FuNGI

A0A3N4JP39

Protein Details

Accession

A0A3N4JP39

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
235-256	MKRKVAPASKPRSKKRQKVSIY	Hydrophilic
360-382	IVAAPRPPKKKARKRSYSDDEGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
236-252	KRKVAPASKPRSKKRQK
364-375	PRPPKKKARKRS

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013197 RNA_pol_III_RPC82-rel_HTH IPR008806 RNA_pol_III_Rpc82_C IPR039748 RPC3 IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF08221 HTH_9 PF05645 RNA_pol_Rpc82

Amino Acid Sequences

MSQNATELCVLLVKDIYGEVSSRVVSVLLELGRLPVSQLVRQLKLPEKIIKQTLAVLIQQHLVVHFAHLETGQEVVYYECEWTQVYELLRAGRIIRAVEERFGNNGALIVSNLLQLGHARVSDFIAAYGTSTKKSKITVNGKSDALTIEDESPITSIETLKSVMADMLKERFLVQVQEHHMHIRTDTQNTLRAQLISQLRKSQLSENKLGKEVDRQMKIKMQELADGDISEHAGMKRKVAPASKPRSKKRQKVSIYDLIEQEEEEEWEINENIVLRVNHEKFLVLFRNAELVSLAEGRHGKVSSQVYAEFLKRLEGKYFRCRELYSADDDEEEDPKKRIKLSVLELSKTFSKDIDLENSIVAAPRPPKKKARKRSYSDDEGEDKPRTNGYKKKVNGKGKCRQSDSEDDGDDDDDLSDLEELNDDDDEEGIDAENRKKKHRMELLKQHMQLLAEDSWKFVRLESNRGLGEWSVNYKELGKLMRHIELEKVVEETFGEMGLRLLRIIKDKGKLEEKQVASIALLKQKEIRSILTGLQENGYLHLQEVPKTSIPQVSRTYFLWFHDSDRAIQSLITDTHKAMSRAIQRTNVERTKRSSLLEKWERTDVQANVEEYLTTSEKRELEIWLSREEKLLCQLMRLDKTMMILRDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.1
3	0.11
4	0.09
5	0.1
6	0.1
7	0.11
8	0.11
9	0.11
10	0.11
11	0.1
12	0.09
13	0.09
14	0.12
15	0.11
16	0.11
17	0.11
18	0.12
19	0.13
20	0.13
21	0.12
22	0.13
23	0.16
24	0.17
25	0.26
26	0.31
27	0.32
28	0.35
29	0.41
30	0.44
31	0.47
32	0.51
33	0.51
34	0.5
35	0.55
36	0.58
37	0.53
38	0.46
39	0.44
40	0.41
41	0.36
42	0.32
43	0.27
44	0.23
45	0.23
46	0.22
47	0.18
48	0.15
49	0.14
50	0.12
51	0.11
52	0.1
53	0.09
54	0.1
55	0.09
56	0.1
57	0.09
58	0.1
59	0.08
60	0.07
61	0.08
62	0.07
63	0.09
64	0.08
65	0.09
66	0.08
67	0.09
68	0.09
69	0.1
70	0.12
71	0.14
72	0.14
73	0.17
74	0.18
75	0.19
76	0.2
77	0.19
78	0.18
79	0.17
80	0.18
81	0.15
82	0.17
83	0.22
84	0.22
85	0.24
86	0.26
87	0.25
88	0.25
89	0.26
90	0.23
91	0.17
92	0.16
93	0.13
94	0.11
95	0.1
96	0.09
97	0.07
98	0.08
99	0.08
100	0.07
101	0.07
102	0.07
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.11
109	0.12
110	0.11
111	0.09
112	0.09
113	0.08
114	0.09
115	0.12
116	0.12
117	0.14
118	0.15
119	0.17
120	0.19
121	0.22
122	0.27
123	0.33
124	0.42
125	0.49
126	0.54
127	0.56
128	0.54
129	0.52
130	0.47
131	0.37
132	0.29
133	0.21
134	0.16
135	0.13
136	0.13
137	0.12
138	0.11
139	0.11
140	0.09
141	0.08
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.1
154	0.12
155	0.12
156	0.12
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.15
161	0.14
162	0.18
163	0.23
164	0.25
165	0.25
166	0.26
167	0.27
168	0.25
169	0.24
170	0.25
171	0.23
172	0.24
173	0.26
174	0.26
175	0.31
176	0.31
177	0.33
178	0.27
179	0.24
180	0.21
181	0.25
182	0.31
183	0.29
184	0.31
185	0.33
186	0.33
187	0.34
188	0.36
189	0.37
190	0.37
191	0.38
192	0.44
193	0.44
194	0.45
195	0.46
196	0.45
197	0.37
198	0.37
199	0.4
200	0.39
201	0.4
202	0.39
203	0.39
204	0.43
205	0.44
206	0.41
207	0.37
208	0.3
209	0.28
210	0.28
211	0.27
212	0.23
213	0.21
214	0.17
215	0.13
216	0.12
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.13
221	0.13
222	0.15
223	0.2
224	0.23
225	0.27
226	0.29
227	0.37
228	0.4
229	0.5
230	0.57
231	0.62
232	0.66
233	0.73
234	0.8
235	0.81
236	0.81
237	0.81
238	0.8
239	0.79
240	0.79
241	0.77
242	0.71
243	0.64
244	0.55
245	0.46
246	0.39
247	0.3
248	0.23
249	0.14
