Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1D0I7

Protein Details
Accession A0A0D1D0I7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-84AELARSQVHWKRKPKLEHMLWAEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
545-603KRKQEKEREANAAATGGGGGAARGGRGGGAAGSNSRGRGGMTPARGAAPRGRGGAAGGR
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11.833, nucl 9.5, mito_nucl 7.666, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0055087  C:Ski complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030968  P:endoplasmic reticulum unfolded protein response  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
GO:0070481  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay  
KEGG uma:UMAG_00393  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MSDSPVDRTEAINRYNDAIATLRKEGVANAVDSVPSLLDRPDTIDTLIEDLLTPSNKLSTAELARSQVHWKRKPKLEHMLWAEPSTSLHSLEFVRAGLEGRIVSYREVSHTSTPLLDSRSSASMTRKPATSSNFVRGKSAYVPFAPGGLESEVMKNPDGSERDAEDLSDTIRSQVADMEETLSSGRGLRTKAPGLSRSFIDPTEESLDDEEDTEAVERASSRVQDASQAVDVGLGMAPIPVYRPVEQDRPGPSALRGSRSQINGDGKDRADTSVHDAELDELLPVERPQPLTHARRTAKIDAKRDWAHVIDVNQQLSNFHELVPQMAHSFPFELDTFQKEAVYHLEQGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRCIYTSPIKALSNQKYRDFKQTFGAANVGILTGDVQINPEAPCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDQERGVVWEEVIILCPQHINLILLSATVPNTKEFADWVGRTKKKDIYVISTPKRPVPLEHFLYAGKEMFKIVDARAQFLGSGLKEAGEALKRKQEKEREANAAATGGGGGAARGGRGGGAAGSNSRGRGGMTPARGAAPRGRGGAAGGRGGGFPGTTTVRTGLDKNLWIHLVGHLRKKELLPCVVFVFSKKRCEEYATSMPNTDLNTAKDKSEVHILIEKSLTRLKGTDKELPQIKRMRDLLGRGIGVHHGGLLPIVKEIVELLFQRGLVKVLFATETFAMGVNMPARSVVFSSIRKHDGHGFRELLPGEYTQMSGRAGRRGLDATGVVIINAADQLPETAVLHKTLLGQPTKLSSQFRLTYNMILNLLRVEALKVEEMIKRSFSENAAQKMLPDQQKKAQELEKKLAKAQHPQPPELDEQMSTYYDLCAAVVASNQSLFELALGHQQGAKNFGAGRVVILRDGHFDFDIAAIVRQVSASEFLVLAAVTPERKKGELDLQGCNNGESGGVAPLWPPRVRAAKAELVYDLREVSLSSISLVTEQTIKLDVALITAHRISAMNRALESLLPIRESFATTTQAEGIREAEWTKLRRLDFQEALRSRDSYASKTHQHLSLLDSPTFSTDYALVSTYKTITRTLEQTLKLQSDENLELLPDYHQRVSVLKTLRYIDPITESVLLKGRVACEVNSANELVLTELILENVLVEYEPEQLVALLSIFLTQEKTDDIPVLEGKILEGYQKILEIAERVSAIQLSNSLASEDFTAPNKIALVPVVYEWAKGTDFATIAAMTDIQEGSIVRVITRLDETCREIRDAARVIGDRDLGEKIQSCQTLIRRDIVFAASLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.33
4 0.27
5 0.25
6 0.26
7 0.26
8 0.27
9 0.25
10 0.24
11 0.25
12 0.23
13 0.26
14 0.24
15 0.2
16 0.19
17 0.19
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.12
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.15
28 0.17
29 0.18
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.2
34 0.19
35 0.15
36 0.12
37 0.12
38 0.15
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.14
43 0.15
44 0.16
45 0.17
46 0.2
47 0.24
48 0.28
49 0.3
50 0.32
51 0.33
52 0.34
53 0.41
54 0.41
55 0.47
56 0.52
57 0.58
58 0.65
59 0.73
60 0.8
