FuNGI

Q4PGM6

Protein Details

Accession

Q4PGM6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
972-991	IYDLGKKKLLRKCENRSFPT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 14, cyto_nucl 11.5, nucl 7, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0030620 F:U2 snRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	uma:UMAG_00737 -
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MDGMYLYNLTLQASGSVNATVVGQFSGTRQQEIIVAKGSRLELLRPDTQTGKVDTVLSHDAFGVIRSLAAFRLTGGSKDYVIVGSDSGRIVILEYQPKTNSLEKVHQETFGRSGSRRIVPGQYLATDPKGRATMIGAMEKAMLVYILNRDAQANLTISSPLEAHRPSAIIHHIVGVDVGFENPLFACLEVDYSDSDHDPSGRAFEEAAKTLTYYELDLGLNHVVRKWSEPVDPRSNLLVQVPGGYNQNLEKWDGPSGVLVCSEDYITYKHQDQPEHRVPIPKRLNPVEKLSERRGTLIVASVLHKMKNAFFFLVQTEDGDLFKITMEHQDDEIRSLKIKYFDTVPVASGLVILRSGFLFVASEYGAQLLYSFQKLGDDDDLPEYISTDYDENGAGRRRPQLPTFTPRPLDNLVQVDEMPSLDPILDAKPLNPLAADSPQIFAACGRGARSSFKMLRHGLEVQEAVSSDLPGVPSAVWTTKITQQDEYDSYIILSFVNGTLVLSIGETIEEVSDSGFLTSSSTLAVQQLGQDALLQVHPHGIRHVLVDKQINEWATPSLPNGRQTTIVATCTNERQVVVALSSNELVYFELDMDGQLNEYQERKAMGAGVLTMSMPDCPEGRQRTPYLAVGCDDSTVRIISLEPNSTLASISIQALTAPASSICMAEMLDATIDRNHATTFVNIGLQNGVLLRTILDAVTGQLTDTRTRFLGSKAVRLIRTKVHGQAAVMALSTRTWLSYTYQDRLQFVPLIFDVLDHAWSFSAELCPEGLIGIVGSTLRIFTIPSLASKLKQDSVALSYTPRKIANHPNEQGLFYVVEAEHRTLSPGAQRRRTEMLGKELKPHQRGVLDLNPAEFGAIRAEAGNWASCIRAVDGVQAQTTHRLEMDDNEAAFSIAVVPFASAEKEVMLVVGSAVDVVLSPRSCKKAYLTTYRLLDNGRELELLHKTEVDDIPLVLRAFQGRLLAGIGKALRIYDLGKKKLLRKCENRSFPTAVVSLDAQGSRIVVGDMQESIIFASYKPLENRLVTFADDVMPKFVTRCTMLDYDTVAAADKFGNIYVLRLDGNTSRSVDEDPTGMTIVHEKPVLMGAAHKASLVAHFFVGDIITSLHRTAMVAGGREVLLYTGLSGSIGALVPFVSKEDVDTLSTLESHLRQENNSIVGRDHLAYRSSYAPVKSVIDGDLCETFGLLSPAKQNAIAGELDRKPGEINKKLAQLREGATGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.12
3	0.12
4	0.11
5	0.11
6	0.12
7	0.09
8	0.08
9	0.08
10	0.07
11	0.07
12	0.09
13	0.19
14	0.19
15	0.21
16	0.2
17	0.21
18	0.25
19	0.27
20	0.28
21	0.26
22	0.25
23	0.24
24	0.27
25	0.27
26	0.25
27	0.24
28	0.24
29	0.23
30	0.29
31	0.35
32	0.34
33	0.37
34	0.37
35	0.39
36	0.4
37	0.38
38	0.34
39	0.29
40	0.28
41	0.25
42	0.27
43	0.29
44	0.25
45	0.22
46	0.2
47	0.19
48	0.18
49	0.18
50	0.14
51	0.09
52	0.08
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.1
57	0.1
58	0.09
59	0.14
60	0.15
61	0.15
62	0.18
63	0.19
64	0.18
65	0.19
66	0.19
67	0.14
68	0.14
69	0.14
70	0.11
71	0.11
72	0.12
73	0.12
74	0.11
75	0.1
76	0.09
77	0.1
78	0.13
79	0.17
80	0.23
81	0.25
82	0.29
83	0.29
84	0.31
85	0.34
86	0.36
87	0.36
88	0.34
89	0.41
90	0.43
91	0.5
92	0.5
93	0.51
94	0.48
95	0.45
96	0.43
97	0.39
98	0.36
99	0.29
100	0.33
101	0.36
102	0.38
103	0.38
104	0.38
105	0.39
106	0.38
107	0.41
108	0.38
109	0.33
110	0.31
111	0.31
112	0.32
113	0.3
114	0.27
115	0.27
116	0.26
117	0.24
118	0.22
119	0.22
120	0.23
121	0.23
122	0.26
123	0.23
124	0.21
125	0.21
126	0.2
127	0.18
128	0.12
129	0.08
130	0.05
131	0.06
132	0.09
133	0.11
134	0.12
135	0.12
136	0.13
137	0.14
138	0.15
139	0.16
140	0.15
141	0.13
142	0.13
143	0.13
144	0.13
145	0.13
146	0.12
147	0.11
148	0.14
149	0.14
150	0.15
151	0.16
152	0.17
153	0.16
154	0.2
155	0.23
156	0.2
157	0.19
158	0.2
159	0.18
160	0.17
161	0.17
162	0.12
163	0.09
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.05
