Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CA16

Protein Details
Accession A0A0D1CA16    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-221PSTAKPEGDRTPKQKRKRRWDVAAPAETSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-211RTPKQKRKRR
Subcellular Location(s) cyto 14.5cyto_nucl 14.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR015016  SF3b_su1  
IPR038737  SF3b_su1-like  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005689  C:U12-type spliceosomal complex  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
KEGG uma:UMAG_05241  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08920  SF3b1  
Amino Acid Sequences MTEEVDEIRRLQEARSASALKNTLAVGKLGIYDQDIYGSGKRSSDYVRELPMDMGNTDSGSDNDDDTSSGRRSNPLDVYSAPHHLLHEFVDEDHDPLKARAESRQIAARQSDYHLRRFNRELGDGKAVDAFAEDDQANGGDDQESYKDRMRRAALERETRQVTRLIEIKEKEAKEKEAERSQETDEWDVKPSPSTAKPEGDRTPKQKRKRRWDVAAPAETSEADTETKGQTSQASSSEQAPRKRRSRWDEAPVEANDTASILTPEAANPIAKRSRWDQAPIEEDGSNGIGKVQSSSSSISHAVSIAVDPRNRYMSDEELDSILPSEGYKVVQPPPDYAPTRTPAANLITVPSLETGGFMMQDEGATRAVLEEMIPELPTDIPGVGQLAFFKTEDQAFFKKILNEQDETKLSLDEQKERKIMRLLLKIKNGTPATRKTALRQITDRARDFGPGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVGRILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFSVVASALGIPALLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAIMMGCAILPHLKSLVDCVEKGLEDEQQKVKTMTALSLAALAEAAAPYGIESFENVLKPLWIGIRQHRGKGLAAFLKAIGFIIPLMDSDSTLYFVKEVTPTLIREFQSADEEMKKIVLKVVKQCAATDGVTGAFLRDEMLPEYFKNFWVRRLALDRRNYKQVVETTVELANKVGVAEVVSRIVNELKDESEPFRKMVMETIQQVVSNLGAADIDERLEVQLIDGLIYAFQEQTVEDHVMLEGVGTVVNALGMRVKPYLTQIVSTILWRLNNKNAKTRQQAADLTTKLALVIKQCGEEALLAKLGVVLFEQLGEEFPEALASIISAETAIANVVGMAQMNPPIKDLLPRMTPILRNRHEKVQEASINLIGRIADKGADSVNPREWMRICFELLDLLKAHKKAIRRAAVNSFGYIARAIGPSDVLQVLLTNLRVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTTIPAILNEYRTPELNVRNGCLKALSWVFEYIGEMSKDYVYSVISCLDDALTDRDHVHRQTAASIVHHLALGTFGLGHEESMQHLLNLIWPNIFETSPHVLGSVMAAIESLEVALGPGVLLNHTLQGLFHPARKVREIYVRLYNSTYLRSQDAMVAYYPDFSEFSDERNDFRRHELYTLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.32
4 0.3
5 0.36
6 0.38
7 0.32
8 0.32
9 0.28
10 0.26
11 0.23
12 0.22
13 0.16
14 0.15
15 0.16
16 0.14
17 0.14
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.17
25 0.2
26 0.19
27 0.19
28 0.2
29 0.22
30 0.25
31 0.29
32 0.34
33 0.34
34 0.38
35 0.39
36 0.4
37 0.39
38 0.37
39 0.32
40 0.25
41 0.23
42 0.18
43 0.16
44 0.15
45 0.14
46 0.12
47 0.13
48 0.14
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.18
55 0.17
56 0.19
57 0.2
58 0.25
59 0.27
60 0.34
61 0.38
62 0.35
63 0.37
64 0.34
65 0.39
66 0.37
67 0.38
68 0.33
69 0.28
70 0.27
71 0.24
72 0.24
73 0.19
74 0.19
75 0.16
76 0.14
77 0.18
78 0.17
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.16
83 0.16
84 0.21
85 0.2
86 0.21
87 0.25
88 0.33
89 0.35
90 0.37
91 0.44
92 0.41
93 0.43
94 0.45
95 0.42
96 0.36
97 0.37
98 0.43
99 0.39
100 0.46
101 0.49
102 0.49
103 0.53
104 0.55
105 0.58
106 0.54
107 0.56
108 0.51
109 0.48
110 0.52
111 0.45
112 0.41
113 0.35
114 0.29
115 0.23
116 0.2
117 0.16
118 0.09
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.07
128 0.07
129 0.09
130 0.11
131 0.14
132 0.16
133 0.23
134 0.27
135 0.28
136 0.35
137 0.38
138 0.43
139 0.48
140 0.54
141 0.57
142 0.62
143 0.63
144 0.63
145 0.64
146 0.57
147 0.52
148 0.46
149 0.39
150 0.34
151 0.37
152 0.34
153 0.36
154 0.37
155 0.41
156 0.45
157 0.45
158 0.47
159 0.45
160 0.45
161 0.44
162 0.5
163 0.52
164 0.52
165 0.55
166 0.51
167 0.5
168 0.5
169 0.47
170 0.43
171 0.4
172 0.35
173 0.32
174 0.32
175 0.3
176 0.27
177 0.25
178 0.24
179 0.25
180 0.26
181 0.32
182 0.33
183 0.38
184 0.41
185 0.46
186 0.53
187 0.56
188 0.6
189 0.62
190 0.68
191 0.71
192 0.78
193 0.81
194 0.84
195 0.86
196 0.89
197 0.91
198 0.89
199 0.9
200 0.9
201 0.9
202 0.85
203 0.75
204 0.64
205 0.55
206 0.44
207 0.35
208 0.25
209 0.16
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.15
219 0.16
220 0.17
221 0.19
222 0.19
223 0.25
224 0.33
225 0.37
226 0.43
227 0.49
228 0.56
229 0.61
230 0.68
231 0.73
232 0.72
233 0.76
234 0.77
235 0.79
236 0.76
237 0.71
238 0.7
239 0.6
240 0.56
241 0.45
242 0.36
243 0.25
244 0.19
245 0.16
246 0.1
247 0.1
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.16
257 0.21
258 0.21
259 0.24
260 0.27
261 0.34
262 0.36
263 0.42
264 0.4
265 0.42
266 0.45
267 0.43
268 0.42
269 0.34
270 0.3
271 0.25
272 0.21
273 0.14
274 0.11
275 0.09
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.11
282 0.13
283 0.13
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.14
289 0.12
290 0.1
291 0.1
292 0.12
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.19
297 0.22
298 0.22
299 0.24
300 0.22
301 0.23
302 0.23
303 0.23
304 0.22
305 0.2
306 0.19
307 0.16
308 0.14
309 0.1
310 0.08
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.09
316 0.11
317 0.15
318 0.2
319 0.21
320 0.23
321 0.26
322 0.32
323 0.34
324 0.34
325 0.34
326 0.32
327 0.34
328 0.31
329 0.28
330 0.24
331 0.24
332 0.23
333 0.19
334 0.17
335 0.15
336 0.15
337 0.14
338 0.11
339 0.09
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.1
380 0.11
381 0.15
382 0.17
383 0.17
384 0.19
385 0.21
386 0.22
387 0.25
388 0.3
389 0.29
390 0.29
391 0.3
392 0.33
393 0.32
394 0.31
395 0.28
396 0.21
397 0.18
398 0.22
399 0.21
400 0.24
401 0.27
402 0.3
403 0.34
404 0.34
405 0.37
406 0.36
407 0.4
408 0.39
409 0.45
410 0.47
411 0.49
412 0.55
413 0.54
414 0.5
415 0.52
416 0.45
417 0.4
418 0.38
419 0.36
420 0.37
421 0.41
422 0.41
423 0.37
424 0.44
425 0.45
426 0.44
427 0.42
428 0.42
429 0.44
430 0.5
431 0.47
432 0.42
433 0.37
434 0.35
435 0.33
436 0.31
437 0.25
438 0.2
439 0.21
440 0.19
441 0.19
442 0.17
443 0.17
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.1
451 0.09
452 0.11
453 0.11
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.14
458 0.15
459 0.15
460 0.13
461 0.14
462 0.13
463 0.17
464 0.18
465 0.17
466 0.18
467 0.18
468 0.18
469 0.18
470 0.18
471 0.13
472 0.13
473 0.14
474 0.14
475 0.15
476 0.16
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.12
482 0.11
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.04
493 0.03
494 0.03
495 0.04
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.08
503 0.09
504 0.11
505 0.11
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.14
510 0.12
511 0.1
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.05
525 0.06
526 0.08
527 0.1
528 0.11
529 0.1
530 0.13
531 0.13
532 0.15
533 0.15
534 0.14
535 0.11
536 0.11
537 0.12