61 0.81
62 0.84
63 0.81
64 0.82
65 0.81
66 0.79
67 0.72
68 0.64
69 0.55
70 0.44
71 0.37
72 0.32
73 0.26
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.19
79 0.19
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.13
84 0.11
85 0.12
86 0.1
87 0.11
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.17
93 0.19
94 0.22
95 0.25
96 0.26
97 0.27
98 0.27
99 0.26
100 0.26
101 0.26
102 0.26
103 0.22
104 0.2
105 0.21
106 0.22
107 0.23
108 0.24
109 0.27
110 0.31
111 0.37
112 0.39
113 0.38
114 0.38
115 0.43
116 0.45
117 0.48
118 0.47
119 0.5
120 0.52
121 0.51
122 0.5
123 0.45
124 0.42
125 0.4
126 0.38
127 0.32
128 0.27
129 0.3
130 0.27
131 0.27
132 0.24
133 0.18
134 0.17
135 0.14
136 0.14
137 0.11
138 0.14
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.15
143 0.15
144 0.21
145 0.22
146 0.22
147 0.24
148 0.25
149 0.27
150 0.27
151 0.26
152 0.21
153 0.19
154 0.17
155 0.15
156 0.13
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.15
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.15
175 0.19
176 0.25
177 0.29
178 0.34
179 0.38
180 0.42
181 0.43
182 0.44
183 0.41
184 0.4
185 0.37
186 0.33
187 0.32
188 0.26
189 0.25
190 0.27
191 0.26
192 0.22
193 0.21
194 0.22
195 0.17
196 0.18
197 0.14
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.14
210 0.14
211 0.18
212 0.19
213 0.2
214 0.18
215 0.18
216 0.16
217 0.14
218 0.14
219 0.09
220 0.08
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.06
227 0.08
228 0.11
229 0.13
230 0.17
231 0.22
232 0.29
233 0.32
234 0.36
235 0.37
236 0.38
237 0.38
238 0.35
239 0.31
240 0.33
241 0.33
242 0.32
243 0.3
244 0.31
245 0.35
246 0.36
247 0.37
248 0.36
249 0.4
250 0.39
251 0.4
252 0.4
253 0.34
254 0.34
255 0.33
256 0.27
257 0.22
258 0.19
259 0.23
260 0.23
261 0.22
262 0.2
263 0.2
264 0.19
265 0.19
266 0.17
267 0.1
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.11
275 0.11
276 0.17
277 0.25
278 0.31
279 0.37
280 0.45
281 0.45
282 0.5
283 0.56
284 0.59
285 0.59
286 0.6
287 0.62
288 0.57
289 0.63
290 0.59
291 0.56
292 0.5
293 0.42
294 0.37
295 0.33
296 0.3
297 0.29
298 0.3
299 0.29
300 0.26
301 0.25
302 0.23
303 0.22
304 0.24
305 0.16
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.1
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.13
322 0.16
323 0.17
324 0.16
325 0.17
326 0.15
327 0.16
328 0.18
329 0.19
330 0.17
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.1
337 0.08
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.09
360 0.11
361 0.12
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.21
367 0.24
368 0.26
369 0.27
370 0.28
371 0.31
372 0.31
373 0.34
374 0.4
375 0.43
376 0.48
377 0.5
378 0.53
379 0.56
380 0.58
381 0.64
382 0.57
383 0.49
384 0.46
385 0.48
386 0.42
387 0.36
