Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4JXT6

Protein Details
Accession A0A3N4JXT6    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-126EEDTTTWVRKMKKRQKKLAEKMAKEMEHydrophilic
275-302VDPSTLKIRQPKKKKTRATRKRSEDDDDBasic
610-633KGSGKAKTEKRLKKIEDEKKREAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-87NARKARIEGIKKARDAEKRFAK
108-118RKMKKRQKKLA
282-296IRQPKKKKTRATRKR
358-361KKRK
610-630KGSGKAKTEKRLKKIEDEKKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MEESLSIEETNKIRLSLGLKPLKVDTETPATSSKPVDAAPDNSVEAQERRAVDNWKKRQDDIEKENARKARIEGIKKARDAEKRFAKLEGKGLGEADENEEDTTTWVRKMKKRQKKLAEKMAKEMEDELQRAVAERKEYTAEDLTGVRVGHDLGELDGEGTILTLKDTTIEENEEEGDELISTDIAERERLKEQLDLKRKKPTYNAYEDEDENGEKRILAQYDEEIDGKKKKRFVLDGTGSASNVDAHRKEVAEKLKAIAVTLDPIKPEVTSDYVDPSTLKIRQPKKKKTRATRKRSEDDDDSLAPPTVEAPAEDSMEVDSGSAPAQSKPKRVFEETSFVDDDDLQSSLAAQRRIALKKRKVLKPGDLARQLREESAAAATPGTDSPMKVEDGEEEPGLVIDETSEFVATLRAPVVPERRKSRSSAPAHSPPVTSMADEEGEDEDKDRTEEMDLDTKPEVKPDPETGEISSTGLAQETTIAHGVGATLAMLHQRGLLTRDSESDAKINLQRDREKFRTAKRLRELEAEEKAKSQRLRDRQSGKFDRMSAREREEHARWENKQRDHQEAKEMAARFKEYKPDVKLSYKDEFGREMSQKEAFKHLSHQFHGKGSGKAKTEKRLKKIEDEKKREAASSLNASATENAVQSAAKKSKQAGVRLM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.28
4 0.37
5 0.4
6 0.4
7 0.42
8 0.43
9 0.43
10 0.41
11 0.36
12 0.31
13 0.31
14 0.31
15 0.31
16 0.32
17 0.3
18 0.3
19 0.29
20 0.26
21 0.2
22 0.2
23 0.23
24 0.25
25 0.27
26 0.27
27 0.28
28 0.28
29 0.26
30 0.26
31 0.24
32 0.21
33 0.2
34 0.22
35 0.21
36 0.23
37 0.27
38 0.35
39 0.42
40 0.51
41 0.59
42 0.64
43 0.65
44 0.64
45 0.7
46 0.71
47 0.71
48 0.68
49 0.69
50 0.68
51 0.68
52 0.73
53 0.67
54 0.59
55 0.52
56 0.46
57 0.45
58 0.45
59 0.49
60 0.52
61 0.58
62 0.63
63 0.62
64 0.65
65 0.63
66 0.64
67 0.63
68 0.64
69 0.63
70 0.62
71 0.62
72 0.62
73 0.59
74 0.53
75 0.53
76 0.48
77 0.4
78 0.35
79 0.34
80 0.29
81 0.26
82 0.23
83 0.2
84 0.16
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.13
90 0.15
91 0.13
92 0.15
93 0.19
94 0.27
95 0.35
96 0.46
97 0.56
98 0.64
99 0.73
100 0.81
101 0.87
102 0.91
103 0.93
104 0.93
105 0.93
106 0.85
107 0.82
108 0.78
109 0.68
110 0.57
111 0.48
112 0.42
113 0.36
114 0.34
115 0.26
116 0.2
117 0.19
118 0.2
119 0.21
120 0.18
121 0.17
122 0.17
123 0.18
124 0.2
125 0.21
126 0.24
127 0.23
128 0.21
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.17
133 0.16
134 0.12
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.09
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.09
174 0.1
175 0.13
176 0.16
177 0.17
178 0.18
179 0.22
180 0.29
181 0.36
182 0.46
183 0.5
184 0.51
185 0.6
186 0.61
187 0.6
188 0.61
189 0.61
190 0.59
191 0.6
192 0.6
193 0.54
194 0.55
195 0.51
196 0.45
197 0.37
198 0.29
199 0.2
200 0.18
201 0.13
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.13
213 0.16
214 0.22
215 0.26
216 0.28
217 0.3
218 0.33
219 0.38
220 0.42
221 0.45
222 0.48
223 0.48
224 0.47
225 0.46
226 0.43
227 0.37
228 0.32
229 0.27
230 0.17
231 0.14
232 0.14
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.14
237 0.15
238 0.2
239 0.25
240 0.24
241 0.24
242 0.24
243 0.24
244 0.24
245 0.22
246 0.17
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.11
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.13