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.06
172	0.06
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.09
178	0.09
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.12
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.14
188	0.13
189	0.12
190	0.12
191	0.16
192	0.18
193	0.19
194	0.2
195	0.17
196	0.17
197	0.17
198	0.17
199	0.14
200	0.11
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.12
206	0.13
207	0.14
208	0.14
209	0.14
210	0.14
211	0.15
212	0.18
213	0.2
214	0.21
215	0.27
216	0.34
217	0.41
218	0.47
219	0.48
220	0.47
221	0.46
222	0.44
223	0.38
224	0.32
225	0.26
226	0.17
227	0.19
228	0.17
229	0.15
230	0.17
231	0.16
232	0.16
233	0.15
234	0.17
235	0.16
236	0.17
237	0.17
238	0.17
239	0.19
240	0.18
241	0.18
242	0.17
243	0.17
244	0.15
245	0.14
246	0.12
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.08
251	0.08
252	0.1
253	0.12
254	0.15
255	0.18
256	0.23
257	0.27
258	0.34
259	0.37
260	0.45
261	0.51
262	0.54
263	0.53
264	0.57
265	0.54
266	0.58
267	0.62
268	0.57
269	0.55
270	0.57
271	0.62
272	0.57
273	0.62
274	0.6
275	0.57
276	0.6
277	0.58
278	0.56
279	0.49
280	0.47
281	0.41
282	0.33
283	0.27
284	0.24
285	0.19
286	0.15
287	0.15
288	0.18
289	0.19
290	0.18
291	0.19
292	0.18
293	0.19
294	0.22
295	0.23
296	0.19
297	0.18
298	0.19
299	0.19
300	0.2
301	0.17
302	0.14
303	0.13
304	0.12
305	0.12
306	0.11
307	0.1
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.12
313	0.15
314	0.15
315	0.16
316	0.2
317	0.2
318	0.22
319	0.24
320	0.19
321	0.18
322	0.18
323	0.2
324	0.21
325	0.21
326	0.2
327	0.21
328	0.23
329	0.25
330	0.25
331	0.22
332	0.19
333	0.18
334	0.16
335	0.14
336	0.11
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.09
361	0.09
362	0.11
363	0.12
364	0.12
365	0.12
366	0.14
367	0.14
368	0.13
369	0.12
370	0.11
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.07
379	0.1
380	0.14
381	0.14
382	0.17
383	0.23
384	0.26
385	0.29
386	0.32
387	0.37
388	0.4
389	0.47
390	0.51
391	0.5
392	0.49
393	0.45
394	0.46
395	0.41
396	0.36
397	0.31
398	0.27
399	0.23
400	0.22
401	0.21
402	0.18
403	0.15
404	0.13
405	0.1
406	0.07
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.13
416	0.13
417	0.13
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.13
422	0.15
423	0.11
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.11
428	0.09
429	0.09
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.1
434	0.11
435	0.14
436	0.16
437	0.22
438	0.25
439	0.27
440	0.32
441	0.32
442	0.32
443	0.33
444	0.32
445	0.26
446	0.24
447	0.22
448	0.16
449	0.14
450	0.13
451	0.11
452	0.09
453	0.08
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.08
464	0.09
465	0.11
466	0.16
467	0.22
468	0.23
469	0.24
470	0.24
471	0.25
472	0.26
473	0.27
474	0.21
475	0.16
476	0.15
477	0.13
478	0.12
479	0.08
480	0.07
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.03
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.05
513	0.06
514	0.07
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.05
519	0.06
520	0.06
521	0.06
522	0.05
523	0.08
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.1
529	0.11
530	0.13
