Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4JEF0

Protein Details
Accession A0A3N4JEF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-121SGKGIAPTGKRKYRRHPKPDEHAPEKPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-112GKGIAPTGKRKYRRHPKP
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTDLEEVLARLGLSQYLGRLSEEGFEKWEAVMDITEQDLAFLNFKLGHRRLLQREIASARGIPPTQALTSLHNYPSDDIEPEDRSSPKPFKQDSGKGIAPTGKRKYRRHPKPDEHAPEKPPSAYVMFANRVRDELKGQNLSFTDIAKLVGEKWKVLDPENKESYEHEASIAKEKYNSELLEYKKTDSYKEYIQYLSDFKSKASKEGREGSEQAEANRKRPKLESVPTAGTVGSATTSSSVSVASGISATAPPVLGLGRGCGPTGPGTATSSDQSAYTSPSSHDSGTYHSSGTQSMPPSASRAYPVSPIRRSRSPSDVARYRDAVMRSTQQQQQEAFVAPVTEPESPFFPRIHPTIQSPHIQQQSSFMRHQPPPMGAQPISRTGPPIPNPAMRRASLRSDETVPSTPTSISSGSSSAPSLTPSVSSFDDGGRSHRALPSLPPPTPGPSAGSGYFDQRPHRPPASSTRSPRTYQQNLPPPPTPVGMSSYPSYQTASSHASSTPSQLGPESMNTSVGANAGGINPSPPQSKPPSQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.12
4 0.13
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.18
9 0.2
10 0.19
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.2
16 0.16
17 0.13
18 0.13
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.13
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.12
30 0.14
31 0.16
32 0.25
33 0.25
34 0.31
35 0.36
36 0.45
37 0.5
38 0.54
39 0.59
40 0.52
41 0.57
42 0.53
43 0.49
44 0.42
45 0.36
46 0.31
47 0.29
48 0.27
49 0.21
50 0.2
51 0.21
52 0.19
53 0.21
54 0.2
55 0.2
56 0.24
57 0.28
58 0.27
59 0.26
60 0.27
61 0.25
62 0.28
63 0.24
64 0.21
65 0.19
66 0.22
67 0.22
68 0.23
69 0.26
70 0.24
71 0.25
72 0.31
73 0.36
74 0.38
75 0.45
76 0.46
77 0.49
78 0.57
79 0.63
80 0.61
81 0.62
82 0.59
83 0.51
84 0.51
85 0.49
86 0.44
87 0.45
88 0.48
89 0.49
90 0.55
91 0.62
92 0.71
93 0.76
94 0.83
95 0.85
96 0.87
97 0.88
98 0.89
99 0.92
100 0.91
101 0.87
102 0.83
103 0.77
104 0.72
105 0.64
106 0.54
107 0.43
108 0.36
109 0.3
110 0.24
111 0.21
112 0.21
113 0.24
114 0.27
115 0.29
116 0.27
117 0.27
118 0.27
119 0.26
120 0.25
121 0.25
122 0.3
123 0.32
124 0.32
125 0.33
126 0.33
127 0.35
128 0.3
129 0.25
130 0.2
131 0.14
132 0.15
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.15
137 0.16
138 0.15
139 0.16
140 0.2
141 0.21
142 0.24
143 0.29
144 0.29
145 0.37
146 0.4
147 0.39
148 0.36
149 0.36
150 0.39
151 0.35
152 0.29
153 0.22
154 0.2
155 0.21
156 0.28
157 0.28
158 0.22
159 0.22
160 0.22
161 0.24
162 0.25
163 0.24
164 0.2
165 0.24
166 0.26
167 0.32
168 0.32
169 0.31
170 0.31
171 0.32
172 0.3
173 0.28
174 0.28
175 0.26
176 0.28
177 0.28
178 0.25
179 0.25
180 0.25
181 0.24
182 0.23
183 0.21
184 0.18
185 0.16
186 0.23
187 0.23
188 0.28
189 0.32
190 0.33
191 0.35
192 0.43
193 0.45
194 0.42
195 0.43
196 0.37
197 0.36
198 0.33
199 0.29
200 0.31
201 0.29
202 0.31
203 0.36
204 0.35
205 0.32
206 0.33
207 0.39
208 0.38
209 0.43
210 0.42
211 0.41
212 0.42
213 0.4
214 0.38
215 0.31
216 0.23
217 0.17
218 0.12
219 0.07
220 0.05
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.09
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.12
267 0.13
268 0.12
269 0.13
270 0.11
271 0.14
272 0.17
273 0.17
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.18
291 0.22
292 0.27
293 0.32
294 0.37
295 0.41
296 0.44
297 0.48
298 0.46
299 0.47
300 0.46
301 0.45
302 0.48
303 0.5
304 0.49
305 0.47
306 0.45
307 0.4
308 0.38
309 0.34
310 0.27
311 0.23
312 0.23
313 0.23
314 0.27
315 0.3
316 0.28
317 0.31
318 0.29
319 0.29
320 0.27
321 0.24
322 0.19
323 0.15
324 0.13
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.1
331 0.12
332 0.14
333 0.16
334 0.15
335 0.14
336 0.17
337 0.19
338 0.22
339 0.21
340 0.23
341 0.27
342 0.3
343 0.33
344 0.32
345 0.37
346 0.39
347 0.37
348 0.33
349 0.35
350 0.39
351 0.39
352 0.38
353 0.35
354 0.37
355 0.38
356 0.42
357 0.38
358 0.32
359 0.32
360 0.34
361 0.35
362 0.28
363 0.3
364 0.29
365 0.3
366 0.3
367 0.25
368 0.25
369 0.23
370 0.29
371 0.28
372 0.32
373 0.32
374 0.37
375 0.39
376 0.43
377 0.44
378 0.39
379 0.4
380 0.37
381 0.4
382 0.38
383 0.39
384 0.35
385 0.35
386 0.35
387 0.35
388 0.34
389 0.29
390 0.25
391 0.24
392 0.2
393 0.18
394 0.19
395 0.15
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.14
410 0.14
411 0.15
412 0.14
413 0.14
414 0.18
415 0.17
416 0.2
417 0.21
418 0.22
419 0.22
420 0.24
421 0.25
422 0.22
423 0.26
424 0.32
425 0.34
426 0.33
427 0.34
428 0.34
429 0.37
430 0.38
431 0.34
432 0.28
433 0.24
434 0.27
435 0.25
436 0.27
437 0.23
438 0.25
439 0.29
440 0.29
441 0.31
442 0.34
443 0.38
444 0.42
445 0.46
446 0.44
447 0.43
448 0.51
449 0.56
450 0.58
451 0.62
452 0.64
453 0.65
454 0.65
455 0.68
456 0.67
457 0.66
458 0.65
459 0.67
460 0.68
461 0.69
462 0.72
463 0.67
464 0.61
465 0.56
466 0.49
467 0.41
468 0.32
469 0.31
470 0.28
471 0.28
472 0.26
473 0.26
474 0.26
475 0.25
476 0.25
477 0.2
478 0.19
479 0.2
480 0.24
481 0.22
482 0.22
483 0.22
484 0.24
485 0.24
486 0.27
487 0.28
488 0.23
489 0.23
490 0.22
491 0.23
492 0.22
493 0.24
494 0.24
495 0.2
496 0.2
497 0.2
498 0.19
499 0.18
500 0.16
501 0.12
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.11
509 0.14
510 0.17
511 0.17
512 0.23
513 0.31