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.1
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.09
546 0.08
547 0.07
548 0.05
549 0.04
550 0.04
551 0.03
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.04
558 0.05
559 0.08
560 0.13
561 0.19
562 0.23
563 0.26
564 0.33
565 0.43
566 0.51
567 0.57
568 0.58
569 0.6
570 0.62
571 0.66
572 0.62
573 0.55
574 0.48
575 0.43
576 0.39
577 0.32
578 0.27
579 0.2
580 0.18
581 0.14
582 0.12
583 0.07
584 0.05
585 0.04
586 0.03
587 0.02
588 0.03
589 0.03
590 0.04
591 0.04
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.07
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.11
600 0.11
601 0.1
602 0.11
603 0.11
604 0.11
605 0.11
606 0.14
607 0.17
608 0.17
609 0.18
610 0.18
611 0.17
612 0.15
613 0.14
614 0.12
615 0.1
616 0.1
617 0.08
618 0.09
619 0.09
620 0.07
621 0.06
622 0.06
623 0.04
624 0.03
625 0.03
626 0.02
627 0.02
628 0.02
629 0.03
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.05
634 0.06
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.08
641 0.07
642 0.08
643 0.11
644 0.16
645 0.26
646 0.28
647 0.29
648 0.3
649 0.3
650 0.29
651 0.28
652 0.26
653 0.19
654 0.18
655 0.17
656 0.16
657 0.14
658 0.13
659 0.11
660 0.07
661 0.04
662 0.04
663 0.03
664 0.03
665 0.03
666 0.05
667 0.04
668 0.05
669 0.05
670 0.06
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.06
675 0.06
676 0.08
677 0.07
678 0.08
679 0.08
680 0.1
681 0.11
682 0.13
683 0.18
684 0.17
685 0.17
686 0.18
687 0.16
688 0.17
689 0.17
690 0.16
691 0.13
692 0.13
693 0.12
694 0.13
695 0.12
696 0.1
697 0.12
698 0.13
699 0.15
700 0.21
701 0.27
702 0.3
703 0.3
704 0.3
705 0.28
706 0.28
707 0.25
708 0.19
709 0.13
710 0.09
711 0.09
712 0.09
713 0.07
714 0.05
715 0.04
716 0.05
717 0.05
718 0.06
719 0.07
720 0.08
721 0.09
722 0.09
723 0.12
724 0.11
725 0.13
726 0.19
727 0.19
728 0.21
729 0.26
730 0.27
731 0.27
732 0.35
733 0.41
734 0.41
735 0.49
736 0.52
737 0.5
738 0.56
739 0.53
740 0.46
741 0.44
742 0.39
743 0.35
744 0.31
745 0.27
746 0.23
747 0.25
748 0.24
749 0.19
750 0.16
751 0.12
752 0.09
753 0.08
754 0.06
755 0.04
756 0.04
757 0.05
758 0.05
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.07
763 0.08
764 0.08
765 0.08
766 0.09
767 0.09
768 0.1
769 0.12
770 0.14
771 0.19
772 0.2
773 0.2
774 0.2
775 0.19
776 0.18
777 0.21
778 0.22
779 0.19
780 0.2
781 0.21
782 0.21
783 0.2
784 0.2
785 0.16
786 0.12
787 0.09
788 0.07
789 0.04
790 0.04
791 0.04
792 0.04
793 0.04
794 0.04
795 0.04
796 0.04
797 0.04
798 0.05
799 0.05
800 0.04
801 0.06
802 0.05
803 0.05
804 0.05
805 0.05
806 0.05
807 0.05
808 0.06
809 0.04
810 0.04
811 0.04
812 0.04
813 0.05
814 0.07
815 0.08
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.08
820 0.08
821 0.07
822 0.04
823 0.03
824 0.03
825 0.03
826 0.03
827 0.03
828 0.03
829 0.03
830 0.03
831 0.05
832 0.06
833 0.08
834 0.08
835 0.09
836 0.09
837 0.12
838 0.18
839 0.16
840 0.17
841 0.16
842 0.18
843 0.19
844 0.18
845 0.18
846 0.14
847 0.17
848 0.18
849 0.21
850 0.26
851 0.34
852 0.36
853 0.43
854 0.49
855 0.54
856 0.59
857 0.63
858 0.58
859 0.56
860 0.56
861 0.51
862 0.51
863 0.43
864 0.38
865 0.31
866 0.27
867 0.21
868 0.19
869 0.17
870 0.11
871 0.15
872 0.14
873 0.14
874 0.14
875 0.14
