Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4JRD9

Protein Details
Accession A0A3N4JRD9    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-32KSTSRYSGANEKNPKRPRVTKPTFMEVGHydrophilic
144-172PDTPADKQDKQKKQTKKRRFDYTRTADSLHydrophilic
241-263SDSPRKADPPKNNRSKRPSPTNFHydrophilic
425-450DDDLLRKSRKSTPKRRKFAQSPSPGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-302KRGGRR
430-441RKSRKSTPKRRK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSTRKSTSRYSGANEKNPKRPRVTKPTFMEVGPKFGGGRGKRETYMRAGNDDDEQDKRPFGVRANSQFSDAYAIRSPPHSPRRVTSLNNGIAKSPLFDDPLSSLNAPTITENRFARRTRTGKSVPAPSAYTDGNGSVGAQYIIPDTPADKQDKQKKQTKKRRFDYTRTADSLDYHDSAKGMLAERLTRSRSRSLEKDLESLKNDAFGAKRTSTSPSLSSLSSLSSLPSASSGETSPILINSDSPRKADPPKNNRSKRPSPTNFDSADGGDDRDDLIKPVEKKAKTSPISTWKTGEEKRGGRRPVTFKKATYGAGGRSGASTVPYAKELMKSHPFEAPLSRSEKLQKEREAGVAALSKIAQRANQNNQKISKKAGRSLAENEEVVESQGQDDPLAESSFINPREKFGFGIAREVDLKRLSDDDLDDDDLLRKSRKSTPKRRKFAQSPSPGIEKIECQACNEPLPVNFLDTWKDGRFKKGHVPLLEWMDICTEHKAVSLRGEWVRKGYPEINWKGLKRRIEGNYKSIEAILHGEIESPFLAIFQEQEKDVRGNPILLLRKDHRLQYPGYYGPRGANIMLHWLLRRFGKDITAYNNATSNLTHSSAAAFVQAVLVPEMAVRLIMEDMKVNEKRAREVLEESRSIGETLNLKDYQEDIYGTGGNWVDVNNLKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.75
4 0.79
5 0.8
6 0.79
7 0.8
8 0.81
9 0.81
10 0.83
11 0.83
12 0.81
13 0.81
14 0.74
15 0.65
16 0.64
17 0.54
18 0.51
19 0.42
20 0.36
21 0.28
22 0.28
23 0.36
24 0.29
25 0.35
26 0.36
27 0.4
28 0.42
29 0.46
30 0.48
31 0.46
32 0.52
33 0.47
34 0.45
35 0.43
36 0.41
37 0.41
38 0.39
39 0.35
40 0.29
41 0.31
42 0.28
43 0.27
44 0.26
45 0.26
46 0.25
47 0.27
48 0.33
49 0.38
50 0.44
51 0.52
52 0.51
53 0.5
54 0.48
55 0.43
56 0.4
57 0.32
58 0.27
59 0.23
60 0.23
61 0.22
62 0.25
63 0.28
64 0.31
65 0.41
66 0.43
67 0.44
68 0.47
69 0.54
70 0.58
71 0.59
72 0.58
73 0.58
74 0.58
75 0.59
76 0.56
77 0.48
78 0.43
79 0.39
80 0.32
81 0.24
82 0.19
83 0.17
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.19
88 0.2
89 0.18
90 0.16
91 0.15
92 0.16
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.17
97 0.22
98 0.25
99 0.29
100 0.35
101 0.37
102 0.4
103 0.46
104 0.49
105 0.48
106 0.55
107 0.55
108 0.56
109 0.61
110 0.63
111 0.56
112 0.54
113 0.5
114 0.42
115 0.4
116 0.32
117 0.27
118 0.19
119 0.17
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.11
134 0.16
135 0.21
136 0.24
137 0.34
138 0.44
139 0.54
140 0.61
141 0.66
142 0.73
143 0.78
144 0.85
145 0.87
146 0.88
147 0.87
148 0.9
149 0.9
150 0.88
151 0.88
152 0.85
153 0.82
154 0.74
155 0.66
156 0.56
157 0.48
158 0.43
159 0.36
160 0.28
161 0.21
162 0.18
163 0.16
164 0.15
165 0.15
166 0.13
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.16
172 0.2
173 0.23
174 0.25
175 0.27
176 0.33
177 0.36
178 0.41
179 0.43
180 0.47
181 0.51
182 0.5
183 0.52
184 0.48
185 0.48
186 0.43
187 0.4
188 0.32
189 0.26
190 0.24
191 0.2
192 0.17
193 0.16
194 0.18
195 0.17
196 0.19
197 0.19
198 0.23
199 0.24
200 0.25
201 0.23
202 0.23
203 0.23
204 0.22
205 0.22
206 0.18
207 0.16
208 0.14
209 0.13
210 0.1
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.1
225 0.08
226 0.1
227 0.12
228 0.19
229 0.19
230 0.2
231 0.21
232 0.24
233 0.32
234 0.38
235 0.45
236 0.49
237 0.59
238 0.69
239 0.75
240 0.8
241 0.81
242 0.82
243 0.81
244 0.82
245 0.78
246 0.76
247 0.74
248 0.71
249 0.63
250 0.55
251 0.47
252 0.36
253 0.31
254 0.22
255 0.17
256 0.11
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.12
264 0.13
265 0.19
266 0.26
267 0.25
268 0.29
269 0.34
270 0.43
271 0.41
272 0.43
273 0.43
274 0.46
275 0.5
276 0.48
277 0.44
278 0.36
279 0.4
280 0.4
281 0.39
282 0.36
283 0.37
284 0.43
285 0.49
286 0.48
287 0.44
288 0.49
289 0.53
290 0.54
291 0.57
292 0.52
293 0.45
294 0.47
295 0.47
296 0.41
297 0.35
298 0.28
299 0.21
300 0.21
301 0.21
302 0.17
303 0.14
304 0.14
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.13
314 0.13
315 0.18
316 0.24
317 0.25
318 0.25
319 0.27
320 0.27
321 0.24
322 0.25
323 0.22
324 0.19
325 0.21
326 0.2
327 0.19
328 0.24
329 0.3
330 0.33
331 0.37
332 0.38
333 0.37
334 0.38
335 0.38
336 0.33
337 0.27
338 0.22
339 0.17
340 0.14
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.11
347 0.13
348 0.2
349 0.29
350 0.36
351 0.39
352 0.42
353 0.48
354 0.48
355 0.46
356 0.45
357 0.42
358 0.38
359 0.39
360 0.42
361 0.38
362 0.38
363 0.42
364 0.41
365 0.36
366 0.33
367 0.28
368 0.21
369 0.19
370 0.16
371 0.12
372 0.07
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.06
383 0.08
384 0.13
385 0.15
386 0.18
387 0.17
388 0.19
389 0.21
390 0.22
391 0.2
392 0.19
393 0.22
394 0.18
395 0.24
396 0.22
397 0.21
398 0.22
399 0.22
400 0.22
401 0.17
402 0.17
403 0.13
404 0.14
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.13
412 0.12
413 0.14
414 0.13
415 0.14
416 0.13
417 0.12
418 0.15
419 0.24
420 0.34
421 0.43
422 0.53
423 0.63
424 0.73
425 0.81
426 0.84
427 0.86
428 0.84
429 0.84
430 0.83
431 0.81
432 0.75
433 0.7
434 0.67
435 0.57
436 0.49
437 0.39
438 0.3
439 0.24
440 0.23
441 0.2
442 0.19
443 0.22
444 0.23
445 0.23
446 0.23
447 0.22
448 0.17
449 0.21
450 0.18
451 0.17
452 0.16
453 0.15
454 0.17
455 0.17
456 0.2
457 0.19
458 0.24
459 0.23
460 0.31
461 0.32
462 0.33
463 0.41
464 0.46
465 0.5
466 0.46
467 0.49
468 0.45
469 0.48
470 0.46
471 0.37
472 0.28
473 0.22
474 0.21
475 0.19
476 0.16
477 0.11
478 0.09
479 0.12
480 0.13
481 0.13
482 0.16
483 0.17
484 0.2
485 0.25
486 0.28
487 0.26
488 0.29
489 0.3
490 0.28
491 0.31
492 0.29
493 0.3
494 0.37
495 0.4
496 0.44
497 0.47
498 0.48
499 0.52
500 0.56
501 0.55
502 0.49
503 0.53
504 0.53
505 0.58
506 0.6
507 0.57
508 0.56
509 0.51
510 0.48
511 0.4
512 0.33
513 0.23
514 0.22
515 0.16
516 0.12
517 0.11
518 0.12
519 0.11
520 0.12
521 0.11
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.05
527 0.07
528 0.08
529 0.1
530 0.1
531 0.12
532 0.14
533 0.16
534 0.17
535 0.21
536 0.2
537 0.19
538 0.2
539 0.26
540 0.31
541 0.3
542 0.36
543 0.33
544 0.41
545 0.43
546 0.48
547 0.46
548 0.42
549 0.43
550 0.43
551 0.46
552 0.43
553 0.44
554 0.4
555 0.36
556 0.34
557 0.34
558 0.3
559 0.24
560 0.2
561 0.16
562 0.21
563 0.21
564 0.21
565 0.2
566 0.2
567 0.22
568 0.23
569 0.25
570 0.22
571 0.22
572 0.25
573 0.28
574 0.3
575 0.34
576 0.38
577 0.37
578 0.36
579 0.37
580 0.33
581 0.3
582 0.26
583 0.23
584 0.19
585 0.2
586 0.19
587 0.16
588 0.16
589 0.16
590 0.15
591 0.13
592 0.09
593 0.08
594 0.08
595 0.09
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.08
600 0.08
601 0.08
602 0.07
603 0.06
604 0.05
605 0.05
606 0.06
607 0.07
608 0.08
609 0.11
610 0.13
611 0.21
612 0.24
613 0.27
614 0.3
615 0.32
616 0.36
617 0.38
618 0.41
619 0.36
620 0.41
621 0.46
622 0.48
623 0.47
624 0.44
625 0.41
626 0.38
627 0.34
628 0.28
629 0.23
630 0.21
631 0.23
632 0.27
633 0.25
634 0.25
635 0.25
636 0.26
637 0.25
638 0.22
639 0.2
640 0.14
641 0.16
642 0.16
643 0.15
644 0.18
645 0.16
646 0.14
647 0.13
648 0.13
649 0.15