
179	0.4
180	0.43
181	0.49
182	0.53
183	0.5
184	0.55
185	0.6
186	0.59
187	0.6
188	0.59
189	0.54
190	0.54
191	0.52
192	0.47
193	0.39
194	0.36
195	0.33
196	0.28
197	0.24
198	0.19
199	0.16
200	0.15
201	0.13
202	0.09
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.07
207	0.09
208	0.1
209	0.11
210	0.13
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.12
215	0.11
216	0.1
217	0.09
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.09
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.07
247	0.1
248	0.1
249	0.12
250	0.14
251	0.15
252	0.16
253	0.17
254	0.24
255	0.25
256	0.28
257	0.28
258	0.27
259	0.27
260	0.3
261	0.3
262	0.22
263	0.19
264	0.16
265	0.13
266	0.16
267	0.16
268	0.14
269	0.19
270	0.19
271	0.2
272	0.25
273	0.3
274	0.34
275	0.45
276	0.52
277	0.55
278	0.61
279	0.61
280	0.63
281	0.59
282	0.52
283	0.43
284	0.35
285	0.27
286	0.22
287	0.21
288	0.14
289	0.14
290	0.12
291	0.1
292	0.1
293	0.11
294	0.1
295	0.1
296	0.12
297	0.11
298	0.11
299	0.1
300	0.09
301	0.08
302	0.08
303	0.07
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.08
308	0.12
309	0.18
310	0.23
311	0.24
312	0.25
313	0.27
314	0.29
315	0.31
316	0.31
317	0.32
318	0.32
319	0.38
320	0.39
321	0.45
322	0.46
323	0.48
324	0.51
325	0.48
326	0.51
327	0.53
328	0.6
329	0.62
330	0.71
331	0.77
332	0.81
333	0.83
334	0.78
335	0.79
336	0.79
337	0.79
338	0.79
339	0.79
340	0.78
341	0.75
342	0.74
343	0.65
344	0.63
345	0.56
346	0.47
347	0.46
348	0.39
349	0.43
350	0.42
351	0.41
352	0.35
353	0.32
354	0.31
355	0.25
356	0.31
357	0.3
358	0.36
359	0.39
360	0.38
361	0.37
362	0.37
363	0.33
364	0.26
365	0.22
366	0.16
367	0.12
368	0.12
369	0.14
370	0.14
371	0.14
372	0.13
373	0.12
374	0.12
375	0.12
376	0.13
377	0.11
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.1
391	0.1
392	0.12
393	0.15
394	0.15
395	0.16
396	0.17
397	0.17
398	0.16
399	0.16
400	0.13
401	0.1
402	0.09
403	0.13
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.12
408	0.13
409	0.16
410	0.17
411	0.13
412	0.15
413	0.18
414	0.2
415	0.23
416	0.24
417	0.26
418	0.31
419	0.34
420	0.32
421	0.31
422	0.31
423	0.3
424	0.31
425	0.25
426	0.2
427	0.21
428	0.19
429	0.21
430	0.23
431	0.24
432	0.22
433	0.26
434	0.28
435	0.26
436	0.25
437	0.24
438	0.23
439	0.2
440	0.2
441	0.18
442	0.2
443	0.21
444	0.2
445	0.19
446	0.19
447	0.24
448	0.27
449	0.29
450	0.26
451	0.28
452	0.29
453	0.29
454	0.28
455	0.27
456	0.32
457	0.29
458	0.27
459	0.26
460	0.3
461	0.31
462	0.3
463	0.27
464	0.2
465	0.18
466	0.19
467	0.2
468	0.17
469	0.18
470	0.19
471	0.22
472	0.24
473	0.26
474	0.3
475	0.34
476	0.38
477	0.44
478	0.48
479	0.49
480	0.53
481	0.54
482	0.54
483	0.58
484	0.59
485	0.57
486	0.57
487	0.52
488	0.48
489	0.46
490	0.42
491	0.34
492	0.24
493	0.2
494	0.15
495	0.13
496	0.1
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.1
502	0.15
503	0.2
504	0.22
505	0.29
506	0.3
507	0.35
508	0.4
509	0.44
510	0.43
511	0.4
512	0.41
513	0.4
514	0.42
515	0.41
516	0.35
517	0.28
518	0.24
519	0.24
520	0.22
521	0.16
522	0.14
523	0.1
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.1
528	0.11
529	0.12
530	0.11
531	0.11
532	0.1
533	0.12
534	0.11
535	0.14
536	0.14
537	0.13
538	0.12
539	0.14
540	0.15
541	0.15
542	0.16
543	0.13
544	0.11
545	0.14
546	0.15
547	0.14
548	0.13
549	0.12
550	0.13
551	0.14
552	0.14
553	0.13
554	0.15
555	0.18
556	0.18
557	0.18
558	0.18
559	0.2
560	0.2
561	0.19
562	0.19
563	0.18
564	0.23
565	0.22
566	0.23
567	0.29
568	0.32
569	0.34
570	0.32
571	0.3
572	0.28
573	0.29
574	0.27
575	0.22
576	0.24
577	0.25
578	0.28
579	0.29
580	0.27
581	0.27
582	0.27
583	0.23
584	0.25
585	0.28
586	0.27
587	0.34
588	0.38
589	0.48
590	0.57
591	0.66
592	0.71
593	0.75
594	0.83
595	0.85
596	0.9
597	0.87

A0A3N4IWV1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer