Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1E671

Protein Details
Accession A0A0D1E671    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-203SARGRGRGRGRGRPFRGRGRGRGRGYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-201GLSARGRGRGRGRGRPFRGRGRGRGR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033620  C:Mei2 nuclear dot complex  
GO:1990251  C:nuclear exosome focus  
GO:0140602  C:nucleolar ring  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0106222  F:lncRNA binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:0033621  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts  
KEGG uma:UMAG_02401  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12306  RRM_II_PABPs  
Amino Acid Sequences MASHQEEVSLSEPGTSELHHAQSTDAAGVEPTSTDTTADVTAMTDEDAEIEAMKQRVAEMEAEAAKLRELQQAAGEAGGAGLHPTEEEREEVDSRSIYVGNVDYGATPEEVQQHFQSCGTINRVTILCDKFTGHPKGFAYVEFAEPSLVANAMVLNESLFRGRLIKVTAKRTNMPGLSARGRGRGRGRGRPFRGRGRGRGRGYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.14
4 0.16
5 0.19
6 0.19
7 0.19
8 0.17
9 0.18
10 0.19
11 0.15
12 0.12
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.07
18 0.08
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.06
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.08
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.14
60 0.13
61 0.12
62 0.1
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.04
67 0.02
68 0.02
69 0.02
70 0.02
71 0.03
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.1
97 0.11
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.11
105 0.13
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.21
113 0.2
114 0.16
115 0.16
116 0.18
117 0.19
118 0.26
119 0.3
120 0.25
121 0.28
122 0.28
123 0.3
124 0.29
125 0.26
126 0.24
127 0.19
128 0.2
129 0.16
130 0.16
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.12
151 0.16
152 0.24
153 0.3
154 0.39
155 0.45
156 0.48
157 0.51
158 0.52
159 0.56
160 0.48
161 0.45
162 0.4
163 0.4
164 0.4
165 0.42
166 0.4
167 0.41
168 0.41
169 0.45
170 0.47
171 0.5
172 0.54
173 0.58
174 0.67
175 0.69
176 0.76
177 0.8
178 0.81
179 0.82
180 0.84
181 0.82
182 0.82
183 0.82
184 0.84