Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4K540

Protein Details
Accession A0A3N4K540    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-338EAKAKGAVKRGKKKAKTGTAGEBasic
372-399AAPVPSSRKRGPKGGNKKKTTQERLAMIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
316-332EEAKAKGAVKRGKKKAK
378-390SRKRGPKGGNKKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MLRRIKKHVQKELGDKIELDVQCELTYRQRALYKGLRDKISIMDIIEKAASGADENNATLMNLVMQFRKVCNHPDLFERAETSSPIDLGLYPIPKMLPEPSSEKMGYAHIKVPSMRRFVSDSGKLAKLDALLTELKAGGHRVLLYFQMTKMMDLCEEYLTYRHHRYLRLDGSSKLEDRRDMVSAWQTTSEIFVFILSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTIDSQAMDRAHRLGQTRQVTVYRLITRGTIEERIRTRAKQKEEVQRVVIQGGDPGAKKNTVDFKGTREVAAWLFDDEEAEQLEKTLEAKEKEAEEAKAKGAVKRGKKKAKTGTAGEEAKAVNLEDLYHEGEGRFDDSGKPSEAGTPAASAAPVPSSRKRGPKGGNKKKTTQERLAMIDGVTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.6
3 0.51
4 0.49
5 0.41
6 0.34
7 0.26
8 0.22
9 0.21
10 0.22
11 0.22
12 0.21
13 0.27
14 0.25
15 0.29
16 0.32
17 0.34
18 0.4
19 0.47
20 0.49
21 0.54
22 0.6
23 0.57
24 0.54
25 0.54
26 0.5
27 0.45
28 0.37
29 0.28
30 0.27
31 0.24
32 0.24
33 0.22
34 0.18
35 0.14
36 0.13
37 0.12
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.09
50 0.1
51 0.11
52 0.13
53 0.15
54 0.16
55 0.21
56 0.22
57 0.25
58 0.31
59 0.33
60 0.33
61 0.36
62 0.4
63 0.39
64 0.37
65 0.34
66 0.29
67 0.26
68 0.25
69 0.23
70 0.18
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.1
75 0.12
76 0.14
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.14
83 0.14
84 0.12
85 0.15
86 0.2
87 0.21
88 0.26
89 0.26
90 0.25
91 0.23
92 0.26
93 0.26
94 0.23
95 0.26
96 0.23
97 0.25
98 0.27
99 0.33
100 0.34
101 0.36
102 0.34
103 0.32
104 0.34
105 0.35
106 0.4
107 0.36
108 0.34
109 0.33
110 0.35
111 0.32
112 0.29
113 0.27
114 0.2
115 0.17
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.12
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.12
147 0.16
148 0.18
149 0.22
150 0.25
151 0.28
152 0.32
153 0.38
154 0.4
155 0.41
156 0.41
157 0.38
158 0.39
159 0.38
160 0.36
161 0.3
162 0.26
163 0.21
164 0.21
165 0.22
166 0.18
167 0.16
168 0.16
169 0.19
170 0.18
171 0.18
172 0.16
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.12
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.02
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.08
204 0.08
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.17
221 0.2
222 0.17
223 0.24
224 0.27
225 0.27
226 0.28
227 0.28
228 0.27
229 0.27
230 0.3
231 0.24
232 0.21
233 0.2
234 0.19
235 0.18
236 0.19
237 0.19
238 0.2
239 0.18
240 0.23
241 0.25
242 0.3
243 0.32
244 0.33
245 0.39
246 0.4
247 0.46
248 0.49
249 0.56
250 0.61
251 0.66
252 0.67
253 0.62
254 0.57
255 0.52
256 0.43
257 0.35
258 0.24
259 0.17
260 0.14
261 0.13
262 0.1
263 0.11
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.17
268 0.24
269 0.24
270 0.29
271 0.28
272 0.31
273 0.38
274 0.39
275 0.35
276 0.27
277 0.27
278 0.22
279 0.23
280 0.19
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.1
295 0.15
296 0.15
297 0.17
298 0.2
299 0.21
300 0.25
301 0.27
302 0.26
303 0.25
304 0.25
305 0.24
306 0.27
307 0.27
308 0.26
309 0.31
310 0.37
311 0.43
312 0.52
313 0.62
314 0.67
315 0.72
316 0.8
317 0.82
318 0.84
319 0.81
320 0.77
321 0.74
322 0.72
323 0.67
324 0.58
325 0.5
326 0.4
327 0.33
328 0.28
329 0.21
330 0.12
331 0.1
332 0.1
333 0.08
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.11
343 0.1
344 0.13
345 0.16
346 0.2
347 0.21
348 0.21
349 0.2
350 0.23
351 0.23
352 0.23
353 0.2
354 0.17
355 0.16
356 0.16
357 0.15
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.14
362 0.19
363 0.25
364 0.33
365 0.4
366 0.5
367 0.54
368 0.61
369 0.68
370 0.73
371 0.78
372 0.82
373 0.85
374 0.83
375 0.86
376 0.87
377 0.87
378 0.86
379 0.83
380 0.8
381 0.76
382 0.74
383 0.68
384 0.59