388 0.35
389 0.24
390 0.22
391 0.2
392 0.14
393 0.08
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.11
419 0.09
420 0.09
421 0.1
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.07
434 0.06
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.11
442 0.11
443 0.09
444 0.09
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.11
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.08
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.05
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.08
470 0.07
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.11
476 0.14
477 0.14
478 0.2
479 0.29
480 0.32
481 0.34
482 0.37
483 0.39
484 0.38
485 0.43
486 0.39
487 0.37
488 0.42
489 0.5
490 0.5
491 0.5
492 0.48
493 0.45
494 0.46
495 0.39
496 0.34
497 0.32
498 0.35
499 0.34
500 0.33
501 0.32
502 0.29
503 0.29
504 0.27
505 0.21
506 0.13
507 0.1
508 0.09
509 0.08
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.11
514 0.11
515 0.13
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.11
520 0.13
521 0.09
522 0.1
523 0.08
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.09
528 0.1
529 0.12
530 0.13
531 0.2
532 0.22
533 0.24
534 0.32
535 0.38
536 0.43
537 0.51
538 0.55
539 0.55
540 0.54
541 0.52
542 0.45
543 0.37
544 0.28
545 0.18
546 0.12
547 0.05
548 0.04
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.04
563 0.06
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.13
571 0.15
572 0.16
573 0.17
574 0.17
575 0.18
576 0.18
577 0.18
578 0.17
579 0.16
580 0.16
581 0.16
582 0.16
583 0.15
584 0.15
585 0.17
586 0.14
587 0.11
588 0.09
589 0.09
590 0.08
591 0.08
592 0.07
593 0.04
594 0.03
595 0.05
596 0.06
597 0.06
598 0.07
599 0.08
600 0.09
601 0.1
602 0.11
603 0.12
604 0.13
605 0.15
606 0.16
607 0.16
608 0.15
609 0.14
610 0.14
611 0.15
612 0.2
613 0.2
614 0.25
615 0.24
616 0.25
617 0.26
618 0.27
619 0.28
620 0.24
621 0.26
622 0.21
623 0.22
624 0.22
625 0.21
626 0.2
627 0.17
628 0.21
629 0.19
630 0.25
631 0.24
632 0.25
633 0.25
634 0.3
635 0.31
636 0.31
637 0.37
638 0.34
639 0.34
640 0.32
641 0.31
642 0.29
643 0.27
644 0.2
645 0.14
646 0.12
647 0.16
648 0.17
649 0.17
650 0.17
651 0.16
652 0.16
653 0.2
654 0.18
655 0.15
656 0.2
657 0.19
658 0.19
659 0.19
660 0.18
661 0.14
662 0.16
663 0.15
664 0.1
665 0.12
666 0.14
667 0.19
668 0.24
669 0.29
670 0.28
671 0.34
672 0.4
673 0.4
674 0.43
675 0.43
676 0.39
677 0.38
678 0.38
679 0.35
680 0.31
681 0.31
682 0.29
683 0.26
684 0.25
685 0.19
686 0.18
687 0.15
688 0.13
689 0.11
690 0.07
691 0.05
692 0.04
693 0.05
694 0.05
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.05
703 0.05
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.08
708 0.08
709 0.09
710 0.07
711 0.07
712 0.06
