Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4JDS6

Protein Details
Accession A0A3N4JDS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MGASAKRKKEKQKDFQKPKLKVGKAKAKPDNFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-28AKRKKEKQKDFQKPKLKVGKAKAK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGASAKRKKEKQKDFQKPKLKVGKAKAKPDNFTNTSFKSKAITLATQSLHTSAPSTSYLFTHHLSLLTHHNASTRKESLSYLKTHLPTALSTTTSNPNAISSLPTTSSLISSLLPLILDPAASVRAQLLTLLSHLPQTHIALHTRKILLFVNSAMTHISSEIRADSPKFLDWLVGACGEDVFSAGGWGVCLRGLCGCLGFAGAGGSGAGGKASSIVLPKVQDVKIALPHLSVLTKVLEAGLVGRVDVEGQEDGRRRRPDGLHVSYEAHKLPSRSNAYASLGLFEPLGAVSKDGVLQEAEPEDRVSRMRYLTGGGSGRAVFDSLTAGLGRLKKDGGEVGRAAGKALAVLDAASKEDLVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.94
3 0.94
4 0.89
5 0.89
6 0.88
7 0.85
8 0.82
9 0.82
10 0.82
11 0.8
12 0.84
13 0.83
14 0.8
15 0.77
16 0.75
17 0.74
18 0.67
19 0.64
20 0.6
21 0.55
22 0.56
23 0.51
24 0.45
25 0.39
26 0.36
27 0.36
28 0.33
29 0.32
30 0.28
31 0.34
32 0.34
33 0.32
34 0.32
35 0.28
36 0.23
37 0.2
38 0.18
39 0.12
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.17
46 0.19
47 0.2
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.2
53 0.23
54 0.24
55 0.24
56 0.22
57 0.26
58 0.28
59 0.31
60 0.35
61 0.31
62 0.28
63 0.29
64 0.31
65 0.34
66 0.35
67 0.35
68 0.33
69 0.36
70 0.36
71 0.35
72 0.34
73 0.28
74 0.23
75 0.24
76 0.22
77 0.18
78 0.18
79 0.2
80 0.24
81 0.24
82 0.24
83 0.19
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.16
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.17
128 0.17
129 0.19
130 0.22
131 0.22
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.18
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.12
142 0.11
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.02
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.1
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.17
211 0.19
212 0.2
213 0.18
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.1
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.06
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.05
236 0.06
237 0.11
238 0.16
239 0.19
240 0.27
241 0.3
242 0.3
243 0.37
244 0.39
245 0.44
246 0.49
247 0.52
248 0.47
249 0.47
250 0.48
251 0.43
252 0.43
253 0.35
254 0.27
255 0.24
256 0.21
257 0.22
258 0.28
259 0.32
260 0.31
261 0.32
262 0.33
263 0.34
264 0.36
265 0.33
266 0.27
267 0.21
268 0.2
269 0.17
270 0.14
271 0.1
272 0.07
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.1
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.15
291 0.16
292 0.18
293 0.19
294 0.19
295 0.19
296 0.21
297 0.21
298 0.25
299 0.24
300 0.2
301 0.21
302 0.19
303 0.19
304 0.17
305 0.16
306 0.1
307 0.08
308 0.1
309 0.08
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.12
314 0.16
315 0.17
316 0.17
317 0.17
318 0.17
319 0.19
320 0.25
321 0.24
322 0.26
323 0.25
324 0.26
325 0.3
326 0.29
327 0.28
328 0.22
329 0.19
330 0.14
331 0.13
332 0.11
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.1
338 0.1