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.14
266 0.16
267 0.19
268 0.24
269 0.33
270 0.42
271 0.53
272 0.63
273 0.7
274 0.77
275 0.84
276 0.87
277 0.89
278 0.91
279 0.91
280 0.9
281 0.89
282 0.85
283 0.8
284 0.75
285 0.67
286 0.6
287 0.52
288 0.43
289 0.35
290 0.28
291 0.24
292 0.17
293 0.13
294 0.1
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.07
313 0.14
314 0.16
315 0.22
316 0.26
317 0.31
318 0.34
319 0.37
320 0.39
321 0.34
322 0.39
323 0.35
324 0.35
325 0.29
326 0.26
327 0.23
328 0.19
329 0.17
330 0.11
331 0.09
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.08
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.13
340 0.19
341 0.24
342 0.31
343 0.38
344 0.41
345 0.48
346 0.58
347 0.61
348 0.62
349 0.63
350 0.62
351 0.62
352 0.63
353 0.63
354 0.62
355 0.57
356 0.52
357 0.49
358 0.43
359 0.33
360 0.27
361 0.19
362 0.12
363 0.12
364 0.1
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.12
380 0.13
381 0.12
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.04
388 0.03
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.07
401 0.1
402 0.19
403 0.24
404 0.31
405 0.37
406 0.43
407 0.44
408 0.48
409 0.52
410 0.53
411 0.54
412 0.55
413 0.56
414 0.58
415 0.6
416 0.58
417 0.5
418 0.41
419 0.39
420 0.32
421 0.24
422 0.16
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.09
428 0.1
429 0.09
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.11
439 0.17
440 0.17
441 0.19
442 0.2
443 0.21
444 0.2
445 0.21
446 0.21
447 0.16
448 0.19
449 0.2
450 0.25
451 0.25
452 0.27
453 0.25
454 0.25
455 0.24
456 0.2
457 0.17
458 0.12
459 0.09
460 0.08
461 0.07
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.05
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.04
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.08
482 0.1
483 0.12
484 0.13
485 0.13
486 0.15
487 0.18
488 0.19
489 0.2
490 0.19
491 0.18
492 0.2
493 0.24
494 0.27
495 0.27
496 0.33
497 0.39
498 0.43
499 0.51
500 0.51
501 0.56
502 0.57
503 0.61
504 0.66
505 0.64
506 0.68
507 0.69
508 0.71
509 0.66
510 0.67
511 0.64
512 0.6
513 0.62
514 0.55
515 0.47
516 0.44
517 0.43
518 0.42
519 0.39
520 0.39
521 0.4
522 0.48
523 0.55
524 0.61
525 0.67
526 0.69
527 0.77
528 0.77
529 0.73
530 0.68
531 0.64
532 0.62
533 0.59
534 0.57
535 0.52
536 0.51
537 0.5
538 0.49
539 0.52
540 0.48
541 0.5
542 0.52
543 0.54
544 0.53
545 0.59
546 0.63
547 0.63
548 0.7
549 0.67
550 0.69
551 0.69
552 0.67
553 0.66
554 0.6
555 0.55
556 0.52
557 0.49
558 0.42
559 0.38
560 0.39
561 0.33
562 0.33
563 0.39
564 0.38
565 0.44
566 0.47
567 0.51
568 0.53
569 0.56
570 0.58
571 0.55
572 0.56
573 0.53
574 0.5
575 0.45
576 0.43
577 0.38
578 0.41
579 0.39
580 0.35
581 0.34
582 0.37
583 0.37
584 0.37
585 0.41
586 0.37
587 0.35
588 0.41
589 0.46
590 0.47
591 0.47
592 0.53
593 0.48
594 0.48
595 0.55
596 0.51
597 0.49
598 0.47
599 0.5
600 0.48
601 0.53
602 0.57
603 0.59
604 0.66
605 0.68
606 0.71
607 0.75
608 0.75
609 0.77
610 0.81
611 0.82
612 0.82
613 0.82
614 0.82
615 0.79
616 0.76
617 0.67
618 0.58
619 0.52
620 0.48
621 0.45
622 0.4
623 0.33
624 0.31
625 0.31
626 0.3
627 0.27
628 0.22
629 0.15
630 0.13
631 0.13
632 0.13
633 0.14
634 0.22
635 0.26
636 0.27
637 0.31
638 0.34
639 0.4
640 0.47