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.07
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.06
722 0.06
723 0.07
724 0.07
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.08
732 0.1
733 0.14
734 0.17
735 0.21
736 0.24
737 0.24
738 0.25
739 0.31
740 0.34
741 0.34
742 0.35
743 0.34
744 0.31
745 0.34
746 0.32
747 0.25
748 0.2
749 0.17
750 0.13
751 0.12
752 0.12
753 0.09
754 0.09
755 0.09
756 0.11
757 0.13
758 0.15
759 0.15
760 0.15
761 0.17
762 0.17
763 0.16
764 0.14
765 0.13
766 0.1
767 0.1
768 0.09
769 0.07
770 0.06
771 0.06
772 0.05
773 0.05
774 0.04
775 0.03
776 0.03
777 0.03
778 0.03
779 0.04
780 0.04
781 0.06
782 0.07
783 0.08
784 0.08
785 0.08
786 0.11
787 0.13
788 0.17
789 0.16
790 0.16
791 0.16
792 0.18
793 0.2
794 0.2
795 0.2
796 0.18
797 0.23
798 0.26
799 0.27
800 0.3
801 0.29
802 0.29
803 0.29
804 0.28
805 0.23
806 0.2
807 0.18
808 0.13
809 0.12
810 0.09
811 0.07
812 0.06
813 0.05
814 0.06
815 0.06
816 0.07
817 0.09
818 0.11
819 0.13
820 0.14
821 0.14
822 0.15
823 0.16
824 0.17
825 0.16
826 0.21
827 0.24
828 0.27
829 0.28
830 0.27
831 0.26
832 0.27
833 0.32
834 0.32
835 0.3
836 0.3
837 0.34
838 0.41
839 0.42
840 0.43
841 0.43
842 0.43
843 0.45
844 0.51
845 0.5
846 0.45
847 0.46
848 0.48
849 0.45
850 0.46
851 0.49
852 0.49
853 0.47
854 0.47
855 0.45
856 0.43
857 0.42
858 0.35
859 0.28
860 0.2
861 0.18
862 0.18
863 0.17
864 0.14
865 0.12
866 0.09
867 0.09
868 0.08
869 0.07
870 0.05
871 0.05
872 0.05
873 0.05
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.06
878 0.06
879 0.06
880 0.05
881 0.05
882 0.05
883 0.05
884 0.09
885 0.1
886 0.1
887 0.12
888 0.13
889 0.14
890 0.17
891 0.16
892 0.13
893 0.13
894 0.14
895 0.13
896 0.12
897 0.12
898 0.11
899 0.11
900 0.11
901 0.12
902 0.11
903 0.14
904 0.14
905 0.14
906 0.12
907 0.12
908 0.11
909 0.1
910 0.11
911 0.08
912 0.07
913 0.06
914 0.06
915 0.06
916 0.06
917 0.06
918 0.05
919 0.07
920 0.07
921 0.07
922 0.07
923 0.07
924 0.07
925 0.07
926 0.06
927 0.05
928 0.06
929 0.07
930 0.08
931 0.11
932 0.13
933 0.14
934 0.14
935 0.17
936 0.25
937 0.31
938 0.34
939 0.36
940 0.37
941 0.39
942 0.39
943 0.35
944 0.27
945 0.19
946 0.16
947 0.1
948 0.09
949 0.06
950 0.06
951 0.06
952 0.07
953 0.09
954 0.13
955 0.13
956 0.14
957 0.18
958 0.25
959 0.27
960 0.3
961 0.33
962 0.36
963 0.37
964 0.37
965 0.33
966 0.28
967 0.27
968 0.24
969 0.19
970 0.11
971 0.1
972 0.09
973 0.09
974 0.08
975 0.07
976 0.07
977 0.08
978 0.08
979 0.08
980 0.08
981 0.08
982 0.09
983 0.09
984 0.09
985 0.1
986 0.1
987 0.09
988 0.11
989 0.1
990 0.08
991 0.09
992 0.08
993 0.09
994 0.09
995 0.09
996 0.08
997 0.09
998 0.09
999 0.16
1000 0.19
1001 0.19
1002 0.19
1003 0.2
1004 0.2
1005 0.19
1006 0.21
1007 0.17
1008 0.14
1009 0.14
1010 0.14
1011 0.14
1012 0.15
1013 0.16
1014 0.15
1015 0.14
1016 0.18
1017 0.17
1018 0.18
1019 0.19
1020 0.2
1021 0.19
1022 0.18
1023 0.17
1024 0.13
1025 0.14
1026 0.14
1027 0.15
1028 0.18
1029 0.2
1030 0.24
1031 0.29
1032 0.3
1033 0.35
1034 0.41
1035 0.45
1036 0.46
1037 0.48
1038 0.54
1039 0.51
1040 0.54
1041 0.49
1042 0.43
1043 0.36
1044 0.37
1045 0.34
1046 0.27
1047 0.31
1048 0.34
1049 0.38
1050 0.41
1051 0.44
1052 0.4
1053 0.4
1054 0.38
1055 0.37
1056 0.39
1057 0.37
1058 0.33
1059 0.3
1060 0.27
1061 0.27
1062 0.27
1063 0.2
1064 0.14
1065 0.1
1066 0.11
1067 0.11
1068 0.12
1069 0.11
1070 0.1
1071 0.12
1072 0.13
1073 0.14
1074 0.14
1075 0.16
1076 0.18
1077 0.21
1078 0.24
1079 0.28
1080 0.33
1081 0.33
1082 0.36
1083 0.39
1084 0.37
1085 0.35
1086 0.33
1087 0.28
1088 0.27
1089 0.26
1090 0.23
1091 0.18
1092 0.16
1093 0.15
1094 0.15
1095 0.15
1096 0.13
1097 0.15
1098 0.15
1099 0.16
1100 0.18
1101 0.2
1102 0.23
1103 0.27
1104 0.29
1105 0.28
1106 0.31
1107 0.34
1108 0.34
1109 0.36
1110 0.34
1111 0.28
1112 0.27
1113 0.26
1114 0.25
1115 0.25
1116 0.23
1117 0.21
1118 0.26
1119 0.24
1120 0.21
1121 0.22
1122 0.2
1123 0.21
1124 0.23
1125 0.21
1126 0.21
1127 0.24
1128 0.24
1129 0.24
1130 0.23
1131 0.18
1132 0.17
1133 0.17
1134 0.12
1135 0.09
1136 0.07
1137 0.07
1138 0.06
1139 0.06
1140 0.06
1141 0.06
1142 0.05
1143 0.05
1144 0.05
1145 0.04
1146 0.05
1147 0.05
1148 0.08
1149 0.08
1150 0.08
1151 0.08
1152 0.08
1153 0.08
1154 0.08
1155 0.07
1156 0.05
1157 0.05
1158 0.06
1159 0.06
1160 0.06
1161 0.08
1162 0.07
1163 0.08
1164 0.1
1165 0.12
1166 0.12
1167 0.14
1168 0.14
1169 0.15
1170 0.16
1171 0.17
1172 0.16
1173 0.14
1174 0.14
1175 0.14
1176 0.13
1177 0.12
1178 0.12
1179 0.12
1180 0.12
1181 0.12
1182 0.12
1183 0.11
1184 0.12
1185 0.11
1186 0.12
1187 0.12
1188 0.12
1189 0.11
1190 0.12
1191 0.12
1192 0.12
1193 0.11
1194 0.11
1195 0.11
1196 0.12
1197 0.12
1198 0.12
1199 0.11
1200 0.11
1201 0.14
1202 0.15
1203 0.15
1204 0.17
1205 0.19
1206 0.18
1207 0.19
1208 0.19
1209 0.16
1210 0.15
1211 0.14
1212 0.13
1213 0.12
1214 0.12
1215 0.16
1216 0.15
1217 0.15
1218 0.15
1219 0.16
1220 0.15
1221 0.15
1222 0.15
1223 0.13
1224 0.13
1225 0.13
1226 0.14
1227 0.11
1228 0.11
1229 0.11
1230 0.11
1231 0.09
1232 0.1
1233 0.1
1234 0.08
1235 0.09
1236 0.09
1237 0.1
1238 0.13
1239 0.13
1240 0.11
1241 0.13
1242 0.14
1243 0.15
1244 0.19
1245 0.19
1246 0.21
1247 0.25
1248 0.31
1249 0.34
1250 0.36
1251 0.37
1252 0.35
1253 0.35
1254 0.38
1255 0.37
1256 0.33
1257 0.35
1258 0.34
1259 0.33
1260 0.34
1261 0.33
1262 0.25
1263 0.24
1264 0.25
1265 0.19
1266 0.2
1267 0.21
1268 0.21
1269 0.26
1270 0.27
1271 0.26
1272 0.3
1273 0.36
1274 0.42
1275 0.42
1276 0.45
1277 0.4
1278 0.4
1279 0.41
1280 0.36
1281 0.3