Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CQU2

Protein Details
Accession A0A0D1CQU2    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MPPKIRQRGKKPSKVRKLQQEQEQLQQHHydrophilic
633-660SKRGRDGKAKQSKTKYSKKKDAEVSNKEBasic
891-918ETKRVSEASAKSKRRKKSKLDGQLDSILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-16KIRQRGKKPSKVR
629-652GARGSKRGRDGKAKQSKTKYSKKK
899-909SAKSKRRKKSK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
KEGG uma:UMAG_10321  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
Amino Acid Sequences MPPKIRQRGKKPSKVRKLQQEQEQLQQHDAQPLASSASSSTNPIQSQADYIPVDVEDADTSTVPQNDAEEDQPNWIKLGDRPGKAEHEAPFGYVDAELKAYLRAGWERVTELESQGYTSKSTLTAIVAASAPSGAHKNGLGADDDEADDDDELALLLQATLKEMDGKELLLSTDPDTSLIVEAILHRLPAKPLRVFVDRLAGNFAVLAKHRFASHVIQACLTTLQPAVTLEHASQQHFYQHQHRSSGLNGKATASSAYASDAATIVNEDGILRSATQLILDLIDELSSDQDMLFSLVTDSFGSHVIRSLLCVLTGRNIQTDPSSTAHAAAASDLRSRRSAKFRNRKAPTAPNSAAVAGAVSPEDLLVVVPDLLYNRAMLLRQEILKDASVETVRRWATDAVASPLLQLLIEIEADSLDGEQGDKLWKGTLVDSLLNGFVSSPPETVEEGEVKKDVYLETSLRDNVASHALQLVLERAPASTASRFFHIYIRSRMAKLCIHPAANHIVATLIRRLSTADLEPVIAEMAKIASGMVKEQMVGCLQAAVDRVVQLTQEESDKEEVKELVKAVSEVVLAAFRFKSQSSSEQSDEEGLKLLVPAVLALRTRKAYLHTYSAHLKKDNRDGEGENGARGSKRGRDGKAKQSKTKYSKKKDAEVSNKEEEQEQSPWTMDASYELPAAESTTQGSLLLQSLLRLPGPAAPARAPPKRTFGRAAPASASCTSAARAESWGSALVLDSLCSLPTLTPFARNPTAVHTLISCLCPPPHPTSPHLDWNQSTRRRTLSSTLTTSLASFCGDKYGSRLADSLWFSVDGYSKEKIVKYVIEHSTEIIKQPYASYFTNKLQLQLYRKGKVREWNQAIQAQAQLANKDKEISVSTVQSGARKHSPIIVETKRVSEASAKSKRRKKSKLDGQLDSILDQI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.93
3 0.93
4 0.93
5 0.91
6 0.9
7 0.9
8 0.83
9 0.81
10 0.79
11 0.7
12 0.62
13 0.58
14 0.5
15 0.44
16 0.4
17 0.31
18 0.24
19 0.23
20 0.22
21 0.17
22 0.15
23 0.11
24 0.15
25 0.16
26 0.18
27 0.21
28 0.23
29 0.24
30 0.26
31 0.27
32 0.24
33 0.26
34 0.24
35 0.26
36 0.21
37 0.21
38 0.19
39 0.17
40 0.17
41 0.13
42 0.13
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.1
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.19
55 0.2
56 0.19
57 0.19
58 0.24
59 0.26
60 0.26
61 0.24
62 0.22
63 0.22
64 0.21
65 0.32
66 0.34
67 0.34
68 0.37
69 0.41
70 0.45
71 0.46
72 0.48
73 0.4
74 0.38
75 0.36
76 0.33
77 0.3
78 0.25
79 0.22
80 0.18
81 0.15
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.12
90 0.14
91 0.15
92 0.17
93 0.18
94 0.2
95 0.21
96 0.23
97 0.2
98 0.19
99 0.2
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.15
107 0.13
108 0.14
109 0.13
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.12
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.11
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.11
150 0.11
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.13
156 0.13
157 0.11
158 0.12
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.15
176 0.2
177 0.25
178 0.24
179 0.27
180 0.32
181 0.35
182 0.37
183 0.34
184 0.37
185 0.32
186 0.3
187 0.31
188 0.26
189 0.22
190 0.2
191 0.19
192 0.12
193 0.13
194 0.15
195 0.12
196 0.14
197 0.14
198 0.15
199 0.17
200 0.2
201 0.25
202 0.3
203 0.29
204 0.28
205 0.28
206 0.28
207 0.25
208 0.21
209 0.15
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.11
217 0.1
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.21
224 0.23
225 0.26
226 0.29
227 0.36
228 0.38
229 0.39
230 0.4
231 0.37
232 0.39
233 0.44
234 0.39
235 0.34
236 0.31
237 0.3
238 0.29
239 0.27
240 0.23
241 0.15
242 0.12
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.11
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.14
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.16
311 0.15
312 0.16
313 0.15
314 0.14
315 0.12
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.12
320 0.12
321 0.13
322 0.17
323 0.2
324 0.24
325 0.33
326 0.41
327 0.49
328 0.59
329 0.67
330 0.75
331 0.77
332 0.78
333 0.75
334 0.76
335 0.71
336 0.69
337 0.6
338 0.52
339 0.47
340 0.41
341 0.34
342 0.24
343 0.17
344 0.08
345 0.07
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.1
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.15
380 0.15
381 0.14
382 0.16
383 0.14
384 0.14
385 0.15
386 0.16
387 0.13
388 0.14
389 0.14