531	0.11
532	0.14
533	0.17
534	0.17
535	0.17
536	0.19
537	0.18
538	0.15
539	0.15
540	0.13
541	0.1
542	0.1
543	0.1
544	0.13
545	0.15
546	0.19
547	0.2
548	0.2
549	0.2
550	0.2
551	0.23
552	0.18
553	0.18
554	0.15
555	0.14
556	0.14
557	0.15
558	0.16
559	0.12
560	0.11
561	0.1
562	0.1
563	0.09
564	0.08
565	0.09
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.07
570	0.07
571	0.06
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.06
586	0.06
587	0.07
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.06
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.04
599	0.04
600	0.04
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.05
605	0.12
606	0.16
607	0.18
608	0.22
609	0.23
610	0.25
611	0.26
612	0.28
613	0.23
614	0.19
615	0.18
616	0.16
617	0.15
618	0.13
619	0.11
620	0.08
621	0.08
622	0.07
623	0.06
624	0.05
625	0.05
626	0.07
627	0.09
628	0.1
629	0.09
630	0.1
631	0.1
632	0.1
633	0.1
634	0.08
635	0.07
636	0.06
637	0.07
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.05
648	0.05
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.05
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.07
664	0.07
665	0.07
666	0.08
667	0.08
668	0.1
669	0.1
670	0.1
671	0.09
672	0.08
673	0.08
674	0.07
675	0.06
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.05
686	0.04
687	0.04
688	0.06
689	0.07
690	0.1
691	0.1
692	0.11
693	0.11
694	0.12
695	0.13
696	0.12
697	0.19
698	0.18
699	0.22
700	0.25
701	0.29
702	0.31
703	0.32
704	0.33
705	0.29
706	0.32
707	0.3
708	0.3
709	0.29
710	0.27
711	0.25
712	0.26
713	0.23
714	0.19
715	0.16
716	0.12
717	0.09
718	0.08
719	0.08
720	0.05
721	0.04
722	0.05
723	0.06
724	0.08
725	0.16
726	0.19
727	0.21
728	0.25
729	0.27
730	0.28
731	0.28
732	0.28
733	0.23
734	0.19
735	0.18
736	0.14
737	0.14
738	0.12
739	0.11
740	0.1
741	0.08
742	0.09
743	0.07
744	0.07
745	0.06
746	0.06
747	0.06
748	0.06
749	0.07
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.05
757	0.03
758	0.03
759	0.03
760	0.03
761	0.03
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.04
768	0.04
769	0.07
770	0.07
771	0.08
772	0.13
773	0.13
774	0.15
775	0.17
776	0.2
777	0.18
778	0.19
779	0.19
780	0.16
781	0.18
782	0.18
783	0.16
784	0.16
785	0.19
786	0.19
787	0.21
788	0.21
789	0.21
790	0.25
791	0.35
792	0.41
793	0.46
794	0.47
795	0.49
796	0.49
797	0.48
798	0.42
799	0.33
800	0.24
801	0.14
802	0.14
803	0.09
804	0.1
805	0.1
806	0.11
807	0.1
808	0.1
809	0.12
810	0.1
811	0.11
812	0.16
813	0.24
814	0.3
815	0.37
816	0.39
817	0.42
818	0.46
819	0.48
820	0.47
821	0.42
822	0.45
823	0.45
824	0.45
825	0.47
826	0.49
827	0.53
828	0.5
829	0.48
830	0.41
831	0.34
832	0.34
833	0.34
834	0.34
835	0.3
836	0.28
837	0.27
838	0.24
839	0.22
840	0.21
841	0.15
842	0.1
843	0.07
844	0.06
845	0.06
846	0.06
847	0.06
848	0.07
849	0.08
850	0.08
851	0.07
852	0.07
853	0.07
854	0.08
855	0.08
856	0.08
857	0.09
858	0.09
859	0.12
860	0.14
861	0.15
862	0.15
863	0.15
864	0.14
865	0.19
866	0.19
867	0.16
868	0.14
869	0.14
870	0.14
871	0.16
872	0.21
873	0.17
874	0.17
875	0.16
876	0.16
877	0.15
878	0.14
879	0.11
880	0.08
881	0.05
882	0.05
883	0.05
884	0.05
885	0.05
886	0.06
887	0.07
888	0.06
889	0.06
890	0.06
891	0.06
892	0.06
893	0.06
894	0.05
895	0.05
896	0.04
897	0.04
898	0.04
899	0.03
900	0.03
901	0.03
902	0.03
903	0.03
904	0.06
905	0.07
906	0.09
907	0.13
908	0.18
909	0.19
910	0.21
911	0.25
912	0.31
913	0.38
914	0.46
915	0.47
916	0.49
917	0.51
918	0.5
919	0.47
920	0.39
921	0.33
922	0.27
923	0.24
924	0.19
925	0.17
926	0.16
927	0.18
928	0.2
929	0.21
930	0.17
931	0.16
932	0.15
933	0.19
934	0.19
935	0.18
936	0.14
937	0.13
938	0.13
939	0.16
940	0.15
941	0.11
942	0.12
943	0.11
944	0.11
945	0.12
946	0.12
947	0.09
948	0.1
949	0.11
950	0.11
951	0.09
952	0.12
953	0.11
954	0.1
955	0.1
956	0.1
957	0.09
958	0.09
959	0.12
960	0.17
961	0.25
962	0.28
963	0.34
964	0.39
965	0.47
966	0.51
967	0.59
968	0.61
969	0.63
970	0.71
971	0.76
972	0.81
973	0.78
974	0.8
975	0.73
976	0.64
977	0.57
978	0.48
979	0.37
980	0.29
981	0.24
982	0.18
983	0.16
984	0.15
985	0.11
986	0.1
987	0.1
988	0.08
989	0.08
990	0.07
991	0.06
992	0.07
993	0.07
994	0.07
995	0.08
996	0.08
997	0.07
998	0.07
999	0.08
1000	0.07
1001	0.06
1002	0.11
1003	0.13
1004	0.18
1005	0.19
1006	0.23
1007	0.26
1008	0.28
1009	0.3
1010	0.29
1011	0.28
1012	0.24
1013	0.24
1014	0.2
1015	0.19
1016	0.19
1017	0.18
1018	0.16
1019	0.16
1020	0.15
1021	0.15
1022	0.15
1023	0.15
1024	0.16
1025	0.17
1026	0.2
1027	0.21
1028	0.22
1029	0.23
1030	0.23
1031	0.21
1032	0.19
1033	0.18
1034	0.13
1035	0.11
1036	0.1
1037	0.09
1038	0.08
1039	0.07
1040	0.07
1041	0.1
1042	0.09
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.1
1048	0.13
1049	0.14
1050	0.16
1051	0.18
1052	0.19
1053	0.18
1054	0.19
1055	0.21
1056	0.2
1057	0.18
1058	0.17
1059	0.15
1060	0.14
1061	0.14
1062	0.13
1063	0.11
1064	0.15
1065	0.15
1066	0.17
1067	0.16
1068	0.15
1069	0.15
1070	0.17
1071	0.17
1072	0.12
1073	0.13
1074	0.14
1075	0.17
1076	0.17
1077	0.16
1078	0.14
1079	0.14
1080	0.17
1081	0.17
1082	0.14
1083	0.12
1084	0.12
1085	0.12
1086	0.12
1087	0.11
1088	0.08
1089	0.06
1090	0.07
1091	0.08
1092	0.09
1093	0.09
1094	0.1
1095	0.1
1096	0.1
1097	0.1
1098	0.14
1099	0.15
1100	0.15
1101	0.16
1102	0.17
1103	0.16
1104	0.16
1105	0.15
1106	0.1
1107	0.09
1108	0.07
1109	0.07
1110	0.06
1111	0.06
1112	0.06
1113	0.06
1114	0.06
1115	0.06
1116	0.06
1117	0.06
1118	0.06
1119	0.06
1120	0.06
1121	0.07
1122	0.08
1123	0.08
1124	0.08
1125	0.09
1126	0.12
1127	0.14
1128	0.15
1129	0.15
1130	0.15
1131	0.14
1132	0.14
1133	0.14
1134	0.14
1135	0.14
1136	0.17
1137	0.22
1138	0.23
1139	0.23
1140	0.28
1141	0.31
1142	0.33
1143	0.34
1144	0.31
1145	0.26
1146	0.27
1147	0.28
1148	0.25
1149	0.24
1150	0.22
1151	0.21
1152	0.21
1153	0.23
1154	0.23
1155	0.24
1156	0.27
1157	0.26
1158	0.25
1159	0.26
1160	0.28
1161	0.26
1162	0.25
1163	0.23
1164	0.2
1165	0.19
1166	0.2
1167	0.18
1168	0.16
1169	0.14
1170	0.12
1171	0.11
1172	0.11
1173	0.13
1174	0.11
1175	0.12
1176	0.16
1177	0.19
1178	0.21
1179	0.21
1180	0.2
1181	0.18
1182	0.2
1183	0.19
1184	0.16
1185	0.22
1186	0.23
1187	0.27
1188	0.26
1189	0.26
1190	0.25
1191	0.32
1192	0.39
1193	0.39
1194	0.44
1195	0.46
1196	0.55
1197	0.59
1198	0.6
1199	0.56
1200	0.51
1201	0.47

Q4PGM6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer