FuNGI

A0A3N4JVL5

Protein Details

Accession

A0A3N4JVL5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-50	EANSNPLVQRQKRPRAPVANRPKPAT	Hydrophilic
121-140	PSQFTRPVRLHRRDPRAPLQ	Hydrophilic
188-209	GGAQKQKQKVFHKKTQQVFKSN	Hydrophilic
555-574	SGTESRKKPKKNAATNNGTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
36-41	KRPRAP
392-408	RKKLEEVRRKHGKKVRK
444-473	RKEEEKKKEEERKKAEAAAEKEKADLRKSK
545-546	KR
558-565	ESRKKPKK

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MTSPASGSAPTTGSPVPRMVARRREANSNPLVQRQKRPRAPVANRPKPATPTPTPPSAAAPAKTAASTAPSSSRAGGTIPAEDEGEWHEFKLTTTKASLLKGLRHHVMRMQSKREIDPTDPSQFTRPVRLHRRDPRAPLQGAKEEAAANQLAAANKAAEAGGKVKDEVEQAKKDAEKQANLDKIAPFGGAQKQKQKVFHKKTQQVFKSNDAEKKLRYEEFFPWFIEDFDNKNTWQGQLESSLSKGVFAMFVLEEGAFRMVPIEKWYKFQEKNRFPTMTSEEAELEMKKNARPPRWLMKRTEEKESKQRELEENARANKTLFTRKGDRLKGEADNDDLDFEDDQFADDEETPIMEGEEQENKEIEKRIKKEQLSANFFDARDERDWEKEELERKKLEEVRRKHGKKVRKALMTREGNFTYESDSDENPYDSAGEEESEGEEETARKEEEKKKEEERKKAEAAAEKEKADLRKSKTPPVATPTSSSTATPSSAAVATTVAPTSQAKSKATVGASGGVGGAHSNVANKKDKHQTGTPLPPSDKKPQLKRAGTPSHPESGTESRKKPKKNAATNNGTTTTTTGKSTTLPILGGADKKNIVKLKVAGESLSQIASSTPSPSPPPPGGVSTGSSNKKRKADMTGGARSGDERSGEMSDGPGSKKQRIKIAAGGAGGGAGRSLSPAAAAAVASRQGTPGASRAGSPAAAATANTSAPAAARGTPGPPDFITDAEIRTVLSSNPEGVTLKFIADKFKNRVRNEEVKKGLVSSLRRLSVSTDKRTYKLKEGVGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.21
3	0.21
4	0.25
5	0.32
6	0.37
7	0.45
8	0.48
9	0.54
10	0.56
11	0.64
12	0.63
13	0.65
14	0.63
15	0.62
16	0.61
17	0.61
18	0.67
19	0.64
20	0.7
21	0.72
22	0.76
23	0.75
24	0.79
25	0.81
26	0.82
27	0.84
28	0.85
29	0.85
30	0.85
31	0.83
32	0.79
33	0.74
34	0.69
35	0.67
36	0.65
37	0.59
38	0.59
39	0.57
40	0.58
41	0.56
42	0.51
43	0.48
44	0.47
45	0.46
46	0.38
47	0.35
48	0.31
49	0.3
50	0.28
51	0.24
52	0.18
53	0.17
54	0.17
55	0.16
56	0.18
57	0.2
58	0.21
59	0.22
60	0.22
61	0.19
62	0.18
63	0.2
64	0.18
65	0.18
66	0.17
67	0.16
68	0.16
69	0.15
70	0.15
71	0.15
72	0.17
73	0.15
74	0.14
75	0.15
76	0.15
77	0.16
78	0.23
79	0.21
80	0.19
81	0.21
82	0.25
83	0.27
84	0.28
85	0.34
86	0.3
87	0.35
88	0.38
89	0.42
90	0.44
91	0.42
92	0.43
93	0.41
94	0.47
95	0.51
96	0.53
97	0.54
98	0.54
99	0.56
100	0.58
101	0.59
102	0.54
103	0.47
104	0.47
105	0.46
106	0.47
107	0.44
108	0.43
109	0.41
110	0.43
111	0.42
112	0.43
113	0.42
114	0.44
115	0.54
116	0.6
117	0.66
118	0.7
119	0.78
120	0.77
121	0.8
122	0.79
123	0.78
124	0.73
125	0.68
126	0.64
127	0.59
128	0.54
129	0.47
130	0.39
131	0.3
132	0.27
133	0.24
134	0.18
135	0.12
136	0.11
137	0.12
138	0.11
139	0.11
140	0.12
141	0.09
142	0.09
143	0.1
144	0.09
145	0.07
146	0.08
147	0.1
148	0.12
149	0.12
150	0.12
151	0.12
152	0.14
153	0.17
154	0.22
155	0.26
156	0.27
157	0.27
158	0.32
159	0.32
160	0.35
161	0.4
162	0.39
163	0.36
164	0.37