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.08
394 0.07
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.08
424 0.06
425 0.05
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.11
447 0.11
448 0.1
449 0.11
450 0.09
451 0.09
452 0.11
453 0.1
454 0.08
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.07
467 0.08
468 0.1
469 0.1
470 0.12
471 0.13
472 0.14
473 0.17
474 0.2
475 0.22
476 0.24
477 0.28
478 0.29
479 0.28
480 0.28
481 0.28
482 0.27
483 0.24
484 0.27
485 0.25
486 0.24
487 0.23
488 0.24
489 0.25
490 0.22
491 0.21
492 0.14
493 0.12
494 0.11
495 0.12
496 0.12
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.11
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.07
510 0.05
511 0.05
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.06
521 0.05
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.07
543 0.09
544 0.11
545 0.13
546 0.13
547 0.14
548 0.14
549 0.13
550 0.15
551 0.13
552 0.12
553 0.1
554 0.1
555 0.09
556 0.09
557 0.08
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.08
566 0.08
567 0.11
568 0.12
569 0.19
570 0.23
571 0.28
572 0.29
573 0.29
574 0.29
575 0.29
576 0.27
577 0.21
578 0.16
579 0.11
580 0.1
581 0.09
582 0.08
583 0.06
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.06
588 0.08
589 0.09
590 0.11
591 0.12
592 0.13
593 0.13
594 0.17
595 0.2
596 0.22
597 0.27
598 0.27
599 0.29
600 0.37
601 0.4
602 0.4
603 0.39
604 0.4
605 0.4
606 0.48
607 0.48
608 0.42
609 0.41
610 0.39
611 0.38
612 0.41
613 0.36
614 0.27
615 0.23
616 0.22
617 0.19
618 0.18
619 0.17
620 0.15
621 0.22
622 0.29
623 0.33
624 0.43
625 0.5
626 0.6
627 0.68
628 0.7
629 0.71
630 0.72
631 0.78
632 0.77
633 0.8
634 0.8
635 0.8
636 0.83
637 0.81
638 0.81
639 0.8
640 0.81
641 0.81
642 0.78
643 0.75
644 0.7
645 0.64
646 0.56
647 0.49
648 0.41
649 0.34
650 0.28
651 0.22
652 0.17
653 0.17
654 0.16
655 0.15
656 0.13
657 0.09
658 0.09
659 0.1
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.08
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.08
676 0.07
677 0.07
678 0.09
679 0.1
680 0.1
681 0.09
682 0.09
683 0.1
684 0.14
685 0.15
686 0.16
687 0.16
688 0.23
689 0.3
690 0.36
691 0.37
692 0.37
693 0.44
694 0.47
695 0.5
696 0.49
697 0.46
698 0.5
699 0.48
700 0.47
701 0.41
702 0.38
703 0.37
704 0.32
705 0.3
706 0.2
707 0.18
708 0.17
709 0.16
710 0.15
711 0.12
712 0.13
713 0.13
714 0.13
715 0.13
716 0.13
717 0.11
718 0.1
719 0.09
720 0.09
721 0.08
722 0.07
723 0.08
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.08
728 0.06
729 0.08
730 0.13
731 0.12
732 0.18
733 0.2
734 0.26
735 0.28
736 0.29
737 0.29
738 0.3
739 0.35
740 0.3
741 0.29
742 0.23
743 0.23
744 0.24
745 0.25
746 0.19
747 0.16
748 0.17
749 0.19
750 0.23
751 0.28
752 0.33
753 0.35
754 0.38
755 0.44
756 0.48
757 0.55
758 0.54
759 0.51
760 0.46
761 0.5
762 0.57
763 0.56
764 0.54
765 0.49
766 0.5
767 0.49
768 0.51
769 0.49
770 0.48
771 0.47
772 0.49
773 0.47
774 0.43
775 0.4
776 0.36
777 0.3
778 0.22
779 0.16
780 0.12
781 0.1
782 0.13
783 0.13
784 0.13
785 0.16
786 0.22
787 0.22
788 0.23
789 0.23
790 0.2
791 0.27
792 0.28
793 0.25
794 0.19
795 0.19
796 0.18
797 0.19
798 0.21
799 0.16
800 0.18
801 0.19
802 0.19
803 0.23
804 0.24
805 0.24
806 0.25
807 0.26
808 0.27
809 0.35
810 0.37
811 0.37
812 0.36
813 0.35
814 0.37
815 0.35
816 0.33
817 0.26
818 0.23
819 0.2
820 0.21
821 0.23
822 0.23
823 0.24
824 0.27
825 0.3
826 0.33
827 0.4
828 0.39
829 0.39
830 0.39
831 0.44
832 0.44
833 0.49
834 0.53
835 0.52
836 0.58
837 0.6
838 0.61
839 0.63
840 0.65
841 0.66
842 0.66
843 0.66
844 0.65
845 0.64
846 0.59
847 0.52
848 0.45
849 0.36
850 0.33
851 0.28
852 0.26
853 0.29
854 0.3
855 0.28
856 0.28
857 0.27
858 0.25
859 0.26
860 0.27
861 0.25
862 0.25
863 0.25
864 0.27
865 0.29
866 0.29
867 0.28
868 0.3
869 0.33
870 0.32
871 0.33
872 0.34
873 0.36
874 0.36
875 0.44
876 0.43
877 0.44
878 0.44
879 0.46
880 0.43
881 0.41
882 0.38
883 0.36
884 0.37
885 0.4
886 0.48
887 0.55
888 0.62
889 0.7
890 0.79
891 0.83
892 0.86
893 0.86
894 0.87
895 0.88
896 0.89
897 0.91
898 0.86
899 0.81
900 0.78
901 0.69