FuNGI

A0A3N4JHM8

Protein Details

Accession

A0A3N4JHM8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
364-390	FYPVLTRYTIRPRRKNKYPPGMPGRHD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSQRSNRPHAQDYIARIRYNNSLPPPPCPPKMLNIPNSSLEMYCDPSFTSKLARAEGVNVEIDSELGMPLDLVHVPKIFDGDHSAILALDPVPPIDPKDRLLMRPAAALGKTNARATGSAGNVSFLRRTEYISAEQSRSTFKSGGNTERLMAASRAKRASRPEDNDPIRILQAVLKGFDVANPETAGQDHNGLGALAVGDIAAANAERNWKELKHPTKPNVRAVETYPLLPDFQATSDNGGYMVFKFMGSPVVPGEKRDTRLDVGLLKPKDKPLDDDGNPVGQDIFDYYIPATESIANKVKAKFAAYAEDEDEEDGKEDSEEFRYDFVREYETKAHKRYPPDVLEEAALLLNKGDDKKPKGAYFYPVLTRYTIRPRRKNKYPPGMPGRHDEESEDDGEKPPEVMNLKVRALNEVERQRHEDVRNRWDNRPGTGGEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.54
3	0.49
4	0.48
5	0.47
6	0.47
7	0.46
8	0.42
9	0.46
10	0.46
11	0.51
12	0.57
13	0.57
14	0.56
15	0.54
16	0.5
17	0.49
18	0.58
19	0.62
20	0.6
21	0.59
22	0.59
23	0.56
24	0.56
25	0.5
26	0.39
27	0.33
28	0.26
29	0.26
30	0.22
31	0.2
32	0.18
33	0.2
34	0.21
35	0.19
36	0.22
37	0.23
38	0.26
39	0.27
40	0.28
41	0.26
42	0.28
43	0.3
44	0.27
45	0.22
46	0.19
47	0.17
48	0.15
49	0.14
50	0.11
51	0.08
52	0.06
53	0.05
54	0.05
55	0.04
56	0.04
57	0.06
58	0.06
59	0.07
60	0.09
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.12
65	0.11
66	0.11
67	0.16
68	0.16
69	0.16
70	0.16
71	0.15
72	0.14
73	0.13
74	0.13
75	0.08
76	0.07
77	0.07
78	0.07
79	0.08
80	0.08
81	0.11
82	0.15
83	0.17
84	0.17
85	0.25
86	0.28
87	0.28
88	0.33
89	0.34
90	0.31
91	0.31
92	0.3
93	0.25
94	0.22
95	0.22
96	0.19
97	0.21
98	0.22
99	0.21
100	0.2
101	0.18
102	0.18
103	0.19
104	0.23
105	0.18
106	0.19
107	0.18
108	0.18
109	0.18
110	0.19
111	0.17
112	0.12
113	0.15
114	0.13
115	0.16
116	0.17
117	0.2
118	0.23
119	0.27
120	0.3
121	0.27
122	0.28
123	0.26
124	0.27
125	0.25
126	0.25
127	0.21
128	0.18
129	0.24
130	0.28
131	0.32
132	0.33
133	0.32
134	0.29
135	0.28
136	0.28
137	0.22
138	0.19
139	0.2
140	0.19
141	0.23
142	0.27
143	0.27
144	0.3
145	0.35
146	0.42
147	0.45
148	0.47
149	0.5
150	0.56
151	0.57
152	0.56
153	0.51
154	0.43
155	0.34
156	0.29
157	0.22
158	0.14
159	0.15
160	0.13
161	0.13
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.14
167	0.1
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.1
172	0.11
173	0.1
174	0.07
175	0.08
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.06
180	0.06
181	0.05
182	0.04
183	0.03
184	0.03
185	0.02
186	0.02
187	0.02
188	0.02
189	0.02
190	0.02
191	0.02
192	0.03
193	0.06
194	0.06
195	0.08
196	0.1
197	0.1
198	0.15
199	0.24
200	0.31
201	0.37
202	0.44
203	0.5
204	0.58
205	0.63
206	0.65
207	0.61
208	0.56
209	0.49
210	0.44
211	0.43
212	0.34
213	0.29
214	0.22
215	0.17
216	0.16
217	0.14
218	0.12
219	0.06
220	0.06
221	0.07
222	0.07
223	0.09
224	0.09
225	0.09
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.06
230	0.07
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.08
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.13
240	0.14
241	0.15
242	0.2
243	0.22
244	0.25
245	0.26
246	0.28
247	0.23
248	0.24
249	0.25
250	0.22
251	0.22
252	0.27
253	0.26
254	0.25
255	0.25
256	0.27
257	0.3
258	0.27
259	0.28
260	0.27
261	0.35
262	0.34
263	0.38
264	0.36
265	0.33
266	0.32
267	0.28
268	0.22
269	0.12
270	0.11
271	0.08
272	0.08
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.1
281	0.11
282	0.15
283	0.21
284	0.22
285	0.25
286	0.26
287	0.28
288	0.26
289	0.27
290	0.26
291	0.22
292	0.26
293	0.24
294	0.25
295	0.24
296	0.23
297	0.21
298	0.18
299	0.17
300	0.11
301	0.1
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.1
308	0.11
309	0.1
310	0.12
311	0.13
312	0.13
313	0.15
314	0.15
315	0.17
316	0.17
317	0.22
318	0.29
319	0.37
320	0.43
321	0.45
322	0.52
323	0.51
324	0.57
325	0.59
326	0.58
327	0.54
328	0.54
329	0.51
330	0.45
331	0.4
332	0.34
333	0.28
334	0.2
335	0.16
336	0.09
337	0.07
338	0.07
339	0.09
340	0.11
341	0.15
342	0.22
343	0.27
344	0.35
345	0.42
346	0.44
347	0.48
348	0.49
349	0.5
350	0.47
351	0.47
352	0.46
353	0.41
354	0.4
355	0.36
356	0.35
357	0.35
358	0.41
359	0.46
360	0.5
361	0.58
362	0.67
363	0.75
364	0.84
365	0.89
366	0.89
367	0.91
368	0.88
369	0.89
370	0.89
371	0.87
372	0.79
373	0.75
374	0.72
375	0.63
376	0.55
377	0.46
378	0.4
379	0.36
380	0.36
381	0.3
382	0.24
383	0.23
384	0.24
385	0.22
386	0.18
387	0.15
388	0.18
389	0.18
390	0.22
391	0.27
392	0.31
393	0.33
394	0.35
395	0.35
396	0.34
397	0.36
398	0.37
399	0.39
400	0.43
401	0.47
402	0.48
403	0.53
404	0.54
405	0.58
406	0.59
407	0.6
408	0.59
409	0.64
410	0.69
411	0.69
412	0.7
413	0.71
414	0.68
415	0.63
416	0.59

A0A3N4JHM8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer