Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CIK4

Protein Details
Accession A0A0D1CIK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-220ASGSEQPPPKKRAKQPSHPRPTVNDHydrophilic
1230-1250VQLGSEKRRIRRNLMRKSQFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-212PKKRAKQPS
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 4, cyto 4, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0000448  P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG uma:UMAG_12286  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MAPRKKAGTPASAPMSALAARKAREEALANRSEGDPSTLGNGEAAPTSRLSRRQSENADATVEVPTTASHPVASDSTLASSSSARTSSSTLKRSRRSSTAPDPTSIAVTRPKRNSNSSSAQLPPDSTPSKATKATLSDRSCRTQSSTQTTPAGRNRGKDRQISDAEDIENDMNSDHDIQQILSEFGREAARSDIEASGSEQPPPKKRAKQPSHPRPTVNDPKKMPINRTHTDATPEVKMSSKNVALTKLASKEMHSEESSTSQHKAQQLVQRKPTEQQVRTRGAKRYFADKSHLRGESHIDSSAMPIEDEVTGFLAFGHEEDDEDQSIEANGVPDVDPKVDKKAKDMQSDLESHDSSEDEEQQGPTAAGNNGKKPNTRSVNRSRHRADPNGNGHQTSRTHVTTNHALVNQHEQDDDSVDDGHLQIGAPALTRAALLNAIPYSNFTPILDGKLKNTIVVENKRKRGREALYFGLRNGETLVFLGIGHVEILQGSAQVGGAVLSPATHGFKAANIFAPISNPLPVLKSVSTSHYPGQGMASADSLSSNADKNSDTYVDELLDAAFDTVVKVTPFASPITALGQVCPIGGLATPFSAPPSLELSNKVHHLAGIKVLFEPSIEEIAQKPKNLLADGTFSTMGLSAAYIPHKWQASLHHLSAAALSAAQHPQEESVVALIRGNKKVGKSTLSRMALERLLSMGKNIGAKVAYLELDLGQSDFGPPGMVALHVFSLSDNVQSDPVGEEADAVTAISQSQPQDTVDTEESIAVPKSNGVRSVRSVISLGPGWCQPRVPVRAHFIGDVSPRDDPESYVAAVHDLMDFFRARIQPGEPNENGGSHRVPIVINTQGWIKGLGADLAARIVPILRPTHIFDVIPRGSPDPIPPPTRGHPWLDVEGAILGAGPEIVTLESVSQLEFVQGSFGGGDKRSDTGGKQLNGTSETNEENDSLGDGGSEPPRYITEVGSKLAPAEARLLNVMSYLYATQLAPAEPDHALQVRGSWDLSEPLVHRRPLVVNVAQGLKAGIRVMALGSSVPDSLKLFALNSSIVAIVIRECDAAQDADAPQDVHGNIEAQKEHDVASPWKQAFDRAAQIAPSGLKSSTRCIGLGIVRSIDADAGHVHLLSPLDPAFLHRIEASTGASIGLVKGALELPVWASLNFEAIQEARESRLDVPPAAQHSTANGDDQQQQQLLAGMPRNQVPYLEWPHSANQNYKRKHLATNSLGSMSSGTSTVQLGSEKRRIRRNLMRKSQFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.36
3 0.3
4 0.27
5 0.24
6 0.23
7 0.23
8 0.26
9 0.28
10 0.26
11 0.28
12 0.32
13 0.33
14 0.37
15 0.4
16 0.38
17 0.38
18 0.37
19 0.34
20 0.3
21 0.27
22 0.19
23 0.16
24 0.19
25 0.18
26 0.17
27 0.16
28 0.15
29 0.12
30 0.14
31 0.14
32 0.11
33 0.12
34 0.16
35 0.21
36 0.28
37 0.33
38 0.4
39 0.46
40 0.54
41 0.59
42 0.64
43 0.64
44 0.58
45 0.55
46 0.47
47 0.4
48 0.32
49 0.26
50 0.17
51 0.12
52 0.1
53 0.1
54 0.12
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.14
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.15
70 0.14
71 0.14
72 0.15
73 0.19
74 0.27
75 0.35
76 0.42
77 0.48
78 0.57
79 0.65
80 0.7
81 0.74
82 0.72
83 0.71
84 0.72
85 0.74
86 0.75
87 0.69
88 0.64
89 0.59
90 0.52
91 0.48
92 0.39
93 0.32
94 0.3
95 0.35
96 0.42
97 0.47
98 0.55
99 0.57
100 0.64
101 0.67
102 0.66
103 0.67
104 0.62
105 0.6
106 0.55
107 0.53
108 0.46
109 0.42
110 0.36
111 0.35
112 0.33
113 0.28
114 0.31
115 0.31
116 0.35
117 0.35
118 0.35
119 0.33
120 0.37
121 0.43
122 0.47
123 0.48
124 0.51
125 0.53
126 0.57
127 0.54
128 0.5
129 0.5
130 0.47
131 0.5
132 0.51
133 0.51
134 0.49
135 0.54
136 0.53
137 0.55
138 0.54
139 0.56
140 0.51
141 0.54
142 0.58
143 0.62
144 0.66
145 0.66
146 0.62
147 0.61
148 0.62
149 0.6
150 0.55
151 0.48
152 0.42
153 0.35
154 0.33
155 0.25
156 0.2
157 0.15
158 0.11
159 0.08
160 0.09
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.12
170 0.12
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.14
177 0.14
178 0.14
179 0.16
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.2
185 0.2
186 0.23
187 0.27
188 0.32
189 0.39
190 0.44
191 0.51
192 0.54
193 0.63
194 0.71
195 0.75
196 0.8
197 0.84
198 0.9
199 0.91
200 0.87
201 0.81
202 0.76
203 0.76
204 0.76
205 0.73
206 0.7
207 0.62
208 0.64
209 0.69
210 0.68
211 0.64
212 0.62
213 0.62
214 0.57
215 0.59
216 0.55
217 0.48
218 0.48
219 0.45
220 0.39
221 0.33
222 0.31
223 0.26
224 0.26
225 0.25
226 0.22
227 0.25
228 0.24
229 0.26
230 0.27
231 0.28
232 0.27
233 0.28
234 0.31
235 0.28
236 0.29
237 0.25
238 0.25
239 0.28
240 0.3
241 0.32
242 0.27
243 0.26
244 0.24
245 0.28
246 0.29
247 0.26
248 0.24
249 0.22
250 0.26
251 0.27
252 0.29
253 0.31
254 0.37
255 0.45
256 0.52
257 0.58
258 0.59
259 0.57
260 0.57
261 0.6
262 0.62
263 0.57
264 0.57
265 0.58
266 0.61
267 0.66
268 0.69
269 0.68
270 0.63
271 0.66
272 0.59
273 0.59
274 0.56
275 0.52
276 0.54
277 0.51
278 0.5
279 0.5
280 0.51
281 0.43
282 0.39
283 0.42
284 0.39
285 0.35
286 0.31
287 0.24
288 0.2
289 0.21
290 0.22
291 0.16
292 0.11
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.05
307 0.06
308 0.07
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.21
327 0.25
328 0.25
329 0.29
330 0.38
331 0.43
332 0.48
333 0.49
334 0.44
335 0.44
336 0.46
337 0.43
338 0.37
339 0.3
340 0.24
341 0.23
342 0.18
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.1
353 0.11
354 0.1
355 0.15
356 0.18
357 0.23
358 0.29
359 0.31
360 0.35
361 0.36
362 0.45
363 0.48
364 0.5
365 0.53
366 0.58
367 0.67
368 0.69
369 0.74
370 0.68
371 0.68
372 0.7
373 0.68
374 0.64
375 0.62
376 0.65
377 0.64
378 0.62
379 0.53
380 0.48
381 0.44
382 0.39
383 0.33
384 0.3
385 0.22
386 0.23
387 0.23
388 0.28
389 0.29
390 0.3
391 0.3
392 0.27
393 0.26
394 0.26
395 0.32
396 0.28
397 0.23
398 0.21
399 0.18
400 0.16
401 0.17
402 0.16
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.08
428 0.09
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.11
433 0.12
434 0.16
435 0.19
436 0.18
437 0.18
438 0.24
439 0.24
440 0.22
441 0.22
442 0.21
443 0.25
444 0.33
445 0.42
446 0.44
447 0.52
448 0.57
449 0.58
450 0.57
451 0.58
452 0.54
453 0.53
454 0.51
455 0.5
456 0.51
457 0.5
458 0.46
459 0.42
460 0.37
461 0.28
462 0.24
463 0.16
464 0.1
465 0.09
466 0.1
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.04
491 0.06
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.08
496 0.09
497 0.1
498 0.11
499 0.1
500 0.11
501 0.11
502 0.11
503 0.12
504 0.11
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.1
510 0.11
511 0.1
512 0.12
513 0.12
514 0.16
515 0.18
516 0.19
517 0.2
518 0.21
519 0.21
520 0.18
521 0.18
522 0.16
523 0.14
524 0.12
525 0.12
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.08
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.09
544 0.08
545 0.07
546 0.06
547 0.05
548 0.04
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.05
557 0.06
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.09
564 0.1
565 0.1
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.06
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.06
583 0.1
584 0.11
585 0.12
586 0.15
587 0.17
588 0.18
589 0.19
590 0.19
591 0.15
592 0.14
593 0.15
594 0.12
595 0.14
596 0.12
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.09
602 0.09
603 0.06
604 0.07
605 0.06
606 0.07
607 0.08
608 0.15
609 0.17
610 0.16
611 0.15
612 0.15
613 0.16
614 0.16
615 0.16
616 0.1
617 0.11
618 0.12
619 0.13
620 0.12
621 0.1
622 0.1
623 0.1
624 0.09
625 0.06
626 0.05
627 0.03
628 0.05
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.09
633 0.09
634 0.1
635 0.11
636 0.14
637 0.21
638 0.25
639 0.24
640 0.23
641 0.22
642 0.22
643 0.21
644 0.17
645 0.09
646 0.05
647 0.06
648 0.05
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.06
661 0.1
662 0.13
663 0.14
664 0.15
665 0.16
666 0.17
667 0.21
668 0.22
669 0.22
670 0.22
671 0.26
672 0.33
673 0.33
674 0.33
675 0.3
676 0.3
677 0.27
678 0.24
679 0.2
680 0.12
681 0.11
682 0.1
683 0.09
684 0.08
685 0.08
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.08
693 0.07
694 0.06
695 0.06
696 0.05
697 0.06
698 0.06
699 0.05
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.03
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.05
713 0.04
714 0.05
715 0.04
716 0.06
717 0.06
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.08
722 0.08
723 0.08
724 0.07
725 0.07
726 0.06
727 0.06
728 0.05
729 0.05
730 0.05
731 0.05
732 0.04
733 0.03
734 0.03
735 0.03
736 0.04
737 0.05
738 0.05
739 0.06
740 0.07
741 0.07
742 0.09
743 0.09
744 0.13
745 0.12
746 0.13
747 0.12
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.11
752 0.07
753 0.06
754 0.08
755 0.1
756 0.11
757 0.16
758 0.17
759 0.19
760 0.21
761 0.26
762 0.24
763 0.22
764 0.21
765 0.17
766 0.17
767 0.17
768 0.15
769 0.12
770 0.14
771 0.15
772 0.15
773 0.15
774 0.15
775 0.2
776 0.24
777 0.26
778 0.28
779 0.32
780 0.35
781 0.35
782 0.34
783 0.27
784 0.25
785 0.24
786 0.22
787 0.18
788 0.15
789 0.14
790 0.16
791 0.16
792 0.13
793 0.14
794 0.14
795 0.12
796 0.12
797 0.12
798 0.11
799 0.1
800 0.1
801 0.07
802 0.06
803 0.05
804 0.07
805 0.07
806 0.07
807 0.11
808 0.11
809 0.12
810 0.13
811 0.15
812 0.19
813 0.23
814 0.3
815 0.26
816 0.29
817 0.29
818 0.28
819 0.27
820 0.24
821 0.2
822 0.14
823 0.15
824 0.12
825 0.11
826 0.11
827 0.14
828 0.14
829 0.13
830 0.14
831 0.14
832 0.14
833 0.14
834 0.13
835 0.1
836 0.08
837 0.09
838 0.08
839 0.07
840 0.07
841 0.06
842 0.06
843 0.06
844 0.04
845 0.04
846 0.04
847 0.05
848 0.08
849 0.09
850 0.1
851 0.13
852 0.16
853 0.19
854 0.2
855 0.2
856 0.17
857 0.25
858 0.25
859 0.24
860 0.22
861 0.2
862 0.2
863 0.21
864 0.23
865 0.21
866 0.25
867 0.26
868 0.28
869 0.31
870 0.34
871 0.4
872 0.4
873 0.37
874 0.37
875 0.37
876 0.37
877 0.33
878 0.29
879 0.23
880 0.19
881 0.15
882 0.1
883 0.07
884 0.04
885 0.03
886 0.03
887 0.02
888 0.02
889 0.03
890 0.03
891 0.03
892 0.03
893 0.04
894 0.05
895 0.05
896 0.05
897 0.06
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.06
902 0.06
903 0.05
904 0.06
905 0.05
906 0.06
907 0.07
908 0.08
909 0.09
910 0.09
911 0.1
912 0.11
913 0.13
914 0.13
915 0.19
916 0.26
917 0.26
918 0.27
919 0.27
920 0.28
921 0.3
922 0.3
923 0.23
924 0.19
925 0.19
926 0.18
927 0.18
928 0.16
929 0.13
930 0.12
931 0.11
932 0.09
933 0.07
934 0.06
935 0.06
936 0.08
937 0.1
938 0.11
939 0.1
940 0.11
941 0.12
942 0.14
943 0.14
944 0.14
945 0.19
946 0.21
947 0.22
948 0.22
949 0.21
950 0.19
951 0.19
952 0.18
953 0.11
954 0.14
955 0.13
956 0.14
957 0.14
958 0.14
959 0.12
960 0.13
961 0.12
962 0.07
963 0.07
964 0.06
965 0.06
966 0.07
967 0.07
968 0.08
969 0.09
970 0.09
971 0.09
972 0.09
973 0.11
974 0.1
975 0.11
976 0.12
977 0.12
978 0.12
979 0.11
980 0.13
981 0.12
982 0.13
983 0.13
984 0.11
985 0.11
986 0.12
987 0.13
988 0.14
989 0.14
990 0.21
991 0.26
992 0.26
993 0.25
994 0.27
995 0.29
996 0.3
997 0.35
998 0.29
999 0.25
1000 0.27
1001 0.29
1002 0.25
1003 0.23
1004 0.2
1005 0.14
1006 0.12
1007 0.11
1008 0.08
1009 0.06
1010 0.06
1011 0.06
1012 0.06
1013 0.06
1014 0.05
1015 0.06
1016 0.07
1017 0.07
1018 0.07
1019 0.08
1020 0.09
1021 0.1
1022 0.11
1023 0.11
1024 0.1
1025 0.11
1026 0.12
1027 0.11
1028 0.1
1029 0.1
1030 0.09
1031 0.08
1032 0.08
1033 0.07
1034 0.06
1035 0.07
1036 0.07
1037 0.07
1038 0.07
1039 0.08
1040 0.09
1041 0.09
1042 0.09
1043 0.11
1044 0.11
1045 0.12
1046 0.13
1047 0.12
1048 0.11
1049 0.14
1050 0.13
1051 0.12
1052 0.12
1053 0.13
1054 0.14
1055 0.17
1056 0.18
1057 0.16
1058 0.19
1059 0.18
1060 0.19
1061 0.2
1062 0.21
1063 0.21
1064 0.27
1065 0.34
1066 0.32
1067 0.35
1068 0.34
1069 0.34
1070 0.34
1071 0.35
1072 0.35
1073 0.3
1074 0.31
1075 0.27
1076 0.28
1077 0.26
1078 0.23
1079 0.2
1080 0.16
1081 0.14
1082 0.17
1083 0.18
1084 0.22
1085 0.25
1086 0.25
1087 0.24
1088 0.23
1089 0.27
1090 0.27
1091 0.3
1092 0.27
1093 0.23
1094 0.22
1095 0.22
1096 0.21
1097 0.18
1098 0.13
1099 0.09
1100 0.08
1101 0.09
1102 0.09
1103 0.09
1104 0.09
1105 0.1
1106 0.1
1107 0.1
1108 0.11
1109 0.09
1110 0.1
1111 0.1
1112 0.13
1113 0.16
1114 0.16
1115 0.17
1116 0.15
1117 0.16
1118 0.17
1119 0.18
1120 0.17
1121 0.13
1122 0.12
1123 0.11
1124 0.1
1125 0.1
1126 0.08
1127 0.08
1128 0.06
1129 0.05
1130 0.06
1131 0.06
1132 0.07
1133 0.07
1134 0.07
1135 0.07
1136 0.1
1137 0.12
1138 0.1
1139 0.12
1140 0.11
1141 0.14
1142 0.14
1143 0.13
1144 0.12
1145 0.11
1146 0.13
1147 0.13
1148 0.14
1149 0.13
1150 0.14
1151 0.16
1152 0.18
1153 0.23
1154 0.25
1155 0.23
1156 0.25
1157 0.28
1158 0.31
1159 0.32
1160 0.29
1161 0.24
1162 0.24
1163 0.28
1164 0.27
1165 0.24
1166 0.22
1167 0.22
1168 0.27
1169 0.3
1170 0.32
1171 0.27
1172 0.26
1173 0.24
1174 0.25
1175 0.23
1176 0.22
1177 0.23
1178 0.24
1179 0.26
1180 0.29
1181 0.31
1182 0.3
1183 0.28
1184 0.27
1185 0.32
1186 0.35
1187 0.36
1188 0.34
1189 0.34
1190 0.38
1191 0.45
1192 0.46
1193 0.46
1194 0.49
1195 0.56
1196 0.58
1197 0.62
1198 0.66
1199 0.63
1200 0.66
1201 0.66
1202 0.66
1203 0.64
1204 0.67
1205 0.63
1206 0.56
1207 0.53
1208 0.44
1209 0.36
1210 0.26
1211 0.2
1212 0.13
1213 0.1
1214 0.1
1215 0.1
1216 0.1
1217 0.11
1218 0.14
1219 0.18
1220 0.25
1221 0.33
1222 0.4
1223 0.46
1224 0.55
1225 0.6
1226 0.67
1227 0.74
1228 0.77
1229 0.8
1230 0.84