Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4JYI0

Protein Details
Accession A0A3N4JYI0    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
415-436LGVLKWKKPSRRCMFVTRHEQIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040662  Tfb2_C  
IPR004598  TFIIH_p52/Tfb2  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03849  Tfb2  
PF18307  Tfb2_C  
Amino Acid Sequences MSGNIRGLPPVTFRRLYQQPATALAIFRRMLPNLAKTFVTTLLYNESPVALGDLEALVRPESYREREDAFGKLRRLHIITENHLDVSLDPVFKKNFRLAGDHHSFGVPCNTEDKKKITVQFLDDYATRQFEAILHYMVGTHNEVKPSEGVITLLTKGGLMERYGAGSQATITKHGFSFLLQDGNPQIWALLIQYLEMAEELGMEQTDVLHFLLMLGSLELGQAYSVNTLTETQKLMLADLRDYGIVYQRKTSSDRFYPTRLATTLTSESGGLRSASASMSNAITKDAEEGKGFIILETNYRVYAYTDSPLQIAVLNLFVKLSTRYPNLVSGRISRRSIQEAIKMGITADQVIDYLSAHAHPQMRKSLVTLPPTVVDQIRLWQIEGERMKTTTGFLFKDFHSTQEFEEVAKYAEELGVLKWKKPSRRCMFVTRHEQIADWLKRRASAQQQLQKKVAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.51
4 0.51
5 0.5
6 0.46
7 0.48
8 0.5
9 0.43
10 0.39
11 0.33
12 0.33
13 0.27
14 0.27
15 0.27
16 0.25
17 0.27
18 0.3
19 0.36
20 0.34
21 0.36
22 0.34
23 0.31
24 0.32
25 0.3
26 0.28
27 0.2
28 0.18
29 0.22
30 0.22
31 0.21
32 0.19
33 0.17
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.11
48 0.17
49 0.22
50 0.24
51 0.26
52 0.3
53 0.33
54 0.35
55 0.37
56 0.38
57 0.4
58 0.41
59 0.42
60 0.42
61 0.44
62 0.43
63 0.4
64 0.41
65 0.41
66 0.42
67 0.44
68 0.42
69 0.37
70 0.35
71 0.32
72 0.24
73 0.22
74 0.19
75 0.14
76 0.14
77 0.17
78 0.2
79 0.22
80 0.25
81 0.25
82 0.28
83 0.28
84 0.33
85 0.33
86 0.4
87 0.44
88 0.41
89 0.37
90 0.33
91 0.31
92 0.27
93 0.29
94 0.2
95 0.16
96 0.21
97 0.23
98 0.26
99 0.3
100 0.33
101 0.33
102 0.38
103 0.42
104 0.43
105 0.44
106 0.44
107 0.43
108 0.4
109 0.36
110 0.31
111 0.28
112 0.23
113 0.2
114 0.16
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.11
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.09
164 0.13
165 0.12
166 0.14
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.1
173 0.08
174 0.05
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.02
208 0.02
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.17
235 0.18
236 0.2
237 0.24
238 0.27
239 0.26
240 0.29
241 0.34
242 0.34
243 0.36
244 0.38
245 0.35
246 0.35
247 0.29
248 0.26
249 0.22
250 0.23
251 0.21
252 0.17
253 0.16
254 0.14
255 0.14
256 0.12
257 0.12
258 0.08
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.1
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.1
299 0.08
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.09
308 0.11
309 0.14
310 0.16
311 0.18
312 0.2
313 0.27
314 0.29
315 0.3
316 0.3
317 0.33
318 0.38
319 0.41
320 0.42
321 0.37
322 0.39
323 0.41
324 0.43
325 0.39
326 0.38
327 0.36
328 0.36
329 0.33
330 0.29
331 0.24
332 0.22
333 0.18
334 0.12
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.1
346 0.16
347 0.17
348 0.21
349 0.27
350 0.29
351 0.29
352 0.31
353 0.36
354 0.36
355 0.39
356 0.37
357 0.32
358 0.31
359 0.31
360 0.31
361 0.23
362 0.2
363 0.16
364 0.18
365 0.21
366 0.2
367 0.2
368 0.2
369 0.2
370 0.26
371 0.29
372 0.28
373 0.26
374 0.26
375 0.26
376 0.24
377 0.25
378 0.22
379 0.24
380 0.22
381 0.22
382 0.25
383 0.24
384 0.32
385 0.31
386 0.29
387 0.28
388 0.28
389 0.27
390 0.31
391 0.31
392 0.22
393 0.24
394 0.21
395 0.18
396 0.16
397 0.15
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.18
404 0.19
405 0.22
406 0.29
407 0.36
408 0.45
409 0.53
410 0.63
411 0.63
412 0.71
413 0.75
414 0.78
415 0.81
416 0.81
417 0.83
418 0.76
419 0.71
420 0.62
421 0.56
422 0.52
423 0.53
424 0.51
425 0.45
426 0.46
427 0.42
428 0.44
429 0.46
430 0.49
431 0.48
432 0.5
433 0.56
434 0.6
435 0.68
436 0.72