876 0.13
877 0.13
878 0.12
879 0.09
880 0.09
881 0.08
882 0.08
883 0.09
884 0.08
885 0.07
886 0.06
887 0.05
888 0.05
889 0.05
890 0.05
891 0.04
892 0.05
893 0.06
894 0.06
895 0.06
896 0.06
897 0.06
898 0.06
899 0.06
900 0.05
901 0.04
902 0.04
903 0.04
904 0.04
905 0.04
906 0.03
907 0.03
908 0.04
909 0.04
910 0.03
911 0.03
912 0.03
913 0.03
914 0.03
915 0.03
916 0.04
917 0.04
918 0.09
919 0.11
920 0.12
921 0.13
922 0.14
923 0.14
924 0.17
925 0.2
926 0.21
927 0.22
928 0.23
929 0.25
930 0.28
931 0.34
932 0.37
933 0.44
934 0.45
935 0.5
936 0.53
937 0.59
938 0.59
939 0.57
940 0.54
941 0.53
942 0.5
943 0.44
944 0.42
945 0.36
946 0.32
947 0.28
948 0.24
949 0.15
950 0.13
951 0.12
952 0.1
953 0.08
954 0.07
955 0.08
956 0.09
957 0.11
958 0.14
959 0.17
960 0.21
961 0.24
962 0.24
963 0.28
964 0.29
965 0.28
966 0.3
967 0.29
968 0.26
969 0.22
970 0.22
971 0.23
972 0.22
973 0.22
974 0.17
975 0.18
976 0.22
977 0.22
978 0.24
979 0.22
980 0.27
981 0.33
982 0.42
983 0.47
984 0.46
985 0.52
986 0.57
987 0.62
988 0.57
989 0.49
990 0.41
991 0.33
992 0.3
993 0.24
994 0.17
995 0.11
996 0.11
997 0.1
998 0.09
999 0.1
1000 0.09
1001 0.11
1002 0.11
1003 0.09
1004 0.08
1005 0.08
1006 0.09
1007 0.1
1008 0.1
1009 0.09
1010 0.11
1011 0.13
1012 0.14
1013 0.16
1014 0.25
1015 0.3
1016 0.36
1017 0.39
1018 0.42
1019 0.42
1020 0.42
1021 0.4
1022 0.32
1023 0.3
1024 0.23
1025 0.19
1026 0.15
1027 0.13
1028 0.12
1029 0.11
1030 0.1
1031 0.05
1032 0.05
1033 0.05
1034 0.06
1035 0.06
1036 0.07
1037 0.1
1038 0.11
1039 0.12
1040 0.13
1041 0.18
1042 0.18
1043 0.21
1044 0.21
1045 0.23
1046 0.23
1047 0.23
1048 0.25
1049 0.26
1050 0.3
1051 0.34
1052 0.35
1053 0.34
1054 0.38
1055 0.37
1056 0.35
1057 0.3
1058 0.25
1059 0.24
1060 0.24
1061 0.23
1062 0.19
1063 0.2
1064 0.2
1065 0.19
1066 0.2
1067 0.16
1068 0.18
1069 0.16
1070 0.15
1071 0.15
1072 0.15
1073 0.14
1074 0.13
1075 0.12
1076 0.09
1077 0.09
1078 0.1
1079 0.11
1080 0.11
1081 0.11
1082 0.11
1083 0.1
1084 0.1
1085 0.11
1086 0.13
1087 0.12
1088 0.13
1089 0.14
1090 0.18
1091 0.23
1092 0.24
1093 0.26
1094 0.26
1095 0.25
1096 0.27
1097 0.29
1098 0.27
1099 0.24
1100 0.26
1101 0.24
1102 0.21
1103 0.2
1104 0.18
1105 0.14
1106 0.12
1107 0.1
1108 0.07
1109 0.06
1110 0.05
1111 0.07
1112 0.08
1113 0.08
1114 0.08
1115 0.09
1116 0.1
1117 0.13
1118 0.14
1119 0.11
1120 0.12
1121 0.11
1122 0.16
1123 0.19
1124 0.18
1125 0.16
1126 0.16
1127 0.18
1128 0.19
1129 0.19
1130 0.14
1131 0.16
1132 0.22
1133 0.22
1134 0.22
1135 0.2
1136 0.19
1137 0.19
1138 0.19
1139 0.15
1140 0.08
1141 0.07
1142 0.07
1143 0.07
1144 0.06
1145 0.06
1146 0.05
1147 0.03
1148 0.03
1149 0.03
1150 0.03
1151 0.03
1152 0.03
1153 0.04
1154 0.04
1155 0.05
1156 0.07
1157 0.07
1158 0.08
1159 0.09
1160 0.09
1161 0.08
1162 0.1
1163 0.18
1164 0.19
1165 0.23
1166 0.29
1167 0.33
1168 0.38
1169 0.44
1170 0.45
1171 0.43
1172 0.51
1173 0.51
1174 0.49
1175 0.55
1176 0.53
1177 0.51
1178 0.5
1179 0.48
1180 0.4
1181 0.4
1182 0.37
1183 0.3
1184 0.3
1185 0.28
1186 0.27
1187 0.27
1188 0.26
1189 0.24
1190 0.22
1191 0.22
1192 0.19
1193 0.19
1194 0.18
1195 0.15
1196 0.14
1197 0.13
1198 0.19
1199 0.17
1200 0.2
1201 0.27
1202 0.28
1203 0.3
1204 0.37
1205 0.4
1206 0.35
1207 0.42
1208 0.44
1209 0.38