250	0.1
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.17
264	0.18
265	0.19
266	0.19
267	0.19
268	0.16
269	0.21
270	0.22
271	0.15
272	0.15
273	0.14
274	0.17
275	0.17
276	0.16
277	0.12
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.09
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.11
286	0.11
287	0.1
288	0.14
289	0.16
290	0.15
291	0.16
292	0.16
293	0.16
294	0.17
295	0.18
296	0.13
297	0.12
298	0.13
299	0.13
300	0.14
301	0.16
302	0.19
303	0.23
304	0.32
305	0.36
306	0.35
307	0.36
308	0.35
309	0.33
310	0.32
311	0.29
312	0.24
313	0.21
314	0.2
315	0.18
316	0.18
317	0.17
318	0.15
319	0.14
320	0.11
321	0.11
322	0.13
323	0.14
324	0.14
325	0.15
326	0.17
327	0.21
328	0.25
329	0.32
330	0.33
331	0.32
332	0.32
333	0.32
334	0.3
335	0.25
336	0.2
337	0.12
338	0.11
339	0.12
340	0.13
341	0.15
342	0.15
343	0.14
344	0.14
345	0.14
346	0.12
347	0.11
348	0.1
349	0.09
350	0.12
351	0.18
352	0.23
353	0.28
354	0.37
355	0.48
356	0.59
357	0.68
358	0.74
359	0.78
360	0.81
361	0.86
362	0.85
363	0.82
364	0.74
365	0.67
366	0.6
367	0.53
368	0.5
369	0.4
370	0.33
371	0.25
372	0.25
373	0.24
374	0.27
375	0.31
376	0.33
377	0.41
378	0.45
379	0.54
380	0.61
381	0.67
382	0.7
383	0.73
384	0.76
385	0.76
386	0.79
387	0.73
388	0.66
389	0.62
390	0.61
391	0.57
392	0.51
393	0.42
394	0.36
395	0.31
396	0.29
397	0.23
398	0.15
399	0.1
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.05
418	0.08
419	0.13
420	0.18
421	0.2
422	0.25
423	0.32
424	0.36
425	0.44
426	0.52
427	0.57
428	0.63
429	0.72
430	0.77
431	0.78
432	0.75
433	0.67
434	0.58
435	0.48
436	0.38
437	0.31
438	0.22
439	0.17
440	0.17
441	0.16
442	0.15
443	0.17
444	0.16
445	0.13
446	0.19
447	0.19
448	0.26
449	0.28
450	0.32
451	0.3
452	0.3
453	0.31
454	0.23
455	0.23
456	0.17
457	0.17
458	0.14
459	0.15
460	0.15
461	0.15
462	0.16
463	0.17
464	0.19
465	0.17
466	0.2
467	0.23
468	0.27
469	0.27
470	0.27
471	0.26
472	0.25
473	0.26
474	0.21
475	0.2
476	0.16
477	0.14
478	0.13
479	0.12
480	0.09
481	0.08
482	0.07
483	0.05
484	0.06
485	0.07
486	0.07
487	0.06
488	0.08
489	0.1
490	0.15
491	0.19
492	0.24
493	0.29
494	0.33
495	0.39
496	0.45
497	0.46
498	0.47
499	0.52
500	0.48
501	0.45
502	0.42
503	0.36
504	0.28
505	0.3
506	0.27
507	0.24
508	0.23
509	0.21
510	0.26
511	0.27
512	0.31
513	0.29
514	0.28
515	0.25
516	0.28
517	0.3
518	0.3
519	0.3
520	0.26
521	0.25
522	0.24
523	0.21
524	0.21
525	0.19
526	0.13
527	0.12
528	0.16
529	0.16
530	0.17
531	0.2
532	0.22
533	0.23
534	0.25
535	0.26
536	0.27
537	0.28
538	0.31
539	0.35
540	0.33
541	0.34
542	0.34
543	0.37
544	0.34
545	0.34
546	0.34
547	0.28
548	0.29
549	0.33
550	0.33
551	0.3
552	0.31
553	0.3
554	0.24
555	0.23
556	0.21
557	0.18
558	0.19
559	0.2
560	0.19
561	0.18
562	0.22
563	0.26
564	0.26
565	0.24
566	0.29
567	0.35
568	0.4
569	0.44
570	0.47
571	0.46
572	0.52
573	0.6
574	0.61
575	0.58
576	0.56
577	0.59
578	0.6
579	0.6
580	0.57
581	0.56
582	0.54
583	0.58
584	0.63
585	0.62
586	0.57
587	0.61
588	0.58
589	0.53
590	0.55
591	0.45
592	0.42
593	0.42
594	0.39
595	0.34
596	0.33
597	0.28
598	0.22
599	0.25
600	0.2
601	0.16
602	0.17
603	0.21
604	0.22
605	0.25
606	0.25
607	0.23
608	0.27
609	0.34
610	0.34
611	0.36
612	0.37
613	0.35
614	0.39
615	0.37
616	0.34
617	0.33
618	0.37
619	0.3
620	0.31
621	0.36
622	0.4
623	0.42
624	0.42
625	0.38
626	0.32
627	0.36
628	0.39

A0A3N4JP39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer