Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4J9A7

Protein Details
Accession A0A3N4J9A7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
337-362TFKGGKRSAYWRKHRRWEKTSRIVAEHydrophilic
486-510GKVEARGRFRGQKKRKDDSNDDDSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-351KHR
492-500GRFRGQKKR
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 9, nucl 8, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSEERILPYTYLLLRLPSGAPRVVRLIPDLTISLGKFGSFPSNALLYRPYNLTFDILDPPAVGLRLVSAEEVTRDILGGGEDTEAEGTGHYDLEIAGESEEDGGEVMRTNKETVDDPLSQKLSWTEIEQLKKQGAGSGRDLVQRLLESHTAIHQKTPFALQKYTLRKTKKFLRRFTVLPLTVTSLTTYLLDTKEPIKILEMRNETIALMLSLANVHYGGRYLVIDESGGLLVSAVAERLGLLEYTPTEPEESKEEDTTRKRCPDTPLPTANTIALIHPNEQPNLSLLKYFSYDTNNPTTSHPLHTHLRTLNWLQLVDPNADISLQRPEEIPVETLATFKGGKRSAYWRKHRRWEKTSRIVAEVQKGGFDGLLVAAFMDLKGILRHAVPLLKGSAQIVAYSQNRESVIELADCYSAARKAEWRNEGEEVADDEDGVGDPTIVLAPTVHETRVRKWQVLPGRTHPVMTARGGAEGVVFAGTRVLPVEGKVEARGRFRGQKKRKDDSNDDDSEVGVDGRGEMMPTSPLKKVKSDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.21
4 0.21
5 0.23
6 0.24
7 0.24
8 0.25
9 0.29
10 0.29
11 0.29
12 0.28
13 0.27
14 0.24
15 0.25
16 0.22
17 0.19
18 0.2
19 0.19
20 0.17
21 0.15
22 0.14
23 0.13
24 0.14
25 0.18
26 0.16
27 0.16
28 0.18
29 0.22
30 0.22
31 0.23
32 0.26
33 0.22
34 0.24
35 0.26
36 0.25
37 0.23
38 0.23
39 0.24
40 0.2
41 0.2
42 0.22
43 0.2
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.12
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.06
93 0.08
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.14
99 0.16
100 0.18
101 0.22
102 0.24
103 0.25
104 0.3
105 0.31
106 0.29
107 0.29
108 0.26
109 0.23
110 0.2
111 0.19
112 0.21
113 0.25
114 0.3
115 0.32
116 0.34
117 0.32
118 0.32
119 0.31
120 0.27
121 0.26
122 0.25
123 0.25
124 0.27
125 0.28
126 0.3
127 0.31
128 0.27
129 0.23
130 0.2
131 0.18
132 0.17
133 0.16
134 0.13
135 0.13
136 0.18
137 0.22
138 0.22
139 0.24
140 0.23
141 0.23
142 0.23
143 0.29
144 0.29
145 0.27
146 0.29
147 0.28
148 0.35
149 0.43
150 0.49
151 0.5
152 0.52
153 0.52
154 0.58
155 0.65
156 0.67
157 0.68
158 0.69
159 0.69
160 0.68
161 0.66
162 0.66
163 0.65
164 0.55
165 0.47
166 0.39
167 0.35
168 0.3
169 0.29
170 0.21
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.11
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.13
184 0.18
185 0.2
186 0.27
187 0.28
188 0.27
189 0.27
190 0.27
191 0.24
192 0.19
193 0.17
194 0.09
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.12
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.16
242 0.22
243 0.27
244 0.31
245 0.33
246 0.35
247 0.35
248 0.37
249 0.43
250 0.47
251 0.48
252 0.51
253 0.51
254 0.48
255 0.47
256 0.44
257 0.37
258 0.28
259 0.22
260 0.15
261 0.12
262 0.11
263 0.12
264 0.14
265 0.16
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.13
270 0.14
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.15
279 0.16
280 0.18
281 0.23
282 0.23
283 0.23
284 0.24
285 0.28
286 0.24
287 0.26
288 0.25
289 0.25
290 0.28
291 0.28
292 0.32
293 0.28
294 0.28
295 0.27
296 0.27
297 0.25
298 0.21
299 0.2
300 0.16
301 0.17
302 0.18
303 0.15
304 0.14
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.08
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.14
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.15
327 0.15
328 0.16
329 0.19
330 0.29
331 0.38
332 0.48
333 0.58
334 0.62
335 0.69
336 0.79
337 0.86
338 0.86
339 0.85
340 0.86
341 0.85
342 0.85
343 0.83
344 0.75
345 0.69
346 0.64
347 0.58
348 0.52
349 0.45
350 0.34
351 0.27
352 0.24
353 0.21
354 0.16
355 0.12
356 0.07
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.09
373 0.11
374 0.11
375 0.13
376 0.14
377 0.14
378 0.14
379 0.13
380 0.14
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.15
385 0.16
386 0.18
387 0.18
388 0.19
389 0.19
390 0.2
391 0.2
392 0.16
393 0.16
394 0.14
395 0.14
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.12
404 0.17
405 0.24
406 0.33
407 0.38
408 0.39
409 0.41
410 0.43
411 0.42
412 0.36
413 0.3
414 0.24
415 0.19
416 0.16
417 0.12
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.08
422 0.06
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.04
430 0.06
431 0.1
432 0.11
433 0.12
434 0.17
435 0.2
436 0.25
437 0.35
438 0.38
439 0.37
440 0.39
441 0.47
442 0.51
443 0.56
444 0.58
445 0.55
446 0.6
447 0.57
448 0.55
449 0.47
450 0.42
451 0.38
452 0.33
453 0.31
454 0.22
455 0.22
456 0.22
457 0.2
458 0.15
459 0.12
460 0.1
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.12
472 0.12
473 0.14
474 0.17
475 0.22
476 0.25
477 0.29
478 0.34
479 0.38
480 0.46
481 0.54
482 0.61
483 0.66
484 0.73
485 0.78
486 0.83
487 0.86
488 0.86
489 0.86
490 0.83
491 0.83
492 0.76
493 0.69
494 0.59
495 0.5
496 0.41
497 0.31
498 0.23
499 0.13
500 0.09
501 0.07
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.08
507 0.12
508 0.15
509 0.19
510 0.23
511 0.29
512 0.31