165	0.44
166	0.45
167	0.44
168	0.44
169	0.35
170	0.31
171	0.28
172	0.24
173	0.16
174	0.15
175	0.22
176	0.25
177	0.29
178	0.37
179	0.43
180	0.48
181	0.56
182	0.62
183	0.66
184	0.69
185	0.74
186	0.76
187	0.78
188	0.82
189	0.84
190	0.81
191	0.78
192	0.73
193	0.7
194	0.68
195	0.65
196	0.61
197	0.57
198	0.53
199	0.46
200	0.48
201	0.45
202	0.4
203	0.37
204	0.36
205	0.37
206	0.38
207	0.38
208	0.33
209	0.31
210	0.28
211	0.26
212	0.25
213	0.21
214	0.18
215	0.19
216	0.21
217	0.18
218	0.2
219	0.2
220	0.18
221	0.18
222	0.17
223	0.15
224	0.16
225	0.18
226	0.16
227	0.16
228	0.17
229	0.15
230	0.14
231	0.12
232	0.09
233	0.08
234	0.07
235	0.08
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.05
244	0.05
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.11
249	0.18
250	0.18
251	0.22
252	0.27
253	0.34
254	0.4
255	0.48
256	0.55
257	0.57
258	0.63
259	0.66
260	0.63
261	0.55
262	0.56
263	0.52
264	0.46
265	0.38
266	0.32
267	0.26
268	0.25
269	0.25
270	0.19
271	0.15
272	0.13
273	0.14
274	0.14
275	0.2
276	0.26
277	0.29
278	0.33
279	0.39
280	0.47
281	0.56
282	0.6
283	0.58
284	0.62
285	0.68
286	0.66
287	0.69
288	0.64
289	0.59
290	0.64
291	0.65
292	0.6
293	0.52
294	0.52
295	0.46
296	0.46
297	0.46
298	0.44
299	0.43
300	0.42
301	0.4
302	0.37
303	0.34
304	0.31
305	0.3
306	0.31
307	0.28
308	0.3
309	0.35
310	0.41
311	0.49
312	0.51
313	0.49
314	0.44
315	0.45
316	0.43
317	0.39
318	0.33
319	0.26
320	0.23
321	0.21
322	0.18
323	0.14
324	0.11
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.1
344	0.1
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.13
349	0.17
350	0.21
351	0.24
352	0.27
353	0.35
354	0.42
355	0.42
356	0.48
357	0.5
358	0.54
359	0.53
360	0.51
361	0.46
362	0.41
363	0.4
364	0.34
365	0.28
366	0.22
367	0.17
368	0.19
369	0.17
370	0.17
371	0.2
372	0.19
373	0.2
374	0.2
375	0.26
376	0.27
377	0.3
378	0.28
379	0.26
380	0.32
381	0.36
382	0.41
383	0.43
384	0.44
385	0.5
386	0.6
387	0.61
388	0.64
389	0.65
390	0.66
391	0.66
392	0.72
393	0.7
394	0.68
395	0.68
396	0.66
397	0.7
398	0.67
399	0.59
400	0.54
401	0.46
402	0.38
403	0.36
404	0.3
405	0.22
406	0.16
407	0.16
408	0.13
409	0.12
410	0.13
411	0.13
412	0.13
413	0.1
414	0.1
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.06
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.15
433	0.23
434	0.32
435	0.37
436	0.41
437	0.49
438	0.6
439	0.66
440	0.69
441	0.68
442	0.66
443	0.63
444	0.61
445	0.56
446	0.52
447	0.49
448	0.47
449	0.42
450	0.36
451	0.35
452	0.35
453	0.33
454	0.3
455	0.32
456	0.3
457	0.37
458	0.4
459	0.46
460	0.5
461	0.51
462	0.5
463	0.49
464	0.48
465	0.4
466	0.4
467	0.35
468	0.32
469	0.29
470	0.26
471	0.22
472	0.18
473	0.17
474	0.15
475	0.12
476	0.1
477	0.1
478	0.09
479	0.08
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.07
484	0.05
485	0.06
486	0.07
487	0.09
488	0.13
489	0.16
490	0.16
491	0.18
492	0.2
493	0.23
494	0.23
495	0.23
496	0.19
497	0.18
498	0.17
499	0.14
500	0.13
501	0.08
502	0.08
503	0.06
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.06
508	0.09
509	0.13
510	0.2
511	0.22
512	0.28
513	0.37
514	0.4
515	0.43
516	0.46
517	0.49
518	0.5
519	0.59
520	0.57
521	0.52
522	0.52
523	0.52
524	0.52
525	0.53
526	0.54
527	0.53
528	0.57
529	0.62
530	0.7
531	0.7
532	0.7
533	0.71
534	0.71
535	0.66
536	0.64
537	0.57
538	0.53
539	0.48
540	0.43
541	0.39
542	0.38
543	0.44
544	0.44
545	0.46
546	0.5
547	0.58
548	0.63
549	0.66
550	0.68
551	0.7
552	0.74
553	0.79
554	0.79
555	0.82
556	0.79
557	0.75
558	0.67
559	0.57
560	0.46
561	0.37
562	0.3
563	0.22
564	0.2
565	0.16
566	0.15
567	0.15
568	0.17
569	0.18
570	0.15
571	0.14
572	0.13
573	0.14
574	0.16
575	0.18
576	0.17
577	0.17
578	0.18
579	0.19
580	0.24
581	0.25
582	0.24
583	0.25
584	0.27
585	0.3
586	0.32
587	0.32
588	0.27
589	0.24
590	0.25
591	0.21
592	0.18
593	0.13
594	0.09
595	0.08
596	0.1
597	0.09
598	0.11
599	0.11
600	0.13
601	0.17
602	0.18
603	0.24
604	0.23
605	0.26
606	0.25
607	0.27
608	0.28
609	0.26
610	0.26
611	0.25
612	0.32
613	0.35
614	0.41
615	0.46
616	0.5
617	0.53
618	0.55
619	0.54
620	0.54
621	0.55
622	0.56
623	0.57
624	0.57
625	0.54
626	0.5
627	0.47
628	0.39
629	0.33
630	0.27
631	0.19
632	0.13
633	0.13
634	0.14
635	0.15
636	0.14
637	0.13
638	0.14
639	0.16
640	0.18
641	0.21
642	0.24
643	0.31
644	0.36
645	0.39
646	0.45
647	0.47
648	0.49
649	0.5
650	0.52
651	0.48
652	0.43
653	0.39
654	0.3
655	0.25
656	0.2
657	0.14
658	0.07
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.05
663	0.04
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.07
671	0.09
672	0.09
673	0.09
674	0.09
675	0.1
676	0.11
677	0.12
678	0.14
679	0.16
680	0.15
681	0.16
682	0.17
683	0.18
684	0.17
685	0.16
686	0.13
687	0.11
688	0.11
689	0.1
690	0.1
691	0.1
692	0.1
693	0.1
694	0.1
695	0.08
696	0.08
697	0.1
698	0.1
699	0.1
700	0.12
701	0.13
702	0.15
703	0.2
704	0.21
705	0.22
706	0.21
707	0.24
708	0.22
709	0.22
710	0.24
711	0.2
712	0.2
713	0.18
714	0.18
715	0.14
716	0.14
717	0.14
718	0.11
719	0.14
720	0.15
721	0.16
722	0.16
723	0.18
724	0.18
725	0.17
726	0.21
727	0.17
728	0.17
729	0.19
730	0.2
731	0.27
732	0.32
733	0.39
734	0.43
735	0.51
736	0.59
737	0.58
738	0.66
739	0.66
740	0.71
741	0.71
742	0.74
743	0.7
744	0.65
745	0.63
746	0.55
747	0.51
748	0.47
749	0.43
750	0.41
751	0.43
752	0.42
753	0.42
754	0.41
755	0.43
756	0.47
757	0.51
758	0.51
759	0.53
760	0.54
761	0.57
762	0.65
763	0.65
764	0.64
765	0.63

A0A3N4JVL5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer